Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST002135)

Reversed phase NEGATIVE ION MODE (Analysis AN003495)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19	F20	F21	F22	F23	F24	F25	F26	F27	F28	F29	F30	F31
Cer[NS] 32:1	ME518207	NA	1.14	1.27	1.29	1.26	1.12	1.11	1.36	1.20	1.39	1.06	1.22	1.31	1.15	1.20	0.82	1.79	1.27	1.19	NA	1.19	NA	1.03	0.65	0.37	0.41	0.55	0.40	0.66	0.43	0.48
Cer[EODS] 53:0	ME518193	NA	0.98	0.84	0.82	0.83	0.89	0.75	0.56	0.63	1.25	1.08	1.02	0.83	0.77	0.96	1.06	0.98	0.98	0.80	NA	0.85	NA	0.74	1.23	1.58	1.10	1.09	1.37	1.09	1.46	0.85
Cer[NP] 34:0	ME518201	NA	0.83	0.87	1.31	1.07	1.03	0.93	0.54	0.76	1.13	1.17	1.22	1.28	0.86	1.63	0.53	0.96	1.18	1.14	NA	1.50	NA	1.50	0.77	0.59	0.58	0.64	0.77	0.67	0.44	0.60
Cer[AS] 42:2_R2	ME518190	NA	1.58	1.54	1.56	1.38	1.23	1.16	3.55	1.22	1.13	1.06	1.30	1.25	1.18	1.08	1.23	1.51	1.24	1.08	NA	1.23	NA	1.15	0.29	0.20	0.32	0.32	0.27	0.46	0.09	0.52
Cer[NDS] 40:0_R1	ME518197	NA	1.26	1.40	1.27	1.19	1.29	1.27	1.40	1.23	0.77	0.81	0.90	0.77	0.71	0.85	0.72	1.04	0.80	0.96	NA	1.25	NA	1.16	0.90	0.86	0.85	0.88	0.81	0.92	0.78	0.71
Cer[NP] 41:0	ME518204	NA	1.43	1.58	1.41	1.11	1.65	1.13	3.45	0.75	1.19	0.86	1.09	1.08	1.08	0.99	1.21	1.28	0.87	1.05	NA	1.41	NA	1.32	0.31	0.42	0.40	0.38	0.39	0.63	0.54	0.39
Cer[NS] 37:1	ME518219	NA	1.13	1.04	1.10	1.27	1.02	0.97	1.52	0.89	1.08	0.93	0.92	1.06	0.96	0.96	1.18	1.04	0.96	0.85	NA	1.17	NA	0.90	0.88	1.02	0.88	0.87	0.97	0.94	0.91	0.89
Cer[EODS] 49:1	ME518191	NA	1.60	1.30	1.67	1.27	1.88	1.37	2.50	2.18	1.08	0.98	1.20	0.87	1.01	0.95	1.03	0.92	0.94	0.67	NA	0.63	NA	0.71	0.57	0.52	0.43	0.48	0.66	0.71	0.72	0.96
Cer[NS] 36:1_R1	ME518216	NA	1.44	1.27	1.44	1.71	1.55	1.31	2.10	1.35	0.87	0.91	1.08	0.90	1.01	0.80	0.99	0.87	0.95	0.98	NA	1.01	NA	0.98	0.62	0.57	0.61	0.65	0.51	0.77	0.56	0.85
Cer[NS] 35:1_R2	ME518214	NA	0.89	0.91	0.94	0.92	0.87	0.91	0.95	0.84	1.00	0.98	0.97	0.96	0.97	0.92	1.04	1.10	0.99	0.77	NA	1.00	NA	0.94	1.08	1.29	1.14	1.14	1.16	1.17	1.13	1.01
Cer[NP] 38:0	ME518202	NA	1.57	0.89	1.39	1.64	1.18	1.12	2.81	1.42	1.23	1.12	1.28	1.16	0.98	0.87	0.61	1.25	0.86	1.16	NA	1.40	NA	1.14	0.48	0.38	0.40	0.54	0.52	0.72	0.33	0.45
Cer[NDS] 42:0	ME518199	NA	1.17	1.24	1.24	1.18	1.14	1.25	1.39	0.75	0.74	0.82	0.99	0.75	0.71	0.76	0.75	0.96	0.99	0.88	NA	0.99	NA	0.95	1.08	1.07	1.04	1.07	0.91	1.00	1.07	0.94
Cer[NS] 38:1_R1	ME518220	NA	1.48	1.52	1.62	1.58	1.62	1.38	2.27	1.30	1.03	1.03	1.03	1.15	1.06	1.03	1.07	1.15	0.95	1.02	NA	1.10	NA	1.10	0.34	0.32	0.31	0.39	0.31	0.60	0.23	0.49
Cer[NP] 40:0	ME518203	NA	1.23	1.17	1.20	1.34	1.21	1.02	1.34	1.06	1.27	1.18	1.10	1.22	1.15	1.36	1.10	1.35	0.97	1.32	NA	2.05	NA	1.40	0.29	0.30	0.27	0.30	0.41	0.60	0.14	0.34
Cer[NP] 42:0	ME518205	NA	1.21	1.19	1.19	1.16	1.22	0.98	1.27	1.10	1.43	1.22	1.08	1.20	1.12	1.24	0.98	1.35	1.06	1.58	NA	1.99	NA	1.36	0.32	0.29	0.31	0.36	0.36	0.51	0.21	0.31
Cer[NS] 36:1_R2	ME518217	NA	1.27	1.15	1.59	1.78	1.47	1.44	1.76	1.58	0.86	0.80	1.24	1.08	0.90	0.82	1.16	0.96	0.82	0.97	NA	1.03	NA	1.04	0.68	0.56	0.55	0.60	0.58	0.66	0.43	0.99
Cer[NS] 34:2	ME518212	NA	1.11	1.04	0.98	1.28	1.08	0.97	1.13	1.18	0.99	1.28	1.14	0.96	1.02	0.93	1.07	1.25	0.73	1.32	NA	1.12	NA	1.12	0.94	0.80	0.73	0.83	0.60	0.92	1.01	0.92
Cer[NS] 36:2	ME518218	NA	1.16	1.16	1.19	1.39	1.26	1.21	1.42	0.62	0.86	0.97	1.05	0.84	1.03	0.65	0.97	1.20	0.95	0.90	NA	1.05	NA	0.98	0.82	0.77	0.94	0.94	0.91	0.98	0.52	1.17
Cer[NS] 33:1	ME518208	NA	0.88	1.02	1.02	1.01	0.82	0.86	0.75	1.10	0.98	0.89	1.26	1.01	0.95	0.97	1.12	1.22	0.99	0.98	NA	1.08	NA	1.25	0.94	1.10	0.96	1.10	1.01	1.09	0.97	0.74
Cer[NS] 34:1_R2	ME518210	NA	0.97	0.94	1.24	1.19	1.00	1.11	1.36	0.65	0.83	0.80	1.22	0.91	0.94	1.02	0.79	1.27	1.06	1.06	NA	1.03	NA	1.11	0.94	0.98	0.93	0.96	0.96	0.95	1.05	0.76
Cer[NDS] 42:1	ME518200	NA	1.37	1.52	1.30	1.32	1.45	1.36	1.46	1.31	1.09	1.05	1.13	0.97	0.99	1.00	1.07	1.18	1.17	1.13	NA	1.38	NA	1.23	0.40	0.40	0.37	0.47	0.48	0.66	0.39	0.54
Cer[NS] 35:1_R3	ME518215	NA	0.92	0.95	0.96	0.94	0.91	0.88	0.84	0.85	1.00	0.97	0.98	0.96	0.99	0.93	0.99	1.11	0.98	0.78	NA	0.96	NA	0.96	1.09	1.22	1.17	1.07	1.15	1.18	1.06	1.04
Cer[AS] 41:1	ME518188	NA	1.62	1.50	1.12	1.62	1.38	1.20	3.13	0.82	1.46	0.98	1.21	0.97	0.95	0.87	1.62	1.55	1.38	1.36	NA	1.17	NA	0.95	0.29	0.33	0.34	0.33	0.47	0.57	0.21	0.37
Cer[NS] 35:1_R1	ME518213	NA	0.96	0.94	1.23	1.18	0.99	1.10	1.35	0.65	0.83	0.80	1.21	0.90	0.93	1.02	0.79	1.26	1.05	1.05	NA	1.02	NA	1.10	0.93	0.98	0.99	0.96	0.96	1.06	1.04	0.76
Cer[NDS] 34:0	ME518195	NA	1.24	1.07	1.15	1.30	1.09	0.97	1.73	1.44	0.88	0.87	1.03	0.89	0.83	0.85	0.83	1.08	0.92	1.01	NA	1.02	NA	1.06	0.93	0.91	0.87	1.01	0.89	0.99	1.06	1.08
Cer[EODS] 57:2	ME518194	NA	1.13	1.10	1.24	1.26	1.45	1.17	1.24	0.85	1.26	1.14	1.31	1.44	1.27	1.31	0.35	1.44	1.21	1.19	NA	1.19	NA	0.98	0.40	0.43	0.33	0.43	0.56	0.69	0.49	0.47
Cer[EODS] 51:3	ME518192	NA	1.95	1.89	1.43	1.15	1.29	1.47	1.97	1.31	0.75	1.08	0.78	1.14	1.10	1.03	0.77	2.33	1.02	0.56	NA	0.81	NA	0.92	0.42	0.35	0.63	0.60	0.48	0.73	0.29	0.53
Cer[NDS] 40:0_R2	ME518198	NA	1.27	1.31	1.27	1.32	1.18	1.17	1.30	0.99	0.78	0.76	0.95	0.86	0.68	0.96	0.60	0.98	0.83	1.02	NA	1.19	NA	1.12	1.01	0.87	0.82	0.99	0.78	0.86	0.84	0.67
Cer[NS] 34:1_R3	ME518211	NA	1.17	1.14	1.23	1.07	1.13	1.16	1.00	1.09	1.13	1.07	1.16	1.00	0.99	0.96	0.67	1.08	1.03	1.04	NA	1.00	NA	1.03	0.78	0.68	0.77	0.76	0.70	1.06	1.16	1.07
Cer[NDS] 36:0	ME518196	NA	1.29	1.22	1.18	1.42	1.21	1.15	1.90	1.15	0.49	0.67	0.83	0.56	0.68	0.55	0.61	0.74	0.56	0.67	NA	0.80	NA	0.81	1.22	1.31	1.34	1.31	1.17	1.10	0.99	1.14
Cer[AS] 42:2_R1	ME518189	NA	1.20	1.40	1.49	1.39	1.30	1.07	2.49	0.85	1.41	1.38	1.51	1.14	1.30	1.16	1.05	1.57	1.32	1.06	NA	1.37	NA	1.07	0.31	0.28	0.24	0.26	0.22	0.45	0.15	0.46
Cer[NP] 42:1	ME518206	NA	1.28	0.97	1.01	1.26	1.02	0.92	1.87	0.71	1.31	1.43	1.17	1.53	1.09	1.25	0.92	1.26	1.03	1.21	NA	1.47	NA	1.18	0.50	0.43	0.48	0.52	0.53	0.72	0.62	0.40
Cer[AS] 34:1	ME518187	NA	0.97	0.75	0.75	1.22	0.69	0.81	0.51	0.25	1.20	1.39	1.03	1.19	1.02	0.92	1.02	1.34	1.10	0.45	NA	0.91	NA	1.00	0.82	0.84	1.47	0.61	2.03	1.14	0.44	0.77
Cer[NS] 34:1_R1	ME518209	NA	0.88	1.02	1.02	1.01	0.82	0.86	0.75	1.10	0.98	0.89	1.26	1.01	0.95	0.97	1.12	1.22	0.99	0.98	NA	1.08	NA	1.25	0.94	1.10	0.96	1.10	1.01	1.09	0.97	0.74

Factors:

F1	SampleType:- \| BATCH:- \| LIPIDOMICS_BATCH:-
F2	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F3	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F4	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F5	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F6	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F7	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F8	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F9	SampleType:Delivery maternal plasma \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F10	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F11	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F12	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F13	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F14	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F15	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F16	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F17	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F18	SampleType:First trimester maternal plasma \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F19	SampleType:POOLED \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F20	SampleType:POOLED \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:#N/A
F21	SampleType:POOLED \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F22	SampleType:POOLED \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:#N/A
F23	SampleType:POOLED \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F24	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F25	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F26	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:1 \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F27	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F28	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:2
F29	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:2 \| LIPIDOMICS_BATCH:3
F30	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:1
F31	SampleType:Umbilical cord blood \| BATCH:#N/A \| LIPIDOMICS_BATCH:3

Data matrix