Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001908)

(Analysis AN003105)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19
deoxyadenosine	ME438516	0.71	0.01	0.66	1.48	0.43	1.71	0.01	1.48	2.01	0.38	1.05	1.08	1.10	1.22	1.43	5.31	0.01	0.18	0.76
S-ribosyl-L-homocysteine_neg	ME438565	0.58	0.00	0.67	1.53	0.50	1.43	0.02	2.01	3.09	0.70	1.12	1.17	0.77	1.97	0.48	4.27	0.00	0.00	0.65
D-glucarate	ME438559	0.76	0.06	0.94	0.48	1.12	1.58	3.63	0.06	0.06	1.26	0.63	0.79	1.57	0.06	3.87	0.06	0.06	3.01	0.06
cytidine	ME438515	1.15	0.10	0.87	1.23	0.75	0.58	0.10	0.94	0.80	1.16	1.14	1.21	0.58	1.15	0.25	0.90	1.79	0.11	5.10
glucose-1-phosphate	ME438563	0.34	0.01	0.54	1.13	0.91	1.70	2.59	1.05	0.85	0.01	0.82	1.13	1.21	0.01	1.83	3.42	3.20	0.94	0.40
D-gluconate	ME438558	0.01	0.63	0.51	0.33	1.37	1.15	2.78	0.15	0.21	0.14	0.47	0.91	3.96	1.19	1.39	0.72	0.01	0.97	0.47
orotate	ME438547	0.03	0.03	1.46	0.03	2.04	2.11	0.03	0.03	0.03	0.03	0.42	0.98	1.75	0.03	2.19	0.03	0.03	0.03	0.03
NAD+_pos	ME438530	1.37	0.67	0.71	0.42	1.15	2.55	1.27	1.30	0.03	1.84	1.18	0.63	0.78	0.03	1.99	0.03	0.96	1.06	0.40
p-hydroxybenzoate	ME438541	1.91	0.01	1.27	0.78	1.19	1.69	0.01	1.41	0.01	1.67	0.91	0.83	0.53	0.01	0.40	0.01	2.27	1.61	0.01
S-adenosyl-L-homoCysteine_pos	ME438528	1.19	1.47	0.98	0.88	1.23	0.91	0.64	0.99	3.66	1.08	1.00	0.89	0.75	0.78	0.94	0.69	1.23	0.60	1.08
glutathione disulfide_neg	ME438581	0.92	2.01	1.06	1.16	1.23	1.07	1.78	0.66	1.94	1.47	1.02	0.89	0.80	0.72	0.95	0.33	0.41	0.27	0.68
UDP-D-glucose	ME438578	1.05	2.41	0.98	0.99	1.01	1.49	1.20	0.97	1.72	1.49	1.16	0.68	0.90	0.41	1.01	0.84	1.05	0.74	0.73
a-ketoglutarate	ME438543	0.74	2.34	0.61	1.05	0.91	1.48	1.96	0.49	2.76	1.20	0.99	1.51	0.80	0.91	1.45	0.00	0.00	0.00	0.36
glutathione disulfide_pos	ME438529	0.88	2.71	1.62	1.24	1.12	1.54	2.39	0.48	2.57	1.39	0.55	0.89	0.41	0.70	1.10	0.02	0.02	0.02	1.09
adenosine	ME438519	0.80	0.00	0.71	1.49	0.57	1.00	0.02	1.78	1.73	0.79	1.26	1.24	0.88	1.83	0.62	2.56	0.00	0.00	0.76
ribose-phosphate	ME438560	0.63	0.40	0.73	1.28	0.83	1.14	0.31	1.24	1.57	0.82	1.02	1.26	1.02	1.23	0.78	2.21	0.44	0.31	1.32
cyclic-AMP	ME438570	1.09	0.62	0.96	1.22	1.05	0.91	0.67	1.32	1.44	0.93	1.16	0.94	0.80	1.20	0.63	1.00	0.01	0.47	1.31
inosine	ME438566	0.88	0.05	0.76	1.19	0.77	0.85	0.03	1.32	2.08	1.09	1.33	1.36	0.70	1.48	0.40	0.96	0.08	0.03	1.65
D-sedoheptulose-1-7-phosphate	ME438567	0.56	0.71	0.84	1.14	0.96	1.56	2.07	0.72	2.46	1.36	0.91	0.86	1.31	0.81	1.28	1.75	1.03	0.42	0.64
hydroxyphenylpyruvate	ME438556	0.55	1.04	0.98	0.89	0.87	1.18	2.08	0.92	1.27	1.65	0.89	1.01	1.18	0.93	1.51	1.97	1.19	0.31	0.81
2-Aminooctanoic acid	ME438505	0.81	1.61	0.90	0.69	0.93	1.50	1.32	2.29	0.66	0.68	1.05	0.82	0.66	1.34	1.60	0.75	0.48	0.74	1.07
cholesteryl sulfate	ME438575	0.57	0.60	1.62	1.05	0.90	0.45	0.27	1.10	0.38	0.65	1.14	0.97	0.74	1.33	0.78	0.52	1.57	1.36	0.62
AMP	ME438525	0.97	1.64	0.83	1.05	0.97	1.14	1.46	0.81	0.81	0.93	0.97	1.00	1.04	0.62	1.41	1.02	1.78	1.06	1.02
D-glyceraldehdye-3-phosphate	ME438550	0.66	1.31	0.90	1.25	0.90	1.03	0.69	0.89	1.22	0.68	0.91	1.14	0.94	0.81	1.37	1.67	1.83	0.89	0.98
dihydroxy-acetone-phosphate	ME438549	0.74	1.27	0.84	1.17	0.91	1.08	0.72	0.95	1.04	0.72	0.92	1.14	1.01	0.93	1.29	1.21	2.04	0.97	1.04
Citraconic acid	ME438537	0.80	0.72	0.90	0.79	0.93	1.10	0.80	0.89	0.92	1.10	0.93	1.13	1.13	0.98	1.09	1.80	1.92	1.08	1.17
malate	ME438538	0.86	1.15	0.91	0.77	1.06	1.26	0.67	1.01	0.86	0.92	0.98	1.03	1.13	0.96	0.79	1.46	1.73	0.80	1.11
fructose-6-phosphate	ME438564	0.72	0.85	0.74	1.05	0.99	1.18	1.54	0.90	1.32	0.79	0.80	1.06	1.36	0.58	1.24	2.58	1.22	0.77	1.27
hexose-phosphate	ME438562	0.71	0.65	0.76	1.02	0.92	1.27	1.48	0.86	1.06	0.67	0.85	1.08	1.36	0.68	1.25	2.31	1.68	0.83	1.27
aconitate	ME438552	0.70	0.52	0.89	0.77	0.95	1.08	0.79	0.79	0.97	1.16	0.84	1.15	1.42	1.14	1.40	2.07	1.29	1.00	0.66
isocitrate	ME438557	0.42	0.88	0.71	0.79	1.04	1.46	0.72	0.80	1.38	0.91	0.61	1.25	1.53	1.01	1.51	1.89	2.04	0.70	0.96
citrulline	ME438509	1.08	1.37	0.87	0.71	1.25	1.72	1.24	0.40	0.91	1.32	0.96	0.75	1.32	0.81	1.53	0.42	0.70	1.50	0.54
S-methyl-5-thioadenosine	ME438521	0.51	0.74	0.81	1.01	0.89	1.23	1.08	1.04	1.66	0.96	0.99	1.18	1.30	1.27	0.72	0.86	0.64	0.91	0.83
anthranilate	ME438540	1.10	1.80	1.04	0.68	0.74	0.98	1.24	0.72	0.86	1.10	0.82	1.21	1.07	1.03	1.55	1.34	0.87	1.48	1.51
S-ribosyl-L-homocysteine_pos	ME438518	0.29	0.97	0.97	0.65	0.87	1.17	1.12	1.11	0.70	0.42	1.08	1.37	0.76	0.72	1.61	1.05	0.99	1.02	0.91
succinate	ME438534	0.82	0.70	0.99	0.64	0.93	1.13	1.17	0.84	0.84	0.87	0.95	1.16	1.08	1.58	1.43	1.14	1.32	1.33	0.61
hypoxanthine	ME438539	0.95	0.91	1.02	0.83	0.87	1.06	1.30	0.80	0.93	0.96	0.91	1.02	1.06	1.05	1.74	1.09	1.24	1.38	1.30
methylnicotinamide	ME438499	0.95	0.90	1.13	0.82	0.92	1.01	1.33	0.81	0.64	0.88	0.91	0.99	1.01	0.86	1.58	0.79	1.21	1.56	1.24
myo-inositol	ME438555	0.97	0.88	1.01	1.05	1.08	1.28	1.19	1.17	2.10	1.44	1.07	0.78	0.83	0.77	0.81	0.70	0.94	0.82	0.83
proline	ME438487	1.09	0.88	1.18	0.90	1.14	1.04	1.12	1.03	1.54	1.17	1.05	0.77	0.86	0.75	0.80	0.96	0.98	0.90	1.10
Acetylcarnitine DL	ME438513	1.23	1.05	1.27	1.02	1.11	0.99	1.57	1.33	1.23	1.17	0.99	0.80	0.85	0.73	0.64	0.63	0.79	0.41	0.64
Creatinine	ME438486	1.21	0.74	1.18	1.01	1.20	0.94	1.53	0.94	1.43	1.74	1.26	0.56	0.83	0.83	0.68	0.64	0.76	0.65	0.92
ATP_neg	ME438577	0.92	0.84	1.00	1.02	1.02	1.68	1.52	1.10	1.37	1.84	0.98	0.75	0.96	0.98	1.18	1.09	0.84	0.47	0.32
UDP_neg	ME438571	1.19	1.40	1.05	0.96	0.98	1.58	1.46	1.01	1.86	1.61	0.87	0.77	0.99	0.96	1.33	1.11	1.34	0.25	0.59
N-acetyl-glucosamine-1-phosphate	ME438568	0.98	1.36	0.91	0.97	1.09	1.34	1.56	0.81	1.30	1.52	1.04	0.88	0.84	0.89	0.99	1.39	0.89	0.90	0.99
Phenylpropiolic acid	ME438544	0.88	1.80	1.13	1.01	1.06	1.24	1.40	0.97	1.37	1.37	0.91	0.82	1.00	0.86	0.66	1.08	1.03	0.92	0.83
glutathione	ME438522	1.12	1.66	1.12	1.05	1.12	1.34	1.50	0.99	1.30	1.38	1.07	0.68	0.80	0.50	0.89	0.58	0.98	0.91	0.74
glutathione_neg	ME438569	1.02	1.69	1.04	1.01	1.05	1.35	1.42	1.03	1.59	1.61	1.07	0.75	0.82	0.74	0.99	0.98	0.79	0.77	0.65
aspartate	ME438496	1.37	1.39	1.06	0.86	0.98	1.32	1.52	0.72	0.88	1.42	1.03	0.83	0.88	0.46	1.38	1.05	0.99	1.16	0.93
Phosphorylcholine	ME438511	0.88	1.47	0.96	1.02	1.16	1.46	1.44	0.95	0.58	1.10	0.87	0.84	1.11	0.53	0.95	1.40	1.27	0.76	0.94
ADP_neg	ME438572	0.96	1.16	0.94	1.14	0.96	1.62	1.72	0.88	1.15	1.31	0.93	0.92	0.94	0.86	1.22	1.07	1.16	0.74	0.48
dGDP_neg	ME438573	1.02	1.31	0.88	1.19	0.96	1.38	1.74	0.93	0.83	1.33	0.97	0.98	0.94	0.67	1.20	1.25	1.11	0.56	0.54
UDP-D-glucuronate	ME438579	1.07	1.45	1.09	1.20	0.93	1.45	0.75	0.68	1.26	1.84	0.90	0.90	0.82	0.70	1.18	0.17	1.50	0.73	1.24
CDP-choline	ME438576	0.90	1.88	1.06	1.01	1.16	1.06	1.08	1.15	0.30	1.59	1.14	0.78	0.84	1.06	0.52	0.80	0.91	0.67	0.99
lysine	ME438500	1.02	0.99	1.04	0.95	0.99	0.80	0.90	0.97	1.02	1.17	0.91	1.07	1.00	0.02	1.17	0.39	1.67	0.93	1.76
shikimate	ME438551	1.59	0.77	0.89	1.06	1.04	1.17	1.30	0.62	1.15	1.14	1.01	0.99	0.90	1.23	1.24	0.54	1.15	1.06	0.68
1-Methyladenosine	ME438520	1.51	0.45	1.06	1.13	1.07	0.88	0.91	1.01	0.89	1.78	1.03	0.89	0.76	0.96	0.70	0.86	1.00	0.70	1.28
CDP-ethanolamine	ME438574	1.48	1.06	1.00	1.01	1.03	1.17	1.14	1.07	0.68	1.33	1.12	0.86	0.68	1.39	1.17	0.78	1.05	0.32	1.00
UDP-N-acetyl-glucosamine	ME438580	0.99	0.85	1.07	1.09	1.01	1.30	0.93	1.04	0.89	1.27	1.12	0.81	0.85	0.88	1.11	0.77	1.44	0.46	0.86
betaine	ME438488	0.87	0.90	1.27	0.81	1.29	1.30	1.07	0.69	0.79	1.04	0.85	0.77	1.06	0.87	1.04	0.48	0.61	1.33	1.09
ornithine	ME438494	1.20	1.10	1.42	0.98	1.10	1.45	1.06	0.53	1.49	0.91	0.89	0.83	0.73	0.68	0.90	0.29	0.91	1.27	0.79
carnitine	ME438506	1.07	1.50	0.94	1.00	1.12	1.11	1.45	1.04	0.88	0.91	1.09	0.99	0.63	0.95	0.87	0.39	1.14	1.35	0.81
Glycerophosphocholine	ME438517	1.06	0.51	1.16	1.14	1.07	0.73	1.24	0.94	0.82	0.97	1.21	0.82	0.82	0.57	1.01	0.88	1.16	0.83	1.07
CMP	ME438523	1.29	1.59	0.87	1.02	1.18	1.14	1.18	0.88	1.25	0.97	1.01	0.92	0.89	0.64	0.93	0.63	1.09	0.59	1.53
FAD	ME438531	1.21	1.46	1.00	0.83	1.12	1.17	1.26	0.70	1.09	0.99	1.14	1.05	0.80	0.37	0.58	0.70	0.82	0.82	1.17
lactate	ME438533	1.22	1.12	1.14	0.83	1.02	1.14	0.46	0.84	0.94	1.29	0.99	1.00	0.83	1.27	1.09	0.65	0.89	0.98	0.95
nicotinamide	ME438491	1.21	1.13	1.22	1.04	1.21	0.74	0.65	1.05	0.88	1.27	1.13	0.82	0.71	0.91	0.54	0.55	0.81	0.92	1.06
Ng,NG-dimethyl-L-arginine	ME438512	1.16	1.04	1.14	0.83	1.02	0.56	0.66	0.89	0.55	1.07	0.96	1.03	0.98	0.97	1.23	0.55	1.24	1.54	1.38
choline	ME438482	1.04	1.14	0.98	0.90	1.05	0.84	0.93	0.79	0.67	1.09	1.00	1.00	1.13	1.27	1.05	0.55	0.92	1.48	1.11
dimethylglycine	ME438483	1.04	1.19	0.99	0.88	1.08	0.88	0.90	0.79	0.68	1.13	0.99	0.99	1.12	1.16	0.99	0.59	0.84	1.44	1.13
2-Hydroxy-2-methylbutanedioic acid	ME438545	1.09	1.06	1.08	1.17	1.31	0.86	0.71	1.13	0.53	0.82	0.97	0.83	0.74	0.71	0.95	0.84	1.24	1.02	1.05
2-hydroxygluterate	ME438582	1.10	1.37	1.16	1.07	1.24	0.92	0.69	1.13	1.00	0.87	0.96	0.81	0.71	0.92	1.04	0.64	1.22	0.89	1.15
GMP	ME438527	1.13	1.62	0.97	1.04	0.97	0.65	1.19	0.71	0.76	0.80	1.02	1.16	0.98	0.64	0.94	0.75	1.13	0.97	1.54
UMP	ME438524	1.27	1.59	1.00	0.99	1.13	0.82	1.14	0.83	0.77	0.95	0.99	0.96	0.88	0.78	1.01	0.73	1.08	0.93	1.57
arginine	ME438508	0.95	0.99	1.05	0.90	0.98	0.59	0.74	0.97	0.98	1.25	1.01	1.14	0.92	0.92	0.88	0.77	1.21	0.84	1.64
IMP	ME438526	1.26	1.36	1.06	0.92	1.08	0.71	0.83	0.79	0.83	0.90	1.05	1.08	0.89	0.85	0.84	0.60	0.95	0.96	1.30
threonine	ME438490	1.34	1.15	1.11	0.86	1.15	0.85	0.78	0.85	0.68	0.93	0.95	0.99	0.90	0.72	0.80	0.78	0.91	1.20	1.52
Methylcysteine	ME438498	1.21	1.32	1.11	0.92	1.08	0.87	1.11	0.91	1.05	1.04	0.84	0.89	0.98	0.97	1.34	0.65	1.23	1.32	1.35
tryptophan	ME438514	1.08	1.00	1.10	0.94	1.11	0.93	1.00	0.96	1.05	0.78	1.06	0.86	0.87	0.80	1.07	0.75	1.17	1.12	1.24
valine	ME438489	1.08	1.27	1.13	0.83	1.14	1.02	1.16	0.97	1.03	1.01	0.99	0.78	1.03	0.77	1.11	0.55	1.17	1.09	1.19
histidine	ME438504	1.02	1.05	1.05	0.83	1.08	0.79	0.70	0.89	0.69	1.16	1.02	1.02	0.95	0.86	1.08	0.65	1.34	1.09	1.42
serine	ME438484	1.21	1.01	1.13	0.91	1.06	0.85	0.73	0.85	1.06	1.00	0.97	0.97	0.94	0.79	0.99	0.76	1.22	1.16	1.29
tyrosine	ME438510	1.11	1.20	1.08	0.86	1.06	0.86	0.94	0.87	0.91	0.91	1.00	0.97	0.96	0.83	1.04	0.70	1.14	1.17	1.42
methionine	ME438503	1.12	1.20	1.07	0.85	1.08	0.85	0.75	0.86	1.05	1.14	1.00	0.98	0.98	0.81	0.97	0.62	1.04	1.12	1.35
leucine-isoleucine	ME438493	1.05	1.10	1.05	0.88	1.06	0.89	0.88	0.91	1.02	1.13	0.97	0.96	1.04	0.76	0.99	0.68	1.12	1.15	1.50
phenylalanine	ME438507	1.11	1.18	1.08	0.82	1.09	0.88	0.79	0.90	1.00	1.08	1.01	0.95	0.94	0.82	0.90	0.69	1.18	1.09	1.57
asparagine	ME438495	1.32	1.28	1.11	1.02	1.04	0.93	1.13	0.89	0.95	1.36	0.96	0.87	0.82	0.80	0.89	0.87	1.63	0.96	1.49
2-Isopropylmalic acid	ME438554	1.29	1.06	1.15	0.86	1.02	1.15	0.95	0.94	0.55	1.19	0.81	1.01	0.94	0.96	1.13	0.89	1.40	0.79	1.08
Ascorbic acid	ME438553	1.22	1.17	1.12	0.90	1.04	1.18	0.97	0.86	0.61	1.32	0.82	1.01	0.96	0.99	1.00	0.86	1.01	0.85	1.24
taurine	ME438536	1.03	1.09	1.03	1.01	1.04	0.89	1.05	1.01	0.83	0.95	1.01	0.96	1.01	0.94	0.93	0.85	1.01	1.13	0.95
alanine	ME438481	1.10	1.23	1.17	0.99	1.04	1.03	0.86	0.96	0.99	1.04	1.03	0.91	0.79	0.81	0.85	0.99	1.01	1.01	1.17
sarcosine	ME438532	1.14	1.24	1.21	0.98	1.05	1.01	0.95	0.94	0.91	1.05	1.01	0.92	0.79	0.83	0.79	0.95	1.07	0.89	1.02
Carbamoyl phosphate	ME438542	1.06	1.35	0.97	1.01	1.07	1.12	1.32	0.92	1.13	1.08	1.00	0.90	0.98	0.86	0.94	0.90	1.25	0.78	1.15
glutamate	ME438502	1.26	1.38	1.12	0.92	1.15	1.11	1.07	0.92	0.89	1.30	1.06	0.80	0.90	0.76	0.85	0.67	1.07	0.81	0.86
DL-Pipecolic acid	ME438492	1.21	1.33	1.12	1.04	1.20	1.06	1.20	0.88	1.06	1.24	1.02	0.82	0.77	0.77	0.71	0.79	1.12	0.85	1.04
glutamine	ME438501	1.29	1.37	1.15	1.03	1.16	1.02	1.17	0.84	1.04	1.39	0.99	0.82	0.79	0.78	0.69	0.83	1.14	0.89	1.14
cytosine	ME438485	0.54	2.85	1.15	0.22	1.40	1.68	1.00	0.19	0.98	0.52	0.63	0.94	1.44	0.57	1.53	0.00	0.00	2.77	0.70
deoxyinosine	ME438561	0.70	0.94	1.00	0.72	0.81	1.35	2.48	0.81	0.95	0.83	0.74	0.96	1.37	1.18	2.21	1.03	1.40	1.65	0.65
adenine	ME438497	0.78	1.26	1.00	0.68	1.01	1.12	2.00	0.70	0.55	0.74	0.64	1.14	1.37	0.60	1.75	0.54	2.16	1.84	0.52
Uric acid	ME438548	0.83	1.08	1.04	0.59	1.06	1.67	2.25	0.53	0.65	0.69	0.60	0.81	1.63	0.74	2.32	0.54	1.73	1.88	0.32
nicotinate	ME438535	0.75	1.40	0.96	0.56	0.99	1.39	1.73	0.38	0.94	0.52	0.78	0.99	1.62	0.94	2.39	0.48	0.00	2.37	0.20
xanthine	ME438546	0.91	2.11	1.17	0.47	1.03	1.63	2.16	0.34	0.54	0.64	0.48	0.80	1.43	0.66	2.93	0.50	1.41	2.79	0.29

Factors:

F1	Condition:AMI \| Race:Chinese \| Gender:Female \| Smoker:Current-smoker
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F16	Condition:Control \| Race:Indian \| Gender:Male \| Smoker:Current-smoker
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F19	Condition:Control \| Race:Malay \| Gender:Male \| Smoker:Current-smoker

Data matrix