Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST000880)

(Analysis AN001433)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12
Spermidine	ME227246	0.26	0.30	0.66	0.04	0.04	0.25	0.89	1.04	7.77	0.06	0.14	0.47
Deoxyadenosine	ME227156	2.33	0.69	6.53	0.13	0.08	0.37	0.73	1.76	0.33	0.13	0.11	0.18
Xanthosine	ME227255	3.00	0.72	7.65	0.15	0.09	0.15	0.28	0.13	0.18	0.45	0.08	0.78
Histamine	ME227219	2.26	4.04	6.56	0.04	0.04	0.02	0.17	0.04	0.06	0.02	0.11	0.03
N-Acetylhistamine	ME227260	1.83	4.54	6.90	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.03	0.00	0.06	0.00
Aspartic acid	ME227172	2.53	2.06	4.92	0.18	0.34	0.09	0.96	0.63	0.72	0.13	0.17	0.23
cis-3-hydroxyproline	ME227222	2.69	3.08	5.45	0.28	0.26	0.21	0.14	0.08	0.13	0.25	0.16	0.38
Niacinamide	ME227232	1.32	0.32	0.64	0.27	0.19	0.26	0.43	0.39	0.71	0.28	6.64	0.44
Putrescine	ME227239	0.30	0.25	0.46	0.80	3.90	0.21	0.11	0.07	0.05	0.28	4.92	0.52
Imidazoleacetic acid	ME227258	0.54	2.89	0.50	0.50	0.08	0.11	5.17	1.07	0.12	0.55	0.04	0.30
Gamma-Aminobutyric acid	ME227215	0.61	1.06	0.60	4.15	0.74	1.23	1.03	0.96	1.07	0.04	0.30	0.09
Valine	ME227254	0.25	0.30	0.42	3.03	1.70	1.93	1.29	1.40	0.81	0.36	0.16	0.19
1-methyl nicotinamide	ME227155	0.01	0.07	0.01	4.05	1.90	0.78	1.28	0.01	0.01	1.19	2.09	0.36
CAR(5:0)	ME227198	0.22	0.03	0.02	2.94	1.56	1.12	0.26	0.02	0.22	3.07	1.07	1.22
Creatine	ME227210	0.27	0.09	0.10	2.15	1.75	1.41	0.59	0.26	0.17	1.74	1.82	1.41
Creatinine	ME227211	0.34	0.38	0.03	2.16	1.53	0.77	1.72	0.34	0.04	1.41	1.89	1.14
CAR(2:0)	ME227189	2.07	0.24	0.51	2.29	0.09	0.78	1.01	0.10	0.26	2.68	0.14	1.70
CAR(7:0)	ME227202	1.72	NA	NA	0.67	0.18	0.49	NA	NA	0.15	1.77	0.54	2.18
CAR(6:0)	ME227201	0.35	0.06	0.04	3.66	0.33	2.15	0.09	0.03	0.07	2.60	0.27	2.13
CAR(9:0)	ME227204	NA	NA	NA	2.04	0.34	0.88	NA	NA	NA	1.27	0.34	1.13
CAR(10:2)	ME227177	0.05	NA	NA	2.06	0.59	0.87	NA	NA	0.09	2.12	0.64	1.33
CAR(5:1)	ME227199	0.26	NA	0.09	2.10	0.86	0.79	0.06	0.01	0.03	2.55	0.63	1.39
CAR(10:0)	ME227176	0.01	0.01	NA	2.05	0.28	2.17	0.00	NA	0.02	1.97	0.19	1.82
CAR(8:0)	ME227203	0.02	0.01	NA	2.22	0.11	1.52	NA	0.00	0.02	1.96	0.08	1.59
CAR(12:1)	ME227179	0.10	NA	NA	1.54	0.38	1.49	NA	NA	0.09	1.43	0.30	2.23
CAR(12:0)	ME227178	0.03	0.04	0.01	1.84	0.61	1.80	0.07	NA	0.10	2.08	0.48	2.73
CAR(14:2)	ME227182	0.18	0.07	0.00	1.88	0.54	1.96	0.03	NA	0.50	1.38	0.45	2.81
Cysteine	ME227212	NA	0.06	NA	1.15	0.94	0.30	NA	0.04	0.02	1.28	1.37	1.68
Pyroglutamic acid	ME227240	NA	NA	0.07	1.35	1.11	1.53	NA	NA	NA	0.43	0.77	1.03
3-Hydroxyanthranilic acid	ME227158	0.65	0.62	1.67	1.11	0.77	0.29	3.81	1.01	1.19	0.07	0.14	0.22
Serotonin	ME227245	1.08	0.90	1.10	0.55	0.43	0.58	3.04	0.96	1.58	0.24	0.58	1.00
CAR(20:0)	ME227190	0.42	0.82	0.71	0.53	0.42	0.85	1.44	2.16	2.59	0.30	0.38	1.06
Aminoisobutyric acid	ME227167	1.45	1.12	1.10	NA	0.18	NA	1.15	0.65	1.53	NA	0.11	0.07
Homocysteine	ME227221	0.98	1.77	0.93	0.86	0.48	NA	1.03	0.99	0.80	0.87	NA	NA
Urocanic acid	ME227261	1.59	1.38	1.99	0.07	0.02	0.02	1.77	0.66	2.01	0.60	0.99	1.16
Taurine	ME227247	1.75	1.61	0.78	0.36	0.33	0.22	1.86	2.02	2.47	0.18	0.16	0.20
Lysine	ME227226	1.04	0.90	1.24	0.60	0.31	0.44	1.35	1.47	2.37	1.14	0.26	0.94
5-Hydroxy-L-tryptophan	ME227160	0.88	0.82	1.40	0.70	0.24	0.30	1.66	1.44	1.83	1.63	0.25	0.94
Tryptophan	ME227252	1.10	0.81	0.98	0.54	0.31	0.35	1.63	1.36	1.45	1.94	0.38	1.14
Thiamine	ME227248	0.70	0.48	2.04	0.74	0.45	0.84	1.94	1.53	1.58	0.60	0.42	0.94
Arginine	ME227170	1.53	0.75	0.78	0.43	0.19	0.52	2.11	1.91	1.60	0.43	0.66	1.05
Beta-Alanine	ME227173	1.28	1.26	1.93	0.93	0.35	0.33	2.09	1.13	1.38	0.63	0.45	0.47
Methionine sulfoxide	ME227228	1.46	1.38	2.11	1.40	0.31	0.19	1.78	1.27	0.94	0.86	0.38	0.21
Tyrosine	ME227253	1.24	1.12	1.32	0.42	0.39	0.32	1.91	1.44	1.60	1.08	0.57	0.67
Methionine	ME227227	1.38	1.17	1.44	0.68	0.28	0.23	2.08	1.57	1.94	0.50	0.44	0.40
Sarcosine	ME227242	1.28	1.39	1.25	0.81	0.35	0.28	1.56	1.80	1.74	0.67	0.46	0.46
Leucine	ME227225	1.01	1.07	1.02	1.20	0.52	0.40	1.67	1.59	1.78	0.69	0.56	0.49
Alanine	ME227164	1.15	1.18	1.45	1.01	0.39	0.33	1.59	1.48	1.79	0.78	0.45	0.50
Phenylalanine	ME227235	1.29	1.14	1.27	1.10	0.42	0.32	1.90	1.54	1.68	0.58	0.44	0.38
Acetylcholine	ME227161	0.75	0.77	1.09	0.34	0.42	0.61	0.79	0.96	1.09	1.72	0.46	3.01
Thymidine	ME227250	1.20	0.81	1.12	NA	NA	NA	0.51	0.44	0.38	1.16	NA	2.42
NMMA	ME227233	1.32	1.04	1.17	1.15	0.41	0.33	0.50	0.44	0.65	2.58	0.32	2.13
Histidine	ME227220	1.11	0.91	1.15	0.31	0.12	0.28	1.14	0.82	1.80	1.83	0.35	2.21
Glutamine	ME227217	1.23	1.41	0.76	0.08	0.03	0.52	1.33	1.13	1.29	2.50	0.06	1.60
Serine	ME227244	0.94	1.00	0.85	0.35	0.27	0.28	1.09	1.24	1.43	2.50	0.43	1.58
1-Methylhistamine	ME227154	1.31	1.64	2.10	1.27	1.06	0.34	1.48	0.71	0.49	0.54	0.70	0.64
Isoleucine	ME227223	0.73	0.93	1.02	1.62	0.68	0.46	1.28	1.47	1.54	0.99	0.64	0.65
Cotinine	ME227209	0.85	1.07	1.43	0.91	1.03	0.72	1.30	0.76	0.97	1.43	0.73	0.90
methyl-hydroxyisobutyric acid	ME227229	0.97	1.24	1.09	1.02	0.95	0.69	0.84	0.94	0.96	0.92	1.37	1.03
phenylalanine-d8 (Internal Standard)	ME227152	1.07	1.03	1.09	1.03	0.88	0.88	1.15	1.05	1.09	0.94	0.90	0.92
Trimethylamine N-oxide	ME227251	0.92	1.00	0.93	1.04	1.05	1.10	1.03	0.97	1.04	0.93	1.01	0.96
valine-d8 (Internal Standard)	ME227153	0.98	0.99	0.97	0.93	1.00	0.96	0.99	1.02	1.03	1.06	1.01	1.05
Betaine	ME227174	0.88	0.71	0.64	1.45	0.91	1.18	0.62	0.53	0.54	1.57	1.09	1.79
Glycine	ME227218	0.73	0.66	0.91	2.20	0.98	0.69	0.69	0.92	0.91	1.46	0.63	1.21
Dimethylarginine	ME227163	1.54	0.95	2.31	1.18	0.43	0.68	0.43	0.21	0.78	1.41	0.59	1.83
Symmetric dimethyl-L-arginine	ME227243	1.17	1.34	2.04	1.09	0.32	0.66	1.03	0.25	1.06	1.15	0.57	1.58
5-amino-levulinic acid	ME227159	1.54	1.34	1.12	0.79	0.84	0.46	0.35	0.33	0.29	1.87	1.33	1.75
N-6-trimethyllysine	ME227259	1.72	1.08	1.31	1.67	0.84	0.74	0.49	0.32	0.49	1.15	0.94	1.32
CAR(16:0(OH))	ME227184	0.46	0.16	0.27	0.74	0.51	1.92	3.48	0.11	0.80	1.02	0.51	1.84
CAR(3:0)	ME227193	1.06	0.12	0.45	3.38	0.19	1.48	0.96	0.06	0.74	1.51	1.12	0.44
CAR(DC3:0)	ME227194	1.25	0.28	0.80	1.86	0.69	0.41	2.88	0.66	0.58	1.10	0.88	0.57
Carnitine	ME227206	1.44	0.29	0.69	1.94	0.89	1.36	0.89	0.31	1.58	1.24	0.38	0.91
C3-DC-CH3 carnitine	ME227195	0.97	0.07	0.12	1.92	1.03	1.08	1.89	0.36	0.76	1.01	1.10	0.79
C5-DC carnitine	ME227200	0.97	0.05	0.01	1.59	1.04	1.30	1.58	0.19	1.46	0.83	1.25	0.74
Ureidopropionic acid	ME227231	0.87	0.90	0.94	1.22	0.83	3.02	0.94	0.36	0.96	0.31	0.51	1.14
CAR(18:0)	ME227185	0.12	0.16	0.17	1.18	0.84	1.57	1.33	0.67	1.45	1.39	0.75	2.17
CAR(20:4)	ME227191	0.27	0.18	0.21	1.97	0.45	2.45	0.46	0.05	1.84	0.65	0.62	2.18
CAR(18:1)	ME227186	0.24	0.22	0.27	0.34	0.38	2.92	0.49	0.20	2.36	0.31	0.38	3.71
CAR(18:2)	ME227188	0.45	0.24	0.30	0.46	0.46	3.26	0.43	0.07	1.32	0.45	0.64	3.76
CAR(14:1)	ME227181	0.13	0.05	0.06	1.34	0.59	2.58	0.16	0.00	0.32	1.45	0.51	4.33
CAR(16:0)	ME227183	0.17	0.13	0.17	0.57	0.64	2.48	0.56	0.27	1.16	1.11	0.70	3.83
Kynurenic acid	ME227224	0.36	0.18	0.69	0.69	0.72	1.67	0.74	0.21	0.95	1.18	0.76	3.78
5^-Methylthioadenosine	ME227230	1.20	0.60	0.06	0.26	0.06	0.54	0.27	0.17	0.50	5.29	0.37	2.45
sn-glycero-3-phosphocholine	ME227166	2.63	0.63	0.42	0.14	0.11	0.37	0.30	0.05	0.15	3.93	0.11	3.02
Proline	ME227238	0.60	0.48	0.58	0.18	0.19	0.12	0.76	0.60	0.68	2.71	2.55	2.44
Cytosine	ME227213	0.42	0.38	1.07	0.04	0.01	0.09	1.14	1.22	0.58	2.59	0.20	4.28
Deoxycytidine	ME227157	0.36	0.36	0.32	0.04	0.01	0.09	1.10	1.24	0.55	2.83	0.01	4.42
Choline	ME227207	0.74	0.53	0.88	0.22	0.25	0.31	0.63	0.34	0.65	2.76	0.27	4.40
Guanine	ME227256	0.65	0.64	0.87	0.75	0.09	0.65	0.84	0.59	0.59	2.67	0.22	3.43
CAR(14:0)	ME227180	0.12	0.08	0.09	1.37	0.90	1.89	0.47	0.05	0.38	2.94	0.64	2.85
Ornithine	ME227234	0.23	0.43	0.39	1.57	0.24	1.22	0.23	0.22	0.60	3.54	0.16	3.04
Asparagine	ME227171	0.20	0.92	0.03	1.39	0.01	0.81	0.91	1.03	1.20	2.93	0.01	2.31
Threonine	ME227249	0.64	0.80	0.62	0.29	0.21	0.19	0.76	0.90	0.89	3.80	0.28	2.53
Anserine	ME227168	0.94	0.65	2.95	0.06	0.04	0.45	0.90	0.36	4.05	0.17	0.18	1.50
CAR(4:0(OH))	ME227197	3.10	0.47	1.44	0.91	0.53	0.32	2.00	0.24	0.67	1.13	0.47	0.81
CAR(18:1(OH))	ME227187	3.25	0.35	0.60	0.50	0.38	1.48	1.28	0.04	1.11	0.66	0.65	1.60
S-Adenosylmethionine	ME227241	3.00	0.57	NA	NA	NA	0.60	0.93	0.42	0.85	0.42	NA	0.82
CAR(4:0)	ME227196	5.00	0.33	0.76	0.53	0.09	0.38	2.76	0.10	0.93	0.47	0.08	0.52
Dimethylglycine	ME227214	5.52	0.70	1.71	0.70	0.45	0.39	0.76	0.13	0.54	0.49	0.44	0.34
Glutamic acid	ME227216	2.53	1.66	2.77	0.34	0.31	0.70	1.12	0.82	0.93	0.38	0.24	0.66
Pipecolic acid	ME227237	3.52	1.75	2.95	0.64	1.09	0.11	0.81	0.37	0.80	0.09	0.28	0.09
Adenosine	ME227162	4.38	0.91	3.65	0.18	0.10	0.26	0.82	0.83	0.75	0.19	0.19	0.40
L-Histidinol	ME227257	3.02	1.12	3.96	0.24	0.04	0.14	1.38	1.29	1.35	0.02	0.17	0.02
3-Dehydroxycarnitine	ME227175	2.26	1.16	2.63	0.37	0.28	0.01	1.97	2.08	1.36	0.01	0.27	0.01
Citrulline	ME227208	1.91	1.74	3.49	0.50	0.26	0.19	1.37	0.46	2.11	0.37	0.05	0.16
2-Aminobenzoic acid	ME227169	1.59	3.99	0.89	0.54	0.25	0.45	0.77	0.56	1.57	0.13	0.34	0.13
Choline phosphate	ME227236	2.79	2.10	1.25	0.09	0.04	0.04	1.21	0.39	2.18	0.34	0.13	0.32

Factors:

F1	Diet:Chow \| Treatment:none \| Strain:129Jax
F2	Diet:Chow \| Treatment:none \| Strain:129Tac
F3	Diet:Chow \| Treatment:none \| Strain:B6Jax
F4	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Strain:129Jax
F5	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Strain:129Tac
F6	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Strain:B6Jax
F7	Diet:HFD \| Treatment:placebo \| Strain:129Jax
F8	Diet:HFD \| Treatment:placebo \| Strain:129Tac
F9	Diet:HFD \| Treatment:placebo \| Strain:B6Jax
F10	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Strain:129Jax
F11	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Strain:129Tac
F12	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Strain:B6Jax

Data matrix