Clustering data with hclust algorithm for (Study ST000302)
(Analysis AN000480)Metabolite | Structure | F1 | F2 | F3 | F4 | F5 | F6 | F7 | F8 | F9 | F10 | F11 | F12 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CIT/ICIT_13C_1 | ME108436 | 0.44 | 0.84 | NA | 1.14 | NA | NA | 0.23 | 1.34 | NA | 1.56 | NA | NA |
ADP_13C_2 | ME108414 | 0.21 | 1.29 | NA | 1.10 | NA | NA | 0.16 | 1.40 | NA | 1.30 | NA | NA |
AMP_13C_2 | ME108420 | 0.32 | 1.09 | NA | 1.05 | NA | NA | 0.43 | 1.59 | NA | 1.32 | NA | NA |
CIT/ICIT_13C_2 | ME108437 | 0.01 | 1.47 | NA | 1.27 | NA | NA | 0.01 | 1.84 | NA | 1.39 | NA | NA |
MAL_13C_2 | ME108481 | 0.01 | 1.16 | NA | 1.15 | NA | NA | 0.01 | 1.91 | NA | 1.77 | NA | NA |
SUC_13C_1 | ME108519 | 0.02 | 0.84 | NA | 1.07 | NA | NA | 0.09 | 1.86 | NA | 1.79 | NA | NA |
ASP_13C_1 | ME108425 | 0.06 | 0.95 | NA | 1.45 | NA | NA | 0.06 | 1.41 | NA | 2.06 | NA | NA |
GLU_13C_1 | ME108470 | 0.09 | 1.01 | NA | 1.52 | NA | NA | 0.12 | 1.50 | NA | 1.76 | NA | NA |
CIT/ICIT_13C_3 | ME108438 | 0.02 | 1.10 | NA | 1.18 | NA | NA | 0.04 | 1.66 | NA | 2.00 | NA | NA |
ASP_13C_3 | ME108427 | 0.09 | 0.93 | NA | 1.07 | NA | NA | 0.09 | 1.47 | NA | 1.75 | NA | NA |
MAL_13C_1 | ME108480 | 0.04 | 0.95 | NA | 1.24 | NA | NA | 0.04 | 1.56 | NA | 1.85 | NA | NA |
6PG_13C_1 | ME108403 | 0.20 | 1.13 | NA | 1.27 | NA | NA | 0.17 | 1.56 | NA | 1.76 | NA | NA |
6PG_13C_2 | ME108404 | 0.02 | 1.20 | NA | 1.17 | NA | NA | 0.09 | 1.61 | NA | 1.60 | NA | NA |
ASP_13C_2 | ME108426 | 0.01 | 1.11 | NA | 1.28 | NA | NA | 0.03 | 1.56 | NA | 1.68 | NA | NA |
GLU_13C_2 | ME108471 | 0.00 | 1.13 | NA | 1.30 | NA | NA | 0.00 | 1.55 | NA | 1.69 | NA | NA |
NADH_13C_1 | ME108495 | 1.02 | 1.74 | NA | 0.59 | NA | NA | 1.03 | 0.14 | NA | 1.68 | NA | NA |
PEP | ME108500 | 0.52 | 1.77 | NA | 1.04 | NA | NA | 0.95 | 0.71 | NA | 1.12 | NA | NA |
S7P_13C_1 | ME108511 | 0.55 | 2.15 | NA | 1.12 | NA | NA | 0.46 | 0.58 | NA | 1.48 | NA | NA |
AMP_13C_3 | ME108421 | 1.27 | 0.69 | NA | 1.12 | NA | NA | 0.23 | 1.35 | NA | 1.12 | NA | NA |
GI_OH3P | ME108465 | 0.49 | 0.53 | NA | 0.67 | NA | NA | 1.28 | 1.96 | NA | 1.07 | NA | NA |
NADH_13C_2 | ME108496 | 0.57 | 0.61 | NA | 0.80 | NA | NA | 1.07 | 1.78 | NA | 1.17 | NA | NA |
ATP_13C_2 | ME108431 | 0.20 | 0.73 | NA | 1.25 | NA | NA | 0.71 | 1.62 | NA | 1.13 | NA | NA |
6PG | ME108402 | 0.65 | 1.12 | NA | 1.12 | NA | NA | 0.60 | 1.25 | NA | 1.26 | NA | NA |
ASP | ME108424 | 0.59 | 1.06 | NA | 1.22 | NA | NA | 0.63 | 1.20 | NA | 1.30 | NA | NA |
MAL | ME108479 | 0.74 | 0.97 | NA | 0.99 | NA | NA | 0.86 | 1.24 | NA | 1.20 | NA | NA |
NADH | ME108494 | 0.71 | 0.89 | NA | 0.91 | NA | NA | 1.18 | 1.20 | NA | 1.12 | NA | NA |
SUC | ME108518 | 0.72 | 0.85 | NA | 0.94 | NA | NA | 1.09 | 1.21 | NA | 1.19 | NA | NA |
NADH_13C_4 | ME108498 | 0.58 | 0.34 | NA | 0.37 | NA | NA | 1.84 | 1.28 | NA | 1.36 | NA | NA |
aCoA_13C_1 | ME108410 | 0.96 | 0.19 | NA | 0.47 | NA | NA | 1.45 | 1.29 | NA | 0.93 | NA | NA |
ADP_13C_3 | ME108415 | 0.82 | 0.07 | NA | 0.90 | NA | NA | 1.59 | 1.23 | NA | 0.97 | NA | NA |
aCoA | ME108409 | 1.02 | 0.45 | NA | 0.91 | NA | NA | 1.89 | 0.51 | NA | 1.23 | NA | NA |
LAC | ME108475 | 1.10 | 0.53 | NA | 0.71 | NA | NA | 1.87 | 0.78 | NA | 1.03 | NA | NA |
FBP | ME108447 | 1.04 | 0.66 | NA | 0.67 | NA | NA | 1.80 | 1.05 | NA | 0.77 | NA | NA |
G6P/F6P_13C_3 | ME108461 | 1.25 | 0.87 | NA | 0.33 | NA | NA | 1.68 | 0.72 | NA | 0.91 | NA | NA |
FBP_13C_2 | ME108449 | 0.65 | 0.65 | NA | 1.00 | NA | NA | 1.66 | 1.23 | NA | 0.81 | NA | NA |
ATP | ME108429 | 0.83 | 0.80 | NA | 0.76 | NA | NA | 1.44 | 1.24 | NA | 0.93 | NA | NA |
FBP_13C_1 | ME108448 | 0.72 | 0.84 | NA | 0.83 | NA | NA | 1.31 | 1.52 | NA | 0.78 | NA | NA |
ATP_13C_3 | ME108432 | 1.06 | 1.14 | NA | 0.42 | NA | NA | 1.33 | 1.09 | NA | 0.96 | NA | NA |
E4P | ME108442 | 1.35 | 0.83 | NA | 0.90 | NA | NA | 1.41 | 0.78 | NA | 0.73 | NA | NA |
G6P/F6P | ME108458 | 1.47 | 0.73 | NA | 0.83 | NA | NA | 1.54 | 0.73 | NA | 0.70 | NA | NA |
S7P | ME108510 | 1.07 | 1.15 | NA | 1.08 | NA | NA | 1.09 | 0.90 | NA | 0.71 | NA | NA |
G3P | ME108454 | 1.34 | 0.76 | NA | 0.93 | NA | NA | 1.07 | 0.83 | NA | 1.07 | NA | NA |
mCoA | ME108484 | 1.00 | 1.00 | NA | 1.00 | NA | NA | 1.00 | 1.00 | NA | 1.00 | NA | NA |
R5P/X5P_13C_1 | ME108505 | 0.92 | 0.92 | NA | 1.07 | NA | NA | 1.09 | 0.94 | NA | 1.05 | NA | NA |
ATP_13C_1 | ME108430 | 1.07 | 0.79 | NA | 0.91 | NA | NA | 1.18 | 1.22 | NA | 0.83 | NA | NA |
2PG/3PG | ME108398 | 0.93 | 0.96 | NA | 0.84 | NA | NA | 1.23 | 1.09 | NA | 0.95 | NA | NA |
R5P/X5P | ME108504 | 1.05 | 0.97 | NA | 0.85 | NA | NA | 1.27 | 1.11 | NA | 0.74 | NA | NA |
CIT/ICIT | ME108435 | 1.16 | 0.85 | NA | 0.80 | NA | NA | 1.46 | 0.84 | NA | 0.89 | NA | NA |
ADP | ME108412 | 0.96 | 0.75 | NA | 0.87 | NA | NA | 1.34 | 1.03 | NA | 1.06 | NA | NA |
AMP | ME108418 | 1.05 | 0.74 | NA | 0.87 | NA | NA | 1.30 | 0.98 | NA | 1.06 | NA | NA |
GLU | ME108469 | 1.11 | 0.79 | NA | 0.94 | NA | NA | 1.17 | 0.92 | NA | 1.06 | NA | NA |
G6P/F6P_13C_1 | ME108459 | 1.14 | 0.83 | NA | 0.92 | NA | NA | 1.27 | 0.98 | NA | 0.85 | NA | NA |
NAD | ME108488 | 1.18 | 0.88 | NA | 0.97 | NA | NA | 1.18 | 0.87 | NA | 0.93 | NA | NA |
Factors:
F1 | Cell line:pLKO | Labelint time (hours):0 |
F2 | Cell line:pLKO | Labelint time (hours):1 |
F3 | Cell line:pLKO | Labelint time (hours):24 |
F4 | Cell line:pLKO | Labelint time (hours):3 |
F5 | Cell line:pLKO | Labelint time (hours):48 |
F6 | Cell line:pLKO | Labelint time (hours):72 |
F7 | Cell line:shIDH1 | Labelint time (hours):0 |
F8 | Cell line:shIDH1 | Labelint time (hours):1 |
F9 | Cell line:shIDH1 | Labelint time (hours):24 |
F10 | Cell line:shIDH1 | Labelint time (hours):3 |
F11 | Cell line:shIDH1 | Labelint time (hours):48 |
F12 | Cell line:shIDH1 | Labelint time (hours):72 |