Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST002435)

(Analysis AN003967)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9
L-ANSERINE	ME576735	0.38	0.57	0.95	0.57	0.75	0.25	5.60	0.06	0.18
PHOSPHOCHOLINE	ME576688	0.94	0.19	2.45	0.95	0.57	0.66	3.96	0.10	0.12
L-GLUTAMIC_ACID	ME576673	0.98	0.48	1.83	0.89	0.80	0.67	3.53	0.09	0.17
4-IMIDAZOLEACETIC_ACID	ME576730	1.03	0.59	1.27	0.59	0.80	0.52	3.84	0.24	0.36
L-LYSINE	ME576651	1.28	0.62	1.47	0.78	1.03	0.37	3.22	0.08	0.26
PANTOTHENIC_ACID	ME576648	1.29	0.63	0.97	0.56	1.06	0.66	3.34	0.10	0.18
C3-CARNITINE	ME576639	0.79	0.55	0.68	0.81	1.19	0.63	3.69	0.13	0.19
C4-CARNITINE	ME576633	0.69	0.55	0.27	0.58	1.55	0.41	4.12	0.12	0.17
N(PAI)-METHYL-L-HISTIDINE	ME576684	0.36	1.14	1.14	0.52	1.07	0.05	4.24	0.07	0.28
UROCANATE	ME576668	0.55	0.29	1.14	0.60	1.45	0.27	4.34	0.22	0.32
5-OXO-L-PROLINE	ME576718	0.70	0.55	1.11	0.47	0.79	0.57	4.58	0.19	0.29
CARNOSINE	ME576739	0.63	0.70	1.04	0.60	0.83	0.40	4.64	0.05	0.26
Thiamine	ME576654	2.17	0.34	0.06	0.72	0.69	2.83	0.37	0.02	0.04
LPC(20:0)	ME576665	0.48	0.45	2.30	0.87	1.36	0.43	0.41	2.29	2.07
PAF-C18	ME576721	0.42	0.38	2.10	0.83	1.48	0.31	0.43	2.35	2.24
5-AMINOPENTANOATE	ME576658	1.04	2.42	0.59	0.90	0.95	0.72	1.21	0.08	0.51
REICHSTEINS_SUBSTANCE_S	ME576716	0.89	2.61	0.28	0.79	1.14	0.61	0.61	0.16	1.05
4-HYDROXY-L-PROLINE	ME576685	1.31	0.56	2.55	0.77	0.85	0.93	2.33	0.15	0.30
3-UREIDOPROPIONATE	ME576682	1.88	0.25	0.72	0.72	0.88	1.43	2.02	0.11	0.19
5,6-DIHYDROURACIL	ME576666	1.84	0.29	0.81	0.75	0.96	1.40	1.81	0.15	0.24
4-AMINOBUTANOATE	ME576650	1.60	0.68	0.95	0.74	0.92	1.32	1.76	0.18	0.32
L-ALANINE	ME576649	1.67	0.46	1.16	1.04	1.04	1.02	1.70	0.16	0.28
L-PROLINE	ME576608	1.44	0.63	1.21	0.98	1.11	0.98	1.73	0.19	0.37
TRIGONELLINE	ME576618	1.81	0.93	1.25	0.74	1.13	0.68	1.18	0.48	0.63
3-METHYLADENINE	ME576724	1.19	1.27	1.06	1.36	1.12	0.45	1.38	0.43	0.52
BETAINE	ME576594	0.99	0.82	1.32	1.03	1.21	1.10	1.35	0.55	0.57
PC(8:0)	ME576695	0.94	0.61	1.22	0.95	1.44	0.83	1.31	0.90	0.87
L-METHIONINE	ME576655	1.34	1.03	1.02	1.02	1.24	0.72	1.38	0.31	0.54
ALLANTOIN	ME576670	1.19	0.84	1.23	0.95	1.22	0.73	1.60	0.39	0.67
CREATININE	ME576600	1.29	0.89	0.96	0.79	1.22	0.83	1.60	0.38	0.66
LEUCINE_NORLEUCINE	ME576612	1.07	0.72	0.94	0.94	1.34	0.77	2.04	0.43	0.47
L-TYROSINE	ME576641	1.20	0.70	0.92	1.19	1.22	0.67	1.71	0.34	0.59
LPC(18:3)	ME576644	1.08	0.98	1.36	0.93	1.06	0.69	1.42	0.44	1.00
L-CARNITINE	ME576597	0.97	0.85	1.66	0.88	1.21	0.83	1.78	0.42	0.60
N-ACETYLPUTRESCINE	ME576736	1.30	0.86	1.75	0.97	1.00	0.69	1.67	0.48	0.58
HIPPURATE	ME576693	1.02	0.48	0.87	0.88	1.60	0.35	2.70	0.23	0.49
TAURINE	ME576606	0.89	0.61	1.24	0.97	1.30	0.67	2.63	0.25	0.38
C2-CARNITINE	ME576624	0.89	0.85	1.36	0.85	1.31	0.75	2.33	0.28	0.40
O-ACETYL-L-CARNITINE	ME576598	0.88	0.84	1.35	0.83	1.29	0.75	2.42	0.28	0.39
GUANIDINOACETATE	ME576713	0.95	1.02	1.54	0.95	0.87	0.67	2.60	0.30	0.39
GLYCINE	ME576720	1.04	0.58	1.43	0.80	1.05	0.83	2.82	0.19	0.33
DEOXYCARNITINE	ME576636	0.97	0.78	1.45	0.72	1.20	0.71	2.80	0.21	0.30
L-ARGININE	ME576637	1.09	0.90	1.38	0.79	1.06	0.61	2.75	0.08	0.35
L-SERINE	ME576686	1.16	0.59	1.85	0.85	1.00	0.78	2.57	0.20	0.33
SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE	ME576623	0.97	0.67	2.13	0.84	1.21	0.69	2.44	0.20	0.39
L-GLUTAMINE	ME576615	1.20	0.58	1.57	0.75	0.97	1.07	2.33	0.27	0.36
NEPSILON,NEPSILON,NEPSILON-TRIMET	ME576664	1.32	0.44	1.66	0.72	1.03	1.00	2.53	0.13	0.25
L-ASPARAGINE	ME576697	1.50	0.57	1.56	0.92	0.90	0.96	2.13	0.12	0.29
L-HISTIDINE	ME576630	1.23	0.64	1.50	0.88	1.11	0.74	2.28	0.18	0.42
L-THREONINE	ME576660	1.31	0.58	1.36	0.94	1.03	0.78	2.38	0.16	0.35
CYTOSINE	ME576628	1.23	0.67	0.97	0.73	1.04	0.95	2.37	0.31	0.45
BETA-ALANINE	ME576672	0.99	0.83	1.15	0.96	0.97	1.05	2.09	0.26	0.48
CREATINE	ME576605	0.96	0.83	1.18	0.95	0.95	1.03	2.22	0.25	0.47
C5-CARNITINE	ME576675	1.16	0.71	0.65	0.77	1.00	0.94	2.78	0.18	0.32
L-VALINE	ME576625	1.06	0.62	1.10	0.79	1.10	0.71	2.83	0.30	0.40
NALPHA-ACETYL-L-LYSINE	ME576707	1.03	0.46	0.87	0.76	1.21	0.81	2.64	0.20	0.59
CITRULLINE	ME576657	1.02	1.01	0.78	0.88	1.13	0.60	2.63	0.14	0.41
THYMINE	ME576712	0.94	0.91	0.81	0.74	0.98	0.67	2.63	0.55	0.67
PC(O-20:6/2:0)	ME576681	0.70	0.71	0.75	0.75	1.36	0.75	2.13	0.26	1.06
HISTAMINE	ME576663	0.65	1.33	0.65	0.85	1.30	1.01	2.19	0.14	0.37
SPERMIDINE	ME576728	0.46	1.03	0.55	1.28	1.21	1.11	2.04	0.42	0.40
LPC(22:6)	ME576634	0.83	0.84	0.98	0.90	1.43	0.80	1.25	0.33	1.15
LPC(20:4)	ME576626	0.91	0.77	0.81	0.88	1.42	0.82	1.24	0.42	1.16
PC(O-18:4/2:0)	ME576662	0.98	0.71	0.79	0.84	1.47	0.84	1.27	0.28	1.11
Acetylcholine	ME576737	0.78	1.20	0.70	0.93	1.41	0.52	1.65	0.54	0.91
C14-CARNITINE	ME576678	0.93	1.11	0.51	0.94	1.53	0.85	1.18	0.63	0.75
LAUROYLCARNITINE	ME576706	0.95	1.08	0.48	0.95	1.48	0.83	1.44	0.49	0.66
LPC(19:1)	ME576729	1.19	0.88	0.51	0.96	1.23	1.05	1.04	1.10	0.70
SM(42:2)	ME576643	1.09	1.18	0.60	1.09	1.23	0.96	0.89	0.44	0.82
SM(34:0)	ME576680	1.09	1.27	0.52	0.90	1.44	0.94	0.74	0.48	0.86
SM(34:1)	ME576631	1.09	1.27	0.53	0.90	1.44	0.94	0.75	0.49	0.87
PC(31:0)	ME576708	0.87	1.08	0.58	1.06	1.35	1.01	0.64	0.67	1.11
PC(32:0)	ME576617	0.87	1.05	0.60	0.92	1.37	1.23	0.66	0.77	0.99
SM(32:1)	ME576702	1.03	1.19	0.79	0.85	1.53	0.90	0.73	0.82	0.85
SM(38:1)	ME576733	1.04	0.86	0.75	1.05	1.41	0.99	0.71	0.55	0.93
SM(38:2)	ME576719	1.16	1.00	0.88	0.96	1.37	0.90	0.73	0.68	0.87
SM(41:2)	ME576701	1.13	1.12	0.78	1.08	1.29	0.93	0.63	0.62	0.91
SM(42:3)	ME576652	1.08	1.18	0.75	1.05	1.28	0.85	0.62	0.71	1.02
NICOTINAMIDE	ME576607	0.77	0.99	0.68	1.21	1.25	1.09	1.00	0.86	0.81
PC(33:0)	ME576700	0.70	1.23	0.71	1.03	1.17	0.96	0.82	1.04	1.17
C10-CARNITINE	ME576717	1.43	1.19	0.42	1.02	1.16	0.89	1.28	0.31	0.54
L-TRYPTOPHAN	ME576620	1.33	1.04	0.50	0.99	1.34	1.11	1.17	0.21	0.40
ADENINE	ME576689	1.27	0.99	0.70	1.30	1.19	1.20	0.63	0.40	0.55
SM(33:1)	ME576676	1.31	1.14	0.69	0.88	1.41	1.10	0.63	0.64	0.65
SM(36:2)	ME576696	1.30	1.19	0.55	0.80	1.63	1.04	0.53	0.50	0.67
SM(35:1)	ME576732	1.27	1.19	0.36	0.85	1.42	1.05	0.91	0.27	0.64
SM(36:1)	ME576698	1.40	1.29	0.37	0.85	1.42	1.24	0.56	0.30	0.53
C8-CARNITINE	ME576704	1.39	1.18	0.16	1.19	1.52	0.93	0.65	0.31	0.48
L-PHENYLALANINE	ME576616	1.44	0.81	0.46	1.11	1.48	0.95	0.61	0.50	0.72
LPC(18:4)	ME576731	0.58	0.72	1.28	0.70	1.88	0.37	1.03	1.30	1.51
PC(O-18:3/2:0)	ME576742	0.76	1.10	1.21	0.72	1.94	0.51	1.26	0.96	0.75
PC(40:7)	ME576715	0.49	1.21	0.76	0.92	1.47	0.45	0.74	0.48	1.90
LPC(22:4)	ME576734	0.65	1.06	0.89	0.95	1.56	0.47	0.83	0.73	1.56
PC(36:5)	ME576677	0.80	0.83	1.05	1.02	1.33	0.69	0.70	0.77	1.56
PC(38:5)	ME576642	0.70	0.94	0.90	1.00	1.48	0.56	0.62	0.64	1.71
PC(38:6)	ME576629	0.74	0.85	0.90	1.02	1.49	0.59	0.62	0.51	1.70
PC(36:4)	ME576622	0.97	0.66	0.70	0.97	1.49	0.71	0.56	0.52	1.65
PC(37:4)	ME576711	0.98	0.78	0.54	0.99	1.51	0.69	0.54	0.43	1.60
PC(40:6)	ME576669	0.79	0.93	0.66	0.82	1.49	0.63	0.70	0.37	1.79
PC(O-20:4/2:0)	ME576741	0.70	0.94	0.58	0.79	1.68	0.51	0.88	0.52	1.68
3-AMINO-4-HYDROXYBENZOIC_ACID	ME576656	0.81	1.09	1.53	0.85	1.17	0.72	0.99	1.18	1.21
LPC(20:3)	ME576640	0.63	0.92	1.29	0.90	1.41	0.63	1.01	1.13	1.38
PC(O-18:2/2:0)	ME576727	0.50	0.96	1.29	1.02	1.42	0.45	1.14	1.24	1.40
LPE(18:2)	ME576726	0.49	1.45	0.76	0.93	1.47	0.56	1.03	0.84	1.29
LPE(16:0)	ME576699	0.65	1.29	0.87	1.04	1.50	0.64	0.77	1.05	1.15
SM(32:2)	ME576738	0.77	1.24	1.02	0.82	1.48	0.51	0.88	1.27	1.23
CHOLESTERYL_ACETATE	ME576638	1.04	0.82	1.07	0.78	1.43	1.03	0.74	1.39	0.93
PC(35:1)	ME576671	0.84	1.21	0.91	1.03	1.19	0.70	0.73	1.34	1.23
PC(36:1)	ME576611	0.88	1.05	0.96	0.92	1.26	0.74	0.74	1.40	1.27
PC(O-14:0/2:0)	ME576604	0.81	0.91	1.13	0.89	1.38	0.78	0.79	1.51	1.21
LPC(16:0)	ME576593	0.80	0.90	1.06	0.89	1.31	0.89	0.95	1.33	1.13
LPC(18:0)	ME576595	0.82	0.94	0.91	0.77	1.37	0.89	0.92	1.36	1.19
PC(34:2)	ME576596	0.95	0.83	1.15	1.04	1.33	0.83	0.58	1.03	1.26
PC(33:2)	ME576692	0.83	0.89	0.96	1.15	1.30	0.78	0.55	0.90	1.41
PC(35:3)	ME576703	0.81	0.89	1.15	1.15	1.28	0.69	0.57	1.07	1.42
PC(35:2)	ME576646	0.96	1.00	0.84	1.09	1.21	0.73	0.66	1.00	1.30
PC(36:2)	ME576599	0.92	0.95	0.95	0.97	1.30	0.76	0.68	1.11	1.32
PC(30:0)	ME576691	0.85	1.10	0.79	1.05	1.36	0.80	0.73	1.06	1.10
SM(34:2)	ME576653	0.98	1.13	0.85	0.96	1.39	0.82	0.56	0.99	1.12
PC(O-16:3/2:0)	ME576683	0.95	1.05	1.13	0.73	1.67	0.74	0.82	1.05	0.96
PAF-C16	ME576610	0.88	0.88	1.02	0.81	1.47	0.69	1.05	1.02	1.18
LPC(18:2)	ME576602	0.87	0.85	1.19	0.97	1.34	0.83	1.02	1.01	1.03
PC(O-16:2/2:0)	ME576621	0.89	0.79	1.17	1.00	1.40	0.84	0.83	0.93	1.14
LPC(22:1)	ME576710	0.59	0.64	1.94	0.92	1.42	0.49	0.49	1.80	1.80
PC(38:2)	ME576667	0.62	0.82	1.23	1.03	1.29	0.44	0.55	1.79	1.84
SM(40:3)	ME576722	0.55	0.63	1.54	1.12	1.27	0.37	0.43	1.94	1.88
SM(39:1)	ME576740	0.70	0.48	1.70	1.46	1.11	0.60	0.40	1.24	1.59
PC(36:3)	ME576614	0.73	0.94	1.08	1.05	1.42	0.56	0.61	1.31	1.48
PC(34:3)	ME576647	0.71	0.78	1.47	1.03	1.32	0.69	0.54	1.43	1.54
SM(40:2)	ME576687	0.69	0.69	1.42	1.21	1.38	0.56	0.39	1.21	1.70
LPC(16:1)	ME576632	0.58	0.86	1.47	0.85	1.38	0.46	0.97	2.47	1.37
PC(O-14:1/2:0)	ME576674	0.54	0.93	1.54	0.90	1.31	0.49	1.04	2.56	1.27
PC(32:1)	ME576645	0.56	0.84	1.38	1.02	1.30	0.60	0.58	2.51	1.48
PC(32:2)	ME576705	0.59	0.80	1.58	1.02	1.38	0.62	0.52	2.18	1.46
LPC(20:2)	ME576690	0.45	1.01	1.31	1.09	1.30	0.44	0.89	1.83	1.51
PC(34:1)	ME576601	0.74	1.06	1.25	0.97	1.28	0.69	0.69	1.69	1.26
PC(O-16:1/2:0)	ME576627	0.73	0.94	1.53	0.95	1.43	0.57	0.84	1.68	1.18
PC(O-12:0/2:0)	ME576714	0.79	1.19	1.36	0.85	1.29	0.79	0.95	1.87	0.86
LPC(14:0)	ME576659	0.71	1.01	1.01	0.85	1.39	0.65	1.07	1.90	1.12
LPC(18:1)	ME576603	0.63	1.01	1.21	0.90	1.41	0.61	0.97	2.00	1.17
PC(25:0)	ME576613	0.52	0.71	0.53	0.77	1.19	1.30	1.06	2.34	1.18
GAMMA-LINOLENIC_ACID	ME576609	0.92	0.39	0.84	0.99	1.34	1.16	0.88	1.44	1.08
PC(21:0)	ME576619	0.91	0.52	0.57	0.76	1.44	1.31	0.81	1.49	1.07
ADENOSINE	ME576725	1.18	1.12	0.61	1.86	1.16	0.70	0.84	0.27	0.41
ADENOSINE_5^-MONOPHOSPHATE	ME576709	1.23	0.77	1.19	2.08	0.83	0.80	0.53	0.20	0.68
SARCOSINE	ME576661	1.71	0.52	1.83	0.95	0.93	1.46	0.64	0.45	0.51
URACIL	ME576635	1.26	0.47	0.61	0.98	1.46	1.66	1.17	0.14	0.23
URIDINE	ME576694	1.30	0.45	0.54	1.01	1.45	1.75	1.06	0.12	0.20
GUANINE	ME576723	2.17	0.66	0.66	0.97	1.24	0.84	0.98	0.16	0.34
METHYLGUANIDINE	ME576679	1.90	0.79	0.83	1.04	1.45	0.87	0.33	0.30	0.61

Factors:

F1	Genotype:CHCHD10S59L/+ \| Gender:female \| Stage:Pre-symptomatic
F2	Genotype:CHCHD10S59L/+ \| Gender:female \| Stage:Symptomatic
F3	Genotype:CHCHD10S59L/+ \| Gender:Male \| Stage:Pre-symptomatic
F4	Genotype:CHCHD10S59L/+ \| Gender:Male \| Stage:Symptomatic
F5	Genotype:QC \| Gender:QC \| Stage:QC
F6	Genotype:Wild-type \| Gender:female \| Stage:Pre-symptomatic
F7	Genotype:Wild-type \| Gender:female \| Stage:Symptomatic
F8	Genotype:Wild-type \| Gender:Male \| Stage:Pre-symptomatic
F9	Genotype:Wild-type \| Gender:Male \| Stage:Symptomatic

Data matrix