{ "METABOLOMICS WORKBENCH":{"STUDY_ID":"ST000057","ANALYSIS_ID":"AN000095","VERSION":"1","CREATED_ON":"2016-09-17"}, "PROJECT":{"PROJECT_TITLE":"Combined Metabolomics and Lipidomics of Type 1 Diabetes","PROJECT_TYPE":"MS study","PROJECT_SUMMARY":"This West Coast Metabolomics Center pilot and feasibility project granted to Bell (University of Chicago) and collaborator Manami Hara uses a multi-omics to investigate the metabolome (primary metabolites), lipidome (complex lipids) signaling lipids (oxylipins) in the plasma of Non-obese Diabetic (NOD) mice progressed to Type 1 Diabetes Mellitus (T1D) and those that did not. NOD Mice were assessed as diabetic or non-diabetic based on their fasting (4hr) blood levels at sacrifice, which defined 30 hyperglycemic (glucose = 250 mg/dL) and normoglycemic animals. The primary objective of this study was to identify biomarkers associated with beta-cell destruction/survival and T1D progression.","INSTITUTE":"University of California, Davis","DEPARTMENT":"Genome and Biomedical Sciences Facility","LABORATORY":"WCMC Metabolomics Core","LAST_NAME":"Fiehn","FIRST_NAME":"Oliver","ADDRESS":"1315 Genome and Biomedical Sciences Facility,451 Health Sciences Drive, Davis, 95616","EMAIL":"ofiehn@ucdavis.edu","PHONE":"(530) 754-8258","FUNDING_SOURCE":"NIH U24DK097154"}, "STUDY":{"STUDY_TITLE":"Combined Metabolomics and Lipidomics of Type 1 Diabetes (GCMS)","STUDY_TYPE":"biomarker study","STUDY_SUMMARY":"This West Coast Metabolomics Center pilot and feasibility project granted to Bell (University of Chicago) and collaborator Manami Hara uses a multi-omics to investigate the metabolome (primary metabolites), lipidome (complex lipids) signaling lipids (oxylipins) in the plasma of Non-obese Diabetic (NOD) mice progressed to Type 1 Diabetes Mellitus (T1D) and those that did not. NOD Mice were assessed as diabetic or non-diabetic based on their fasting (4hr) blood levels at sacrifice, which defined 30 hyperglycemic (glucose = 250 mg/dL) and normoglycemic animals. The primary objective of this study was to identify biomarkers associated with beta-cell destruction/survival and T1D progression.","INSTITUTE":"University of California, Davis","DEPARTMENT":"Genome and Biomedical Sciences Facility","LABORATORY":"WCMC Metabolomics Core","LAST_NAME":"Fiehn","FIRST_NAME":"Oliver","ADDRESS":"1315 Genome and Biomedical Sciences Facility451 Health Sciences DriveDavis, CA","EMAIL":"ofiehn@ucdavis.edu","PHONE":"(530) 754-8258","NUM_GROUPS":"8","TOTAL_SUBJECTS":"75"}, "SUBJECT":{"SUBJECT_TYPE":"plasma","SUBJECT_SPECIES":"Mus musculus","TAXONOMY_ID":"10090","SPECIES_GROUP":"Mammal"}, "SUBJECT_SAMPLE_FACTORS":[ { "Subject ID":"3", "Sample ID":"131124dlvsa24_1", "Factors":{"Diagnosis":"Non-diabetic"}, "Additional sample data":{"Group":"1"} }, { "Subject ID":"16", "Sample ID":"131124dlvsa25_1", "Factors":{"Diagnosis":"Non-diabetic"}, "Additional sample data":{"Group":"1"} }, { "Subject ID":"8", "Sample ID":"131124dlvsa26_1", "Factors":{"Diagnosis":"Non-diabetic"}, 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