Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001726)

(Analysis AN002811)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19	F20	F21	F22	F23	F24
ec_Formate	ME402431	NA	1.46	0.30	1.20	0.87	0.63	0.55	0.23	0.22	0.19	0.38	0.69	0.26	0.57	0.67	1.22	4.47	4.59	0.77	1.36	0.10	0.25	NA	NA
ec_3_Hydroxybutyrate	ME402417	NA	1.78	0.45	0.45	0.45	0.45	0.45	0.45	0.45	0.45	2.02	0.83	4.32	0.45	2.32	2.62	0.77	0.45	0.45	0.45	0.45	0.48	NA	NA
ec_Isovaleric_acid	ME402413	NA	1.58	0.81	1.56	1.01	0.95	0.94	0.61	0.40	0.53	0.91	0.26	0.67	1.74	2.15	0.54	0.11	2.04	3.10	0.45	0.23	0.42	NA	NA
ec_Fumaric_acid	ME402427	NA	0.69	0.39	0.51	0.46	0.30	0.40	0.37	0.42	0.55	0.93	3.27	0.62	1.44	2.24	0.45	1.72	0.92	2.08	0.74	0.61	1.90	NA	NA
ec_Isoleucine	ME402416	NA	1.29	1.07	0.75	0.44	0.48	0.51	0.55	0.46	0.79	1.32	2.90	0.96	0.85	2.94	0.53	1.15	0.73	1.33	0.62	0.33	1.02	NA	NA
ec_Leucine	ME402414	NA	1.53	1.26	0.82	0.39	0.34	0.37	0.40	0.37	0.76	1.46	3.57	0.81	0.73	3.48	0.47	1.10	0.58	0.92	0.60	0.08	0.93	NA	NA
ec_Tyrosine	ME402428	NA	1.25	1.01	0.97	0.67	0.60	0.61	0.61	0.57	0.77	1.27	1.60	1.18	1.79	1.91	0.43	1.32	0.95	1.72	0.65	0.22	0.90	NA	NA
ec_Phenylalanine	ME402429	NA	1.70	1.22	1.23	0.69	0.66	0.65	0.56	0.39	0.74	1.46	2.69	0.82	1.11	2.36	0.20	0.80	0.92	1.67	0.36	0.07	0.70	NA	NA
ec_Valine	ME402415	NA	1.08	1.08	0.84	0.48	0.45	0.48	0.52	0.43	0.73	1.27	2.35	0.87	1.91	2.83	0.36	0.95	0.59	2.30	0.48	0.23	0.78	NA	NA
ec_Methionine	ME402422	NA	0.92	1.08	0.91	0.62	0.57	0.71	0.77	0.82	1.03	1.54	0.11	1.40	3.00	1.65	0.67	1.04	0.67	1.37	0.46	0.11	1.56	NA	NA
ec_Lactic_acid	ME402418	NA	0.94	0.89	0.77	0.80	0.61	0.69	0.77	0.80	0.77	0.82	0.89	1.06	1.10	1.17	2.72	1.24	0.66	1.47	1.44	0.58	0.80	NA	NA
ec_Betaine	ME402424	NA	1.76	0.57	1.29	1.12	1.07	1.09	0.73	0.72	0.64	0.88	0.62	0.96	1.13	0.81	0.42	1.41	2.31	0.97	1.08	0.19	1.23	NA	NA
ec_Aspartate	ME402423	NA	1.02	0.89	0.75	0.61	0.60	0.86	0.82	0.75	1.07	1.49	1.79	1.28	1.43	1.02	0.56	1.00	0.97	1.21	0.47	0.28	2.14	NA	NA
ec_Nicotinic_acid	ME402430	NA	1.60	0.94	0.96	0.79	0.61	0.54	0.44	0.53	0.78	1.06	2.54	0.84	1.45	0.94	1.09	1.94	1.20	0.67	0.90	0.25	0.94	NA	NA
ec_Uracil	ME402426	NA	1.50	1.01	0.82	0.68	0.66	0.64	0.57	0.71	0.86	1.24	1.57	1.14	2.23	1.19	0.70	1.74	1.02	0.34	0.84	0.50	1.03	NA	NA
ec_Acetic_acid	ME402420	NA	1.49	0.93	1.10	0.92	0.83	0.76	0.66	0.71	0.76	1.01	1.34	1.05	1.82	1.32	0.84	1.67	0.83	0.81	1.02	0.45	0.68	NA	NA
ec_Ribose_2	ME402425	NA	1.32	0.90	0.86	0.80	0.76	0.74	0.67	0.70	0.81	1.08	1.57	0.86	1.97	1.57	0.74	1.64	0.70	0.83	1.07	0.36	1.05	NA	NA
ec_Cadaverine	ME402419	NA	1.06	0.80	0.93	0.84	0.77	0.82	0.79	0.81	0.83	0.98	0.76	1.08	1.68	1.14	0.98	1.60	0.98	1.38	1.15	0.58	1.01	NA	NA
ec_Glutamic_acid	ME402421	NA	1.25	0.81	0.95	0.92	0.78	0.79	0.76	0.80	0.77	1.09	0.83	0.91	0.98	1.55	0.98	2.06	0.73	0.81	1.40	0.37	1.46	NA	NA

Factors:

F1	sample_type:IBAT
F2	sample_type:IBAT_batch1
F3	sample_type:IBAT_batch10
F4	sample_type:IBAT_batch2
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F23	sample_type:PD1074
F24	sample_type:poolQC

Data matrix