Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003379)

(Analysis AN005534)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
DG 38:6	ME883889	1.98	0.75	0.92	0.36
CE 20:4	ME883949	0.97	1.61	0.28	1.14
TG 58:8	ME883934	1.35	2.11	0.21	0.33
TG 56:7	ME883925	1.53	1.73	0.30	0.43
TG 56:8	ME883926	1.62	1.76	0.25	0.38
TG 60:7	ME883940	0.85	2.15	0.55	0.45
TG 60:8	ME883941	0.99	2.17	0.38	0.46
TG 58:7	ME883933	1.14	1.92	0.42	0.52
CE 22:4	ME883950	1.25	1.74	0.42	0.59
TG 58:6	ME883932	1.15	1.75	0.56	0.54
DG 32:1	ME883873	1.08	0.38	1.87	0.66
DG 38:3	ME883886	0.77	0.69	1.58	0.96
DG 34:3	ME883878	0.73	0.42	1.96	0.89
DG 34:2	ME883877	0.96	0.45	1.76	0.83
DG 32:2	ME883874	0.79	0.51	1.83	0.87
DG 38:2	ME883885	0.82	0.54	1.69	0.94
DG 32:0	ME883872	1.24	0.67	1.50	0.59
DG 34:1	ME883876	1.22	0.60	1.50	0.68
TG 48:2	ME883893	1.03	0.60	1.35	1.02
TG 50:3	ME883898	0.97	0.57	1.39	1.07
TG 48:1	ME883892	1.16	0.61	1.33	0.90
TG 50:2	ME883897	1.10	0.70	1.25	0.94
TG 60:2	ME883935	0.63	1.72	0.90	0.75
TG 60:5	ME883938	0.62	1.68	1.01	0.69
TG 58:1	ME883927	0.76	1.65	0.88	0.71
TG 60:6	ME883939	0.71	1.77	0.82	0.70
TG 56:3	ME883921	0.81	0.96	1.25	0.97
DG 36:1	ME883880	0.96	0.88	1.29	0.87
DG 38:5	ME883888	0.89	0.88	1.29	0.94
DG 36:4	ME883883	0.98	0.92	1.18	0.93
PC 40:3	ME883852	1.00	0.97	1.06	0.97
LPE 18:1-d7	ME883817	0.99	0.95	1.11	0.95
TG 54:2	ME883912	0.97	0.99	1.10	0.94
LPC 18:1-d7	ME883796	0.93	0.99	1.08	1.00
PC 38:1	ME883843	0.97	0.99	1.02	1.01
TG 56:4	ME883922	0.81	0.99	1.13	1.06
TG 54:4	ME883914	0.82	0.95	1.06	1.17
PE 38:6	ME883867	0.89	0.99	1.05	1.07
TG 54:3	ME883913	0.84	0.99	1.06	1.11
PC 36:1	ME883836	0.94	0.95	0.99	1.12
PE 40:7	ME883869	0.92	0.92	1.11	1.06
TG 52:3	ME883905	0.96	0.88	1.08	1.08
CE 16:1	ME883944	0.93	0.92	0.93	1.22
PC 38:7	ME883849	0.91	0.90	0.93	1.26
LPC 20:3	ME883807	0.90	0.74	1.08	1.28
PC 36:3	ME883838	0.94	0.73	1.07	1.25
PE 36:4	ME883865	0.84	0.83	1.14	1.19
TG 52:4	ME883906	0.83	0.80	1.15	1.22
PC 36:2	ME883837	0.84	0.88	1.01	1.26
PC 34:1	ME883830	0.86	0.87	1.05	1.21
PC 40:7	ME883856	0.89	0.85	1.07	1.20
DG 36:2	ME883881	0.80	0.81	1.28	1.11
PC 38:2	ME883844	0.83	0.71	1.26	1.19
PE 36:2	ME883863	0.74	0.92	1.16	1.19
PC 38:5	ME883847	0.73	0.94	1.24	1.09
PE 38:5	ME883866	0.72	0.89	1.26	1.14
PE 34:2	ME883860	0.60	0.86	1.23	1.31
LPC 22:4	ME883812	0.73	0.87	1.14	1.27
PC 36:5	ME883840	0.72	0.80	1.19	1.29
DG 38:1	ME883884	0.88	1.17	1.12	0.82
TG 58:2	ME883928	0.76	1.28	1.20	0.76
DG 34:0	ME883875	1.05	0.95	1.27	0.72
TG 56:2	ME883920	0.97	1.13	1.22	0.68
TG 60:3	ME883936	0.60	1.42	1.22	0.77
TG 60:4	ME883937	0.56	1.28	1.34	0.82
TG 58:3	ME883929	0.73	1.03	1.50	0.74
PE 34:1	ME883859	0.73	0.94	1.40	0.93
PC 40:5	ME883854	0.63	1.08	1.27	1.02
TG 58:4	ME883930	0.63	1.02	1.37	0.98
LPC 24:1	ME883816	0.86	1.34	0.61	1.18
CE 20:3	ME883948	1.00	1.23	0.67	1.10
DG 15:0/18:1-d7	ME883871	0.88	1.25	0.73	1.14
LPC 22:0	ME883809	0.90	1.33	0.68	1.08
CE 18:1	ME883945	0.81	1.52	0.57	1.09
LPC 22:6	ME883814	1.02	1.44	0.58	0.96
LPE 22:6	ME883825	1.01	1.42	0.60	0.97
LPC 22:1	ME883810	0.83	1.13	0.75	1.30
LPC 14:0	ME883797	0.70	1.16	0.82	1.32
LPE 20:4	ME883823	0.71	1.06	0.83	1.41
DG 36:0	ME883879	0.81	1.15	1.00	1.05
LPE 16:0	ME883818	0.87	1.07	0.94	1.12
PC 40:2	ME883851	0.90	1.13	0.91	1.06
TG 54:5	ME883915	0.95	1.07	0.92	1.05
CE 20:2	ME883947	0.80	1.32	0.80	1.09
CE 16:0	ME883943	0.79	1.22	0.83	1.16
LPC 20:4	ME883808	0.86	1.14	0.86	1.14
PC 38:3	ME883845	1.37	0.95	0.90	0.78
TG 48:0	ME883891	1.44	0.87	1.06	0.63
TG 50:1	ME883896	1.28	0.91	1.08	0.72
DG 38:4	ME883887	0.97	1.29	0.95	0.79
TG 52:0	ME883902	0.95	1.31	0.87	0.86
TG 56:1	ME883919	0.93	1.38	0.99	0.70
TG 58:5	ME883931	0.82	1.48	0.93	0.77
TG 54:6	ME883916	1.08	1.22	0.77	0.94
LPC 18:0	ME883800	1.20	1.17	0.73	0.91
PC 38:6	ME883848	1.21	1.13	0.82	0.84
PC 40:8	ME883857	1.20	1.06	0.81	0.93
LPE 18:0	ME883819	0.99	1.19	0.93	0.90
PE 36:1	ME883862	0.95	1.12	1.01	0.92
PC 32:0	ME883827	1.01	1.11	1.04	0.84
PC 40:6	ME883855	1.04	1.09	0.99	0.88
LPC 16:0	ME883798	1.07	1.05	0.85	1.03
PC 34:2	ME883831	1.09	1.11	0.86	0.95
PC 36:4	ME883839	1.14	1.07	0.92	0.87
TG 52:2	ME883904	1.07	1.01	0.97	0.95
PC 40:4	ME883853	1.10	1.24	0.87	0.78
TG 56:5	ME883923	1.11	1.35	0.79	0.74
PC 15:0/18:1-d7	ME883826	1.18	1.35	0.85	0.62
PC 38:4	ME883846	1.22	1.22	0.88	0.69
TG 54:1	ME883911	1.09	1.22	1.02	0.67
TG 50:0	ME883895	1.11	1.08	1.02	0.78
TG 52:1	ME883903	1.22	1.07	0.95	0.75
PE 15:0/18:1-d7	ME883858	1.44	1.30	0.79	0.47
LPC 24:0	ME883815	1.12	1.52	0.67	0.69
TG 56:6	ME883924	1.21	1.60	0.55	0.63
LPC 20:0	ME883804	1.38	1.36	0.56	0.70
PC 34:0	ME883829	1.16	1.34	0.68	0.81
PC 36:0	ME883835	1.19	1.31	0.64	0.85
TG 54:7	ME883917	1.29	1.31	0.61	0.79
TG 54:8	ME883918	1.23	1.41	0.59	0.77
LPE 18:2	ME883821	0.31	0.48	1.08	2.13
PE 34:4	ME883861	0.21	0.52	1.07	2.20
LPC 16:1	ME883799	0.34	0.43	1.26	1.97
PC 34:5	ME883834	0.39	0.57	1.13	1.91
LPE 18:1	ME883820	0.48	0.62	1.22	1.68
PC 38:8	ME883850	0.51	0.56	1.19	1.75
LPC 18:1	ME883801	0.58	0.63	1.08	1.71
LPC 18:2	ME883802	0.56	0.67	1.01	1.77
PC 34:3	ME883832	0.47	0.65	1.12	1.75
PC 34:4	ME883833	0.44	0.68	1.05	1.83
LPE 20:3	ME883822	0.65	0.77	1.00	1.59
PE 38:7	ME883868	0.67	0.68	1.05	1.61
TG 52:7	ME883909	0.52	0.86	1.15	1.47
PE 36:3	ME883864	0.57	0.68	1.21	1.54
PE 40:8	ME883870	0.68	0.69	1.12	1.51
TG 52:6	ME883908	0.60	0.75	1.19	1.46
PC 36:6	ME883841	0.62	0.76	1.14	1.49
PC 36:7	ME883842	0.60	0.78	1.10	1.52
DG 36:3	ME883882	0.58	0.62	1.43	1.37
LPC 22:3	ME883811	0.54	0.71	1.35	1.40
LPC 20:2	ME883806	0.67	0.63	1.28	1.43
PC 32:1	ME883828	0.65	0.61	1.31	1.43
LPC 20:1	ME883805	0.71	0.66	1.19	1.44
TG 52:5	ME883907	0.72	0.72	1.20	1.36
TG 48:3	ME883894	0.70	0.53	1.47	1.30
TG 50:4	ME883899	0.66	0.46	1.56	1.32
LPC 22:5	ME883813	0.36	0.61	1.38	1.65
LPE 22:5	ME883824	0.29	0.62	1.46	1.63
TG 50:5	ME883900	0.41	0.46	1.62	1.50
TG 50:6	ME883901	0.25	0.48	1.65	1.61
CE 18:1-d7	ME883942	0.43	1.47	0.31	1.79
TG 15:0/18:1-d7/15:0	ME883890	0.35	1.26	0.29	2.10
TG 52:8	ME883910	0.40	1.12	1.03	1.45
CE 18:2	ME883946	0.49	1.06	0.61	1.84
LPC 18:3	ME883803	0.41	0.90	0.78	1.91

Factors:

F1	Genotype:Ldlr-/- \| Sample source:Mouse liver \| Group:Cis HFD
F2	Genotype:Ldlr-/- \| Sample source:Mouse liver \| Group:Cis HFD + Myriocin
F3	Genotype:Ldlr-/- \| Sample source:Mouse liver \| Group:Trans HFD
F4	Genotype:Ldlr-/- \| Sample source:Mouse liver \| Group:Trans HFD + Myriocin

Data matrix