Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for Rat Retinal Detachment Metabolomics Timecourse (Study ST000832)

HILIC NEGATIVE ION MODE/Nucleotides, Amino acids (Analysis AN001840)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14
ADENINE	ME268389	4.40	0.57	0.78	0.73	0.99	0.61	3.69	0.20	0.26	0.36	0.25	0.41	0.15	0.59
GLYCERATE 3-PHOSPHATE	ME268430	0.68	0.84	0.54	0.42	0.52	0.52	0.53	2.66	1.79	0.51	0.43	0.42	3.44	0.70
PHOSPHOCREATINE	ME268436	0.45	1.27	0.51	0.65	0.43	0.80	0.65	0.80	2.22	1.00	0.69	0.95	1.04	2.55
DL-HOMOCYSTEIC ACID	ME268435	1.07	1.05	0.66	1.01	1.17	0.61	0.87	0.65	1.60	0.81	1.03	0.84	1.65	0.97
MALIC ACID	ME268399	1.96	0.83	1.02	0.93	1.82	1.50	1.50	0.36	0.66	0.75	0.17	0.66	0.51	1.35
ADENOSINE 5^-DIPHOSPHATE	ME268411	1.88	1.18	1.41	1.58	1.87	1.23	1.68	0.20	0.49	0.57	0.54	0.71	0.23	0.43
SUCCINIC ACID	ME268379	1.46	1.53	1.33	1.08	1.46	1.93	2.09	0.22	0.40	0.46	0.17	0.87	0.23	0.78
ACETYL-COA	ME268395	0.80	1.50	1.81	1.85	1.82	1.65	0.82	0.39	0.55	0.57	0.79	0.90	0.16	0.39
NADP-REDUCED	ME268390	0.84	1.33	1.44	1.60	1.67	2.08	0.96	0.37	0.78	0.68	0.54	0.78	0.27	0.39
GUANOSINE DIPHOSPHATE	ME268434	1.18	1.33	1.58	1.93	2.50	1.55	0.72	0.20	0.52	0.64	0.49	0.64	0.30	0.41
INOSINIC ACID	ME268433	1.15	1.60	1.92	1.58	2.40	1.08	1.18	0.32	0.44	0.51	0.36	0.79	0.33	0.34
L-ASPARTIC ACID	ME268407	1.14	0.93	1.31	1.08	2.27	1.03	0.92	0.76	0.81	0.91	0.52	1.25	0.61	0.43
UDP-GLUCURONIC ACID	ME268387	0.78	0.97	1.93	1.11	2.72	1.08	0.82	0.50	0.63	0.89	0.47	1.27	0.37	0.46
NADH	ME268392	0.67	1.40	1.60	1.38	1.45	1.47	1.03	0.33	0.65	0.60	0.45	0.82	0.25	1.65
GLUCONIC ACID	ME268378	0.83	1.00	1.86	1.01	1.59	0.90	1.00	0.70	0.62	0.96	0.54	1.65	0.58	0.77
L-LYSINE	ME268409	1.22	1.27	1.66	0.93	1.26	1.21	1.23	0.63	0.63	0.99	0.55	1.31	0.50	0.61
OXIGLUTATIONE	ME268426	1.81	0.95	1.63	1.22	1.37	1.40	1.19	0.58	0.69	0.63	0.69	0.64	0.53	0.68
3-GLYCEROPHOSPHATE	ME268431	0.88	1.36	1.95	1.43	1.46	1.41	0.60	0.75	0.78	0.79	0.64	0.81	0.58	0.56
2^-DEOXYURIDINE	ME268383	1.30	1.41	1.28	1.61	1.78	1.46	1.02	0.40	0.67	0.74	0.38	1.00	0.29	0.65
UDPGLUCOSE	ME268401	1.18	1.24	1.66	1.39	1.81	1.26	1.21	0.49	0.64	0.68	0.46	0.89	0.45	0.64
UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE	ME268397	1.11	1.17	1.62	1.46	1.88	1.24	0.99	0.49	0.79	0.76	0.60	0.96	0.32	0.59
L-METHIONINE	ME268416	1.24	1.44	1.48	1.24	1.15	1.49	0.91	0.82	0.73	0.79	0.54	0.86	0.65	0.65
L-TYROSINE	ME268413	1.42	1.46	1.29	1.33	1.04	1.48	1.01	0.80	0.78	0.70	0.60	0.76	0.62	0.72
PHENYLPYRUVIC ACID	ME268438	1.55	1.63	1.33	1.37	0.91	1.58	0.85	0.82	0.72	0.67	0.59	0.75	0.59	0.65
ACETYLPHOSPHATE	ME268388	1.33	1.15	1.34	0.91	1.62	1.20	0.89	0.79	1.02	0.80	0.67	0.78	0.73	0.77
GLUTATHIONE	ME268382	1.41	1.02	1.41	1.44	1.52	1.24	1.13	0.69	0.95	0.66	0.64	0.66	0.50	0.72
RIBULOSE-5-PHOSPHATE	ME268393	1.38	1.11	1.39	1.32	1.65	1.28	0.78	0.64	0.98	0.81	0.62	0.84	0.51	0.69
LACTIC ACID	ME268415	0.90	1.19	1.30	1.09	1.27	1.25	1.27	0.69	0.90	0.81	0.72	1.07	0.61	0.92
L-PROLINE	ME268384	0.96	1.15	1.40	1.06	1.20	1.21	1.02	0.78	0.80	0.99	0.65	1.36	0.62	0.78
INOSINE	ME268410	0.91	1.25	1.40	1.32	1.36	1.30	0.68	0.83	1.01	0.83	0.77	1.00	0.59	0.75
DL-SERINE	ME268418	0.96	1.40	1.37	1.45	1.42	1.41	0.99	0.65	0.71	0.82	0.56	1.04	0.58	0.64
L-THREONINE	ME268423	1.12	1.29	1.36	1.25	1.56	1.42	0.92	0.59	0.67	0.88	0.52	1.12	0.56	0.74
L-HISTIDINE	ME268421	1.05	1.31	1.51	1.40	1.42	1.18	0.98	0.71	0.69	0.82	0.62	1.07	0.59	0.66
L-TRYPTOPHAN	ME268424	1.12	1.32	1.61	1.35	1.27	1.25	0.98	0.71	0.72	0.87	0.61	0.91	0.60	0.69
L-ARGININE	ME268425	0.95	1.28	1.65	1.28	1.52	1.21	1.04	0.61	0.70	0.80	0.48	1.15	0.66	0.68
L-PHENYLALANINE	ME268417	1.09	1.25	1.59	1.23	1.57	1.24	0.92	0.68	0.62	0.88	0.54	1.17	0.56	0.66
ROBISON ESTER	ME268406	1.21	1.28	1.26	1.31	1.45	1.24	1.07	0.69	0.77	0.75	0.52	0.79	0.62	1.03
CREATININE	ME268404	1.12	1.25	1.19	1.27	1.35	1.33	1.11	0.79	0.94	0.63	0.75	0.82	0.67	0.75
TAURINE	ME268380	1.13	1.18	1.19	1.25	1.42	1.23	1.09	0.81	0.94	0.76	0.70	0.86	0.68	0.75
CREATINE	ME268403	1.24	1.29	1.22	1.27	1.31	1.40	1.14	0.77	0.96	0.63	0.67	0.79	0.57	0.73
L-ALANINE	ME268405	1.09	1.39	1.21	1.35	1.36	1.33	1.09	0.77	0.93	0.67	0.64	0.80	0.57	0.79
O-PHOSPHO-L-SERINE	ME268429	1.18	1.18	1.41	1.14	1.40	1.30	1.15	0.77	0.83	0.73	0.66	1.08	0.54	0.61
L-ASPARAGINE	ME268420	1.01	1.32	1.33	1.22	1.56	1.23	0.98	0.81	0.78	0.80	0.58	1.05	0.67	0.66
D-PANTOTHENIC ACID	ME268427	1.03	1.33	1.33	1.33	1.49	1.25	1.09	0.86	0.88	0.73	0.66	0.80	0.62	0.62
L-GLUTAMIC ACID	ME268391	1.15	1.21	1.30	1.21	1.52	1.18	1.08	0.78	0.85	0.81	0.66	0.96	0.61	0.67
D-GLUCOSE	ME268402	1.23	1.18	1.33	1.38	1.46	1.24	1.07	0.79	0.82	0.72	0.64	0.86	0.63	0.65
FAD	ME268398	1.15	1.17	1.26	1.32	1.55	1.27	1.05	0.75	0.86	0.72	0.61	0.94	0.64	0.72
BETA-NAD+	ME268385	1.01	1.29	1.32	1.34	1.56	1.27	1.16	0.52	0.93	0.85	0.76	0.94	0.40	0.67
COENZYME II	ME268386	1.08	1.11	1.33	1.20	1.56	0.91	1.11	0.78	0.98	0.84	0.75	0.96	0.60	0.76
HYPOXANTHINE	ME268432	0.97	1.16	1.48	1.16	1.50	1.15	1.04	0.61	0.85	0.87	0.71	1.13	0.69	0.68
L-GLUTAMINE	ME268408	1.05	1.20	1.24	1.30	1.53	1.10	1.23	0.68	0.74	0.82	0.69	1.15	0.54	0.72
L-ORNITHINE	ME268419	1.20	1.22	0.97	1.02	1.38	1.12	1.17	0.83	0.99	0.83	0.68	1.03	0.57	0.98
L-VALINE	ME268422	1.12	1.09	1.03	1.11	1.30	0.98	1.05	0.82	1.08	0.85	0.91	0.89	0.87	0.90
N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE 1-PHOSPHATE	ME268394	1.25	1.17	1.39	1.10	1.20	1.07	1.08	1.03	0.75	0.82	0.65	0.88	0.89	0.71
XANTHINE	ME268381	1.12	1.15	1.24	1.07	1.07	1.10	0.83	1.15	1.09	0.76	0.78	0.98	1.05	0.61
STEARIC ACID	ME268400	1.24	1.19	1.14	1.23	1.31	1.26	0.96	0.95	0.94	0.73	0.73	0.82	0.83	0.68
OLEIC ACID	ME268396	1.10	1.19	1.13	1.14	1.36	1.23	0.72	1.06	1.12	0.78	0.79	0.95	0.95	0.48
PALMITIC ACID	ME268437	1.10	1.15	1.09	1.19	1.39	1.21	0.86	1.03	1.08	0.72	0.76	0.83	0.96	0.63
ADENOSINE 5^-MONOPHOSPHATE	ME268414	1.72	1.06	1.69	1.51	1.71	1.09	3.07	0.25	0.29	0.39	0.28	0.46	0.29	0.19
5^-GUANYLIC ACID	ME268428	1.16	1.36	2.47	1.64	2.91	1.23	1.87	0.09	0.12	0.29	0.18	0.51	0.10	0.09
URIDYLIC ACID	ME268412	0.89	1.40	2.40	1.77	2.46	0.87	1.70	0.12	0.20	0.35	0.24	0.51	0.17	0.07

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Data matrix