Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001903)

(Analysis AN003815)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19	F20	F21	F22	F23	F24
Aspartic acid	ME557587	0.09	0.51	0.05	0.35	0.06	0.40	0.06	2.10	0.05	1.95	0.03	2.08	0.11	4.28	0.07	4.66	0.11	4.74	0.03	1.03	0.03	1.22	0.04	1.24
Taurodeoxycholic acid	ME557643	0.05	0.02	0.15	0.63	0.05	0.08	0.26	0.03	2.28	0.06	1.65	0.09	0.90	0.14	3.90	0.35	3.42	0.33	0.80	0.10	2.63	0.38	7.56	0.92
Taurocholic acid	ME557642	0.30	0.27	1.16	3.17	1.09	1.26	0.39	0.07	2.40	0.09	0.94	0.08	0.30	0.05	2.00	0.13	2.22	0.16	0.52	0.05	3.37	0.50	4.13	1.45
Tauromuricholic acid	ME557644	0.31	0.34	1.17	5.56	0.99	1.76	0.28	0.08	2.11	0.07	0.77	0.07	0.24	0.05	1.11	0.06	1.84	0.10	0.55	0.05	3.72	0.33	3.19	1.05
Spermine	ME557637	NA	0.32	NA	0.57	NA	0.30	NA	0.38	NA	0.41	NA	0.39	NA	0.54	NA	1.18	NA	1.99	NA	1.71	NA	1.53	NA	4.59
Putrescine	ME557632	0.35	1.12	0.24	0.83	0.28	1.06	0.40	0.86	0.31	0.65	0.28	0.69	0.44	0.82	0.23	0.82	0.28	0.68	0.39	5.92	0.31	5.10	0.33	6.18
Creatinine	ME557595	0.74	0.82	0.76	0.90	0.71	0.88	0.54	0.55	0.68	0.54	0.62	0.47	0.65	1.34	0.54	1.68	0.55	1.51	0.60	2.99	0.55	3.39	0.62	3.42
beta-Alanine	ME557588	0.20	1.75	0.18	1.48	0.18	1.61	0.16	1.05	0.21	1.02	0.18	1.09	0.16	0.95	0.13	1.05	0.17	0.91	0.17	3.64	0.15	4.67	0.19	5.05
gamma-Aminobutyric acid	ME557604	0.14	1.47	0.13	1.30	0.15	1.27	0.11	1.25	0.15	1.22	0.14	1.27	0.20	1.55	0.13	1.55	0.18	1.31	0.13	4.41	0.14	3.64	0.17	3.86
3-Aminobutyric acid	ME557576	0.06	0.02	3.30	1.03	3.37	1.12	0.03	0.01	1.69	0.43	2.01	0.54	0.05	0.01	1.86	0.92	1.85	0.90	0.06	0.02	1.67	0.63	2.37	0.89
p-Cresol sulfate	ME557627	2.08	0.22	1.14	0.15	2.52	0.39	1.95	0.12	0.59	0.14	0.11	0.02	3.74	0.10	0.91	0.05	1.74	0.08	3.71	0.32	1.66	0.19	2.05	0.08
Cystine	ME557597	2.14	0.02	2.10	0.03	1.28	0.01	2.00	0.01	1.96	0.02	1.77	0.01	1.92	0.01	1.74	0.04	2.22	0.01	2.55	0.04	1.85	0.03	1.35	0.02
Indoxyl sulfate	ME557616	1.52	0.10	1.61	0.13	1.94	0.17	1.20	0.05	1.51	0.12	1.04	0.08	1.88	0.05	2.85	0.11	2.70	0.09	2.18	0.15	2.20	0.13	2.68	0.07
Homoarginine	ME557612	2.42	0.36	1.27	0.23	1.26	0.26	3.45	0.55	1.94	0.28	1.72	0.28	1.99	0.31	0.80	0.17	0.91	0.18	2.00	0.33	0.89	0.19	0.73	0.16
Serotonin	ME557635	1.95	0.11	0.86	0.07	1.33	0.09	3.35	0.06	2.19	0.04	0.75	0.04	3.82	0.06	1.53	0.12	1.93	0.04	1.58	0.13	1.40	0.08	2.04	0.08
Homocysteine	ME557613	0.95	1.36	1.13	1.82	1.00	1.91	0.97	0.83	1.30	0.93	1.06	0.76	0.88	0.54	0.89	0.74	0.94	0.62	0.94	0.53	0.94	0.96	0.91	0.60
1-Methylhistidine	ME557574	0.78	0.46	2.02	1.52	1.97	1.53	0.66	0.27	1.40	0.53	1.34	0.57	0.73	0.68	1.18	1.59	1.03	1.17	0.78	0.37	0.94	0.66	1.16	0.86
3-Methylhistidine	ME557579	0.68	0.67	1.23	1.52	1.59	1.97	0.67	0.47	1.08	0.61	0.95	0.64	0.69	0.90	0.84	1.46	1.00	1.37	0.87	0.75	0.90	1.14	1.05	1.40
Citrulline	ME557594	1.20	0.65	1.53	1.03	1.47	1.02	0.98	0.54	1.61	0.71	1.31	0.68	0.86	0.88	1.02	1.17	1.12	1.31	0.89	0.38	1.11	0.67	1.11	0.68
Symmetric dimethyl-arginine	ME557639	1.43	0.79	1.48	0.99	1.50	1.08	0.99	0.42	1.33	0.55	1.15	0.50	1.11	0.51	1.15	0.75	1.22	0.69	1.23	0.83	1.19	0.91	1.37	0.97
alpha-Aminoadipic acid	ME557582	1.57	1.06	0.83	0.53	0.82	0.60	1.41	1.27	1.00	0.75	0.99	0.84	1.95	1.07	1.05	0.51	1.07	0.54	1.55	1.07	0.85	0.74	0.76	0.68
Valine	ME557651	1.87	0.93	0.87	0.57	0.96	0.67	1.80	0.68	1.21	0.44	0.96	0.46	1.54	1.43	0.80	0.96	0.81	0.88	1.48	0.99	0.94	0.80	0.94	0.83
Isoleucine	ME557617	1.74	0.83	1.04	0.51	1.14	0.63	1.60	0.72	1.34	0.53	1.12	0.52	1.44	1.04	0.83	0.79	0.94	0.78	1.52	0.99	1.11	0.78	1.05	0.86
Leucine	ME557620	1.65	0.82	1.01	0.52	1.05	0.62	1.57	0.79	1.27	0.59	1.05	0.55	1.43	1.05	0.85	0.81	0.99	0.78	1.57	1.05	1.14	0.84	1.06	0.87
Lactic acid	ME557619	1.16	0.83	0.78	0.59	0.81	0.59	0.93	1.07	0.86	0.86	0.90	0.83	1.51	1.37	0.93	1.23	1.18	1.14	0.96	1.20	1.04	1.23	1.24	1.25
Methionine	ME557623	0.93	0.85	0.88	0.81	0.96	0.97	1.20	0.85	1.76	0.87	1.15	0.78	1.07	1.34	1.00	1.35	0.91	1.18	0.84	0.78	0.88	0.81	0.85	0.81
Tyrosine	ME557650	1.07	0.92	0.87	0.83	0.92	0.95	1.23	0.83	1.32	0.68	1.03	0.67	1.21	1.39	0.95	1.45	0.88	1.22	0.98	0.98	0.88	0.96	0.88	0.96
Dimethylarginine	ME557600	1.20	1.17	0.99	1.16	1.02	1.23	1.06	0.74	1.09	0.65	0.98	0.66	1.15	0.75	0.98	0.98	1.03	0.83	1.03	1.16	0.92	1.22	0.89	1.16
Histidine	ME557611	1.13	1.01	1.10	0.95	1.10	1.06	1.11	0.76	1.23	0.63	1.08	0.66	1.05	1.13	0.88	1.12	0.99	1.06	1.09	1.06	0.93	0.93	0.96	0.98
Phenylalanine	ME557629	1.40	0.90	1.13	0.82	1.17	0.94	1.27	0.67	1.11	0.51	0.92	0.50	1.26	1.07	0.93	1.28	0.97	0.98	1.31	1.03	1.01	0.97	0.98	1.01
DHA	ME557599	1.37	0.70	1.50	1.00	1.59	1.33	0.83	0.35	1.41	0.51	1.23	0.55	1.10	0.23	1.09	0.64	1.79	0.40	0.74	1.05	0.90	1.84	1.22	0.69
Arachidonic acid	ME557584	0.69	0.89	0.98	1.21	1.15	1.42	0.90	0.78	1.18	0.80	0.97	0.86	0.90	0.51	0.83	1.28	1.25	0.96	0.57	1.52	0.58	2.12	0.81	1.13
Serine	ME557634	0.84	0.53	0.93	0.49	0.93	0.53	0.94	1.07	1.34	1.08	1.09	1.12	0.92	0.72	1.04	1.07	1.20	0.97	0.86	1.48	0.96	1.73	0.90	1.82
Phenylacetylglycine	ME557628	1.11	0.21	1.28	1.04	1.36	1.08	1.25	0.46	0.68	0.74	1.04	0.83	2.11	0.13	0.71	0.42	0.86	0.31	1.95	2.20	1.39	1.27	1.12	0.34
Eicosatrienoic acid	ME557602	0.72	0.86	1.15	1.43	0.90	2.07	1.07	0.80	0.95	0.37	0.86	0.35	2.23	0.31	1.23	0.81	1.34	0.22	1.14	1.10	1.02	1.40	1.08	0.34
Heneicosenoic acid	ME557608	0.96	0.61	1.02	0.80	0.88	1.21	1.38	0.40	0.95	0.23	0.87	0.20	1.92	0.75	1.85	1.01	1.60	0.63	1.76	1.00	1.20	1.33	1.35	0.66
Glutamine	ME557606	1.34	0.44	1.37	0.32	1.33	0.33	1.20	1.07	1.49	1.07	1.30	1.07	1.19	0.58	1.44	0.85	1.49	0.70	1.23	0.32	1.38	0.47	1.27	0.44
Linoleic acid	ME557621	1.35	0.42	1.74	0.76	2.16	0.91	1.28	0.18	1.60	0.26	1.72	0.28	1.42	0.21	1.32	0.50	1.68	0.29	1.14	0.51	1.19	0.86	1.79	0.42
Oleic acid	ME557625	1.36	0.52	1.32	0.55	1.63	0.71	1.62	0.45	1.14	0.36	1.26	0.33	1.74	0.50	1.56	0.69	1.75	0.43	1.15	0.70	1.20	0.99	1.68	0.54
Ornithine	ME557626	1.78	0.66	1.42	0.55	1.46	0.58	1.77	0.26	1.92	0.25	1.36	0.33	1.87	0.32	1.28	0.46	1.52	0.38	1.55	0.52	1.24	0.45	1.24	0.36
Lysine	ME557622	1.99	0.61	1.29	0.45	1.42	0.52	2.24	0.58	1.60	0.34	1.26	0.34	1.91	0.49	1.01	0.43	1.09	0.39	1.72	0.65	1.09	0.49	0.98	0.48
Tryptophan	ME557649	1.94	0.60	1.37	0.44	1.23	0.44	2.04	0.41	1.36	0.25	1.20	0.24	1.99	0.63	1.33	0.58	1.43	0.54	1.79	0.47	1.36	0.39	1.29	0.38
Arginine	ME557585	2.13	0.19	1.78	0.15	1.80	0.20	1.60	0.36	1.57	0.31	1.54	0.27	1.83	0.39	1.38	0.50	1.50	0.45	1.62	0.41	1.46	0.49	1.34	0.59
cis-Aconitic acid	ME557593	2.17	0.20	1.71	0.11	1.84	0.13	1.50	0.25	1.56	0.29	1.52	0.23	1.43	0.18	1.67	0.27	1.92	0.34	1.46	0.37	1.76	0.51	1.86	0.59
Betaine	ME557589	0.87	0.29	1.24	0.82	1.53	1.20	0.83	0.20	1.77	0.51	2.17	1.02	0.82	0.36	1.17	1.04	1.49	1.43	0.81	0.08	1.30	0.35	1.52	0.64
Succinic acid	ME557638	0.54	0.41	1.07	0.30	1.30	0.45	0.58	0.72	1.89	0.79	2.08	0.67	1.10	0.64	1.57	0.44	2.63	0.64	1.43	0.32	1.35	0.52	2.23	0.53
Trigonelline	ME557648	2.42	NA	0.75	NA	0.77	NA	1.51	NA	0.60	NA	0.60	NA	0.80	NA	1.04	NA	0.77	NA	1.11	NA	0.51	NA	0.49	NA
3-Indolepropionic acid	ME557578	1.04	NA	0.86	NA	0.87	NA	0.63	NA	0.65	NA	0.53	NA	0.85	NA	2.74	NA	1.73	NA	0.61	NA	0.54	NA	0.96	NA
Tetradecanedioic acid	ME557645	0.45	NA	0.49	NA	1.17	NA	0.44	NA	1.38	NA	1.35	NA	0.48	NA	1.53	NA	1.73	NA	0.49	NA	1.20	NA	1.56	NA
EPA	ME557603	0.91	NA	1.32	NA	1.57	NA	0.32	NA	0.78	NA	0.73	NA	0.82	NA	1.17	NA	1.65	NA	0.60	NA	0.98	NA	1.41	NA
Hippuric acid	ME557609	1.22	NA	1.24	NA	1.22	NA	1.23	NA	1.02	NA	0.93	NA	0.70	NA	0.86	NA	0.77	NA	0.66	NA	1.10	NA	0.95	NA
Indoleacetic acid	ME557615	0.91	NA	0.91	NA	0.98	NA	0.74	NA	1.07	NA	0.75	NA	1.42	NA	1.46	NA	1.34	NA	0.77	NA	0.76	NA	0.83	NA
Kynurenine	ME557618	1.25	NA	0.72	NA	0.88	NA	0.89	NA	0.79	NA	0.60	NA	1.19	NA	1.06	NA	1.13	NA	1.44	NA	0.97	NA	1.19	NA
Cholic acid	ME557591	0.11	NA	0.10	NA	0.08	NA	0.72	NA	2.66	NA	1.71	NA	0.56	NA	0.30	NA	1.69	NA	0.58	NA	0.64	NA	3.29	NA
Deoxycholic acid	ME557598	0.03	NA	0.07	NA	0.04	NA	0.33	NA	0.90	NA	0.70	NA	0.53	NA	2.06	NA	2.16	NA	0.61	NA	1.43	NA	3.42	NA
Taurochenodeoxycholic acid	ME557641	0.23	NA	0.70	NA	0.70	NA	0.18	NA	1.44	NA	0.56	NA	0.20	NA	1.28	NA	1.90	NA	0.52	NA	2.82	NA	2.92	NA
5-Aminopentanoic acid	ME557580	1.47	1.80	1.18	1.47	1.55	1.69	0.11	0.25	0.54	0.57	0.67	0.64	0.36	0.40	0.14	0.21	0.28	0.35	1.81	2.17	1.10	1.96	1.84	2.42
Anserine	ME557583	0.32	0.50	0.31	0.99	0.45	1.24	0.20	1.28	0.23	1.76	0.24	1.15	0.37	1.39	0.33	3.76	0.41	3.17	0.14	0.78	0.14	3.85	0.17	2.62
Eicosadienoic acid	ME557601	1.23	0.83	0.66	1.74	0.55	2.59	1.17	0.47	0.77	0.22	0.52	0.28	1.37	1.14	0.76	1.68	0.82	1.03	0.61	1.39	0.60	2.54	0.64	0.91
Histamine	ME557610	0.81	0.64	0.51	1.08	0.56	1.63	0.64	0.46	0.54	0.89	0.33	0.55	0.83	1.64	0.60	3.67	0.69	1.27	0.63	1.59	0.43	2.44	0.67	2.31
Glutamic acid	ME557605	0.10	1.65	0.07	1.50	0.07	1.54	0.08	2.39	0.08	2.16	0.06	2.23	0.11	2.45	0.09	2.38	0.12	2.20	0.05	1.24	0.05	1.73	0.06	1.69
Proline betaine	ME557631	0.30	0.68	0.56	0.92	0.49	0.94	0.28	1.62	0.64	1.78	0.43	1.60	0.69	0.84	1.06	1.17	0.87	0.93	0.96	1.38	1.50	2.15	1.04	2.45
Cysteine	ME557596	0.46	1.02	0.43	0.86	0.39	0.81	0.51	1.93	0.46	1.55	0.48	1.51	0.40	1.15	0.39	2.31	0.39	0.97	0.52	2.49	0.36	3.03	0.31	2.22
Spermidine	ME557636	0.15	1.62	0.13	1.34	0.13	1.46	0.27	2.68	0.25	2.47	0.13	2.54	0.25	1.23	0.17	0.99	0.19	1.35	0.14	2.33	0.17	2.71	0.18	2.17
3-Hydroxyglutaric acid	ME557577	NA	0.82	NA	0.58	NA	0.74	NA	1.23	NA	1.28	NA	0.98	NA	1.09	NA	0.98	NA	0.83	NA	1.10	NA	1.14	NA	1.39
Hypoxanthine	ME557614	NA	1.48	NA	1.57	NA	1.14	NA	0.98	NA	0.50	NA	0.66	NA	0.53	NA	1.22	NA	0.76	NA	0.95	NA	1.05	NA	1.20
Xanthine	ME557652	NA	1.17	NA	1.33	NA	1.03	NA	0.80	NA	0.60	NA	0.59	NA	0.55	NA	1.47	NA	0.86	NA	1.38	NA	1.26	NA	1.27
trans-4-Hydroxyproline	ME557647	0.81	1.14	0.95	1.63	1.00	1.71	0.79	1.40	1.03	1.52	0.85	1.42	0.54	1.17	0.51	1.52	0.55	1.37	0.56	0.54	0.44	0.64	0.46	0.73
Threonine	ME557646	0.93	1.16	0.76	0.96	0.78	1.08	1.26	2.13	0.83	1.02	0.69	1.08	0.87	1.89	0.60	1.23	0.61	1.24	0.79	0.93	0.64	0.78	0.56	0.72
Sarcosine	ME557633	1.14	1.02	0.76	0.77	0.82	0.98	0.81	1.63	1.22	1.02	0.96	1.00	1.02	1.37	0.93	1.38	0.96	1.49	1.18	0.40	0.83	0.45	0.91	0.47
Alanine	ME557581	0.82	0.78	0.74	0.72	0.67	0.74	0.96	1.43	1.17	0.97	0.84	0.89	0.96	2.09	1.03	1.84	0.98	1.74	0.95	0.73	0.91	0.79	0.78	0.77
Methionine sulfoxide	ME557624	0.69	0.55	0.73	0.52	1.11	0.77	1.21	1.12	1.78	0.88	1.22	1.08	0.83	1.63	0.96	1.85	0.79	1.57	0.70	0.66	0.84	0.78	0.84	0.87
2-Aminobutyric acid	ME557575	0.75	0.68	0.69	0.84	0.90	1.12	0.84	1.17	1.36	1.77	0.91	1.30	0.90	1.94	0.73	1.39	0.84	1.54	0.77	0.63	0.65	0.68	0.56	0.62
Asparagine	ME557586	0.68	0.93	0.76	0.86	0.74	0.96	0.80	1.42	1.15	1.30	0.84	1.30	0.72	1.29	0.82	1.69	0.80	1.55	0.72	1.01	0.83	1.05	0.75	1.00
Carnosine	ME557590	0.61	1.01	0.57	1.28	0.72	1.75	0.27	1.42	0.28	1.78	0.29	1.40	0.58	1.32	0.65	2.76	0.69	2.17	0.17	0.67	0.20	1.96	0.23	1.54
Glycine	ME557607	0.61	1.08	0.57	1.00	0.52	1.06	0.57	1.27	0.60	1.04	0.54	1.12	0.54	1.99	0.55	2.21	0.62	2.35	0.53	1.42	0.54	1.57	0.56	1.85
Taurine	ME557640	0.68	1.19	0.55	1.18	0.46	1.24	0.49	1.64	0.43	1.57	0.45	1.59	0.59	1.23	0.60	1.41	0.65	1.30	0.49	1.79	0.50	1.86	0.51	1.95
Choline	ME557592	0.64	1.57	0.73	1.32	0.73	1.30	0.39	1.89	0.83	1.19	0.97	1.34	0.70	1.08	0.50	1.58	0.63	1.21	0.69	1.37	0.45	1.02	0.45	1.00
Proline	ME557630	0.45	1.24	0.51	1.17	0.53	1.27	0.58	1.68	0.92	1.39	0.63	1.42	0.55	1.89	0.54	1.74	0.51	1.63	0.45	1.33	0.49	1.30	0.46	1.34

Factors:

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Data matrix