Clustering data with hclust algorithm for (Study ST003735)
HILIC POSITIVE ION MODE (Analysis AN006129)| Metabolite | Structure | F1 | F2 | F3 | F4 | F5 | F6 | F7 | F8 | F9 | F10 | F11 | F12 | F13 | F14 | F15 | F16 | F17 | F18 | F19 | F20 | F21 | F22 | F23 | F24 | F25 | F26 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Niacin | ME977116 | 0.45 | NA | 0.51 | NA | 0.85 | NA | 0.45 | NA | 3.50 | NA | 0.54 | NA | 0.70 | NA | 0.92 | NA | 2.86 | NA | 0.40 | NA | 0.86 | NA | 0.48 | NA | 0.98 | NA |
| Tryptophan | ME977127 | 0.94 | NA | 0.44 | NA | 1.11 | NA | 0.57 | NA | 2.91 | NA | 2.05 | NA | 0.85 | NA | 0.56 | NA | 0.77 | NA | 0.58 | NA | 1.64 | NA | 0.20 | NA | 0.96 | NA |
| Cadaverine* | ME977088 | 0.28 | NA | 0.38 | NA | 0.71 | NA | 0.08 | NA | 1.41 | NA | 2.05 | NA | 0.65 | NA | 1.39 | NA | 1.28 | NA | 0.08 | NA | 1.72 | NA | 2.00 | NA | 1.17 | NA |
| Carnitine | ME977089 | 0.64 | NA | 0.68 | NA | 0.71 | NA | 0.34 | NA | 0.75 | NA | 2.81 | NA | 0.39 | NA | 0.63 | NA | 0.52 | NA | 0.53 | NA | 1.25 | NA | 3.16 | NA | 1.03 | NA |
| Homocitrulline | ME977102 | 0.58 | NA | 0.50 | NA | 0.53 | NA | 0.49 | NA | 1.72 | NA | 2.92 | NA | 0.47 | NA | 0.65 | NA | 0.50 | NA | 0.64 | NA | 1.26 | NA | 2.16 | NA | 0.99 | NA |
| Guanine | ME977099 | 1.86 | NA | 1.78 | NA | 1.43 | NA | 0.69 | NA | 0.23 | NA | 0.16 | NA | 1.64 | NA | 1.91 | NA | 2.07 | NA | 0.52 | NA | 0.10 | NA | 0.09 | NA | 1.01 | NA |
| Guanosine | ME977134 | 1.68 | NA | 1.61 | NA | 1.32 | NA | 0.34 | NA | 0.16 | NA | 0.21 | NA | 1.41 | NA | 2.09 | NA | 2.80 | NA | 0.15 | NA | 0.07 | NA | 0.11 | NA | 1.02 | NA |
| N-Acetyl-lysine* | ME977113 | 1.03 | NA | 2.84 | NA | 2.75 | NA | 0.45 | NA | 0.11 | NA | 0.13 | NA | 0.86 | NA | 1.91 | NA | 1.64 | NA | 0.65 | NA | 0.16 | NA | 0.08 | NA | 0.96 | NA |
| N-Acetylputrescine* | ME977114 | 1.00 | NA | 2.10 | NA | 1.88 | NA | 0.55 | NA | 0.70 | NA | 0.61 | NA | 1.42 | NA | 2.03 | NA | 1.46 | NA | 0.94 | NA | 0.30 | NA | 0.03 | NA | 0.81 | NA |
| N,N-Dimethyldodecylamine N-oxide* | ME977110 | 0.97 | NA | 1.32 | NA | 2.25 | NA | 0.86 | NA | 1.84 | NA | 0.33 | NA | 0.39 | NA | 0.23 | NA | 0.72 | NA | 1.25 | NA | 0.14 | NA | 0.15 | NA | 1.69 | NA |
| Glucosamine | ME977130 | 0.63 | NA | 0.24 | NA | 0.24 | NA | 0.90 | NA | 1.35 | NA | 1.20 | NA | 1.48 | NA | 0.84 | NA | 1.14 | NA | 1.09 | NA | 2.19 | NA | 0.70 | NA | 1.17 | NA |
| Adenosine | ME977083 | 1.33 | NA | 0.46 | NA | 0.21 | NA | 0.72 | NA | 2.03 | NA | 1.78 | NA | 1.06 | NA | 0.58 | NA | 0.40 | NA | 1.24 | NA | 1.60 | NA | 1.30 | NA | 0.92 | NA |
| Adenine | ME977082 | 1.28 | NA | 1.02 | NA | 0.44 | NA | 0.94 | NA | 1.44 | NA | 1.01 | NA | 1.25 | NA | 0.96 | NA | 0.87 | NA | 1.34 | NA | 1.28 | NA | 0.71 | NA | 0.98 | NA |
| beta-Homoproline* | ME977086 | 1.30 | NA | 0.68 | NA | 0.88 | NA | 0.70 | NA | 1.62 | NA | 1.17 | NA | 1.18 | NA | 0.93 | NA | 0.58 | NA | 0.88 | NA | 1.25 | NA | 1.01 | NA | 1.11 | NA |
| Flavin mononucleotide | ME977097 | 0.89 | NA | 0.53 | NA | 0.47 | NA | 0.89 | NA | 1.16 | NA | 1.44 | NA | 0.81 | NA | 0.60 | NA | 0.55 | NA | 1.10 | NA | 1.70 | NA | 1.84 | NA | 1.01 | NA |
| Riboflavin | ME977125 | 0.94 | NA | 0.21 | NA | 0.18 | NA | 1.61 | NA | 1.03 | NA | 1.27 | NA | 0.96 | NA | 0.33 | NA | 0.30 | NA | 1.48 | NA | 1.64 | NA | 2.47 | NA | 0.94 | NA |
| Homocysteine | ME977103 | 0.92 | NA | 0.35 | NA | 0.15 | NA | 0.80 | NA | 1.99 | NA | 0.84 | NA | 0.96 | NA | 0.48 | NA | 0.32 | NA | 0.89 | NA | 2.96 | NA | 1.65 | NA | 0.97 | NA |
| Pantothenic acid | ME977118 | 1.47 | NA | 0.26 | NA | 0.24 | NA | 1.29 | NA | 1.33 | NA | 1.05 | NA | 1.04 | NA | 0.36 | NA | 0.26 | NA | 1.53 | NA | 2.28 | NA | 1.16 | NA | 1.08 | NA |
| Choline | ME977090 | 1.80 | NA | 2.43 | NA | 2.15 | NA | 0.99 | NA | 0.24 | NA | 0.41 | NA | 1.14 | NA | 0.96 | NA | 0.67 | NA | 1.15 | NA | 0.39 | NA | 0.28 | NA | 0.96 | NA |
| Lysine | ME977107 | 2.01 | NA | 2.78 | NA | 1.93 | NA | 1.20 | NA | 0.04 | NA | 0.07 | NA | 0.99 | NA | 0.93 | NA | 0.48 | NA | 1.79 | NA | 0.11 | NA | 0.15 | NA | 1.00 | NA |
| Glutamine | ME977098 | 1.59 | NA | 2.01 | NA | 1.65 | NA | 1.40 | NA | 0.05 | NA | 0.25 | NA | 0.53 | NA | 0.79 | NA | 0.47 | NA | 2.36 | NA | 0.71 | NA | 0.46 | NA | 1.08 | NA |
| Homoserine* | ME977131 | 2.42 | NA | 1.79 | NA | 1.22 | NA | 1.54 | NA | 0.06 | NA | 0.26 | NA | 0.95 | NA | 1.06 | NA | 0.53 | NA | 1.49 | NA | 0.36 | NA | 0.79 | NA | 1.01 | NA |
| N,N-Dimethylglycine* | ME977111 | 1.17 | NA | 0.63 | NA | 0.47 | NA | 1.23 | NA | 0.22 | NA | 0.64 | NA | 1.20 | NA | 1.35 | NA | 0.86 | NA | 3.01 | NA | 0.53 | NA | 0.99 | NA | 1.06 | NA |
| 2-Deoxyadenosine | ME977081 | 1.04 | NA | 2.20 | NA | 0.77 | NA | 0.56 | NA | 0.64 | NA | 0.73 | NA | 0.67 | NA | 0.84 | NA | 0.71 | NA | 1.06 | NA | 1.64 | NA | 1.85 | NA | 0.92 | NA |
| Citrulline | ME977091 | 1.46 | NA | 1.03 | NA | 0.75 | NA | 0.84 | NA | 0.70 | NA | 1.08 | NA | 1.16 | NA | 0.88 | NA | 0.51 | NA | 1.49 | NA | 0.76 | NA | 1.95 | NA | 0.96 | NA |
| Histamine | ME977100 | 0.64 | NA | 1.05 | NA | 0.43 | NA | 0.44 | NA | 0.36 | NA | 1.69 | NA | 1.49 | NA | 1.79 | NA | 0.79 | NA | 1.29 | NA | 0.76 | NA | 1.60 | NA | 1.06 | NA |
| Cytosine | ME977093 | 2.59 | NA | 1.02 | NA | 0.87 | NA | 1.15 | NA | 0.79 | NA | 0.77 | NA | 1.29 | NA | 0.99 | NA | 0.61 | NA | 0.76 | NA | 0.79 | NA | 0.83 | NA | 1.01 | NA |
| Ethanolamine* | ME977095 | 1.09 | NA | 1.36 | NA | 0.68 | NA | 0.86 | NA | 1.17 | NA | 0.67 | NA | 1.66 | NA | 1.62 | NA | 1.23 | NA | 1.41 | NA | 0.31 | NA | 0.26 | NA | 1.05 | NA |
| Methylguanine* | ME977109 | 1.08 | NA | 1.11 | NA | 0.74 | NA | 0.67 | NA | 1.50 | NA | 0.74 | NA | 1.46 | NA | 1.62 | NA | 1.77 | NA | 0.97 | NA | 0.69 | NA | 0.54 | NA | 0.86 | NA |
| 1-Methylguanine | ME977080 | 1.37 | NA | 1.39 | NA | 1.27 | NA | 0.73 | NA | 0.97 | NA | 0.55 | NA | 1.20 | NA | 1.37 | NA | 1.50 | NA | 1.07 | NA | 0.66 | NA | 0.45 | NA | 0.99 | NA |
| Hypoxanthine | ME977104 | 1.24 | NA | 1.13 | NA | 0.96 | NA | 0.91 | NA | 1.19 | NA | 0.83 | NA | 1.22 | NA | 1.11 | NA | 1.23 | NA | 1.19 | NA | 0.96 | NA | 0.57 | NA | 0.99 | NA |
| S-Adenosylmethionine (SAM) | ME977126 | 1.13 | NA | 1.16 | NA | 1.21 | NA | 1.11 | NA | 0.25 | NA | 1.02 | NA | 1.23 | NA | 1.63 | NA | 1.37 | NA | 1.32 | NA | 0.27 | NA | 0.42 | NA | 1.05 | NA |
| N8-Acetylspermidine | ME977112 | 1.23 | NA | 1.44 | NA | 1.27 | NA | 1.19 | NA | 0.52 | NA | 0.63 | NA | 1.56 | NA | 1.18 | NA | 0.90 | NA | 1.23 | NA | 0.80 | NA | 0.39 | NA | 1.06 | NA |
| Putrescine | ME977133 | 1.58 | NA | 1.26 | NA | 1.11 | NA | 1.37 | NA | 0.29 | NA | 0.37 | NA | 1.66 | NA | 1.39 | NA | 1.02 | NA | 1.40 | NA | 0.39 | NA | 0.33 | NA | 1.12 | NA |
| Uridine diphosphate galactose* | ME977135 | 0.78 | NA | 0.96 | NA | 1.06 | NA | 1.13 | NA | 0.32 | NA | 0.83 | NA | 0.91 | NA | 1.05 | NA | 1.00 | NA | 1.51 | NA | 1.52 | NA | 0.58 | NA | 1.13 | NA |
| Pyridoxal 5-phosphate* | ME977123 | 0.93 | NA | 1.03 | NA | 0.68 | NA | 1.24 | NA | 0.93 | NA | 0.73 | NA | 0.65 | NA | 0.89 | NA | 1.22 | NA | 1.22 | NA | 1.11 | NA | 1.45 | NA | 0.97 | NA |
| Betaine | ME977087 | 1.30 | NA | 1.13 | NA | 1.08 | NA | 1.20 | NA | 0.46 | NA | 0.63 | NA | 1.10 | NA | 0.93 | NA | 0.71 | NA | 1.15 | NA | 1.21 | NA | 1.24 | NA | 1.13 | NA |
| FAD | ME977096 | 1.13 | NA | 0.67 | NA | 0.55 | NA | 1.20 | NA | 0.79 | NA | 0.87 | NA | 1.19 | NA | 0.79 | NA | 0.68 | NA | 1.52 | NA | 1.37 | NA | 1.23 | NA | 1.01 | NA |
| Valine | ME977129 | 1.70 | NA | 1.04 | NA | 1.26 | NA | 1.19 | NA | 0.46 | NA | 0.93 | NA | 0.97 | NA | 0.90 | NA | 0.69 | NA | 1.34 | NA | 0.96 | NA | 0.97 | NA | 1.02 | NA |
| Pipecolic acid | ME977121 | 1.36 | NA | 1.01 | NA | 1.31 | NA | 1.07 | NA | 0.80 | NA | 1.20 | NA | 0.75 | NA | 0.94 | NA | 0.68 | NA | 1.39 | NA | 0.87 | NA | 0.92 | NA | 1.04 | NA |
| Phenylalanine | ME977120 | 1.45 | NA | 0.87 | NA | 1.28 | NA | 1.21 | NA | 0.91 | NA | 1.07 | NA | 0.92 | NA | 1.03 | NA | 0.96 | NA | 1.61 | NA | 0.79 | NA | 0.51 | NA | 0.96 | NA |
| Phenylethanolamine* | ME977079 | 1.45 | NA | 0.87 | NA | 1.29 | NA | 1.18 | NA | 0.91 | NA | 1.10 | NA | 0.93 | NA | 1.02 | NA | 0.94 | NA | 1.63 | NA | 0.78 | NA | 0.48 | NA | 0.96 | NA |
| Tyrosine | ME977128 | 1.44 | NA | 0.86 | NA | 1.20 | NA | 1.09 | NA | 0.75 | NA | 1.13 | NA | 1.00 | NA | 1.02 | NA | 0.94 | NA | 1.43 | NA | 0.87 | NA | 0.81 | NA | 0.98 | NA |
| Isoleucine | ME977105 | 1.54 | NA | 0.88 | NA | 1.15 | NA | 1.12 | NA | 0.78 | NA | 1.20 | NA | 0.87 | NA | 0.95 | NA | 0.84 | NA | 1.56 | NA | 0.93 | NA | 0.71 | NA | 0.99 | NA |
| Leucine | ME977106 | 1.50 | NA | 0.94 | NA | 1.27 | NA | 1.18 | NA | 0.73 | NA | 1.19 | NA | 0.89 | NA | 1.02 | NA | 0.86 | NA | 1.50 | NA | 0.80 | NA | 0.67 | NA | 0.98 | NA |
| Methionine | ME977108 | 1.74 | NA | 1.02 | NA | 1.40 | NA | 1.33 | NA | 0.61 | NA | 1.34 | NA | 0.96 | NA | 0.95 | NA | 0.86 | NA | 1.67 | NA | 0.14 | NA | 0.55 | NA | 0.97 | NA |
| Ornithine* | ME977117 | 1.37 | NA | 1.26 | NA | 1.74 | NA | 1.14 | NA | 0.44 | NA | 0.89 | NA | 0.82 | NA | 1.26 | NA | 1.06 | NA | 1.39 | NA | 0.50 | NA | 0.48 | NA | 1.01 | NA |
| Creatinine | ME977092 | 1.59 | NA | 0.77 | NA | 1.52 | NA | 1.29 | NA | 0.64 | NA | 1.16 | NA | 0.85 | NA | 1.23 | NA | 1.12 | NA | 1.71 | NA | 0.39 | NA | 0.35 | NA | 0.95 | NA |
| Phenethylamine* | ME977119 | 1.37 | NA | 0.78 | NA | 1.56 | NA | 1.09 | NA | 0.60 | NA | 0.90 | NA | 1.12 | NA | 1.18 | NA | 1.11 | NA | 1.52 | NA | 0.69 | NA | 0.53 | NA | 0.99 | NA |
| Proline | ME977122 | 1.13 | NA | 1.41 | NA | 1.65 | NA | 0.70 | NA | 0.63 | NA | 1.22 | NA | 0.68 | NA | 1.09 | NA | 0.82 | NA | 0.85 | NA | 0.88 | NA | 1.56 | NA | 0.96 | NA |
| Histidine | ME977101 | 1.11 | NA | 0.94 | NA | 1.21 | NA | 0.86 | NA | 0.67 | NA | 1.48 | NA | 0.80 | NA | 1.09 | NA | 0.82 | NA | 1.36 | NA | 0.89 | NA | 1.13 | NA | 1.05 | NA |
| 5-Aminovaleric acid | ME977132 | 1.09 | NA | 1.17 | NA | 1.45 | NA | 0.93 | NA | 0.49 | NA | 1.33 | NA | 0.84 | NA | 1.33 | NA | 1.07 | NA | 1.02 | NA | 0.67 | NA | 1.24 | NA | 0.95 | NA |
| Alanine | ME977084 | 1.35 | NA | 1.28 | NA | 1.49 | NA | 0.85 | NA | 0.61 | NA | 1.13 | NA | 0.91 | NA | 1.25 | NA | 0.97 | NA | 1.01 | NA | 0.78 | NA | 0.84 | NA | 1.00 | NA |
| Arginine | ME977085 | 0.72 | NA | 1.62 | NA | 1.31 | NA | 0.89 | NA | 0.84 | NA | 1.02 | NA | 0.62 | NA | 1.50 | NA | 0.94 | NA | 1.14 | NA | 0.98 | NA | 0.76 | NA | 1.06 | NA |
| NAD | ME977115 | 0.95 | NA | 1.17 | NA | 0.91 | NA | 0.76 | NA | 0.70 | NA | 0.85 | NA | 0.98 | NA | 1.36 | NA | 1.26 | NA | 0.98 | NA | 1.13 | NA | 1.06 | NA | 1.06 | NA |
| Deoxycarnitine* | ME977094 | 0.11 | NA | 0.17 | NA | 0.20 | NA | 0.09 | NA | 1.08 | NA | 2.79 | NA | 0.16 | NA | 0.20 | NA | 0.14 | NA | 0.11 | NA | 1.86 | NA | 5.70 | NA | 0.96 | NA |
| Pyridoxine | ME977124 | 0.43 | NA | 0.29 | NA | 0.27 | NA | 0.36 | NA | 0.07 | NA | 0.27 | NA | 0.50 | NA | 0.38 | NA | 0.35 | NA | 0.65 | NA | 0.11 | NA | 9.59 | NA | 0.72 | NA |
Factors:
| F1 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F2 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F3 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F4 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F5 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F6 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F7 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F8 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F9 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F10 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F11 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F12 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F13 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F14 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F15 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F16 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F17 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F18 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F19 | Treatment:Control | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F20 | Treatment:Control | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F21 | Treatment:Control | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F22 | Treatment:Control | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F23 | Treatment:Control | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F24 | Treatment:Control | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F25 | Treatment:QC | Timepoint:QC | Sample source:E coli bacteria cell pellet QC |
| F26 | Treatment:QC | Timepoint:QC | Sample source:E coli bacteria medium supernatant QC |
