Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003432)

(Analysis AN005637)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16
HEPES 107	ME898269	0.77	0.88	0.76	1.00	0.98	1.14	0.87	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	15.18
HEPES 80	ME898268	0.89	0.87	0.93	0.84	0.91	1.16	0.96	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	14.99
Penicillin G 289	ME898280	0.16	0.16	0.14	0.15	0.14	0.12	0.16	0.12	0.14	0.14	0.14	0.15	0.15	0.12	10.99	0.01
Mannose 95	ME898260	0.71	0.33	0.47	0.00	0.00	0.21	0.47	0.02	3.56	5.64	0.01	0.03	5.09	0.03	0.02	0.01
Folic 311	ME898290	0.11	0.12	0.11	0.14	0.12	0.12	0.09	1.53	1.48	1.54	1.48	1.45	1.55	1.51	1.08	5.80
Phenol Red 195	ME898285	0.09	0.08	0.10	0.09	0.07	0.08	0.06	1.49	1.47	1.57	1.39	1.60	1.45	1.25	1.56	4.69
Phenol Red 93	ME898284	0.09	0.09	0.10	0.10	0.08	0.10	0.07	1.56	1.49	1.70	1.68	1.52	1.50	1.60	1.50	4.48
Mannose 59	ME898259	0.11	0.16	0.10	0.10	0.13	0.05	0.12	1.74	1.90	1.53	1.18	1.64	0.98	2.00	2.63	2.16
Glucose 59	ME898256	0.10	0.14	0.09	0.09	0.11	0.05	0.10	1.56	1.78	1.48	1.05	1.53	0.87	1.89	2.48	3.79
Glucose 71	ME898257	0.10	0.14	0.09	0.08	0.11	0.05	0.10	1.53	1.74	1.42	1.00	1.48	0.82	1.86	2.53	4.17
2-Hydroxybutyric 57	ME898222	0.09	0.18	0.07	0.08	0.24	0.14	0.07	2.61	2.72	0.90	1.66	2.87	2.67	1.91	0.23	0.23
Cystine 120	ME898270	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	1.89	1.96	1.85	1.97	1.94	1.87	1.94	1.96	0.81
Cystine 74	ME898271	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	1.92	1.97	1.85	1.95	1.94	1.90	1.89	1.93	0.87
Mannitol 89	ME898261	0.24	0.28	0.20	0.21	0.23	0.17	0.26	1.74	1.88	1.71	1.68	1.81	1.52	1.85	1.79	0.74
Sorbitol 71	ME898262	0.27	0.36	0.27	0.24	0.28	0.20	0.31	1.81	1.75	1.66	2.10	1.80	1.81	1.58	1.31	0.69
Xanthine 108	ME898244	0.57	1.02	0.38	0.74	0.56	0.40	0.44	1.44	2.37	1.47	1.61	2.18	1.52	1.67	0.23	0.00
Uric 124	ME898247	0.62	0.54	0.55	0.67	0.45	0.63	0.47	1.54	1.97	1.66	1.98	1.92	2.08	1.55	0.01	0.03
Uric 96	ME898248	0.51	0.60	0.45	0.65	0.52	0.50	0.42	1.18	1.71	1.41	1.56	1.57	1.65	1.28	NA	NA
Propionic PAR	ME898213	3.88	4.58	4.87	NA	NA	NA	3.92	0.03	NA	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.15
Myristic PAR	ME898267	0.03	2.84	0.32	3.12	2.90	3.25	0.02	0.01	2.07	0.06	0.54	1.26	0.24	0.01	0.00	0.01
Glycerol 2-phosphate 127	ME898250	1.88	0.21	2.78	2.02	1.37	4.84	2.03	0.19	0.16	0.12	0.10	0.15	0.14	0.14	0.07	0.05
O-Phospho-L-serine 97	ME898263	3.56	2.02	4.00	1.84	2.19	1.59	1.41	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
Methylmalonic 73	ME898326	1.34	2.99	1.91	1.82	2.66	2.43	1.11	0.23	0.18	0.28	0.31	0.23	0.28	0.21	0.42	0.08
GSSG 179	ME898292	1.12	2.19	1.31	2.22	2.06	2.56	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
GSSG 306	ME898291	1.32	2.75	1.74	2.87	2.67	3.32	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
NADPH 408	ME898297	4.04	1.92	2.09	1.78	2.22	2.09	2.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
Glycerol 2-phosphate 79	ME898249	3.23	1.63	3.07	2.07	1.97	1.68	2.82	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00
Asparagine 113	ME898235	2.60	1.44	2.49	1.72	1.72	1.74	1.88	0.35	0.42	0.34	0.41	0.40	0.39	0.36	0.27	0.08
Ketoglutaric 57	ME898241	2.28	1.68	2.29	2.17	1.88	1.92	1.62	0.37	0.38	0.34	0.33	0.38	0.32	0.36	0.14	0.21
Ketoglutaric 101	ME898240	2.47	1.89	2.53	2.34	2.08	2.10	1.71	0.21	0.21	0.22	0.20	0.21	0.18	0.22	0.04	0.02
Succinic 73	ME898227	2.13	1.78	2.40	2.23	2.02	2.53	1.54	0.26	0.24	0.25	0.25	0.24	0.27	0.25	0.16	0.06
Succinic 99	ME898228	2.17	1.76	2.37	2.31	1.90	2.45	1.53	0.24	0.28	0.26	0.24	0.28	0.29	0.29	0.17	0.06
Propionyl-CoA 408	ME898308	2.13	2.01	2.10	2.12	2.23	2.94	3.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
Formyl-CoA 408	ME898304	2.85	1.64	2.00	1.77	1.67	2.68	2.51	0.18	0.06	0.20	0.09	0.14	0.06	0.05	0.07	0.06
Formyl-CoA 79	ME898303	2.52	1.68	2.45	2.15	1.73	2.86	2.68	0.06	0.08	0.08	0.05	0.04	0.06	0.09	0.06	0.03
Citraconic 85	ME898233	2.50	2.15	2.51	1.61	2.05	2.00	2.32	0.10	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.06	0.07	0.32
FAD 408	ME898302	2.20	1.90	2.33	2.13	2.13	2.27	2.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	NA
Malonyl-CoA 408	ME898313	2.23	2.05	2.20	2.21	2.12	2.15	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
Methylcrotonyl-CoA 79	ME898311	2.27	2.30	2.37	2.19	2.34	2.27	2.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Acetyl-CoA 79	ME898305	2.50	2.29	2.54	2.05	2.36	2.31	2.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Taurine 80	ME898231	2.54	2.19	2.55	2.13	2.32	2.21	2.56	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00
Coenzyme A 79	ME898299	2.37	2.14	2.58	2.21	2.35	2.33	2.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
NAD+ 540	ME898293	2.50	2.24	2.50	2.27	2.24	2.34	2.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
FAD 79	ME898301	2.47	2.07	2.61	2.34	2.40	2.50	2.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Citric 111	ME898265	2.34	2.21	2.38	2.34	2.28	2.44	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00
Citric 173	ME898266	2.27	2.27	2.35	2.44	2.31	2.49	2.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
NADH 408	ME898295	2.25	2.22	2.35	2.45	2.30	2.56	2.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Glucose 6-phosphate 97	ME898276	2.88	2.24	3.09	1.92	2.46	1.67	2.37	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
Oleoyl-CoA (18:1) 79	ME898325	2.45	2.18	2.94	2.15	2.19	2.03	2.35	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00
Palmitoleyl-CoA (16:1) 79	ME898323	2.92	1.98	3.31	2.32	2.32	1.75	1.95	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01
Malic 115	ME898238	2.74	1.96	2.91	2.32	2.22	2.07	2.12	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00
Fumaric 71	ME898224	2.83	1.83	3.04	2.33	2.17	2.10	2.08	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01
Malic 71	ME898239	2.80	1.86	3.04	2.26	2.21	2.08	2.11	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00
Oxaloacetic 87	ME898234	2.65	1.30	2.64	2.35	1.76	2.31	2.13	0.37	0.17	0.17	0.16	0.17	0.16	0.25	0.04	0.02
Palmitoyl-CoA (16:0) 79	ME898324	2.77	1.63	2.86	2.67	2.12	2.79	1.79	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00
Alanine NEG PAR	ME898215	2.67	1.88	2.69	2.17	1.82	2.62	1.79	0.07	0.07	0.07	0.09	0.08	0.10	0.06	0.34	0.07
Butyryl-CoA 408	ME898310	2.76	1.56	3.00	2.14	2.05	2.34	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Butyryl-CoA 79	ME898309	2.98	1.70	3.18	2.22	2.10	2.50	1.94	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00
Lauroyl-CoA 408	ME898319	2.71	1.53	3.17	2.22	1.73	2.44	2.03	0.12	0.09	0.13	0.13	0.08	0.06	0.06	0.08	0.04
Myristoyl-CoA 408	ME898322	2.49	1.71	3.00	2.24	1.91	2.60	2.16	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01
Beta-Alanine PAR	ME898327	3.26	1.65	1.87	1.32	1.65	1.18	2.08	0.38	0.40	0.37	0.40	0.40	0.40	0.38	0.61	0.17
Palmitic PAR	ME898275	1.00	2.50	1.58	1.75	2.09	1.99	2.54	0.28	0.43	0.35	0.33	0.39	0.39	0.39	0.40	0.08
Succinyl-CoA 408	ME898315	2.12	2.01	1.97	1.76	2.03	1.74	2.68	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01
Coenzyme A 408	ME898300	1.76	1.62	1.88	1.64	1.74	1.69	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	NA
HMG-CoA 408	ME898317	2.06	1.85	2.08	1.60	1.75	1.93	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Palmitoleic PAR	ME898274	1.91	1.98	2.02	1.34	2.06	2.33	2.09	0.30	0.33	0.31	0.29	0.31	0.30	0.36	0.45	0.09
C75 209	ME898273	1.88	1.93	2.00	2.00	2.01	1.68	1.43	0.47	0.31	0.28	0.28	0.43	0.42	0.45	0.35	0.44
Stearic PAR	ME898278	1.58	1.84	1.82	1.86	2.29	1.66	1.95	0.25	0.48	0.35	0.30	0.35	0.39	0.48	0.63	0.18
Aspartic 115	ME898237	2.00	1.70	1.98	1.41	1.75	1.31	2.17	0.45	0.48	0.46	0.47	0.47	0.46	0.46	0.73	0.18
Aspartic 88	ME898236	1.89	1.68	1.85	1.41	1.73	1.30	2.07	0.49	0.51	0.51	0.50	0.52	0.51	0.52	0.79	0.19
Glutamic acid 102	ME898242	1.96	1.89	1.94	1.68	1.88	1.60	2.12	0.44	0.47	0.43	0.43	0.46	0.42	0.46	0.30	0.11
Glutamic acid 128	ME898243	2.12	2.05	2.11	1.67	2.01	1.55	2.39	0.34	0.37	0.34	0.34	0.36	0.30	0.35	0.24	0.07
myo-Inositol 161	ME898258	2.11	2.12	2.12	1.43	2.05	1.56	2.66	0.28	0.28	0.29	0.29	0.28	0.29	0.27	0.30	0.34
Pemetrexed 321	ME898289	NA	0.84	NA	0.84	NA	0.94	2.13	0.78	NA	0.77	NA	NA	0.74	0.78	0.79	NA
Ascorbic 157	ME898254	0.42	0.35	0.40	0.33	0.37	0.37	0.36	0.13	0.13	0.13	0.12	0.15	0.18	0.15	0.08	0.20
Ascorbic 79	ME898255	0.63	0.53	0.34	0.48	0.51	0.63	0.44	0.17	0.27	0.58	0.23	0.26	0.66	0.70	0.23	0.06
Acetic PAR	ME898212	1.36	1.49	1.10	1.21	1.21	1.68	1.26	0.53	0.58	0.62	0.69	0.66	0.61	0.38	0.44	3.22
Lactic 71	ME898218	1.21	0.63	1.35	1.38	0.89	2.14	0.61	0.90	0.78	0.93	1.43	1.01	1.50	0.58	0.00	NA
Lactic 87	ME898217	1.26	0.72	1.43	1.52	0.97	2.35	0.70	0.97	0.84	1.02	1.54	1.08	1.61	0.64	0.01	0.00
Cholic 343	ME898287	0.95	0.69	0.86	1.14	0.81	1.58	0.85	0.64	0.99	0.91	1.20	1.01	1.27	1.14	1.21	1.05
Pemetrexed 297	ME898288	0.74	1.21	0.81	0.80	1.02	0.52	0.91	0.75	0.99	1.23	0.97	0.91	1.11	1.22	1.67	0.66
Formic PAR	ME898211	0.59	0.60	0.71	0.84	0.46	1.20	0.44	1.37	1.39	1.40	1.55	1.39	1.66	1.13	0.77	1.06
3-Hydroxybutyric 59	ME898223	1.30	1.11	1.39	1.30	1.22	1.31	1.05	1.07	1.08	1.11	1.14	1.21	1.22	1.09	0.03	0.01
Arginine 131	ME898251	1.27	0.76	1.27	0.93	0.89	1.22	0.94	1.15	1.23	1.13	1.23	1.23	1.16	1.19	0.30	1.01
Arginine 156	ME898252	1.28	0.76	1.27	0.92	0.89	1.21	0.93	1.15	1.24	1.14	1.24	1.22	1.16	1.19	0.30	1.00
O-Phospho-L-serine 79	ME898264	1.89	1.15	2.14	1.06	1.25	0.97	0.87	NA	0.00	0.00	0.00	NA	0.00	0.00	0.00	NA
HMG-CoA 426	ME898318	1.17	1.03	1.29	0.92	0.94	1.16	1.16	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.00
NAD+ 273	ME898294	1.26	1.09	1.27	1.10	1.10	1.19	1.32	0.00	NA	NA	NA	0.00	NA	0.00	0.00	NA
Methylcrotonyl-CoA 408	ME898312	1.26	1.30	1.38	1.24	1.35	1.29	1.51	NA	NA	0.00	0.00	0.01	NA	0.00	0.00	NA
Acetyl-CoA 408	ME898306	1.58	1.45	1.53	1.25	1.51	1.40	1.61	0.00	NA	NA	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
Acetyl-CoA 461	ME898307	1.56	1.41	1.49	1.23	1.39	1.34	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	NA	0.00	0.00	NA
aCD 161	ME898320	1.41	0.92	0.64	0.61	2.44	1.10	1.21	0.78	NA	1.07	0.56	0.49	0.53	0.77	0.76	0.98
Riboflavin 243	ME898286	0.97	1.49	1.69	0.97	1.46	1.56	1.38	0.50	0.79	1.00	1.19	0.90	0.63	0.63	0.23	1.71
Butyric PAR	ME898216	1.71	1.38	1.84	1.84	1.55	2.03	1.32	0.63	0.40	0.63	0.58	0.51	0.62	0.40	0.02	1.32
Pyruvic 32	ME898214	1.82	1.03	2.04	1.83	1.41	2.33	0.93	0.68	0.41	0.71	0.65	0.56	0.71	0.45	0.00	1.63
Maleic 71	ME898225	1.80	1.72	1.82	1.56	1.65	1.58	1.46	0.64	0.50	0.25	0.57	0.42	0.59	0.48	0.43	0.91
Trehalose 59	ME898283	1.49	1.52	1.65	1.61	1.63	1.81	1.62	0.52	0.44	0.46	0.35	0.33	0.28	0.53	1.40	0.75
Cysteine PAR	ME898230	0.94	1.37	1.44	1.67	1.48	2.32	1.28	0.42	0.89	0.36	0.43	0.34	0.62	0.60	0.97	1.30
Phenylalanine 147	ME898245	1.55	1.56	1.58	1.58	1.59	1.71	1.53	0.34	0.57	0.32	0.49	0.51	0.44	0.43	0.82	2.06
Phenylalanine 72	ME898246	1.47	1.49	1.55	1.49	1.53	1.64	1.50	0.31	0.54	0.30	0.47	0.48	0.41	0.41	0.78	2.07
2-Hydroxybutyric 17	ME898221	1.22	2.11	0.55	1.43	1.21	1.98	1.70	0.87	0.58	0.81	0.37	0.95	0.85	0.98	0.55	0.23
Uridine 111	ME898272	1.14	2.13	0.96	1.94	1.55	1.21	1.97	0.49	1.02	0.54	0.67	0.76	0.94	1.03	0.22	0.01
Methylmalonic 55	ME898229	1.29	1.58	2.37	1.93	1.24	1.08	0.86	0.77	0.65	0.65	0.54	0.55	0.61	0.71	0.89	0.48
Xanthosine 151	ME898279	1.41	1.72	1.44	1.58	1.47	0.94	1.27	1.35	0.79	1.36	0.64	0.82	0.68	1.03	0.12	0.01
Malonic 59	ME898219	0.99	1.14	1.05	1.04	1.47	1.51	1.12	0.59	0.87	0.71	0.46	0.68	0.56	0.37	0.54	0.30
Fructose-1,6-bisphosphate 97	ME898281	1.76	1.44	1.58	0.90	1.24	1.09	1.30	0.49	0.60	1.04	0.80	0.80	0.84	0.80	0.90	0.46
3-Hydroxybutyric 17	ME898220	1.66	1.50	1.58	0.90	1.38	1.56	1.48	0.86	0.90	0.98	0.90	0.86	0.88	0.98	0.16	0.02
Citrulline 131	ME898253	2.03	1.39	2.12	1.38	1.58	1.62	1.67	0.55	0.65	0.59	0.59	0.64	0.61	0.68	0.38	0.06
Pyroglutamic 82	ME898232	1.60	1.33	1.63	1.44	1.38	1.72	1.57	0.74	0.74	0.73	0.73	0.72	0.71	0.74	0.56	0.23

Factors:

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Data matrix