Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST002054)

(Analysis AN003344)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8
TG 56:6	ME474157	0.57	5.48	1.33	0.29	0.47	0.35	0.04	0.09
TG 48:3	ME474133	0.03	7.63	0.54	0.16	0.37	0.18	0.01	0.06
TG 56:1	ME474153	0.06	6.80	0.69	0.09	0.93	0.15	0.00	0.03
TG 50:3	ME474136	0.09	7.18	0.67	0.21	0.42	0.23	0.03	0.07
TG 54:1	ME474145	0.16	7.01	0.71	0.13	0.59	0.19	0.01	0.06
TG 50:1	ME474134	0.12	6.76	0.63	0.22	0.64	0.35	0.03	0.09
TG 52:3	ME474140	0.17	6.46	0.86	0.24	0.59	0.31	0.03	0.11
TG 54:3	ME474147	0.23	6.63	0.85	0.25	0.47	0.25	0.04	0.08
TG 52:2	ME474139	0.19	6.60	0.79	0.22	0.58	0.29	0.03	0.10
TG 52:4	ME474141	0.14	6.59	0.83	0.22	0.56	0.31	0.03	0.10
TG 52:5	ME474142	0.21	6.70	1.00	0.20	0.33	0.23	0.03	0.10
TG 56:2	ME474154	0.22	6.79	0.88	0.14	0.55	0.19	0.01	0.03
TG 50:2	ME474135	0.13	6.83	0.77	0.24	0.48	0.27	0.02	0.07
TG 54:4	ME474148	0.17	6.76	0.79	0.25	0.47	0.27	0.04	0.08
TG 54:2	ME474146	0.19	6.89	0.80	0.22	0.43	0.20	0.03	0.06
TG 54:5	ME474149	0.24	6.87	0.80	0.22	0.36	0.25	0.04	0.08
TG 48:1	ME474132	0.12	6.07	0.73	0.23	0.95	0.48	0.02	0.09
TG 52:1	ME474138	0.17	6.38	0.75	0.20	0.75	0.37	0.02	0.13
TG 54:6	ME474150	0.43	6.06	1.31	0.23	0.28	0.24	0.06	0.09
TG 50:4	ME474137	0.12	6.13	1.14	0.31	0.51	0.26	0.05	0.14
TG 56:4	ME474155	0.32	6.15	1.01	0.28	0.52	0.33	0.04	0.08
TG 56:5	ME474156	0.35	6.14	1.06	0.29	0.45	0.30	0.04	0.08
TG 52:7	ME474144	0.21	3.44	2.92	0.33	0.64	0.26	0.06	0.18
TG 56:7	ME474158	0.67	4.12	1.83	0.33	0.71	0.55	0.05	0.10
TG 54:7	ME474151	0.48	4.39	2.38	0.25	0.40	0.29	0.04	0.09
TG 52:6	ME474143	0.29	4.07	2.32	0.32	0.55	0.42	0.07	0.20
TG 56:8	ME474159	0.64	4.04	2.33	0.20	0.55	0.43	0.03	0.07
CE 22:1	ME474087	0.09	4.77	0.23	2.34	0.31	0.44	0.02	0.19
CE 24:2	ME474091	0.08	4.12	0.42	2.59	0.25	0.59	0.01	0.18
CE 18:1	ME474082	0.37	3.51	0.29	1.95	0.31	0.61	0.28	1.06
CE 20:2	ME474085	0.63	3.72	0.38	1.93	0.33	0.41	0.29	0.67
CE 20:1	ME474084	0.74	3.06	0.27	2.52	0.37	0.42	0.15	0.71
CE 22:2	ME474088	0.37	3.28	0.53	2.24	0.56	0.64	0.11	0.44
CE 24:1	ME474090	0.02	5.02	0.20	1.40	0.63	1.31	0.00	0.02
DG 36:2	ME474112	0.32	4.37	0.68	0.94	0.58	1.37	0.09	0.21
TG 48:0	ME474131	0.31	4.01	0.94	0.67	0.95	0.66	0.18	0.71
CE 18:0	ME474081	0.55	3.50	0.32	1.45	0.85	1.04	0.10	0.62
DG 34:1	ME474109	0.28	3.52	0.41	1.12	0.77	2.01	0.08	0.34
TG 54:8	ME474152	0.62	1.19	4.37	0.42	0.42	0.30	0.08	0.16
TG 56:9	ME474160	0.78	1.05	4.44	0.49	0.34	0.26	0.09	0.12
Cer 32:1;2O	ME474092	3.12	0.12	1.93	0.39	0.56	0.23	0.94	0.78
Cer 34:2;2O	ME474095	2.88	0.33	1.22	0.59	0.82	0.39	0.93	0.98
DG 40:3	ME474119	2.37	0.47	1.08	1.09	0.45	0.78	0.85	1.09
DG 40:4	ME474120	2.22	0.33	0.81	0.97	0.46	0.58	0.82	2.12
Cer 38:1;2O	ME474098	0.86	0.26	1.13	0.64	0.51	0.35	0.80	3.75
Cer 40:2;2O	ME474101	0.71	0.86	1.21	0.92	0.45	0.50	0.55	3.09
SM 38:1;2O	ME474128	0.51	0.76	0.60	1.25	0.44	0.42	0.90	3.39
Cer 36:1;2O	ME474096	1.98	0.10	0.87	0.53	0.43	0.27	1.91	2.00
SM 36:1;2O	ME474126	1.49	0.68	0.73	0.87	0.70	0.36	0.96	2.45
Cer 34:1;2O	ME474094	1.32	0.39	0.88	0.49	0.92	0.34	1.46	2.27
Cer 36:2;2O	ME474097	0.96	0.44	0.98	0.73	0.69	0.54	1.33	2.43
CE 20:3	ME474086	0.56	2.10	0.59	1.73	0.89	0.44	0.39	1.44
SM 34:1;2O	ME474124	0.43	2.27	0.71	1.22	1.17	0.78	0.28	1.35
SM 34:2;2O	ME474125	0.29	2.62	0.68	1.64	0.90	0.68	0.29	1.04
CE 22:3	ME474089	0.93	1.39	0.50	2.10	0.18	0.29	0.85	1.89
SM 32:1;2O	ME474123	0.34	1.62	0.99	1.52	0.88	0.45	0.22	2.11
SM 40:2;2O	ME474130	0.38	1.70	0.49	1.73	0.54	0.79	0.53	2.08
DG 40:6	ME474122	0.77	0.64	0.58	1.13	1.17	0.93	1.28	1.45
SM 38:4;2O	ME474129	0.76	1.16	0.73	0.91	0.83	0.63	1.62	1.34
DG 38:3	ME474115	1.05	1.32	0.91	1.83	0.73	0.77	0.48	0.92
DG 38:4	ME474116	0.91	0.65	1.00	1.78	0.67	0.48	0.82	1.60
DG 40:5	ME474121	1.16	0.86	0.87	1.46	0.71	0.77	0.63	1.65
SM 36:2;2O	ME474127	1.20	0.75	0.96	1.51	0.62	0.57	0.81	1.62
CE 18:2	ME474083	0.98	0.44	1.91	0.60	1.23	0.71	0.34	1.78
Cer 40:1;2O	ME474100	0.29	1.03	1.64	1.01	0.98	0.86	0.32	1.87
Cer 40:0;2O	ME474099	0.25	0.79	0.74	1.37	1.81	0.93	0.28	1.77
Cer 32:2;2O	ME474093	0.93	1.04	1.30	1.09	1.44	0.52	0.64	0.88
Cer 42:2;2O	ME474103	0.23	1.54	1.35	1.48	1.30	1.00	0.15	0.85
Cer 42:3;2O	ME474104	0.27	1.31	1.22	1.68	0.88	1.04	0.24	1.37
DG 32:0	ME474107	0.09	3.02	0.13	0.71	1.04	3.36	0.07	0.26
Cer 44:1;2O	ME474105	0.05	0.73	0.60	0.66	3.62	1.56	0.05	0.41
DG 40:1	ME474117	0.09	1.31	0.62	1.12	2.37	2.17	0.09	0.15
Cer 42:1;2O	ME474102	0.09	1.71	1.00	1.04	2.28	1.07	0.08	0.59
Cer 44:2;2O	ME474106	0.04	1.00	1.09	1.22	2.73	1.26	0.03	0.26
DG 34:0	ME474108	0.39	1.62	0.37	0.84	1.53	2.96	0.07	0.62
DG 36:0	ME474110	0.51	1.40	0.52	0.86	1.51	2.46	0.23	0.80
DG 38:1	ME474113	0.52	1.52	0.92	1.19	1.73	1.62	0.14	0.36
DG 40:2	ME474118	0.35	2.05	1.16	1.34	1.46	1.34	0.10	0.19
DG 36:1	ME474111	1.06	1.86	1.02	1.13	0.91	1.34	0.23	0.69
DG 38:2	ME474114	0.97	2.59	1.18	1.05	0.79	1.36	0.10	0.25

Factors:

F1	Genotype:BE 1
F2	Genotype:BE 2
F3	Genotype:CHLA 122
F4	Genotype:CHLA 136
F5	Genotype:CHLA 15
F6	Genotype:CHLA 20
F7	Genotype:COGN 144
F8	Genotype:COGN 145

Data matrix