Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003566)

(Analysis AN006190)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12
L-Leucine	ME995946	12.30	0.10	0.11	NA	0.22	0.09	0.14	0.46	0.41	0.34	0.23	0.18
L-Methionine	ME995949	12.90	0.02	0.16	NA	0.18	0.02	0.14	0.62	0.11	0.75	0.05	0.15
L-Tyrosine	ME995955	12.85	0.04	0.20	NA	0.23	0.07	0.20	0.48	0.06	0.68	0.08	0.21
L-Tryptophan	ME995954	13.60	0.01	0.07	NA	0.19	0.01	0.07	0.24	0.00	0.22	0.00	0.14
L-Serine	ME995952	13.50	0.04	0.16	NA	0.13	0.03	0.09	0.30	0.12	0.58	0.05	0.13
L-Asparagine	ME995934	13.33	0.05	0.17	NA	0.13	0.05	0.24	0.35	0.19	0.30	0.08	0.14
L-Phenylalanine	ME995950	13.24	0.04	0.18	NA	0.21	0.04	0.17	0.50	0.07	0.50	0.05	0.18
L-Glutamic acid	ME995940	9.68	0.06	0.67	NA	0.21	0.16	0.94	0.70	0.14	0.73	0.07	0.57
L-Threonine	ME995953	10.39	0.02	NA	NA	0.05	0.05	0.03	0.29	0.07	0.21	0.03	0.03
Ureidopropionic acid	ME995998	11.41	0.02	0.04	NA	NA	0.03	0.05	0.29	0.04	0.27	0.01	NA
Adenine	ME995876	11.22	0.18	0.27	NA	0.22	0.17	0.30	0.64	0.32	0.53	0.32	0.14
L-Isoleucine	ME995943	11.57	0.09	0.23	NA	0.25	0.10	0.23	0.74	0.26	0.81	0.14	0.22
L-Valine	ME995956	11.16	0.06	0.33	NA	0.41	0.28	0.28	0.77	0.24	0.82	0.02	0.33
N-Acetylornithine	ME995963	4.94	0.50	0.55	NA	0.12	2.78	0.25	0.21	1.36	0.43	0.27	0.16
L-Proline	ME995951	8.21	0.16	0.52	NA	0.47	0.18	0.66	1.50	0.21	1.41	0.16	0.67
Glycine	ME995919	8.46	0.44	0.19	NA	NA	0.32	0.18	0.64	0.58	0.68	0.40	0.05
L-Lysine	ME995947	7.95	0.13	0.61	NA	NA	0.14	NA	0.27	0.18	0.09	0.08	NA
L-Arginine	ME995933	5.36	0.31	NA	NA	NA	0.30	NA	0.02	0.34	NA	0.22	NA
L-Alanine	ME995932	6.15	0.63	0.48	NA	0.23	0.64	0.45	1.55	0.57	1.48	0.44	0.21
L-Histidine	ME995942	6.29	NA	0.66	NA	0.10	0.15	0.73	1.89	0.07	1.12	0.06	0.09
Guanosine	ME995922	0.03	0.05	0.05	NA	6.16	0.06	0.04	0.04	0.13	0.03	0.10	7.97
Valerylcarnitine	ME996007	0.04	0.04	0.37	NA	7.40	0.06	0.27	0.13	0.23	0.10	0.08	5.93
Cytidine	ME995899	0.07	0.06	0.70	NA	4.02	0.06	0.57	0.93	0.08	0.75	0.08	7.41
Guanine	ME995921	0.37	0.32	0.08	NA	3.90	0.24	0.06	0.03	0.82	0.02	0.58	5.23
Glutathione	ME995917	NA	0.02	0.01	NA	0.00	0.02	0.01	1.65	0.02	7.42	0.01	0.01
Hypotaurine	ME995927	NA	1.35	1.25	NA	0.01	0.23	0.09	0.06	0.11	2.23	2.49	0.01
N-Acetyl-L-methionine	ME995961	0.32	1.15	0.18	NA	0.88	1.79	0.27	1.07	1.07	0.72	0.92	2.83
D-Glucose	ME995904	1.35	1.64	0.09	NA	0.93	1.48	0.08	0.46	1.26	0.10	1.51	1.35
Oxoadipic acid	ME995976	0.69	0.58	NA	NA	1.00	1.21	NA	NA	0.59	NA	1.44	2.25
Butyrylcarnitine	ME995888	0.11	0.41	1.61	NA	2.09	0.18	1.26	0.53	1.52	0.24	1.07	2.04
Thymidine	ME995996	NA	0.47	NA	NA	2.69	0.30	NA	NA	1.20	NA	0.47	1.91
Betaine	ME995887	0.84	0.75	1.60	NA	0.08	1.32	0.40	0.48	1.68	1.51	1.14	0.16
Sarcosine	ME995993	1.33	0.94	0.39	NA	0.01	0.62	0.42	1.80	1.13	1.10	1.65	0.02
Glycerol 3-phosphate	ME995918	NA	1.18	0.38	NA	0.00	0.73	0.56	2.59	1.16	1.39	1.13	0.01
Xanthylic acid	ME996010	NA	0.76	NA	NA	NA	0.64	NA	2.25	0.48	1.55	0.39	NA
Beta-Alanine	ME995886	0.02	2.05	0.10	NA	NA	2.09	0.15	1.55	1.26	0.45	0.34	NA
Taurine	ME995995	NA	1.35	0.76	NA	0.01	1.77	0.57	1.14	0.84	1.02	1.69	0.01
5^-Methylthioadenosine	ME995870	1.88	NA	0.39	NA	NA	NA	0.61	0.55	1.39	0.18	1.54	NA
Pantothenic acid	ME995979	2.98	1.07	0.13	NA	0.06	0.72	0.10	0.22	2.92	0.20	0.93	0.06
4,5-Dihydroorotic acid	ME995868	0.07	0.07	NA	NA	NA	0.27	0.22	1.81	2.83	0.04	0.11	NA
L-Cystathionine	ME995937	0.00	0.57	0.18	NA	0.00	1.62	0.87	1.44	2.14	NA	0.04	0.00
Carnosine	ME995890	0.06	1.34	0.10	NA	0.02	2.29	0.09	0.14	3.39	0.13	0.47	0.03
Citric acid	ME995894	0.38	1.37	0.19	NA	NA	2.07	0.17	0.13	2.76	0.11	1.17	0.02
N-Acetylglutamic acid	ME995958	0.02	1.13	0.12	NA	NA	2.20	0.22	0.56	2.56	0.57	0.85	0.01
Argininosuccinic acid	ME995885	NA	0.88	0.01	NA	NA	3.42	0.02	0.05	1.99	0.01	0.05	0.00
N-Acetyl-L-alanine	ME995960	0.11	0.92	0.09	NA	0.16	3.16	0.09	0.47	2.71	0.42	0.66	0.43
3-Hydroxybutyric acid	ME995866	0.39	0.12	0.75	NA	NA	0.11	0.55	0.87	3.17	0.71	0.97	NA
L-Acetylcarnitine	ME995931	0.00	0.58	1.20	NA	0.37	0.39	1.08	0.71	2.38	0.13	1.45	0.39
Orotic acid	ME995973	NA	0.11	0.00	NA	0.00	0.26	0.00	0.01	4.79	0.00	0.79	0.00
N-Acetylglutamine	ME995959	0.03	0.45	0.08	NA	0.00	0.54	0.06	0.18	4.07	0.14	1.64	0.00
Pyruvic acid	ME995988	0.07	0.39	0.36	NA	NA	0.58	0.37	0.21	3.58	0.26	1.07	NA
Succinic acid	ME995994	0.30	0.39	0.12	NA	NA	0.53	0.13	0.25	3.40	0.18	1.56	NA
cis-Aconitic acid	ME995893	0.01	0.98	0.01	NA	NA	0.93	0.00	0.00	3.40	0.00	1.25	NA
N-Acetylserine	ME995964	0.52	0.71	0.05	NA	0.17	1.34	0.05	0.17	3.76	0.22	1.10	0.21
Nicotinic acid	ME995970	1.08	0.18	NA	NA	NA	0.25	NA	0.38	3.27	NA	0.55	NA
L-Cysteine	ME995938	NA	0.27	NA	NA	0.40	0.74	0.31	0.49	2.57	NA	0.45	0.73
Oxoglutaric acid	ME995977	0.14	0.51	NA	NA	NA	0.40	NA	0.01	3.26	0.04	0.63	NA
Ureidosuccinic acid	ME995999	NA	0.06	NA	NA	NA	0.70	0.03	0.16	2.64	0.01	0.41	NA
1-Methylnicotinamide	ME995864	NA	0.14	0.01	NA	0.13	NA	NA	0.02	2.48	0.02	1.78	0.06
S-Adenosylmethionine	ME995992	0.01	NA	NA	NA	0.05	NA	NA	0.26	1.43	0.10	2.93	0.02
Allantoin	ME995883	0.00	1.16	0.01	NA	0.01	1.02	0.01	0.09	2.65	0.27	2.33	0.01
D-2-Hydroxyglutaric acid	ME995903	0.07	0.88	0.03	NA	NA	0.71	0.03	0.05	2.58	0.08	2.31	NA
Guanidoacetic acid	ME995920	0.00	1.03	0.03	NA	0.00	1.57	0.04	0.04	2.90	0.04	2.28	0.00
Aminoadipic acid	ME995884	0.05	1.59	0.01	NA	0.07	1.01	0.01	0.02	2.92	0.02	2.04	0.05
Creatinine	ME995897	0.00	1.40	0.02	NA	0.17	1.32	0.02	0.04	2.44	0.03	2.16	0.10
Pipecolic acid	ME995986	0.09	1.32	0.07	NA	0.00	1.33	0.06	0.07	2.78	0.06	2.16	0.01
Adenosine	ME995877	0.23	1.18	0.12	NA	NA	1.14	0.18	0.14	1.96	0.12	1.88	NA
Uric acid	ME996000	NA	1.11	0.02	NA	0.09	1.00	0.01	0.02	2.54	0.02	1.66	0.05
5-Phosphoribosylamine	ME995871	0.67	0.84	NA	NA	NA	1.26	0.50	0.76	2.56	0.83	2.40	NA
Acetylcysteine	ME995875	0.61	0.77	NA	NA	0.17	0.75	0.06	0.37	2.08	0.53	1.87	0.20
L-Cystine	ME995939	0.06	1.03	0.06	NA	NA	1.39	NA	NA	0.69	NA	1.55	NA
Phenol	ME995980	NA	0.88	0.16	NA	NA	0.64	0.16	NA	1.49	0.00	1.65	NA
Creatine	ME995896	NA	1.46	0.32	NA	0.36	1.47	0.45	0.57	1.79	0.42	1.38	0.33
Cyclic AMP	ME995898	0.01	0.85	NA	NA	NA	1.57	NA	NA	1.64	0.01	1.01	0.02
N-Acetyl-L-phenylalanine	ME995962	0.66	1.22	0.14	NA	NA	2.17	0.21	0.17	1.54	0.25	1.42	NA
L-Kynurenine	ME995944	1.80	0.27	1.31	NA	1.15	0.08	0.65	1.42	0.25	3.37	0.32	2.35
L-Glutamine	ME995941	3.63	0.22	1.34	NA	0.16	0.22	1.31	2.50	0.63	1.84	0.51	0.17
Carbamoyl phosphate	ME995889	2.73	NA	NA	NA	0.54	NA	NA	1.35	0.49	1.22	0.72	0.19
NAD	ME995965	2.96	0.27	0.84	NA	NA	NA	0.53	1.04	NA	1.09	NA	NA
Citrulline	ME995895	0.05	1.32	0.48	NA	0.05	2.67	2.56	3.18	0.85	0.24	0.06	0.05
L-Aspartic acid	ME995935	1.13	NA	0.90	NA	0.10	NA	1.12	1.23	NA	1.84	NA	0.10
D-Glyceraldehyde 3-phosphate	ME995905	0.18	0.57	1.12	NA	NA	NA	1.30	2.53	0.36	0.30	NA	NA
Phosphoenolpyruvic acid	ME995982	NA	0.97	0.82	NA	NA	NA	0.80	2.32	0.87	0.83	0.57	NA
3-Phosphoglyceric acid	ME995867	0.01	0.66	1.61	NA	NA	NA	1.49	1.37	0.96	0.66	0.68	NA
6-Phosphogluconic acid	ME995872	NA	0.73	1.19	NA	NA	0.67	1.18	1.55	0.45	0.93	NA	NA
Cytidine monophosphate	ME995900	NA	NA	1.06	NA	NA	NA	1.43	1.47	0.01	1.15	0.01	NA
Choline	ME995892	0.18	1.13	2.17	NA	NA	1.26	2.04	0.12	1.23	0.01	0.31	NA
Phosphocreatine	ME995981	NA	NA	0.74	NA	NA	1.08	2.01	0.53	NA	0.26	0.91	NA
Saccharopine	ME995990	0.10	NA	1.61	NA	NA	0.40	2.32	0.84	0.53	1.53	0.06	NA
ADP	ME995882	0.51	NA	1.84	NA	NA	NA	1.86	0.22	0.03	0.25	NA	NA
N6-Acetyl-L-lysine	ME995957	NA	0.10	1.82	NA	NA	0.15	3.18	NA	0.19	NA	0.17	0.15
Palmitic acid	ME995978	1.93	0.36	2.08	NA	NA	NA	3.33	0.20	0.41	0.22	0.39	0.34
Acetoacetic acid	ME995873	0.49	0.12	3.34	NA	0.30	0.12	3.37	0.35	1.18	0.45	0.75	0.32
Xanthosine	ME996009	0.54	0.21	2.89	NA	0.91	0.18	2.30	0.86	0.96	1.50	0.62	0.32
Propionylcarnitine	ME995987	0.06	0.03	3.60	NA	1.36	0.06	3.29	1.66	0.21	0.87	0.12	1.08
Phosphorylcholine	ME995984	0.01	0.48	3.08	NA	0.00	0.44	2.88	1.99	0.12	1.45	0.31	0.00
Ribose 1-phosphate	ME995989	0.00	0.01	2.73	NA	NA	0.02	2.53	1.89	0.01	1.29	0.01	0.00
4-Hydroxyproline	ME995869	0.39	0.75	0.80	NA	0.02	0.35	0.30	1.97	1.20	3.79	0.81	0.04
D-Ribose 5-phosphate	ME995908	NA	0.08	1.51	NA	NA	0.06	1.36	3.30	0.04	1.46	0.03	0.01
D-Sedoheptulose 7-phosphate	ME995909	NA	NA	1.30	NA	NA	0.03	1.50	4.27	0.02	0.91	0.03	NA
Adenosine monophosphate	ME995879	NA	0.00	0.85	NA	NA	0.00	1.10	3.43	0.00	3.22	0.00	NA
L-Lactic acid	ME995945	0.04	0.02	0.93	NA	NA	0.02	0.83	4.03	0.25	2.25	0.19	NA
Hypoxanthine	ME995928	NA	0.09	1.74	NA	1.17	0.08	1.88	2.91	0.25	2.69	0.16	0.98
Inosine	ME995929	NA	0.01	2.25	NA	0.70	0.01	2.28	3.88	0.05	2.37	0.04	0.64
L-Carnitine	ME995936	0.00	0.27	1.90	NA	0.16	0.29	1.75	2.10	1.29	2.23	0.76	0.11
Xanthine	ME996008	0.03	0.31	2.09	NA	0.50	0.22	2.03	2.23	0.90	2.19	0.60	0.28
Guanosine monophosphate	ME995924	NA	0.06	1.74	NA	NA	0.04	1.67	1.77	0.04	3.06	NA	NA
O-Phosphoethanolamine	ME995971	NA	0.11	2.12	NA	NA	0.10	1.64	2.21	0.21	2.66	0.23	NA
Ornithine	ME995972	0.31	NA	1.85	NA	NA	NA	1.90	2.19	0.24	1.65	0.18	NA
Niacinamide	ME995969	NA	0.36	2.06	NA	0.02	0.48	2.06	3.09	0.28	2.72	0.20	0.04
Fumaric acid	ME995915	0.04	0.07	1.71	NA	NA	0.06	2.06	2.80	0.05	1.98	0.25	0.04
L-Malic acid	ME995948	0.05	0.12	1.70	NA	NA	0.10	1.99	3.29	0.14	2.34	0.31	0.03
Uracil	ME995997	NA	0.05	0.56	NA	3.22	0.20	1.32	3.02	0.35	0.60	0.25	3.42
Uridine	ME996001	0.11	0.10	0.78	NA	2.57	0.08	1.55	4.11	0.38	1.15	0.13	2.79
Dihydroxyacetone phosphate	ME995907	0.07	0.18	0.20	NA	NA	0.14	0.24	6.06	0.27	0.99	0.18	NA
S-Adenosylhomocysteine	ME995991	NA	0.06	0.09	NA	0.13	0.15	1.98	7.10	0.10	0.55	0.02	0.19
Fructose 6-phosphate	ME995914	0.01	0.02	1.69	NA	NA	0.09	2.13	6.20	0.03	0.86	0.02	NA
Glucose 6-phosphate	ME995916	NA	0.04	1.11	NA	NA	0.09	1.53	6.02	0.01	0.86	0.01	NA

Factors:

F1	Factor:Food \| Sample source:food
F2	Factor:Het 2 hr \| Sample source:urine
F3	Factor:Het 45 min \| Sample source:liver
F4	Factor:ISTD \| Sample source:standard
F5	Factor:Knockout \| Sample source:Stool
F6	Factor:KO 2 hr \| Sample source:urine
F7	Factor:KO 45 min \| Sample source:liver
F8	Factor:No Cys KO \| Sample source:liver
F9	Factor:No Cys KO \| Sample source:urine
F10	Factor:No Cys WT \| Sample source:liver
F11	Factor:No Cys WT \| Sample source:urine
F12	Factor:Wild Type \| Sample source:Stool

Data matrix