Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST000486)

(Analysis AN000768)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19	F20	F21	F22	F23	F24	F25	F26
Valerate	ME156030	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	16.97	0.15	5.46	0.15	0.15
Quinic acid	ME156018	0.01	0.01	0.01	0.66	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	12.83	0.01	0.01	0.01	0.01	6.44	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	5.80	0.01	0.01	0.01
Shikimic acid	ME156020	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	17.81	0.04	0.04	0.04	0.04	7.16	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04
Putrescine	ME156017	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	0.26	19.53	0.26	0.26	0.26
Adenine	ME155985	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	0.46	14.39	0.46	0.46	0.46
Chlorogenate	ME155992	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	0.41	15.75	0.41	0.41	0.41
trans-Aconitate	ME156034	0.27	0.27	0.27	0.32	15.49	0.27	0.27	4.02	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27	0.27
Nicotinamide ribotide	ME156014	0.14	0.14	0.14	2.56	0.14	0.14	0.14	0.98	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	11.03	0.14	0.14	8.33	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14
Butyrate	ME155991	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	0.61	10.74	0.61	0.61
cis-Aconitate	ME156032	0.08	7.09	1.58	3.27	1.69	5.47	4.86	0.56	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08
Asparagine	ME155989	0.16	1.09	0.57	0.46	0.20	0.00	2.85	0.13	0.29	0.00	1.13	0.46	0.63	5.84	0.00	0.38	4.59	0.21	1.21	0.55	0.89	0.15	1.32	0.52	0.38	1.97
Flavanol	ME156019	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	2.60	3.78	1.66	8.94	0.00	3.24	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.28	0.00	0.00	0.00
Uracil	ME156028	0.18	2.58	0.18	1.05	0.18	0.18	1.89	0.69	2.18	0.18	5.34	0.18	0.18	2.43	0.18	0.18	0.18	0.18	0.18	1.05	0.18	0.18	5.70	0.18	0.18	0.18
Arginine	ME155988	0.01	0.01	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.05	1.74	0.01	2.68	1.38	0.61	1.56	0.07	2.04	0.73	1.52	3.69	3.53	5.93	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
UMP	ME156027	2.58	0.13	2.61	1.44	0.13	0.13	0.13	0.18	0.13	0.13	0.78	1.36	0.13	3.45	0.13	0.13	2.17	0.13	2.17	2.24	3.94	0.13	0.13	0.13	1.25	0.13
Alanine	ME155987	1.06	0.02	0.02	0.18	1.81	3.74	0.02	2.36	0.36	0.05	0.56	0.30	0.64	1.25	0.23	0.33	0.44	0.89	0.83	1.01	0.15	1.20	3.16	1.25	2.57	1.57
Betaine	ME155990	2.86	0.65	0.02	1.22	3.27	6.48	0.04	0.02	0.37	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	3.10	3.42	0.13	2.21	1.71
Ethanol	ME155995	0.34	0.34	0.34	2.48	0.34	0.34	0.34	5.31	0.34	0.34	1.86	0.34	0.34	0.34	2.83	0.34	0.34	0.34	0.34	2.62	0.34	0.34	4.00	0.34	0.34	0.34
NAD+	ME156013	0.64	0.64	0.64	3.48	0.64	0.64	0.64	3.60	0.64	0.64	4.12	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64	0.64
Fumarate	ME155999	1.42	1.26	5.47	1.10	1.17	1.06	2.41	0.12	0.39	0.03	0.36	0.60	1.70	0.47	0.09	0.47	0.25	0.25	1.40	1.79	0.27	0.03	0.18	0.03	1.13	2.56
myo-Inositol	ME156033	3.46	3.76	4.51	3.49	2.15	0.00	5.24	3.21	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Ethanolamine	ME155996	2.91	2.21	2.14	1.91	1.76	0.01	3.16	2.08	0.01	0.10	1.37	0.01	0.01	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.97	0.01	0.01	1.54	0.01	2.60	2.87
Methanol	ME156011	2.92	2.53	2.86	2.20	2.13	0.95	3.74	2.18	0.00	0.03	0.19	0.17	0.07	0.66	0.02	0.14	0.25	0.88	0.44	0.59	0.20	0.35	0.12	0.50	1.68	0.20
Histidine	ME156004	0.28	0.01	0.24	0.39	0.01	0.01	0.01	0.77	0.26	0.01	0.76	1.09	0.62	2.92	0.01	1.36	3.27	0.18	1.41	1.20	0.71	3.86	2.29	3.58	0.45	0.32
Lysine	ME156010	1.54	1.98	0.02	0.68	0.02	0.02	0.02	0.41	0.94	0.02	0.66	0.67	0.02	3.07	0.09	1.27	1.37	1.26	1.45	2.00	1.02	1.08	4.22	2.11	0.02	0.02
Guanosine	ME156003	0.80	1.68	1.94	0.52	1.55	2.02	2.56	0.36	3.49	0.13	1.76	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	1.68	0.91	0.13	0.13	4.45	0.13	0.13	0.62
Fructose	ME155998	1.34	2.66	2.48	2.47	1.46	1.93	2.35	0.52	4.45	0.17	0.34	0.38	0.22	0.48	0.12	0.15	0.12	0.00	0.63	0.38	0.50	0.54	0.31	0.72	0.26	1.02
Glucose	ME156000	1.48	2.82	2.75	2.73	1.18	2.16	2.48	0.49	3.83	0.05	0.36	0.28	0.23	0.68	0.09	0.14	0.22	0.19	0.64	0.36	0.57	0.56	0.19	0.70	0.00	0.83
Phenylalanine	ME156015	0.88	1.12	0.04	0.93	0.04	0.59	4.34	0.56	0.61	0.04	0.54	0.72	0.40	1.44	0.04	0.76	0.83	1.59	0.67	1.16	0.78	1.40	2.44	1.14	1.08	1.85
Tyrosine	ME156026	1.26	1.13	1.02	1.05	0.70	0.55	6.70	0.23	0.45	0.02	0.39	0.84	0.41	1.63	0.35	0.48	0.76	1.42	0.64	1.11	0.47	0.90	1.53	0.76	1.20	0.02
Inosine	ME156005	0.40	0.40	0.40	1.72	0.40	1.74	0.40	0.71	3.80	0.40	2.06	0.40	0.40	3.17	0.40	0.40	2.85	0.40	0.40	2.54	0.40	0.40	0.95	0.40	0.40	0.40
Tryptophan	ME156025	0.76	0.66	0.06	0.56	0.96	0.52	0.88	0.15	3.48	0.06	1.00	0.90	0.98	1.43	0.53	0.06	2.21	0.06	1.18	2.76	2.05	0.65	2.61	0.06	1.39	0.06
Trigonelline	ME156024	1.18	2.49	1.54	4.03	0.73	0.54	0.61	0.87	0.87	0.03	0.71	1.14	0.41	0.05	0.03	0.75	0.03	0.81	1.21	1.20	1.79	0.03	0.03	0.03	2.48	2.39
AMP	ME155984	2.49	0.17	1.65	0.54	0.17	0.17	0.87	0.54	0.17	0.17	1.24	2.02	1.14	3.06	0.17	0.17	2.89	0.17	1.58	1.01	0.91	0.17	0.17	0.17	0.81	3.40
Sucrose	ME156022	1.50	0.17	0.76	0.23	0.49	0.11	0.37	1.24	0.93	0.11	1.68	1.61	1.39	1.29	0.27	1.29	1.40	1.54	1.20	1.21	1.75	0.49	0.22	0.02	2.31	2.43
Isocaproate	ME156006	0.68	0.68	0.68	1.78	3.28	0.68	0.68	0.68	2.46	0.68	1.23	0.68	0.68	0.68	0.68	0.68	0.68	2.19	0.68	1.37	0.68	0.68	0.68	0.68	0.68	0.68
Proline	ME156016	1.76	1.00	0.42	1.00	2.93	1.23	0.60	2.00	0.64	0.00	1.44	1.92	0.68	1.44	0.10	0.55	0.80	0.32	1.93	1.95	1.08	0.00	0.42	1.16	0.25	0.41
Glutamine	ME156002	1.30	2.08	1.67	0.77	3.06	1.37	2.00	0.47	0.01	0.04	0.21	0.01	0.01	0.95	0.01	0.01	1.74	0.74	1.82	2.41	0.01	0.38	0.97	1.53	0.90	1.53
4-Aminobutyrate	ME155983	1.32	1.88	0.01	0.63	1.06	2.35	2.23	1.42	0.15	0.07	1.04	0.27	0.45	0.01	0.13	0.79	0.01	0.90	1.01	1.48	1.07	0.58	1.59	1.07	2.90	1.58
Succinate	ME156021	1.97	0.52	1.79	0.92	1.22	2.75	1.48	0.31	0.43	0.04	0.92	0.81	0.48	0.81	0.11	0.86	0.88	0.77	1.28	1.58	0.88	0.53	0.55	0.36	2.49	1.28
Leucine	ME156009	1.37	1.30	1.10	0.91	0.71	0.82	1.24	0.40	0.62	0.03	0.95	0.59	0.26	1.25	0.08	0.75	0.96	0.62	1.00	1.44	0.64	1.91	3.14	1.29	1.77	0.85
Isoleucine	ME156007	1.20	1.36	0.90	0.96	0.53	0.65	2.63	0.27	0.78	0.04	1.43	0.74	0.39	1.47	0.06	0.78	0.91	0.83	1.14	1.19	0.65	1.05	3.10	1.09	1.00	0.87
Valine	ME156031	1.07	1.29	1.00	0.82	0.71	0.73	2.09	0.45	0.74	0.04	1.07	0.89	0.34	1.29	0.07	0.73	1.40	0.57	1.37	2.09	0.65	0.69	2.30	1.24	1.40	0.98
Threonine	ME156023	1.03	1.35	1.04	0.82	0.73	0.66	1.57	1.08	0.65	0.20	0.78	0.81	0.47	2.10	0.39	0.72	1.78	0.67	0.88	1.22	0.53	0.77	1.15	0.85	1.82	1.93
Choline	ME155993	1.25	1.30	1.44	1.17	1.46	1.26	1.77	1.73	0.67	0.05	0.97	1.00	0.55	0.55	0.16	1.22	0.76	0.21	0.71	0.77	0.68	1.07	1.15	1.37	1.40	1.32
DSS	ME155994	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.01	1.00	1.00	1.00	1.00
Formate	ME155997	0.58	1.56	2.17	1.44	0.51	0.72	1.38	0.51	1.87	0.51	0.99	0.93	1.14	0.83	0.74	0.57	0.94	0.48	2.54	1.68	0.64	0.50	0.54	0.35	0.47	1.42
Adenosine	ME155986	1.00	1.61	1.64	1.61	1.83	1.92	1.67	1.17	0.60	0.03	1.10	0.38	0.49	1.41	0.03	1.19	0.65	0.15	1.18	1.25	1.80	0.84	0.40	1.13	0.88	0.03
Uridine	ME156029	0.80	0.91	1.06	0.76	1.45	1.07	1.28	1.31	1.87	0.03	1.08	0.03	0.68	1.52	0.09	1.72	0.77	0.69	1.36	1.83	2.05	0.79	0.64	0.58	0.03	1.60
Glutamate	ME156001	0.03	0.03	0.03	3.07	0.03	0.03	0.03	0.97	3.87	0.73	3.00	0.03	0.03	4.76	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	5.72	0.03	0.03	0.03	0.03	3.31	0.03
Lactate	ME156008	0.36	0.36	0.36	6.55	0.36	0.36	0.36	1.35	0.36	0.36	5.70	0.36	0.36	0.36	0.36	0.36	0.36	0.36	0.36	4.56	0.36	0.36	0.36	0.36	0.36	0.36
Methionine	ME156012	4.59	0.24	3.56	3.41	0.24	0.24	0.24	0.68	0.24	0.24	2.63	0.24	0.24	0.24	0.24	0.24	0.24	0.24	0.24	4.93	0.24	0.24	1.56	0.24	0.24	0.24

Factors:

F1	Group:Grass \| Species:CD
F2	Group:Grass \| Species:FP
F3	Group:Grass \| Species:KP
F4	Group:Grass \| Species:LP
F5	Group:Grass \| Species:SH
F6	Group:Grass \| Species:TA
F7	Group:Grass \| Species:TP
F8	Group:Grass \| Species:ZM
F9	Group:Tree \| Species:AR
F10	Group:Tree \| Species:AZ
F11	Group:Tree \| Species:BP
F12	Group:Tree \| Species:CA
F13	Group:Tree \| Species:CI
F14	Group:Tree \| Species:FA
F15	Group:Tree \| Species:JA
F16	Group:Tree \| Species:JR
F17	Group:Tree \| Species:OE
F18	Group:Tree \| Species:PT
F19	Group:Tree \| Species:QA
F20	Group:Tree \| Species:QR
F21	Group:Tree \| Species:UA
F22	Group:Weed \| Species:AA
F23	Group:Weed \| Species:AP
F24	Group:Weed \| Species:MW
F25	Group:Weed \| Species:PW
F26	Group:Weed \| Species:UD

Data matrix