Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001613)

GC UNSPECIFIED ION MODE (Analysis AN002648)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11
glutamic acid_M+08	ME382379	0.92	0.96	1.04	1.00	0.94	1.01	1.09	1.00	1.10	1.14	1.17
glutamine_M+04	ME382402	1.51	1.66	1.95	1.84	0.51	0.34	0.40	0.62	0.01	0.03	0.02
asparagine_M+01	ME382381	0.71	0.12	0.73	0.62	0.11	0.30	0.23	0.19	6.99	11.11	11.52
leucine_M+06	ME382251	0.77	1.18	0.99	0.88	1.22	0.88	0.97	0.81	NA	0.44	NA
glycine_M+05	ME382235	0.81	0.83	1.01	1.14	0.88	1.10	0.98	0.92	2.56	1.43	0.98
citric acid_M+01	ME382418	0.28	0.05	0.18	0.09	0.09	0.19	0.17	0.03	12.71	14.03	12.16
aspartic acid_M+03	ME382352	0.74	0.66	0.80	0.67	0.61	0.65	0.68	0.05	5.41	6.05	5.71
citric acid_M+07	ME382424	0.29	0.43	0.31	0.47	0.52	2.33	3.48	1.23	0.26	0.23	0.27
citric acid_M+09	ME382426	0.31	0.38	0.37	0.40	0.55	2.41	3.27	1.23	0.29	0.31	0.33
cysteine_M+00	ME382357	0.16	0.26	0.15	0.13	0.16	0.50	0.60	0.03	9.66	11.88	12.44
isocitric acid_M+00	ME382427	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.10	0.08	0.02	12.42	15.07	14.24
leucine_M+03	ME382248	0.97	1.16	1.13	0.96	0.75	0.79	0.78	0.58	2.17	2.55	2.51
fumarate_M+06	ME382284	1.01	0.98	0.92	0.98	1.05	0.87	0.88	0.99	1.35	1.61	1.25
asparagine_M+04	ME382384	0.59	0.42	0.60	0.63	0.40	0.47	0.35	0.51	5.83	9.02	9.11
lactate_M+01	ME382217	0.99	2.69	0.51	0.16	0.18	0.34	0.19	0.48	5.51	6.34	5.86
a-ketoglutarate _M+01	ME382312	0.06	1.32	0.02	0.02	0.02	0.08	0.07	0.02	10.76	13.11	12.13
asparagine_M+05	ME382385	0.71	0.87	0.83	0.85	0.78	0.81	0.79	0.84	2.72	3.37	4.76
isocitric acid_M+03	ME382430	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.14	0.14	0.09	12.73	14.18	11.81
glutamic acid_M+03	ME382374	0.96	0.65	1.17	0.87	0.54	0.79	0.88	0.17	3.80	4.40	4.16
isoleucine_M+05	ME382258	0.65	1.14	0.80	0.67	1.04	1.23	1.58	0.84	1.10	0.81	0.55
glutamine_M+03	ME382401	1.32	1.43	2.12	1.93	0.49	0.35	0.43	0.62	0.12	0.24	0.22
aspartic acid_M+05	ME382354	0.60	0.62	0.69	0.66	1.36	0.64	0.71	1.24	3.71	1.97	3.51
glycine_M+00	ME382230	0.32	0.05	1.14	0.89	0.29	0.94	0.76	0.73	6.53	7.23	6.35
histidine_M+04	ME382411	0.88	1.19	0.89	0.82	0.69	0.83	0.91	0.56	3.84	2.10	3.33
a-ketoglutarate _M+06	ME382317	0.95	0.96	1.01	1.02	0.96	0.99	1.07	0.84	1.21	1.52	0.88
alanine_M+06	ME382229	0.40	2.12	0.32	0.38	2.04	0.43	0.68	0.44	0.43	0.41	0.46
a-ketoglutarate _M+07	ME382318	0.94	1.11	1.15	0.97	0.93	0.99	0.98	0.98	0.85	1.20	1.02
isocitric acid_M+01	ME382428	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.09	0.02	13.21	14.99	12.95
isoleucine_M+04	ME382257	0.88	1.64	0.82	0.78	1.04	0.73	0.84	0.70	1.40	1.69	1.55
alanine_M+05	ME382228	0.38	2.74	0.08	0.14	2.49	0.10	0.37	0.08	0.17	0.14	0.10
fumarate_M+05	ME382283	0.99	0.87	0.96	0.96	0.85	0.86	0.86	0.86	2.04	1.82	3.17
leucine_M+02	ME382247	0.99	1.13	1.16	0.97	0.72	0.80	0.79	0.58	2.17	2.58	2.57
glycine_M+02	ME382232	0.35	0.09	1.04	0.83	0.43	0.88	0.75	0.70	6.36	7.02	6.16
cysteine_M+04	ME382361	0.65	0.77	0.71	0.59	0.70	0.70	0.73	0.78	5.00	3.86	5.83
cysteine_M+02	ME382359	0.16	0.27	0.18	0.16	0.32	0.49	0.60	0.70	9.07	10.75	11.05
glutamine_M+07	ME382405	1.48	1.62	1.98	1.88	0.56	0.25	0.28	0.73	0.02	0.03	0.03
isocitric acid_M+07	ME382434	0.80	0.84	1.13	0.98	0.90	0.99	1.20	0.90	1.69	1.23	1.46
leucine_M+01	ME382246	1.00	1.14	1.16	0.97	0.73	0.80	0.79	0.60	2.07	2.50	2.51
citric acid_M+08	ME382425	0.26	0.37	0.29	0.40	0.57	2.51	3.37	1.25	0.12	0.18	0.23
fumarate_M+03	ME382281	0.08	0.15	0.09	0.08	0.08	0.14	0.12	0.08	11.25	14.12	13.26
fumarate_M+04	ME382282	0.32	0.43	0.33	0.34	0.29	0.34	0.29	0.30	8.57	10.48	9.92
citric acid_M+06	ME382423	0.45	0.55	0.49	0.50	0.48	1.70	2.64	0.83	2.23	2.29	1.88
glutamic acid_M+00	ME382371	1.02	0.64	1.21	0.86	0.54	0.69	0.74	0.27	3.76	4.56	4.69
glutamic acid_M+04	ME382375	0.23	0.17	0.28	0.20	2.71	0.21	0.27	4.81	0.85	0.99	0.90
histidine_M+05	ME382412	0.64	0.88	0.80	0.85	0.59	1.12	1.08	0.59	3.16	5.01	2.76
isocitric acid_M+06	ME382433	0.88	0.85	0.91	0.82	0.80	0.79	0.88	0.62	3.44	3.02	3.20
lactate_M+00	ME382216	0.89	2.14	0.60	0.18	0.20	0.40	0.22	0.57	6.12	7.05	6.48
isocitric acid_M+08	ME382435	0.75	0.94	1.03	0.99	0.97	1.12	1.21	0.85	1.04	1.31	1.05
asparagine_M+02	ME382382	0.70	0.13	0.72	0.61	0.12	0.30	0.23	0.18	6.93	11.18	11.66
isocitric acid_M+04	ME382431	0.23	0.27	0.25	0.22	0.22	0.23	0.22	0.21	10.93	12.01	10.02
fumarate_M+07	ME382285	0.92	1.05	1.07	1.09	0.93	0.93	0.92	1.10	0.91	1.48	1.21
glutamic acid_M+07	ME382378	0.92	0.82	1.10	0.96	0.92	1.15	1.09	0.98	1.06	1.24	1.15
lactate_M+04	ME382220	2.33	6.36	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03
leucine_M+00	ME382245	1.01	1.13	1.16	0.98	0.72	0.80	0.79	0.60	2.07	2.52	2.53
histidine_M+00	ME382407	0.94	1.34	0.89	0.78	0.67	0.71	0.77	0.45	3.10	3.50	3.50
cysteine_M+03	ME382360	0.27	0.33	0.35	0.33	0.47	0.53	0.55	0.88	7.73	9.09	9.29
lysine_M+00	ME382388	1.07	1.55	1.08	0.94	0.93	0.86	1.01	0.59	0.57	0.59	0.63
glycine_M+04	ME382234	0.47	0.36	0.92	0.80	0.66	0.93	1.03	0.95	4.69	5.01	4.15
histidine_M+08	ME382415	0.77	0.93	0.89	1.14	0.77	1.15	1.33	1.12	0.41	2.95	0.51
isoleucine_M+03	ME382256	0.86	1.29	0.85	0.78	0.93	0.98	1.11	0.74	1.38	1.74	1.67
isoleucine_M+02	ME382255	1.01	1.52	1.00	0.90	0.80	0.62	0.72	0.50	2.03	2.47	2.43
leucine_M+07	ME382252	0.60	1.14	0.56	0.73	0.88	0.86	0.90	0.40	0.09	18.86	0.51
glutamine_M+05	ME382403	1.50	1.66	1.99	1.88	0.49	0.31	0.37	0.63	0.01	0.02	0.02
isoleucine_M+00	ME382253	1.03	1.17	1.13	0.96	0.72	0.73	0.74	0.58	2.22	2.73	2.71
lysine_M+02	ME382390	0.99	1.48	1.06	0.94	0.97	0.90	1.05	0.68	0.59	0.58	0.56
lysine_M+01	ME382389	0.99	1.46	1.06	0.95	0.98	0.90	1.05	0.69	0.59	0.59	0.57
lactate_M+06	ME382222	2.18	6.04	0.06	0.06	0.08	0.06	0.05	0.03	0.08	0.06	0.05
asparagine_M+06	ME382386	1.00	1.00	0.97	1.01	0.98	1.02	0.83	1.14	1.10	1.14	1.42
histidine_M+09	ME382416	0.75	0.97	0.86	0.93	0.84	1.20	1.31	0.83	0.75	2.94	1.05
isoleucine_M+01	ME382254	1.03	1.17	1.13	0.96	0.73	0.71	0.74	0.58	2.24	2.74	2.71
glycine_M+01	ME382231	0.37	0.09	1.02	0.82	0.55	0.85	0.74	0.66	6.07	6.70	5.90
isoleucine_M+07	ME382260	0.71	0.83	0.83	0.88	0.94	1.28	1.65	0.56	1.50	1.00	0.87
asparagine_M+00	ME382380	0.75	0.13	0.74	0.61	0.11	0.29	0.23	0.16	6.67	10.97	11.99
aspartic acid_M+01	ME382350	0.72	0.62	0.76	0.63	0.77	0.59	0.63	0.40	5.15	5.85	5.61
citric acid_M+05	ME382422	0.41	0.44	0.42	0.51	0.38	0.69	0.91	0.45	7.80	7.32	6.74
cysteine_M+01	ME382358	0.15	0.24	0.15	0.14	0.31	0.50	0.60	0.63	9.23	11.12	11.33
citric acid_M+04	ME382421	0.30	0.23	0.24	0.21	0.19	0.32	0.45	0.19	11.10	10.93	10.05
glutamine_M+06	ME382404	1.52	1.70	2.03	1.93	0.54	0.15	0.25	0.70	0.02	0.02	0.04
aspartic acid_M+00	ME382349	0.75	0.64	0.76	0.61	0.73	0.58	0.61	0.36	5.11	5.94	5.88
aspartic acid_M+07	ME382356	1.10	0.93	1.01	1.01	0.91	1.02	1.05	0.83	1.28	0.97	1.35
a-ketoglutarate _M+04	ME382315	0.55	0.91	0.57	0.53	0.49	0.49	0.54	0.46	6.76	6.69	7.16
leucine_M+05	ME382250	0.52	2.04	0.48	0.53	1.80	0.43	0.64	0.41	NA	0.19	NA
cysteine_M+06	ME382363	0.90	1.12	1.04	0.95	0.89	1.12	0.96	0.81	1.21	1.33	1.38
isocitric acid_M+02	ME382429	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.11	0.10	0.03	13.02	14.74	12.75
isocitric acid_M+05	ME382432	0.54	0.56	0.54	0.57	0.50	0.47	0.50	0.44	7.13	7.89	6.60
glutamine_M+02	ME382400	1.25	1.43	2.16	1.98	0.44	0.27	0.39	0.57	0.41	0.83	0.78
glycine_M+03	ME382233	0.41	0.13	1.00	0.82	0.66	0.85	0.81	0.68	5.52	6.08	5.28
isoleucine_M+06	ME382259	1.13	1.16	1.24	1.12	1.16	0.63	0.64	0.67	0.71	0.87	0.67
aspartic acid_M+06	ME382355	0.76	0.99	0.94	1.00	1.04	0.94	0.91	1.13	1.67	1.58	1.33
glutamine_M+00	ME382398	0.97	1.06	1.39	1.35	0.53	0.20	0.25	0.69	2.28	4.81	4.87
aspartic acid_M+02	ME382351	0.70	0.62	0.75	0.61	0.76	0.59	0.62	0.40	5.27	5.96	5.74
alanine_M+04	ME382227	0.40	2.71	0.08	0.17	2.45	0.08	0.37	0.07	0.34	0.39	0.34
asparagine_M+07	ME382387	0.91	1.11	1.00	0.92	1.01	1.00	0.94	1.10	1.07	1.09	1.18
glutamic acid_M+06	ME382377	0.79	1.07	1.06	0.99	0.96	1.01	0.94	0.92	1.25	1.49	1.52
a-ketoglutarate _M+05	ME382316	0.85	0.94	1.00	0.87	0.88	0.77	1.03	0.94	2.14	2.32	2.42
citric acid_M+02	ME382419	0.28	0.06	0.17	0.09	0.09	0.18	0.18	0.04	12.74	14.03	12.15
lactate_M+02	ME382218	1.24	3.93	0.35	0.12	0.15	0.24	0.14	0.33	3.90	4.50	4.15
aspartic acid_M+04	ME382353	0.53	0.47	0.59	0.49	1.36	0.47	0.52	1.44	4.27	4.60	4.42
glutamic acid_M+02	ME382373	0.98	0.62	1.21	0.88	0.50	0.73	0.77	0.18	4.04	4.75	4.64
lactate_M+05	ME382221	2.23	6.23	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
histidine_M+02	ME382409	0.89	1.28	0.85	0.79	0.69	0.73	0.79	0.51	3.30	3.59	3.38
histidine_M+03	ME382410	0.86	1.20	0.85	0.80	0.69	0.76	0.83	0.54	3.44	3.66	3.30
citric acid_M+03	ME382420	0.27	0.08	0.17	0.10	0.11	0.20	0.19	0.09	12.64	13.77	11.53
histidine_M+01	ME382408	0.90	1.28	0.86	0.79	0.69	0.74	0.80	0.52	3.23	3.52	3.31
citric acid_M+00	ME382417	0.30	0.06	0.18	0.09	0.08	0.18	0.16	0.02	11.85	13.94	13.23
alanine_M+03	ME382226	0.41	2.75	0.07	0.15	2.46	0.06	0.31	0.04	0.35	0.43	0.40
glutamic acid_M+05	ME382376	0.73	0.66	0.95	0.75	0.85	0.90	1.28	0.83	3.13	2.39	2.99
fumarate_M+00	ME382278	0.07	0.17	0.07	0.05	0.05	0.12	0.11	0.04	11.85	15.03	14.22
lysine_M+03	ME382391	0.97	1.43	1.04	0.94	0.99	0.91	1.06	0.72	0.61	0.59	0.56
alanine_M+02	ME382225	0.79	1.01	0.74	0.67	0.75	0.55	0.61	0.43	4.55	5.19	4.87
histidine_M+06	ME382413	0.67	0.88	0.90	0.80	0.75	1.01	1.01	0.76	1.85	6.29	1.26
lactate_M+03	ME382219	2.32	6.43	0.01	0.04	0.05	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.04
leucine_M+04	ME382249	0.90	1.24	1.05	0.92	0.89	0.77	0.78	0.60	2.02	2.25	2.19
a-ketoglutarate _M+08	ME382319	0.73	0.60	0.74	0.71	2.07	0.59	0.68	0.87	0.44	1.02	0.81
glutamic acid_M+01	ME382372	0.98	0.62	1.22	0.89	0.52	0.72	0.77	0.21	3.96	4.65	4.52
histidine_M+07	ME382414	0.77	1.18	0.85	1.13	0.74	1.15	1.13	0.75	0.63	3.22	0.95
asparagine_M+03	ME382383	0.67	0.16	0.72	0.61	0.16	0.32	0.25	0.22	6.85	10.96	11.11
glutamine_M+01	ME382399	1.13	1.26	1.87	1.73	0.48	0.30	0.37	0.58	1.01	2.02	1.94
a-ketoglutarate _M+00	ME382311	0.06	1.37	0.01	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	10.65	13.05	12.20
alanine_M+01	ME382224	0.80	0.97	0.78	0.74	0.72	0.62	0.68	0.48	4.26	4.82	4.56
alanine_M+00	ME382223	0.82	0.95	0.80	0.75	0.71	0.63	0.69	0.49	4.21	4.79	4.50
cysteine_M+05	ME382362	0.85	1.00	0.93	0.89	0.89	0.89	1.10	1.01	1.95	1.91	2.02
fumarate_M+02	ME382280	0.07	0.16	0.07	0.05	0.05	0.12	0.10	0.04	12.03	15.05	14.20
a-ketoglutarate _M+02	ME382313	0.06	1.24	0.03	0.03	0.03	0.09	0.08	0.03	10.40	12.80	11.87
fumarate_M+01	ME382279	0.07	0.17	0.07	0.05	0.05	0.12	0.10	0.04	11.90	15.02	14.22
isocitric acid_M+09	ME382436	1.00	0.96	1.04	0.96	0.94	1.01	1.16	1.06	0.77	1.10	0.97
a-ketoglutarate _M+03	ME382314	0.16	1.15	0.18	0.17	0.15	0.20	0.19	0.16	9.20	11.04	10.00
glutamine_M+08	ME382406	1.44	1.57	1.90	1.80	0.58	0.32	0.41	0.77	0.06	0.04	0.04

Factors:

F1	Condition:Ambient \| Collection Time:12h
F2	Condition:Ambient \| Collection Time:24h
F3	Condition:Ambient \| Collection Time:4h
F4	Condition:Ambient \| Collection Time:8h
F5	Condition:Anaerobic \| Collection Time:12h
F6	Condition:Anaerobic \| Collection Time:4h
F7	Condition:Anaerobic \| Collection Time:8h
F8	Condition:- \| Collection Time:-
F9	Condition:- \| Collection Time:day1
F10	Condition:- \| Collection Time:day2
F11	Condition:- \| Collection Time:day3

Data matrix