Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001958)

Reversed phase UNSPECIFIED ION MODE (Analysis AN003193)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15
DG(16:1_18:1)	ME452081	0.14	0.21	0.46	0.36	0.31	0.03	0.43	2.80	2.99	1.05	0.06	0.32	1.04	3.03	1.77
ChE(22:5)	ME452072	2.22	0.49	1.52	1.60	0.64	3.39	0.88	0.56	0.47	0.39	0.98	0.29	0.40	0.61	0.56
PC(18:3e_16:0)	ME452154	1.04	0.79	1.11	1.69	2.07	0.55	0.71	1.38	0.29	0.14	0.77	0.75	0.14	1.73	1.83
DG(16:1_18:2)	ME452082	0.12	0.15	0.47	0.37	0.30	0.05	0.44	3.27	3.06	1.17	0.12	0.22	1.10	2.72	1.44
PC(15:0_20:3)	ME452142	0.19	0.24	0.38	0.45	0.40	0.20	0.60	1.31	1.65	1.20	0.39	0.84	1.31	3.00	2.85
PC(16:0_18:1)	ME452143	0.26	0.09	1.95	1.15	1.02	0.15	0.16	0.12	0.24	2.26	0.54	4.32	0.91	1.41	0.43
PC(17:1_18:1)	ME452149	0.21	0.30	0.73	1.23	0.71	0.24	0.74	1.10	1.20	1.33	0.43	1.15	1.30	2.45	1.87
PE(16:0p_22:1)	ME452182	0.25	0.30	0.51	0.80	0.74	0.28	0.42	1.21	1.43	1.05	0.70	0.89	1.30	2.78	2.33
PE(16:0_14:0)	ME452171	0.58	0.63	0.46	0.34	0.46	0.37	0.94	1.46	1.37	0.91	0.84	1.29	1.60	2.19	1.58
LPC(22:6)	ME452122	0.88	1.06	1.00	1.16	0.77	0.72	0.59	1.58	1.11	1.68	0.86	0.50	0.94	1.35	0.79
ChE(20:4)	ME452070	1.80	0.15	0.51	0.38	0.49	1.80	0.18	1.57	1.33	1.02	1.13	0.04	1.14	1.47	2.00
PE(16:1e_22:6)	ME452194	0.69	0.60	1.06	0.88	0.59	0.51	0.59	1.35	1.17	0.80	1.43	1.04	1.34	1.66	1.30
PE(16:0_16:1)	ME452173	0.30	0.28	0.25	0.22	0.28	0.19	0.55	2.09	2.42	0.79	0.30	0.53	0.95	3.68	2.17
PE(17:1_18:1)	ME452197	1.32	0.79	0.77	0.69	0.39	1.22	1.36	1.44	0.97	0.65	1.21	0.67	0.89	1.33	1.29
DG(18:1_22:6)	ME452093	1.05	0.79	2.08	1.92	1.03	0.58	0.93	1.36	1.34	1.00	0.38	0.45	0.47	1.01	0.63
PE(16:0p_20:3)	ME452181	0.30	0.37	0.58	0.66	0.73	0.31	0.44	1.69	1.96	2.05	0.59	0.49	0.90	2.10	1.84
PE(16:0p_20:1)	ME452180	0.40	0.45	0.53	0.87	0.91	0.33	0.58	1.29	1.47	1.11	0.61	0.73	1.19	2.39	2.12
PE(16:1_14:0)	ME452185	0.37	0.54	0.38	0.24	0.16	0.14	1.31	2.30	1.85	0.84	0.31	0.57	1.76	2.53	1.70
PE(16:1_16:1)	ME452186	0.25	0.22	0.26	0.15	0.19	0.09	0.93	2.61	2.55	0.77	0.18	0.25	1.33	3.14	2.07
DG(16:1_16:1)	ME452080	0.01	0.10	0.28	0.06	0.17	0.00	0.36	3.79	3.55	0.85	0.06	0.07	0.78	3.38	1.52
PE(12:0p_20:4)	ME452167	0.61	0.76	1.37	1.64	1.76	0.97	1.21	1.22	1.25	2.79	0.34	0.36	0.31	0.22	0.18
LPC(18:3)	ME452110	0.49	0.77	0.59	0.91	0.63	0.34	0.26	1.49	1.06	1.88	0.43	0.54	1.05	3.11	1.46
LPC(19:1)	ME452111	0.53	0.69	0.95	1.40	1.00	0.58	0.45	1.18	0.88	2.41	0.76	0.45	0.73	1.96	1.02
PE(16:1e_20:5)	ME452193	1.19	0.95	1.23	0.96	0.54	0.84	1.07	1.76	1.46	0.96	0.96	0.66	0.61	0.97	0.82
PC(12:1e_22:4)	ME452138	0.64	0.68	1.33	1.74	1.82	0.76	0.94	0.95	1.08	1.68	0.81	0.66	0.54	0.71	0.69
PC(14:1e_22:5)	ME452140	0.70	0.49	1.14	1.59	1.78	0.81	0.73	0.87	1.08	1.59	1.03	0.62	0.74	0.92	0.90
PC(14:1e_22:4)	ME452139	0.37	0.27	0.52	0.86	1.00	0.36	0.49	1.13	1.28	1.25	0.92	0.61	1.70	2.41	1.80
PC(15:0_16:0)	ME452141	1.38	0.93	0.46	0.51	0.45	1.26	1.05	0.76	0.78	0.71	1.41	1.39	1.03	1.61	1.27
PE(16:0p_20:0)	ME452179	0.50	0.42	0.58	0.78	0.86	0.67	0.48	1.06	1.09	0.90	1.18	1.00	1.24	2.24	2.01
PE(16:0p_22:4)	ME452183	0.80	0.87	1.16	1.67	1.69	0.76	1.01	1.05	1.12	1.19	0.76	0.70	0.65	0.87	0.70
PE(16:0p_22:6)	ME452184	0.77	0.60	1.02	0.81	0.59	0.54	0.58	1.33	1.10	0.76	1.53	1.04	1.33	1.73	1.27
LPE(18:1)	ME452134	0.49	0.63	0.59	0.71	0.48	0.34	0.39	1.52	1.21	1.23	0.48	0.66	1.18	3.07	2.01
PC(18:3e_20:5)	ME452157	0.42	0.70	1.84	2.86	3.09	0.46	0.70	0.70	0.89	1.40	0.38	0.41	0.40	0.39	0.37
ChE(22:6)	ME452073	2.25	0.48	1.33	1.40	0.92	2.81	0.82	0.63	0.47	0.48	1.25	0.23	0.52	0.63	0.80
PE(16:0_20:3)	ME452175	0.22	0.29	0.27	0.26	0.29	0.14	0.48	1.73	2.12	1.11	0.43	0.62	1.84	3.07	2.13
PE(16:1_18:2)	ME452188	0.60	0.34	0.26	0.22	0.12	0.33	1.04	2.26	1.98	0.74	0.57	0.46	1.94	2.36	1.77
DG(16:0_16:1)	ME452077	0.20	0.21	0.38	0.38	0.43	0.11	0.30	2.63	2.90	1.06	0.23	0.31	0.98	3.22	1.67
PC(19:0_21:0)	ME452159	3.03	2.74	0.16	0.37	0.28	1.53	1.29	0.36	0.25	0.30	2.24	1.14	0.48	0.44	0.39
PE(17:1_16:0)	ME452196	0.81	0.64	0.62	0.53	0.47	0.65	0.69	1.15	1.46	1.07	0.96	0.63	0.79	2.50	2.03
PC(10:1e_22:6)	ME452136	1.06	0.98	1.41	1.02	0.80	1.18	1.25	1.50	1.34	1.84	0.81	0.66	0.57	0.35	0.23
PC(16:1_18:1)	ME452146	0.50	0.82	0.86	0.62	0.37	0.35	1.14	1.22	0.96	0.75	0.53	0.79	1.38	3.40	1.30
PC(30:0_12:1)	ME452166	3.18	3.46	0.20	0.61	0.43	2.60	0.85	0.52	0.37	0.49	1.14	0.64	0.39	0.04	0.07
PE(16:1e_20:3)	ME452191	0.09	0.15	0.34	0.39	0.42	0.07	0.33	1.56	2.03	1.28	0.26	0.61	1.36	3.32	2.78
PC(16:1_13:0)	ME452145	0.32	0.28	0.28	0.23	0.29	0.21	0.62	1.79	2.51	1.09	0.33	0.46	1.05	3.22	2.31
PE(16:0_18:1)	ME452174	0.70	0.48	0.51	0.39	0.39	0.53	0.68	1.37	1.39	0.83	0.85	0.92	1.32	2.68	1.95
PE(16:1_18:1)	ME452187	0.45	0.44	0.47	0.29	0.19	0.31	1.25	2.02	1.76	0.71	0.54	0.67	1.63	2.49	1.78
PC(18:2e_16:0)	ME452152	0.50	0.71	1.03	0.72	0.89	0.03	0.35	1.95	2.31	1.56	0.37	0.63	0.82	1.71	1.42
PE(16:1e_20:4)	ME452192	0.52	0.64	1.13	1.65	1.42	0.58	0.64	1.33	1.47	1.34	0.76	0.63	0.72	1.16	1.01
LPC(22:3)	ME452119	0.09	0.30	0.35	0.62	0.56	0.15	0.27	1.19	0.82	1.36	0.36	0.98	2.00	4.13	1.82
PC(16:0e_10:0)	ME452144	1.90	1.77	0.95	0.77	0.84	1.15	1.25	0.86	0.86	1.70	1.01	0.86	0.48	0.31	0.28
PC(19:1_14:3)	ME452160	0.98	0.44	0.72	0.62	0.65	0.75	0.72	1.66	2.04	1.51	0.82	0.53	1.03	1.39	1.13
PC(20:1_12:2)	ME452162	0.98	1.12	0.98	0.94	0.92	0.70	0.95	1.01	1.14	1.04	1.01	1.07	1.05	1.18	0.91
PC(18:3e_18:1)	ME452156	0.26	0.56	1.42	2.34	2.57	0.31	0.61	0.76	0.98	1.59	0.39	0.39	0.78	1.11	0.94
PE(16:0_22:6)	ME452177	0.72	0.74	0.84	0.63	0.57	0.58	0.72	1.63	1.51	1.00	0.76	1.03	1.10	1.81	1.35
LPE(18:0)	ME452133	1.00	0.82	0.57	0.89	0.80	0.62	0.45	1.28	1.15	1.40	0.67	0.69	0.87	2.24	1.57
PE(16:0_20:4)	ME452176	0.86	0.45	0.75	0.67	0.70	0.77	0.58	1.83	2.20	1.30	0.72	0.48	1.00	1.58	1.11
LPE(16:1)	ME452131	0.17	0.35	0.38	0.35	0.32	0.15	0.29	2.61	2.27	1.48	0.21	0.21	1.27	3.06	1.87
DG(16:1_14:1)	ME452079	NA	NA	0.05	0.08	0.11	NA	0.35	3.19	3.22	0.68	NA	0.00	0.54	1.91	0.88
PC(18:3e_18:0)	ME452155	0.28	0.30	0.56	0.79	1.14	0.23	0.48	1.01	1.29	1.16	0.75	0.91	1.59	2.48	2.03
DG(16:0_18:1)	ME452078	0.46	0.38	0.79	0.70	0.68	0.24	0.39	1.67	1.71	1.17	0.48	0.70	1.21	2.63	1.81
LPE(16:0)	ME452130	0.42	0.41	0.48	0.54	0.43	0.33	0.27	1.76	1.62	1.36	0.42	0.49	1.07	3.38	2.03
LPE(20:4)	ME452135	0.69	0.73	1.32	1.69	1.70	0.73	0.57	1.37	1.28	1.78	0.58	0.37	0.68	0.87	0.65
PE(16:0p_18:3)	ME452178	0.16	0.19	0.34	0.31	0.30	0.19	0.44	2.45	2.13	1.18	0.25	0.35	1.46	3.03	2.23
DG(18:1_18:2)	ME452087	0.21	0.35	0.87	0.59	0.63	0.13	0.26	1.93	1.86	1.21	0.13	0.53	1.39	2.94	1.96
LPC(17:1)	ME452102	0.68	1.07	1.08	1.28	0.76	0.49	0.38	1.29	1.00	1.87	0.54	0.28	0.72	2.16	1.40
LPC(18:1e)_2	ME452107	1.15	0.75	0.67	1.11	1.51	0.48	0.33	0.83	0.81	1.10	0.59	1.31	1.14	1.90	1.32
PC(12:0e_6:0)	ME452137	0.85	0.46	0.62	1.31	0.74	0.91	0.30	1.11	1.24	2.71	1.07	0.29	0.90	1.42	1.07
PE(17:0_18:1)	ME452195	1.34	0.77	0.66	0.71	0.70	1.19	0.92	1.05	1.01	0.88	1.26	0.81	0.80	1.46	1.45
PC(20:1_14:0)	ME452163	0.26	1.72	0.62	0.47	0.63	3.56	0.27	0.35	2.50	0.06	0.45	0.19	2.13	1.58	0.22
PC(22:2_22:3)	ME452165	3.36	1.90	0.42	0.01	0.10	2.63	1.08	0.39	0.14	0.17	2.17	1.53	0.40	0.57	0.13
DG(18:0_16:0)	ME452083	1.93	0.78	0.37	0.79	0.92	0.99	0.59	1.09	0.85	0.76	1.36	0.95	0.86	1.51	1.26
PC(18:1_14:1)	ME452151	0.54	0.02	0.43	0.76	0.18	0.07	1.99	2.23	1.60	0.60	0.64	0.83	1.24	2.61	1.25
PC(17:1_14:0)	ME452148	0.44	0.64	0.77	0.27	0.16	0.01	1.80	1.26	1.27	0.40	0.56	1.25	2.85	1.85	1.47
PE(12:1e_20:4)	ME452168	0.59	0.77	1.33	1.58	1.75	0.98	1.13	1.25	1.32	2.87	0.34	0.35	0.33	0.23	0.18
DG(18:0_18:1)	ME452085	0.94	0.71	0.49	1.09	1.16	0.48	0.60	1.11	1.02	1.27	0.66	0.95	0.82	1.98	1.72
PC(19:1_23:1)	ME452161	0.89	1.55	0.37	0.42	0.35	0.97	2.04	0.64	0.48	0.52	2.18	2.02	0.93	0.88	0.73
DG(18:1_20:3)	ME452089	0.27	0.40	0.68	0.91	0.84	0.22	0.35	1.38	1.27	1.23	0.44	0.80	1.50	2.76	1.94
PC(18:2e_18:0)	ME452153	0.41	0.33	0.69	0.66	0.68	0.30	0.47	1.01	1.02	1.01	0.83	0.74	1.65	2.72	2.48
PC(19:0_11:2)	ME452158	0.03	0.17	0.18	0.13	0.53	0.19	2.24	0.86	0.94	0.45	2.56	3.78	0.77	1.20	0.96
DG(18:1_20:2)	ME452088	0.13	0.24	0.87	0.96	0.81	0.15	0.29	1.63	1.30	1.30	0.24	0.51	1.40	3.03	2.14
PC(18:0_18:3)	ME452150	0.40	0.34	0.50	0.63	0.70	0.45	0.63	1.21	1.87	1.49	0.65	0.85	1.06	2.18	2.03
PE(16:1_20:4)	ME452189	0.78	0.46	0.61	0.39	0.31	0.70	1.02	1.80	1.70	1.03	0.91	0.70	2.33	1.35	0.92
PE(14:0p_20:4)	ME452169	0.71	0.70	1.59	1.67	1.52	0.97	0.93	1.06	1.35	2.32	0.53	0.45	0.28	0.42	0.50
ChE(18:1)	ME452069	0.71	0.18	0.93	0.71	0.51	0.72	0.43	1.46	1.53	0.89	0.68	0.28	1.29	2.18	2.50
PE(14:0p_22:4)	ME452170	0.50	0.60	1.20	1.57	1.45	0.51	0.67	1.32	1.38	1.40	0.76	0.67	0.66	1.25	1.07
PE(16:1e_18:1)	ME452190	0.35	0.35	0.73	0.92	0.85	0.36	0.44	1.37	1.51	1.17	0.66	0.71	1.07	2.33	2.19
DG(16:0_16:0)	ME452076	0.68	0.32	0.39	0.56	0.67	0.33	0.33	1.54	1.57	1.08	0.69	0.65	1.33	2.87	2.00
LPE(16:1e)	ME452132	0.35	0.40	0.63	1.09	0.91	0.25	0.25	1.48	1.35	1.40	0.63	0.46	1.13	2.76	1.89
PC(16:1e_16:0)	ME452147	1.06	0.37	0.59	0.86	1.55	0.98	0.48	0.72	1.29	1.13	3.09	0.49	0.77	0.83	0.79
ChE(24:6)	ME452074	2.50	0.34	0.20	NA	NA	3.09	0.79	NA	NA	0.02	1.76	0.22	0.07	NA	NA
DG(18:1_18:1)	ME452086	0.22	0.39	1.08	0.96	0.72	0.14	0.52	1.62	1.42	1.17	0.26	0.76	1.23	2.63	1.89
ChE(22:4)	ME452071	1.43	0.58	1.62	1.63	0.96	2.92	1.11	0.50	0.29	0.47	1.10	0.45	0.59	0.61	0.71
LPC(18:0)	ME452103	0.95	0.62	0.49	1.04	1.25	0.73	0.35	0.99	0.97	1.94	0.87	0.40	0.69	2.16	1.54
PC(20:1_14:2)	ME452164	0.89	1.01	1.10	1.05	1.12	0.90	0.97	1.13	0.93	0.82	1.04	1.06	0.96	1.08	0.92
DG(18:1_22:3)	ME452091	0.11	0.33	1.01	1.15	0.96	0.10	0.39	1.21	1.10	1.41	0.19	1.26	1.38	2.57	1.82
DG(18:1_20:4)	ME452090	0.85	0.76	1.45	1.42	1.10	0.52	0.63	1.32	1.42	1.67	0.52	0.49	0.56	1.20	1.08
LPE(15:0)	ME452129	0.61	1.13	0.99	1.20	1.04	0.59	0.40	1.38	1.13	1.61	0.58	0.67	1.01	1.47	1.20
DG(18:1_22:4)	ME452092	0.31	0.67	1.54	2.09	1.81	0.25	0.44	1.04	0.98	1.49	0.22	0.66	0.88	1.59	1.04
LPC(28:1)_1	ME452127	1.65	1.48	0.91	0.64	1.61	0.46	1.48	1.59	1.15	1.04	0.38	0.56	0.54	0.87	0.64
LPC(20:0)	ME452112	1.15	0.46	0.58	0.65	0.64	0.57	0.36	1.00	1.03	0.95	0.79	0.39	1.26	2.83	2.34
LPC(20:3)	ME452115	0.12	0.30	0.45	0.60	0.34	0.13	0.22	1.57	1.20	1.84	0.29	0.61	1.49	3.95	1.88
LPC(22:4)	ME452120	0.68	1.05	0.83	0.80	1.40	0.56	1.07	0.94	0.95	0.72	0.66	1.09	0.91	1.61	1.73
DG(20:1_18:1)	ME452094	0.19	0.40	0.59	1.49	1.13	0.15	0.52	1.47	1.22	1.43	0.29	1.16	1.20	2.17	1.61
LPC(16:0e)	ME452098	0.55	0.23	0.56	0.76	0.66	0.34	0.16	1.25	1.03	1.14	1.28	0.39	1.69	2.97	1.99
LPC(14:0)	ME452095	0.45	1.15	0.74	1.00	0.77	0.33	0.34	1.57	1.06	2.28	0.40	0.58	0.86	1.60	1.89
LPC(16:1)	ME452099	0.20	0.76	0.51	0.53	0.33	0.14	0.33	2.48	1.55	2.04	0.20	0.32	1.38	2.64	1.59
LPC(16:1e)	ME452100	0.28	0.44	0.76	2.12	2.28	0.54	0.28	0.79	0.89	1.76	0.92	0.42	0.72	1.65	1.13
DG(18:0_18:0)	ME452084	0.76	0.76	0.16	0.97	1.15	0.70	0.66	2.27	1.55	0.66	0.78	1.03	1.70	0.70	1.15
LPC(15:0)	ME452096	0.54	1.01	1.11	1.33	0.85	0.61	0.38	1.42	1.11	2.22	0.57	0.59	0.94	1.28	1.05
DG(15:0_15:0)	ME452075	0.71	0.77	0.77	1.00	0.87	0.37	0.46	1.68	1.56	1.52	0.48	0.59	1.09	1.94	1.22
LPC(28:1)_2	ME452128	0.78	1.19	0.73	0.94	2.68	0.62	1.27	0.80	0.77	1.77	0.64	1.23	0.44	0.60	0.54
LPC(18:2)	ME452108	0.84	0.90	1.03	1.23	1.56	0.46	1.23	1.18	1.13	1.49	0.62	0.28	0.65	1.54	0.86
LPC(18:2e)	ME452109	0.05	0.05	0.66	1.77	2.78	0.04	0.46	0.85	0.79	1.85	0.95	0.71	0.85	1.81	1.37
LPC(22:0)	ME452118	1.44	1.70	0.76	0.61	0.92	0.80	0.88	0.92	0.63	0.85	0.83	0.58	0.80	1.66	1.61
LPC(17:0)	ME452101	0.98	0.71	0.57	1.23	1.13	0.75	0.28	0.97	0.84	1.82	0.68	0.25	0.61	2.46	1.72
LPC(24:1)	ME452124	1.04	2.12	0.69	0.44	0.41	0.63	1.99	0.98	0.73	0.60	0.77	1.02	0.86	1.58	1.15
LPC(18:1)	ME452105	0.53	0.71	0.70	1.04	0.61	0.37	0.52	1.28	1.06	1.47	0.61	0.87	1.19	2.70	1.36
LPC(16:0)	ME452097	0.45	0.75	0.58	0.93	0.63	0.32	0.25	1.52	1.16	1.91	0.47	0.50	1.11	2.95	1.47
LPC(18:1e)_1	ME452106	0.39	0.22	0.72	1.32	1.27	0.30	0.20	0.97	0.85	1.60	0.61	0.33	1.15	3.08	1.99
LPC(20:1)	ME452113	0.47	0.59	0.73	1.08	0.80	0.44	0.45	1.30	0.88	1.60	0.73	0.69	1.07	2.69	1.50
LPC(28:0)	ME452126	2.13	1.39	0.74	0.78	1.52	1.08	1.22	0.79	0.66	1.22	0.93	1.11	0.46	0.55	0.41
LPC(20:2)	ME452114	0.28	0.38	0.49	0.65	0.36	0.32	0.29	1.81	1.15	1.67	0.50	0.64	1.40	3.28	1.78
LPC(26:0)	ME452125	2.04	2.32	0.72	0.59	1.37	0.89	1.41	0.73	0.65	1.17	0.79	1.13	0.35	0.46	0.38
LPC(20:4)	ME452116	0.41	0.92	1.18	2.13	1.67	0.45	0.33	1.30	1.04	2.98	0.29	0.23	0.53	0.97	0.56
LPC(22:5)	ME452121	0.76	1.04	1.01	1.52	1.41	0.59	0.24	1.22	0.92	1.98	0.64	0.42	0.90	1.50	0.84
PE(16:0_16:0)	ME452172	0.59	0.59	0.52	0.47	0.57	0.49	0.71	1.36	1.11	0.81	0.87	1.19	1.38	2.60	1.74
LPC(20:5)	ME452117	1.23	1.54	1.19	1.45	0.71	1.08	0.62	1.75	1.11	1.87	0.49	0.25	0.42	0.56	0.73
LPC(18:0e)	ME452104	1.15	0.42	0.53	0.93	1.07	0.52	0.30	0.80	0.71	1.01	1.53	0.73	1.14	2.47	1.70
LPC(24:0)	ME452123	1.78	3.18	0.51	0.50	0.46	0.83	1.90	0.73	0.58	0.48	0.68	0.77	0.52	0.93	1.13

Factors:

F1	Cell Line:1 \| Stage:1
F2	Cell Line:1 \| Stage:2
F3	Cell Line:1 \| Stage:3
F4	Cell Line:1 \| Stage:4
F5	Cell Line:1 \| Stage:5
F6	Cell Line:2 \| Stage:1
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F8	Cell Line:2 \| Stage:3
F9	Cell Line:2 \| Stage:4
F10	Cell Line:2 \| Stage:5
F11	Cell Line:3 \| Stage:1
F12	Cell Line:3 \| Stage:2
F13	Cell Line:3 \| Stage:3
F14	Cell Line:3 \| Stage:4
F15	Cell Line:3 \| Stage:5

Data matrix