Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003328)

Reversed phase POSITIVE ION MODE (Analysis AN005453)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
PC(O-38:1)	ME872443	0.13	0.23	0.84	2.39
DG(16:1_18:1)	ME872276	0.32	0.34	1.80	1.21
DG(16:0_18:1)	ME872270	0.32	0.30	1.89	1.14
PC(42:5)	ME872384	0.94	0.85	1.61	0.55
DG(16:0_26:2)	ME872274	0.43	0.78	1.88	0.71
Cer(d18:1_22:1)	ME872225	0.44	0.24	1.73	1.26
PC(30:1)	ME872339	0.06	0.18	0.50	2.82
PC(33:0)	ME872347	0.38	0.55	1.56	1.25
PC(46:8)	ME872403	1.45	1.24	1.35	0.13
PC(42:4)	ME872383	0.36	0.37	2.19	0.76
PC(O-15:2_22:6)	ME872426	1.24	1.45	0.98	0.50
PC(42:1)	ME872379	0.59	1.99	0.74	0.83
PC(46:6)	ME872401	1.22	1.29	1.29	0.32
PC(O-15:1_22:1)	ME872422	0.44	0.53	1.67	1.10
PC(15:1_16:0)	ME872325	0.66	0.64	1.64	0.89
PC(O-34:0)	ME872435	0.33	0.67	1.03	1.73
DG(O-17:1_17:2)	ME872291	0.14	0.14	2.21	1.08
PC(32:3)	ME872346	0.28	0.78	0.90	1.80
PC(O-15:2_22:2)	ME872423	0.22	0.24	1.75	1.41
PC(44:2)	ME872390	0.45	1.10	1.37	0.96
PC(O-21:4_23:4)	ME872431	0.76	2.82	0.39	0.42
PC(48:9)	ME872412	2.10	1.57	0.71	0.04
PC(19:4_21:3)	ME872333	0.87	1.44	0.99	0.78
PA(22:5_18:0)	ME872316	0.57	0.76	0.99	1.51
ChE(20:4)	ME872236	0.01	0.09	0.23	3.19
ChE(22:6)	ME872242	0.03	0.51	0.23	2.87
PC(O-38:5)	ME872447	0.54	0.57	1.16	1.50
PC(O-36:1)	ME872439	0.21	0.33	0.76	2.34
PA(O-20:2_18:1)	ME872322	0.25	0.44	0.92	2.06
ChE(28:4)	ME872252	0.03	0.52	0.32	2.77
CL(70:5)	ME872262	0.64	0.88	1.25	1.10
PC(O-38:4)	ME872446	0.35	0.48	1.09	1.78
PC(O-32:2)	ME872434	0.10	0.22	0.85	2.41
PC(40:4)	ME872375	0.29	0.33	1.99	1.04
PC(30:2)	ME872340	0.09	0.22	0.77	2.50
PA(O-20:2_16:0)	ME872321	0.48	0.92	1.12	1.33
PA(O-18:2_20:5)	ME872319	0.40	0.72	0.78	1.88
DG(O-6:0_21:5)	ME872293	1.03	0.94	0.99	1.03
MG(P-24:6)	ME872315	0.34	0.58	0.48	2.33
ChE(20:5)	ME872237	0.01	0.12	0.34	3.07
DG(18:1_18:2)	ME872281	0.34	0.29	2.23	0.80
PC(O-17:2_22:4)	ME872428	1.00	1.28	1.28	0.51
PC(30:3)	ME872341	0.05	0.23	0.39	2.90
PA(O-18:2_22:6)	ME872320	0.90	1.55	0.77	0.89
LPE(24:5)	ME872312	2.47	1.71	0.31	0.05
cholesterol	ME872229	0.01	0.13	0.17	3.22
DG(18:0_22:3)	ME872279	0.27	0.22	2.54	0.59
PC(31:3)	ME872343	0.31	0.45	1.19	1.74
PC(48:12)	ME872405	0.11	0.15	2.30	1.01
PC(37:2)	ME872358	0.34	0.37	1.88	1.09
ChE(24:3)	ME872245	0.00	0.14	0.19	3.20
DG(O-17:1_22:1)	ME872292	1.01	1.38	0.59	1.12
LPC(26:0)	ME872306	0.52	1.02	1.00	1.35
PC(O-15:1_16:0)	ME872420	0.47	0.92	1.12	1.33
PC(44:7)	ME872395	1.02	0.83	1.80	0.31
PC(40:3)	ME872374	0.26	0.28	1.86	1.23
LPE(20:4)	ME872310	1.33	1.03	0.94	0.79
LPC(30:0)	ME872308	0.14	0.43	0.51	2.57
Cer(d16:0_28:1)	ME872222	0.55	0.11	2.36	0.64
ChE(30:5)	ME872257	0.10	1.21	0.28	2.24
ChE(24:4)	ME872246	0.01	0.23	0.26	3.06
PC(38:7)	ME872366	0.87	1.30	1.04	0.83
PC(48:2)	ME872406	0.06	0.12	1.66	1.71
ChE(16:1)	ME872230	0.02	0.03	0.04	3.42
PC(39:2)	ME872367	0.52	0.76	1.84	0.70
PC(O-34:3)	ME872438	0.33	0.38	1.04	1.93
ChE(20:3)	ME872235	0.00	0.04	0.18	3.28
PC(40:5)	ME872376	0.93	0.96	1.29	0.79
PC(32:1)	ME872344	0.20	0.45	0.98	2.03
PC(38:2)	ME872361	0.32	0.36	1.71	1.28
DG(O-15:1_20:1)	ME872289	1.08	1.45	0.39	1.22
PC(48:4)	ME872407	0.22	0.35	2.08	1.00
PC(38:6)	ME872365	0.91	1.59	1.08	0.55
PC(38:4)	ME872363	0.62	0.69	1.42	1.10
ChE(24:6)	ME872247	0.03	0.79	0.17	2.72
PC(36:1)	ME872353	0.41	0.56	1.47	1.29
PC(O-34:2)	ME872437	0.37	0.59	1.03	1.74
PC(41:6)	ME872378	0.74	0.67	1.98	0.46
PC(40:2)	ME872373	0.38	0.53	1.89	0.92
ChE(30:6)	ME872258	0.15	1.78	0.19	1.86
PC(39:7)	ME872371	1.30	1.05	1.45	0.29
PC(O-34:1)	ME872436	0.43	0.60	1.14	1.59
PC(50:6)	ME872415	0.84	0.79	1.72	0.56
PC(46:9)	ME872404	1.85	1.52	0.90	0.07
PC(46:7)	ME872402	1.11	1.07	1.65	0.21
PA(O-18:2_16:0)	ME872317	0.58	1.11	1.00	1.23
DG(20:2_22:3)	ME872287	0.75	0.51	2.34	0.22
Hex1Cer(d18:1_24:1)	ME872297	0.32	0.35	1.24	1.76
PC(17:3_18:1)	ME872329	0.57	0.76	0.99	1.51
AcCa(21:3)	ME872220	1.03	1.01	0.98	0.99
Hex2Cer(d18:1_18:0)	ME872299	0.81	0.14	2.05	0.74
Hex1Cer(d18:1_18:0)	ME872296	1.05	0.42	1.36	1.03
ChE(28:7)	ME872255	0.11	2.50	0.05	1.50
ChE(26:3)	ME872249	0.01	0.23	0.25	3.08
ChE(28:6)	ME872254	0.13	2.87	0.04	1.21
PC(O-17:3_22:4)	ME872429	1.27	1.39	0.80	0.71
PC(O-13:1_22:6)	ME872419	0.84	1.38	0.76	1.08
CL(68:4)	ME872260	0.29	0.34	1.38	1.65
PC(48:6)	ME872409	1.08	1.11	1.41	0.45
PC(46:2)	ME872398	0.21	0.47	1.36	1.63
PC(38:5)	ME872364	0.90	1.13	1.01	0.96
PC(42:7)	ME872386	1.11	1.08	1.25	0.60
Cer(d18:1_24:0)	ME872226	0.34	0.60	1.08	1.71
PC(O-40:2)	ME872451	0.16	0.27	1.19	1.99
PC(42:10)	ME872380	0.87	1.31	0.81	1.05
PC(O-39:8)	ME872450	0.92	0.99	1.22	0.85
PC(50:4)	ME872413	0.06	0.10	2.30	1.08
Hex2Cer(d18:1_16:0)	ME872298	0.46	0.44	1.71	1.11
PA(O-20:3_16:1)	ME872323	0.43	0.58	1.10	1.64
PC(39:6)	ME872370	0.98	0.87	1.51	0.60
PC(17:3_16:1)	ME872328	0.49	0.88	0.86	1.61
PC(38:3)	ME872362	0.30	0.32	1.90	1.14
PC(28:0)	ME872335	0.05	0.18	0.33	3.00
PC(17:2_18:1)	ME872327	0.30	0.31	1.50	1.55
AcCa(4:0)	ME872221	0.17	0.47	0.64	2.38
ChE(26:2)	ME872248	0.01	0.19	0.30	3.05
ChE(22:5)	ME872241	0.02	0.24	0.32	2.99
PC(O-13:1_20:1)	ME872417	0.26	0.44	0.92	2.05
PC(50:7)	ME872416	0.84	0.80	1.65	0.62
PC(42:2)	ME872381	0.55	0.99	1.62	0.73
PC(34:3)	ME872350	0.26	0.40	1.09	1.91
Co(Q10)	ME872264	0.29	0.55	1.19	1.67
ChE(26:4)	ME872250	0.02	0.39	0.30	2.89
Cer(d20:1_24:1)	ME872228	0.64	0.73	1.34	1.14
ChE(22:1)	ME872238	0.02	0.04	0.28	3.18
PC(O-39:4)	ME872449	0.41	0.49	1.67	1.14
PC(36:4)	ME872356	0.67	1.13	0.96	1.19
ChE(28:5)	ME872253	0.16	2.59	0.08	1.36
CL(70:4)	ME872261	0.50	0.54	1.40	1.32
DG(34:3)	ME872288	0.36	0.31	2.01	0.99
PC(42:3)	ME872382	0.35	0.47	2.08	0.80
PC(40:6)	ME872377	1.07	1.27	0.99	0.75
PC(42:9)	ME872388	0.91	1.83	0.89	0.56
PC(39:3)	ME872368	0.39	0.39	2.13	0.79
ChE(18:1)	ME872231	0.00	0.03	0.11	3.37
ChE(18:2)	ME872232	0.00	0.03	0.10	3.37
PC(O-15:2_22:5)	ME872425	0.88	1.16	1.09	0.88
PC(48:5)	ME872408	0.67	0.76	1.83	0.60
PC(44:9)	ME872397	1.53	1.38	1.09	0.22
PC(44:8)	ME872396	1.44	1.20	1.33	0.19
PC(34:0)	ME872349	0.56	0.90	1.24	1.16
PC(30:0)	ME872338	0.19	0.54	1.04	1.92
Cer(d18:1_22:0)	ME872224	0.31	0.69	1.17	1.57
PA(O-18:2_16:1)	ME872318	0.33	0.55	1.00	1.84
PC(36:3)	ME872355	0.33	0.50	1.46	1.41
PC(32:2)	ME872345	0.12	0.24	0.81	2.42
PC(36:2)	ME872354	0.38	0.44	1.43	1.46
PC(O-18:2_18:1)	ME872430	0.30	0.35	0.95	2.06
MG(O-24:6)	ME872314	0.44	0.80	0.55	2.02
DG(16:0_20:1)	ME872271	0.43	0.31	2.09	0.86
ChE(30:4)	ME872256	0.03	0.26	0.43	2.85
DG(16:0_16:1)	ME872268	0.30	0.44	1.39	1.55
PC(O-39:3)	ME872448	0.39	0.45	1.56	1.31
PC(O-13:1_20:5)	ME872418	0.38	0.69	0.74	1.96
PC(46:5)	ME872400	0.63	0.79	1.90	0.54
PC(39:5)	ME872369	0.64	0.59	1.98	0.60
PC(37:6)	ME872359	1.05	1.08	1.06	0.84
PC(29:0)	ME872337	0.62	0.66	1.56	0.98
DG(16:0_26:4)	ME872275	0.38	0.29	2.74	0.26
PC(19:4_18:1)	ME872332	0.81	0.74	1.47	0.87
ChE(22:4)	ME872240	0.01	0.11	0.24	3.17
ChE(30:8)	ME872259	0.15	3.39	0.04	0.80
PC(42:6)	ME872385	1.07	1.04	1.35	0.56
ChE(24:1)	ME872243	0.02	0.12	0.15	3.24
CL(72:4)	ME872263	0.50	0.60	1.51	1.17
PC(O-32:1)	ME872433	0.16	0.32	0.61	2.53
DG(O-15:1_22:1)	ME872290	1.48	1.62	0.12	1.05
PC(O-38:2)	ME872444	0.11	0.20	0.94	2.32
PC(O-32:0)	ME872432	0.39	0.88	0.82	1.73
PC(48:7)	ME872410	1.08	0.96	1.62	0.35
PC(36:6)	ME872357	0.59	0.76	1.10	1.39
DG(18:1_20:1)	ME872282	0.26	0.25	2.28	0.84
DG(18:1_26:2)	ME872286	0.44	0.35	2.48	0.43
PC(O-37:8)	ME872442	1.07	1.37	0.74	0.94
PC(44:4)	ME872392	0.46	0.50	2.16	0.63
PC(35:1)	ME872351	0.32	0.42	1.74	1.21
PC(44:3)	ME872391	0.43	0.60	1.96	0.76
PC(48:8)	ME872411	1.33	1.28	1.45	0.08
Hex1Cer(d18:1_16:0)	ME872295	0.58	0.42	1.45	1.30
PA(P-12:1_16:0)	ME872324	0.89	1.33	0.81	1.02
PC(O-36:2)	ME872440	0.34	0.42	0.97	1.96
DG(18:1_18:1)	ME872280	0.27	0.21	2.28	0.86
DG(16:0_22:5)	ME872273	1.13	1.11	1.31	0.50
DG(14:0_16:0)	ME872266	0.38	0.64	0.92	1.81
ChE(22:3)	ME872239	0.00	0.06	0.28	3.10
ChE(26:5)	ME872251	0.05	1.49	0.10	2.25
PC(50:5)	ME872414	0.27	0.23	2.23	0.90
PC(31:0)	ME872342	0.72	0.67	1.68	0.77
MG(21:5)	ME872313	1.00	1.25	0.92	0.90
DG(18:1_24:2)	ME872285	0.38	0.30	2.55	0.44
DG(18:0_20:4)	ME872278	0.71	0.68	1.81	0.64
DG(18:1_22:4)	ME872284	0.80	0.61	2.03	0.41
LPC(16:1)	ME872302	0.18	0.41	0.92	2.13
AcCa(2:0)	ME872219	0.12	0.14	1.35	1.96
PC(44:5)	ME872393	0.76	0.75	1.97	0.40
PC(42:8)	ME872387	1.10	1.25	1.11	0.62
PC(26:0)	ME872334	0.03	0.21	0.24	3.08
PC(35:2)	ME872352	0.31	0.34	1.70	1.31
PC(28:1)	ME872336	0.04	0.16	0.33	3.02
ChE(24:2)	ME872244	0.00	0.10	0.28	3.14
PC(40:1)	ME872372	0.51	1.33	1.08	1.04
PC(O-38:3)	ME872445	0.12	0.15	1.39	1.91
DG(16:0_22:3)	ME872272	0.28	0.25	2.39	0.72
DG(P-12:1_22:0)	ME872294	0.73	0.62	1.29	1.20
PC(38:1)	ME872360	0.44	0.58	1.72	1.02
PC(33:2)	ME872348	0.18	0.27	1.59	1.57
LPC(16:0)	ME872301	0.45	0.76	1.20	1.39
PC(17:2_18:0)	ME872326	0.36	0.35	1.71	1.26
PC(17:3_22:1)	ME872330	0.28	0.26	2.30	0.79
PC(44:6)	ME872394	0.89	0.72	1.99	0.30
PC(O-17:2_22:3)	ME872427	0.36	0.47	1.97	0.90
Hex2Cer(d18:1_24:1)	ME872300	0.34	0.19	1.89	1.21
LPC(18:0)	ME872303	0.32	0.91	0.72	1.85
Cer(d18:1_14:0)	ME872223	0.66	0.76	1.20	1.24
Co(Q9)	ME872265	0.36	0.40	2.12	0.81
LPC(20:1)	ME872305	0.20	0.41	1.26	1.78
ChE(18:3)	ME872233	0.00	0.03	0.19	3.29
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Cer(d18:2_24:1)	ME872227	0.45	0.45	1.75	1.08
PC(O-36:4)	ME872441	0.37	0.53	0.93	1.90
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LPE(20:3)	ME872309	0.37	0.28	1.31	1.71
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LPC(28:0)	ME872307	0.44	0.91	0.80	1.69
PC(44:1)	ME872389	0.40	1.31	0.93	1.28

Factors:

F1	Disease status:AMC \| Treatment:SV
F2	Disease status:AMC \| Treatment:untreated
F3	Disease status:PMS \| Treatment:SV
F4	Disease status:PMS \| Treatment:untreated

Data matrix