Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST002473)

HILIC NEGATIVE ION MODE (Analysis AN004040)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12
urate	ME585045	0.02	0.02	0.02	3.19	2.69	3.15	0.19	0.10	0.12	NA	NA	0.01
adenine	ME584970	3.55	3.59	3.63	0.10	0.11	0.10	0.11	0.11	0.14	0.13	0.11	0.09
aspartate	ME584979	3.79	3.97	3.85	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04
malate	ME585013	3.98	3.85	4.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
citrate/isocitrate	ME584983	3.84	3.93	4.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01
succinate	ME585036	3.71	3.88	4.18	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03
quinolinate	ME585030	2.27	2.13	2.01	0.70	0.64	0.67	0.57	0.60	0.53	0.63	0.64	0.63
malonate	ME585014	2.92	2.19	2.63	0.48	0.44	0.40	0.43	0.41	0.39	0.60	0.56	0.55
lactate	ME585012	2.65	2.58	2.63	0.39	0.32	0.38	0.47	0.42	0.29	0.68	0.46	0.73
succinyladenosine	ME585037	2.68	2.53	2.42	0.51	0.46	0.49	0.46	0.48	0.44	0.55	0.48	0.50
fumarate/maleate	ME584993	3.00	3.12	3.35	0.28	0.30	0.29	0.28	0.27	0.25	0.29	0.29	0.28
oxalate	ME585023	2.74	3.08	2.91	0.38	0.36	0.36	0.34	0.35	0.35	0.39	0.37	0.36
guanine	ME585002	2.89	2.82	2.76	0.06	0.05	NA	0.07	0.06	NA	0.19	0.11	NA
MDA	ME585015	2.48	2.57	2.49	0.11	0.10	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	NA	0.11
hypoxanthine	ME585007	1.63	1.67	1.63	0.16	0.17	0.06	0.15	0.15	0.03	2.28	2.04	2.02
6-mercaptopurine	ME584956	3.03	1.17	NA	0.63	0.57	NA	0.79	0.58	0.00	1.21	0.78	0.01
xanthine	ME585047	1.32	1.30	1.25	1.47	1.48	1.39	0.16	0.09	0.11	1.13	1.22	1.09
homovanillate	ME585006	NA	0.21	0.21	1.27	0.85	1.14	0.93	1.12	1.12	1.13	1.24	1.18
indolelactate	ME585008	NA	NA	NA	1.17	0.77	0.99	0.84	1.00	1.00	1.08	1.14	1.01
methylmalonate	ME585017	NA	NA	NA	0.92	0.90	0.83	1.03	0.83	0.93	1.12	1.04	1.40
PEP	ME585026	NA	NA	NA	1.01	0.79	0.99	1.22	0.92	1.07	1.15	0.91	0.94
2-hydroxy-3-methylpentanoate/hydroxyisocaproate	ME584962	0.34	0.33	0.33	1.16	0.95	1.13	1.19	1.01	1.20	1.53	1.33	1.50
alpha-keto-beta-methylvalerate/alpha-ketoisocaproate	ME584976	0.11	0.11	0.11	1.29	1.38	1.27	1.35	1.25	1.19	1.28	1.42	1.22
propionate	ME585027	0.10	0.10	0.10	1.24	1.11	1.22	1.29	1.26	1.32	1.28	1.24	1.27
anhydroDglucose/3-hydroxymethylglutarate	ME584978	1.39	1.99	2.20	0.58	0.65	0.61	0.80	0.57	0.73	0.84	0.60	1.02
N-acetylglutamate	ME585019	1.19	1.40	1.49	0.81	0.82	0.81	0.94	0.80	0.96	0.97	0.81	1.00
butyrate	ME584980	1.48	1.50	1.51	0.83	0.78	0.80	0.79	0.80	0.81	0.93	0.85	0.92
dTMP	ME584988	1.42	1.40	1.40	0.94	0.85	0.81	0.85	0.88	0.84	0.90	0.85	0.85
uracil	ME585044	1.37	1.38	1.37	0.84	0.89	0.83	0.92	0.95	0.93	0.86	0.84	0.83
2-hydroxyglutarate	ME584963	1.44	1.73	1.82	0.73	0.82	0.71	0.68	0.70	0.66	0.90	0.80	0.99
3-methylglutaconate	ME584965	1.81	1.55	1.68	0.89	0.74	0.79	0.77	0.76	0.66	0.81	0.78	0.77
glutamate	ME584997	1.73	1.80	1.75	0.83	0.96	0.74	0.65	0.74	0.64	0.78	0.71	0.65
glycocholate	ME585000	1.20	0.60	0.65	0.88	0.54	1.06	0.72	1.81	1.19	1.27	1.09	1.00
erythrose-4-phosphate	ME584990	0.99	0.70	0.93	1.26	1.11	1.07	1.05	0.90	1.18	0.84	1.15	0.70
2-hydroxy-3-methylbutyrate	ME584961	1.25	1.21	1.23	0.85	0.78	0.83	0.83	0.84	0.84	1.13	1.08	1.12
mesaconate	ME585016	0.93	1.05	1.12	0.90	1.07	0.84	0.96	0.90	0.81	1.15	1.02	1.24
suberate	ME585035	1.01	1.21	1.23	0.91	0.98	0.88	0.98	0.81	0.94	1.00	0.89	1.16
adipate/methylglutarate	ME584971	0.84	0.86	1.09	0.86	0.90	0.88	1.14	1.02	1.19	1.03	0.92	1.25
glutathione oxidized	ME584998	1.20	1.24	1.17	0.93	0.99	0.91	0.87	0.99	0.89	0.97	0.97	0.86
pantothenate	ME585024	1.23	1.25	1.27	0.93	0.94	0.93	0.91	0.91	0.94	0.91	0.88	0.91
4-hydroxybenzaldehyde	ME584967	1.18	1.10	1.07	0.93	0.98	0.91	1.04	0.79	0.95	1.04	1.00	1.00
3-methyladipate/pimelate	ME584964	1.13	1.09	1.13	0.94	0.80	1.02	0.97	1.00	0.97	1.04	0.88	1.04
glycerate	ME584999	1.15	1.12	1.13	1.05	0.96	0.99	0.92	0.97	0.94	0.90	0.94	0.92
AMP	ME584977	1.06	1.12	1.09	0.99	0.96	0.97	0.96	0.95	0.97	1.01	0.97	0.95
UMP	ME585043	1.09	1.16	1.11	0.98	0.93	0.96	0.94	0.96	0.96	1.00	0.96	0.94
salicylurate	ME585032	1.09	1.08	0.94	0.96	0.95	0.98	0.99	0.96	0.93	1.29	0.93	0.91
alpha-hydroxybutyrate/beta-hydroxybutyrate/hydroxyisobutyrate	ME584975	0.95	0.92	0.95	1.02	0.91	0.98	0.97	0.97	0.98	1.14	1.09	1.12
sebacate	ME585033	0.96	1.07	0.93	1.02	0.91	0.95	1.00	0.90	0.92	1.10	1.00	1.23
tetrahydro-1-methyl-beta-carboline-3-carboxylate	ME585039	0.80	0.83	0.83	1.06	0.96	0.99	1.12	1.03	1.09	1.16	1.00	1.12
N-acetylcarnosine	ME585018	0.91	0.84	0.89	1.02	1.02	1.11	1.03	1.11	1.01	1.05	1.01	0.99
4-pyridoxate	ME584968	0.85	0.88	0.87	1.08	1.01	1.05	1.04	1.05	1.06	1.03	1.07	1.02
inosine-15N4	ME584954	0.91	0.88	0.88	1.05	1.02	1.05	1.01	1.04	1.03	1.06	1.06	1.01
norepinephrine	ME585021	0.89	0.89	0.88	1.06	1.02	1.04	1.02	1.03	1.06	1.07	1.03	1.02
adonitol/arabitol	ME584972	0.85	0.88	0.87	1.06	1.08	1.05	1.03	0.99	1.03	1.04	1.07	1.04
sorbitol	ME585034	0.85	0.85	0.84	1.07	1.03	1.05	1.05	1.04	1.06	1.07	1.05	1.04
threitol	ME585040	0.83	0.84	0.84	1.08	1.05	1.07	1.04	1.01	1.03	1.08	1.07	1.06
dCMP	ME584987	1.04	0.96	1.01	0.89	0.94	0.98	1.03	1.07	0.92	1.09	1.02	1.05
erythronate/threonate	ME584989	0.99	0.97	0.98	1.10	0.99	1.05	0.99	1.00	0.98	0.96	1.01	0.98
quinate	ME585029	0.94	1.01	1.00	1.10	1.03	1.06	0.98	0.98	0.97	0.94	1.02	0.98
CDP	ME584982	1.06	1.06	1.00	0.95	1.01	0.94	1.00	0.97	1.02	1.05	0.95	0.99
UDP	ME585042	1.04	1.06	1.09	0.99	0.97	1.01	0.98	0.94	1.01	1.02	0.94	0.95
ADP	ME584973	0.98	1.03	1.01	1.01	0.97	1.00	1.00	0.98	1.03	1.01	1.02	0.96
GMP	ME585001	1.00	1.02	1.01	1.02	0.99	1.01	0.99	0.97	1.01	1.03	1.00	0.97
hexose monophosphate	ME585004	1.03	1.02	1.01	1.02	0.97	1.00	0.96	1.00	1.00	1.03	1.00	0.96
alpha-glycerophosphate	ME584974	1.03	1.04	1.04	0.99	0.98	0.99	0.98	0.98	1.01	1.02	0.97	0.98
CMP	ME584984	1.02	1.04	1.03	1.00	0.96	0.99	0.98	0.97	1.00	1.03	0.99	0.98
GDP	ME584994	1.00	0.99	1.03	0.97	0.98	1.01	1.00	1.00	1.04	1.04	0.97	0.98
glycocholate-d4	ME584955	1.01	1.02	1.04	0.97	0.97	0.97	0.98	0.99	1.01	1.02	0.99	1.03
2-aminoadipate	ME584958	0.98	0.95	0.88	1.03	0.95	1.04	0.98	1.05	1.00	1.07	1.08	1.01
pentose monophosphate	ME585025	0.92	0.96	0.94	1.00	1.00	1.01	1.05	1.05	1.09	1.01	1.02	0.97
thymine	ME585041	0.91	0.92	0.92	1.03	1.01	1.03	1.02	1.01	1.04	1.05	1.04	1.01
cytidine	ME584986	0.94	0.95	0.94	1.04	1.00	1.02	1.01	1.02	1.04	1.04	1.02	1.00
hippurate	ME585005	0.94	0.95	0.94	1.05	1.01	1.00	1.01	1.02	1.02	1.07	1.01	0.99
gentisate	ME584995	0.96	0.97	0.98	1.08	0.98	1.01	0.98	1.02	1.02	1.04	0.99	0.97
thymine-d4	ME584953	0.97	0.97	0.99	0.99	0.99	1.00	1.02	1.00	1.02	1.02	1.01	1.03
cystathionine	ME584985	0.97	0.98	0.95	0.99	1.01	1.02	0.98	1.02	1.02	1.05	1.03	0.98
ranitidine	ME585031	0.95	0.98	0.96	1.02	1.00	1.02	1.01	1.01	1.02	1.02	1.02	1.00
sucrose/lactose/trehalose	ME585038	0.96	0.97	0.96	1.02	1.00	1.01	1.01	1.02	1.01	1.02	1.02	1.00
guanosine	ME585003	0.97	0.99	0.96	1.04	1.00	1.02	0.98	1.01	1.01	1.04	1.01	0.97
cAMP	ME584981	0.98	0.98	0.96	1.04	0.99	1.02	0.99	1.02	1.00	1.02	1.02	0.98
uridine	ME585046	0.98	0.98	0.97	1.03	1.00	1.01	0.99	1.01	1.00	1.03	1.01	0.98
fructose/glucose/galactose_b	ME584992	1.01	0.99	0.98	1.02	0.99	1.00	0.99	1.00	1.01	1.02	1.01	0.98
fructose/glucose/galactose_a	ME584991	0.98	0.98	0.98	1.02	0.99	1.01	1.01	1.01	1.01	1.03	1.00	0.99
pseudouridine	ME585028	1.00	0.98	0.97	1.03	1.00	1.02	0.99	1.01	1.01	1.02	0.99	0.99
glucuronate	ME584996	0.89	0.74	0.49	1.09	0.86	1.14	0.87	1.47	1.04	1.07	1.14	1.00
2-aminoheptanoate	ME584960	0.66	0.73	0.75	1.10	1.03	1.09	1.04	1.13	1.14	1.07	1.12	1.13
3-phosphoglycerate	ME584966	0.69	0.75	0.72	1.05	1.01	1.03	1.20	1.02	1.24	1.18	1.02	1.09
inosine	ME585009	0.60	0.60	0.59	1.03	1.03	0.99	1.18	1.22	1.18	1.23	1.22	1.14
isovalerate/valerate/methylbutyrate	ME585010	0.53	0.51	0.51	1.09	1.05	1.13	1.17	1.13	1.19	1.28	1.19	1.21
2-aminobutyrate	ME584959	0.53	0.55	0.53	1.17	1.13	1.15	1.14	1.11	1.17	1.19	1.16	1.16
nicotinate	ME585020	0.53	0.52	0.52	1.21	1.13	1.18	1.13	1.17	1.14	1.18	1.18	1.12

Factors:

F1	Strain:None \| Drug:6-mercaptopurine
F2	Strain:None \| Drug:Azathioprine
F3	Strain:None \| Drug:None
F4	Strain:pucD \| Drug:6-mercaptopurine
F5	Strain:pucD \| Drug:Azathioprine
F6	Strain:pucD \| Drug:None
F7	Strain:WT \| Drug:6-mercaptopurine
F8	Strain:WT \| Drug:Azathioprine
F9	Strain:WT \| Drug:None
F10	Strain:xdhA \| Drug:6-mercaptopurine
F11	Strain:xdhA \| Drug:Azathioprine
F12	Strain:xdhA \| Drug:None

Data matrix