Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003328)

(Analysis AN005452)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
PC(14:0_15:0)	ME872107	0.05	0.21	0.36	2.95
PS(16:0_16:1)	ME872197	0.09	0.26	0.48	2.75
PE(O-24:6_18:1)	ME872146	1.31	1.56	0.92	0.43
PE(24:6_18:1)	ME872160	1.01	1.61	1.53	0.00
PG(22:6_22:6)	ME872171	0.80	1.22	1.62	0.36
PC(21:2_22:3)	ME872089	1.09	0.93	1.46	0.53
PC(27:6_16:0)	ME872072	1.26	1.12	1.23	0.49
PE(O-26:6_16:0)	ME872148	1.06	1.32	1.34	0.38
FA(22:2)	ME872045	0.22	0.17	2.43	0.77
PC(18:1_22:3)	ME872076	0.19	0.21	2.52	0.68
PE(20:1_22:3)	ME872133	0.20	0.21	2.52	0.67
FA(16:2)	ME872035	0.33	0.32	2.18	0.83
SM(d35:2)	ME872218	0.23	0.27	2.25	0.87
FA(20:2)	ME872042	0.26	0.20	2.29	0.86
FA(20:3)	ME872041	0.28	0.19	2.27	0.88
PI(20:2_22:3)	ME872191	0.34	0.33	2.27	0.72
FA(24:2)	ME872033	0.25	0.23	2.35	0.79
PI(20:1_22:3)	ME872186	0.29	0.28	2.32	0.75
PE(23:3)	ME872134	0.56	0.27	2.11	0.77
PI(20:3_22:3)	ME872194	0.52	0.56	2.05	0.64
PC(27:4_16:0)	ME872118	0.46	0.45	2.09	0.73
SM(d35:1)	ME872215	0.54	0.42	2.07	0.71
PC(25:2_16:0)	ME872117	0.44	0.60	1.79	0.93
PE(16:0_16:0)	ME872119	0.59	0.58	1.76	0.86
FA(18:2)	ME872027	0.52	0.42	1.85	0.95
PC(O-16:2_22:3)	ME872096	0.38	0.47	1.82	1.04
PE(O-18:2_22:3)	ME872149	0.37	0.49	1.84	1.01
SM(d33:1)	ME872212	0.47	0.34	2.02	0.87
PE(18:1_22:3)	ME872131	0.41	0.40	1.98	0.92
PE(O-20:2_22:3)	ME872145	0.43	0.47	1.95	0.88
PE(18:0_22:3)	ME872126	0.25	0.25	2.06	1.07
LPE(22:3)	ME872055	0.35	0.25	1.95	1.09
PI(18:1_22:3)	ME872185	0.27	0.34	2.02	1.02
PE(18:0_22:2)	ME872166	0.32	0.33	1.99	1.03
PC(16:0_22:2)	ME872070	0.33	0.33	1.99	1.01
PE(18:1_24:2)	ME872153	0.33	0.35	1.99	1.00
FA(20:1)	ME872043	0.41	0.34	1.92	1.02
PC(18:1_21:2)	ME872083	0.37	0.37	1.88	1.07
PC(19:1_22:3)	ME872071	0.38	0.40	1.90	1.02
CL(18:1_18:1_18:1_18:1)	ME872008	0.33	0.37	1.93	1.05
PC(18:1_22:2)	ME872086	0.35	0.38	1.92	1.04
FA(26:4)	ME872034	0.32	0.21	2.87	0.24
FA(22:3)	ME872044	0.19	0.10	2.88	0.40
FA(24:4)	ME872032	0.25	0.13	2.87	0.34
SM(d37:1)	ME872216	0.82	0.38	2.13	0.46
SM(d43:2)	ME872213	0.40	0.24	2.47	0.56
SM(d43:3)	ME872217	0.53	0.24	2.52	0.41
SM(d35:0)	ME872214	0.85	0.20	2.49	0.21
FA(22:4)	ME872031	0.61	0.37	2.40	0.37
PC(16:0_24:5)	ME872091	0.65	0.41	2.43	0.27
PE(20:2_22:3)	ME872157	0.67	0.42	2.41	0.27
PG(18:1_22:3)	ME872177	0.01	0.01	1.69	1.79
PC(O-16:1_22:3)	ME872069	0.20	0.24	1.66	1.51
PE(O-18:1_22:3)	ME872142	0.21	0.20	1.68	1.52
CL(14:0_16:1_16:1_18:1)	ME872014	0.10	0.19	1.29	1.99
CL(16:1_16:1_16:1_18:1)	ME872005	0.13	0.18	1.23	2.04
PG(18:1_20:2)	ME872175	0.07	0.06	1.04	2.36
PC(O-17:0_16:1)	ME872082	0.23	0.49	0.66	2.30
PC(O-19:0_18:1)	ME872094	0.25	0.47	0.70	2.26
PE(O-18:1_20:1)	ME872156	0.19	0.34	0.97	2.13
PC(14:1_16:1)	ME872081	0.16	0.30	1.05	2.11
PE(16:1_16:1)	ME872122	0.16	0.30	1.03	2.13
PE(O-16:1_20:3)	ME872137	0.23	0.35	0.89	2.18
PC(16:1_17:1)	ME872116	0.15	0.29	0.85	2.32
PS(16:1_18:1)	ME872200	0.18	0.33	0.86	2.25
PE(18:1_18:1)	ME872127	0.41	0.44	1.48	1.39
CL(16:1_18:1_18:1_18:2)	ME872007	0.39	0.52	1.39	1.42
PC(18:1_19:2)	ME872112	0.43	0.54	1.40	1.38
PC(16:1_18:1)	ME872085	0.43	0.43	1.40	1.46
PC(18:1_19:1)	ME872103	0.44	0.48	1.37	1.44
PE(18:1_18:2)	ME872128	0.39	0.46	1.32	1.54
PC(21:4_16:0)	ME872066	0.34	0.62	1.22	1.56
CL(16:0_16:1_18:1_18:1)	ME872011	0.35	0.56	1.31	1.50
PE(14:0_16:0)	ME872151	0.28	0.54	1.30	1.58
PE(O-16:1_22:3)	ME872139	0.17	0.28	1.45	1.71
CL(16:1_16:1_18:1_18:1)	ME872006	0.16	0.21	1.43	1.79
PI(18:1_20:2)	ME872184	0.17	0.26	1.41	1.77
PC(16:0_20:3)	ME872067	0.29	0.33	1.43	1.60
PE(O-18:1_22:2)	ME872152	0.27	0.33	1.39	1.67
PI(18:1_18:1)	ME872179	0.30	0.33	1.39	1.64
PC(O-16:1_22:2)	ME872078	0.27	0.33	1.31	1.74
PC(14:0_16:1)	ME872109	0.25	0.40	1.27	1.74
PE(16:0_16:1)	ME872120	0.25	0.40	1.30	1.71
PC(16:1_19:1)	ME872111	0.32	0.48	1.28	1.62
PS(16:0_22:1)	ME872209	0.31	0.46	1.28	1.63
CL(16:1_16:1_18:1_18:2)	ME872010	0.31	0.41	1.32	1.64
PE(16:1_18:1)	ME872123	0.33	0.42	1.31	1.63
PE(18:1_20:2)	ME872129	0.33	0.36	1.32	1.66
PG(16:1_18:1)	ME872176	0.30	0.38	1.33	1.66
LPE(18:1)	ME872054	0.37	0.49	1.21	1.65
PC(19:2_16:1)	ME872061	0.26	0.49	1.23	1.71
PG(16:0_18:1)	ME872172	0.35	0.43	1.23	1.69
PI(16:1_18:1)	ME872178	0.30	0.45	1.23	1.70
LPC(19:1)	ME872051	0.23	0.49	0.94	2.02
PC(O-14:1_20:1)	ME872090	0.25	0.45	0.91	2.07
PE(O-16:1_20:1)	ME872136	0.27	0.43	0.93	2.04
PS(18:1_18:1)	ME872205	0.33	0.49	0.94	1.94
PC(17:0_16:1)	ME872110	0.26	0.54	0.99	1.91
PE(O-16:1_16:1)	ME872168	0.28	0.47	1.06	1.89
PC(15:0_16:0)	ME872114	0.23	0.69	0.83	1.98
PE(O-16:1_20:5)	ME872158	0.36	0.65	0.71	2.04
PC(17:1_14:0)	ME872098	0.30	0.51	0.79	2.10
PS(18:0_18:1)	ME872201	0.30	0.58	0.86	1.97
PC(19:1_16:0)	ME872101	0.40	0.59	0.81	1.94
PS(16:0_18:0)	ME872198	0.36	0.55	0.80	2.02
PC(O-19:0_16:1)	ME872093	0.45	0.53	1.01	1.75
Cer(d18:1_24:1)	ME872004	0.33	0.68	1.08	1.66
LPE(18:0)	ME872053	0.33	0.67	1.08	1.67
PC(31:2)	ME872088	0.31	0.63	1.06	1.73
PS(16:0_18:1)	ME872199	0.33	0.57	1.06	1.77
PC(O-16:2_18:1)	ME872106	0.31	0.41	1.14	1.83
PE(O-18:2_18:1)	ME872143	0.31	0.41	1.14	1.81
PC(16:1_16:2)	ME872062	0.31	0.45	1.15	1.79
PE(16:1_18:2)	ME872124	0.31	0.45	1.17	1.76
PS(18:0_20:2)	ME872208	0.27	0.52	1.13	1.77
PS(18:1_18:2)	ME872210	0.29	0.49	1.10	1.82
PC(O-14:1_22:2)	ME872064	0.24	0.40	1.04	1.98
PE(O-16:1_22:2)	ME872138	0.25	0.40	1.07	1.95
PI(18:1_18:2)	ME872193	0.21	0.33	1.15	1.95
PS(16:0_22:3)	ME872207	0.20	0.40	1.18	1.87
FA(30:0)	ME872024	0.89	0.92	1.09	1.05
PA(O-18:2_19:2)	ME872056	0.81	0.87	1.05	1.19
FA(17:1)	ME872018	1.14	0.96	1.05	0.88
FA(24:0)	ME872047	1.06	1.01	0.92	1.03
FA(25:0)	ME872049	1.08	1.03	0.85	1.06
FA(19:1)	ME872019	1.05	0.91	1.05	0.97
FA(16:1)	ME872026	1.02	0.87	1.04	1.04
FA(21:0)	ME872028	1.02	0.91	1.03	1.01
FA(14:1)	ME872037	0.97	0.96	1.06	1.00
FA(23:0)	ME872029	1.04	1.00	1.02	0.95
FA(17:0)	ME872021	1.01	0.98	1.02	0.99
FA(15:1)	ME872030	1.04	0.95	1.03	0.97
FA(19:0)	ME872040	1.04	0.96	1.01	0.99
FA(22:0)	ME872046	0.91	1.01	0.97	1.09
FA(28:0)	ME872025	0.94	0.97	0.95	1.11
FA(20:0)	ME872017	0.98	0.99	0.97	1.05
FA(27:0)	ME872022	0.98	0.98	0.96	1.07
FA(26:0)	ME872023	1.02	1.01	0.96	1.02
FA(16:0)	ME872048	0.98	1.01	0.99	1.02
FA(15:0)	ME872016	1.00	1.00	0.98	1.02
FA(18:0)	ME872039	1.00	1.01	0.99	1.01
PC(O-16:2_22:4)	ME872115	0.84	1.05	1.36	0.73
PE(O-18:2_22:4)	ME872165	0.86	1.04	1.32	0.75
PC(16:0_17:0)	ME872065	0.74	1.01	1.27	0.93
PE(18:0_16:0)	ME872147	0.71	1.08	1.23	0.92
PC(25:6_16:0)	ME872105	1.12	1.33	0.94	0.72
PC(23:4_18:1)	ME872077	1.03	1.14	1.18	0.69
PE(O-24:7_18:1)	ME872159	1.06	1.25	1.14	0.62
PC(O-16:2_22:6)	ME872095	0.97	1.29	1.24	0.56
PE(O-18:2_22:6)	ME872144	0.99	1.25	1.22	0.60
PC(18:1_21:4)	ME872080	0.92	1.17	1.01	0.91
PC(23:6_16:0)	ME872063	0.82	1.33	1.05	0.84
PE(O-18:2_22:5)	ME872150	0.89	1.25	1.12	0.77
PI(20:3_20:4)	ME872190	0.93	1.23	1.09	0.79
PS(18:0_22:6)	ME872206	0.56	1.54	0.66	1.27
PC(O-14:1_22:6)	ME872075	0.82	1.50	0.86	0.90
PE(O-16:1_22:6)	ME872140	0.83	1.44	0.86	0.93
PI(18:1_20:4)	ME872183	0.84	1.15	0.92	1.09
PI(20:4_18:2)	ME872181	0.67	1.26	0.88	1.17
PC(27:2_16:0)	ME872092	0.51	0.93	1.66	0.76
PE(16:0_18:0)	ME872121	0.85	0.73	1.71	0.60
PE(18:1_22:4)	ME872132	0.74	0.67	1.61	0.83
PE(18:0_20:1)	ME872164	0.43	0.47	1.65	1.17
PC(16:0_20:1)	ME872068	0.44	0.48	1.70	1.11
PI(18:1_22:4)	ME872189	0.47	0.50	1.70	1.08
PG(18:1_22:6)	ME872170	0.37	0.54	1.58	1.24
CL(16:0_18:1_18:1_18:1)	ME872012	0.33	0.44	1.61	1.31
PC(18:1_21:1)	ME872104	0.42	0.43	1.61	1.25
PE(18:1_20:1)	ME872169	0.38	0.38	1.64	1.29
FA(24:1)	ME872036	0.51	0.72	1.30	1.28
PC(16:0_19:1)	ME872100	0.55	0.74	1.26	1.26
PC(21:1_16:0)	ME872074	0.47	0.66	1.37	1.28
PC(18:1_18:1)	ME872102	0.56	0.57	1.40	1.25
Cer(d18:1_18:0)	ME872003	0.52	0.61	1.45	1.21
PC(14:0_16:0)	ME872097	0.49	0.61	1.46	1.21
PI(20:3_20:3)	ME872180	0.68	0.81	1.40	0.99
CL(18:1_18:1_18:2_18:2)	ME872013	0.62	0.76	1.30	1.17
PC(16:0_23:4)	ME872113	0.70	0.76	1.32	1.08
PS(18:1_24:2)	ME872211	0.69	0.76	1.33	1.08
FA(18:1)	ME872038	0.70	0.59	1.37	1.16
PC(16:0_18:1)	ME872058	0.59	0.70	1.48	1.05
PE(18:0_18:1)	ME872125	0.60	0.68	1.50	1.04
CL(18:1_18:1_18:1_18:2)	ME872009	0.54	0.63	1.49	1.13
FA(22:1)	ME872020	0.61	0.58	1.51	1.10
PG(18:0_18:1)	ME872174	0.53	0.74	0.63	1.91
LPC(17:0)	ME872052	0.32	0.85	0.79	1.83
PI(16:0_18:1)	ME872192	0.38	0.89	0.81	1.74
LPC(19:0)	ME872050	0.34	0.94	0.65	1.90
PI(16:0_16:1)	ME872195	0.30	0.82	0.72	1.94
PC(16:0_16:0)	ME872057	0.61	0.90	1.28	1.08
PC(O-16:1_16:0)	ME872059	0.51	0.96	1.20	1.20
PE(O-18:1_16:0)	ME872141	0.54	0.97	1.25	1.12
PC(O-14:1_22:4)	ME872108	0.64	0.97	1.05	1.24
PE(O-16:1_22:4)	ME872162	0.62	0.96	1.05	1.26
PC(19:0_16:0)	ME872079	0.66	1.07	1.06	1.14
PC(O-14:1_16:0)	ME872084	0.57	1.12	1.04	1.20
PE(O-16:1_16:0)	ME872135	0.58	1.10	1.04	1.19
PS(16:0_16:0)	ME872196	0.34	0.92	1.11	1.45
PS(18:0_22:4)	ME872203	0.43	0.87	1.16	1.37
Cer(d18:1_16:0)	ME872002	0.52	0.88	1.05	1.40
PE(O-18:2_20:4)	ME872154	0.58	0.83	1.15	1.30
PI(18:0_20:4)	ME872188	0.62	0.56	1.17	1.44
PI(18:1_20:3)	ME872187	0.51	0.65	1.21	1.42
PC(O-16:2_16:0)	ME872073	0.45	0.72	1.17	1.45
PE(O-18:2_16:0)	ME872167	0.45	0.71	1.20	1.43
PS(18:0_22:3)	ME872202	0.41	0.73	1.08	1.56
PE(18:1_20:3)	ME872163	0.53	0.71	1.06	1.51
PC(O-19:1_16:0)	ME872099	0.53	0.73	1.06	1.49
PG(18:1_18:1)	ME872173	0.51	0.74	1.07	1.50
PE(O-16:1_20:4)	ME872155	0.51	1.03	0.82	1.53
PS(18:0_22:5)	ME872204	0.49	0.99	0.88	1.52
CL(16:0_16:0_18:1_18:1)	ME872015	0.52	1.07	0.96	1.34
PI(16:0_20:4)	ME872182	0.56	1.07	0.86	1.41
PC(O-17:0_16:0)	ME872060	0.48	1.02	0.72	1.66
PE(18:1_20:4)	ME872130	0.53	0.86	0.91	1.55
PC(16:1_18:3)	ME872087	0.47	0.88	0.86	1.63
PE(16:0_20:4)	ME872161	0.45	0.84	0.85	1.68

Factors:

F1	Disease status:AMC \| Treatment:SV
F2	Disease status:AMC \| Treatment:untreated
F3	Disease status:PMS \| Treatment:SV
F4	Disease status:PMS \| Treatment:untreated

Data matrix