Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for Diet, genetics and gut microbiome drive dynamic changes in plasma metabolites [cecal] (Study ST000880)

Reversed phase POSITIVE ION MODE (Analysis AN001436)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12
SM(d18:1/24:0)	ME227456	1.49	1.18	1.51	0.07	0.10	1.93	0.20	0.05	0.64	0.20	0.10	4.65
SM(d18:1/14:0)	ME227448	0.39	0.64	0.76	0.05	0.03	1.83	0.15	0.02	0.72	0.05	0.03	5.59
SM(d18:1/22:0)	ME227454	0.51	0.64	0.91	0.13	0.20	2.19	0.39	0.22	1.08	0.26	0.18	5.27
LPC(14:0)	ME227373	0.06	0.94	0.02	0.04	0.07	1.51	NA	NA	0.32	0.20	NA	3.96
LPC(16:1)	ME227374	0.04	0.18	0.03	NA	0.04	0.68	0.09	0.00	0.83	1.49	NA	4.47
PC(P-36:2)/PC(O-36:3)	ME227414	3.53	NA	4.57	1.12	0.42	0.12	1.27	NA	0.65	0.51	0.20	0.04
TG(55:2)	ME227477	6.07	1.26	2.21	0.30	0.11	0.09	0.78	0.97	0.12	0.09	0.18	0.10
CE(20:3)	ME227465	4.74	2.46	2.23	0.12	0.48	NA	0.08	0.18	0.07	0.07	0.15	0.02
PC(16:0_20:4)	ME227396	5.94	2.30	3.19	0.09	0.09	0.08	0.17	0.05	0.13	0.24	0.07	0.18
PE(32:1)	ME227419	0.23	0.49	0.77	1.71	3.22	0.01	0.05	0.49	0.08	NA	2.16	NA
PS(36:1)	ME227472	2.04	1.93	3.76	0.56	0.08	0.06	1.93	0.44	1.52	0.19	0.08	0.10
Sphingosine	ME227443	1.33	2.10	4.29	0.44	0.54	0.73	0.51	0.51	0.82	0.35	0.52	0.70
CE(18:3)	ME227459	2.26	2.16	2.91	0.57	0.70	NA	0.46	0.70	0.87	0.09	0.07	0.09
PE(34:2)	ME227421	1.61	3.02	3.37	0.82	1.09	0.08	0.42	0.58	0.33	0.20	0.95	0.13
Cer(d18:1/24:1)	ME227447	2.11	3.01	1.92	0.04	0.01	0.76	0.03	0.04	0.29	0.06	0.73	0.99
LPE(16:0)	ME227382	2.24	3.66	2.81	0.12	0.38	0.55	0.04	0.29	0.98	0.16	0.45	0.77
CE(20:5)	ME227463	2.76	1.10	1.59	0.09	NA	0.04	0.08	NA	0.12	NA	NA	0.04
CE(22:6)	ME227466	3.57	2.18	2.30	0.21	0.12	0.24	0.53	0.38	0.77	0.05	0.26	0.63
LPC(18:2)	ME227376	1.07	5.08	1.50	0.17	0.32	0.62	0.04	0.07	0.42	1.08	0.27	1.48
LPE(18:2)	ME227383	0.58	3.36	0.62	NA	NA	NA	NA	0.09	0.02	NA	0.01	0.06
TG(43:2)	ME227493	0.03	0.07	NA	1.56	0.63	0.14	2.23	0.17	2.49	0.88	0.47	0.37
TG(49:3)	ME227484	2.38	0.02	0.23	0.75	NA	NA	1.34	2.11	NA	0.07	0.02	0.12
TG(47:1)	ME227489	3.64	0.43	1.29	0.92	0.13	0.33	1.37	1.79	0.16	0.27	0.66	1.07
TG(47:2)	ME227488	3.38	0.12	0.47	0.54	0.03	0.16	1.04	2.33	NA	0.10	0.31	1.24
TG(55:3)	ME227476	4.90	0.07	0.47	1.46	0.12	0.04	2.22	2.19	0.03	0.18	0.12	0.07
TG(49:1)	ME227486	4.06	0.41	1.00	1.23	0.14	0.09	1.92	1.75	0.45	0.36	0.33	0.25
TG(49:2)	ME227485	4.40	0.38	0.85	1.33	0.05	0.03	1.95	2.05	0.05	0.19	0.21	0.23
TG(51:1)	ME227482	2.98	0.40	0.85	1.63	0.51	0.08	1.79	1.31	0.58	0.88	0.28	0.09
TG(53:2)	ME227479	3.48	0.18	0.79	0.92	0.20	NA	1.32	1.75	0.07	0.21	0.14	NA
TG(51:3)	ME227480	3.17	0.12	0.61	1.50	0.18	0.02	1.92	2.21	0.06	0.32	0.24	0.04
TG(51:2)	ME227481	3.43	0.23	0.79	1.74	0.18	0.05	2.27	2.17	0.28	0.47	0.28	0.05
TG(53:3)	ME227478	3.65	0.23	0.80	1.85	0.24	0.14	2.07	1.94	0.15	0.44	0.26	0.16
CE(20:4)	ME227464	2.05	0.17	0.27	0.88	0.32	0.86	2.01	0.96	1.67	0.45	0.92	1.25
PC(38:3)	ME227404	1.63	0.20	0.49	2.31	1.05	0.31	1.67	0.88	1.05	1.08	0.71	0.50
TG(49:0)	ME227487	1.75	0.42	0.30	2.13	0.69	0.13	2.01	1.11	1.18	1.51	0.41	0.18
PE(P-38:4)/PE(O-38:5)	ME227441	1.56	NA	0.70	1.68	0.86	0.71	1.37	0.25	1.19	1.00	0.60	0.77
PC(P-16:0/20:4)/PC(O-16:1/20:4)	ME227412	1.91	0.15	0.67	1.36	0.90	0.58	1.54	0.35	1.18	1.52	0.82	0.93
PC(P-38:5)/PC(O-38:6)	ME227418	2.24	0.06	0.97	1.39	0.94	0.44	1.67	0.50	0.93	1.31	0.68	0.87
C36:4 PC-B	ME227397	1.74	0.24	0.77	1.26	0.85	0.78	1.58	0.53	1.62	0.78	0.82	0.97
PC(38:2)	ME227405	2.00	0.33	0.78	1.24	1.05	0.49	1.15	0.67	1.39	1.05	0.70	1.10
PC(36:1)	ME227400	1.73	0.38	0.95	1.53	1.09	0.49	1.26	0.81	1.12	1.09	0.75	0.78
PC(36:2)	ME227399	1.98	0.54	0.90	1.44	1.01	0.52	1.39	0.70	1.14	0.96	0.70	0.71
PE(P-34:1)/PE(O-34:2)	ME227434	1.84	0.85	1.28	1.61	1.10	0.40	1.26	0.55	0.69	0.83	1.14	0.54
PE(P-36:1)/PE(O-36:2)	ME227438	1.32	0.41	1.37	2.04	1.09	0.58	1.38	0.40	1.06	0.96	0.65	0.84
PE(P-36:2)/PE(O-36:3)	ME227437	1.89	0.20	1.12	1.90	1.14	0.50	1.52	0.46	0.83	0.98	0.79	0.70
PE(40:6)	ME227432	1.04	0.11	0.75	2.08	0.96	0.51	1.73	0.78	0.46	1.32	0.70	1.50
CE(18:1)	ME227461	0.97	0.55	0.65	1.44	0.95	0.42	1.65	1.63	1.21	1.12	0.71	0.62
PE(38:4)	ME227430	1.21	0.30	1.03	1.85	0.94	0.56	1.66	1.08	0.78	1.14	0.65	0.81
PC(38:4)	ME227403	1.11	0.13	0.38	2.01	1.10	0.62	1.61	0.75	1.37	1.13	0.86	0.77
PE(36:1)	ME227426	1.32	0.32	0.69	1.75	1.24	0.70	1.26	0.87	1.08	1.06	0.82	0.82
PE(36:2)	ME227425	1.13	0.44	0.60	1.73	1.29	0.73	1.19	0.89	0.91	1.17	0.98	0.85
PE(P-34:2)/PE(O-34:3)	ME227433	2.51	1.25	1.08	1.33	1.00	0.22	1.52	0.68	0.30	0.65	1.19	0.28
TG(45:0)	ME227492	2.25	1.52	1.14	0.81	0.46	0.42	1.05	1.07	0.71	0.45	1.00	1.16
PC(40:6)	ME227408	2.09	0.37	1.03	1.54	0.73	0.33	1.74	1.16	0.91	0.77	0.56	0.79
CE(18:2)	ME227460	1.85	0.92	0.93	1.20	0.78	0.39	1.43	1.22	1.19	0.81	0.70	0.56
TG(47:0)	ME227490	2.28	1.00	0.70	0.95	0.48	0.37	1.71	1.18	1.15	0.62	0.83	0.64
PI(38:4)	ME227468	1.96	0.05	0.50	1.51	0.79	0.59	0.66	0.30	0.93	1.03	0.41	1.85
PC(P-38:6)/PC(O-38:7)	ME227417	2.84	0.09	0.77	1.88	0.86	0.04	0.84	0.15	0.79	1.48	0.47	0.27
PE(P-36:4)/PE(O-36:5)	ME227435	2.67	NA	0.45	1.53	0.97	0.60	1.22	0.07	0.65	1.05	0.83	0.69
PE(P-38:5)/PE(O-38:6)	ME227440	2.80	NA	NA	1.66	0.93	0.57	1.62	0.06	0.72	1.07	0.74	0.56
TG(51:0)	ME227483	0.56	0.21	0.12	3.18	1.02	0.05	1.89	0.89	0.88	2.20	0.26	0.04
CE(16:0)	ME227458	0.80	0.78	0.71	1.86	0.47	NA	1.49	1.43	1.75	0.56	0.50	0.04
CE(18:0)	ME227462	0.55	0.41	0.49	2.11	0.82	0.02	2.28	1.79	0.44	1.10	0.80	0.15
PE(34:0)	ME227422	3.28	0.60	1.57	0.16	0.13	0.39	1.65	0.35	2.87	0.10	0.32	0.70
PC(38:6)	ME227402	2.63	0.89	1.86	0.77	0.57	0.61	1.12	0.41	0.96	0.58	0.52	1.29
PC(40:9)	ME227407	2.19	1.05	2.30	0.78	0.59	0.61	0.95	0.37	0.97	0.63	0.50	1.39
PE(36:3)	ME227424	3.30	1.22	1.76	1.10	0.76	0.46	0.84	0.61	0.60	0.37	0.60	0.57
PC(P-36:0)/PC(O-36:1)	ME227416	2.93	0.49	2.27	1.00	0.45	0.22	1.44	0.29	1.46	0.51	0.19	1.21
PC(34:1)	ME227394	2.95	0.61	1.72	0.91	0.67	0.52	1.27	0.43	1.32	0.58	0.52	0.69
PC(34:2)	ME227393	3.07	0.92	1.59	0.87	0.67	0.48	1.33	0.41	1.13	0.57	0.51	0.60
C34:1 PC plasmalogen-A	ME227411	3.58	0.40	1.55	0.81	0.63	0.45	1.46	0.47	1.00	0.50	0.59	0.70
PE(38:2)	ME227431	3.22	0.51	1.58	0.95	0.61	0.31	1.68	0.50	1.30	0.51	0.53	0.44
PC(P-34:2)/PC(O-34:3)	ME227409	3.09	0.28	1.45	1.36	0.86	0.25	1.79	0.38	0.77	0.93	0.52	0.43
PE(P-36:3)/PE(O-36:4)	ME227436	2.97	0.06	1.49	1.67	1.00	0.15	2.10	0.31	0.60	0.83	0.54	0.29
PE(38:6)	ME227428	2.41	0.07	1.94	1.56	0.45	0.25	1.59	0.40	0.38	0.80	0.41	1.34
PE(P-40:6)/PE(O-40:7)	ME227442	2.18	0.57	1.96	1.39	0.44	0.29	1.86	0.70	0.71	0.83	0.28	1.02
PC(P-34:1)/PC(O-34:2)	ME227410	2.35	0.70	2.39	1.28	0.78	0.46	1.04	0.40	0.71	0.95	0.57	0.70
PE(P-38:6)/PE(O-38:7)	ME227439	3.02	0.33	2.29	1.41	0.62	0.25	1.48	0.42	0.49	0.88	0.41	0.74
PC(P-36:1)/PC(O-36:2)	ME227415	4.17	0.17	2.00	1.16	0.70	0.10	1.58	0.31	0.95	0.37	0.45	0.28
PC(P-36:3)/PC(O-36:4)	ME227413	4.26	0.10	1.56	0.72	0.99	0.17	1.23	0.45	1.59	0.22	0.38	0.14
PC(32:1)	ME227390	4.20	0.36	2.66	0.31	0.23	0.52	1.09	0.22	1.66	0.24	0.23	0.69
PC(32:2)	ME227389	4.06	0.42	2.53	0.02	0.12	0.16	0.74	0.03	1.86	0.08	0.02	0.43
PC(34:3)	ME227392	4.17	0.93	2.50	0.27	0.23	0.33	1.30	0.14	1.24	0.46	0.16	0.64
PC(36:3)	ME227398	4.13	1.39	2.29	0.57	0.43	0.37	0.81	0.28	0.78	0.40	0.37	0.50
PS(34:0)	ME227470	2.68	0.85	2.29	0.07	0.22	0.00	2.86	0.99	0.58	0.01	0.27	0.00
PE(36:4)	ME227423	1.76	0.54	1.54	0.86	0.52	0.22	0.69	1.49	1.09	0.30	NA	0.50
PS(36:0)	ME227473	1.06	0.62	2.12	NA	NA	NA	1.28	0.65	0.36	NA	NA	NA
TG(45:1)	ME227491	2.76	0.19	1.33	0.44	0.18	0.40	0.45	1.93	0.20	0.33	1.10	3.03
SM(d18:1/18:0)	ME227451	2.30	1.13	1.87	0.33	0.18	1.26	0.81	0.25	0.56	0.25	0.20	3.08
SM(d18:1/24:1)	ME227455	1.61	1.74	2.90	0.05	0.01	1.33	0.27	0.03	0.43	0.07	0.06	3.72
PC(36:0)	ME227401	0.89	1.04	1.31	0.60	0.86	0.31	0.98	1.45	2.13	0.78	1.11	0.63
PC(24:0)	ME227372	0.99	1.00	1.01	1.00	0.99	1.02	1.00	1.00	1.01	0.99	1.00	1.00
PC(34:0)	ME227395	1.01	0.73	0.91	0.78	0.70	0.98	1.01	0.74	2.09	0.95	0.70	1.40
PC(30:0)	ME227388	2.40	0.44	1.41	0.37	0.35	1.15	0.68	0.40	2.55	0.45	0.33	1.57
PC(32:0)	ME227391	2.09	0.84	0.99	0.53	0.42	1.09	0.87	0.54	2.00	0.65	0.56	1.44
LPE(18:1)	ME227384	0.75	0.68	0.64	0.65	0.54	0.88	0.79	1.01	3.19	0.45	0.44	1.90
PE(36:0)	ME227427	1.71	0.59	0.70	0.34	0.39	0.89	0.80	0.66	3.08	0.42	0.69	1.67
LPC(18:1)	ME227377	1.30	2.76	1.19	0.37	0.79	1.40	0.15	0.17	1.44	0.52	0.47	1.50
Cer(d18:1/22:0)	ME227445	0.87	1.22	0.75	0.15	0.25	2.08	0.50	0.31	1.20	0.20	2.01	2.40
LPC(20:5)	ME227379	0.03	1.66	NA	0.33	0.73	1.16	0.12	0.50	2.07	0.72	0.62	2.23
SM(d18:1/16:0)	ME227450	0.81	1.10	1.24	0.47	0.45	1.66	0.56	0.58	1.47	0.35	0.41	2.96
LPC(18:0)	ME227378	0.48	0.65	0.54	0.78	1.05	2.26	0.46	0.69	1.55	0.61	0.59	2.23
LPE(18:0)	ME227385	0.41	0.97	0.91	0.63	1.01	1.90	0.32	0.78	1.84	0.58	0.67	1.96
Cer(d18:1/16:0)	ME227444	0.78	1.42	0.95	0.82	0.83	1.45	0.55	0.79	1.47	0.52	1.00	1.42
Cer(d18:1/24:0)	ME227446	0.96	1.05	0.98	0.95	0.43	1.77	0.76	0.33	1.00	0.68	0.91	2.17
LPC(16:0)	ME227375	1.01	1.67	1.06	0.62	0.85	1.83	0.34	0.30	1.29	0.63	0.55	1.87
LPC(20:3)	ME227380	0.87	1.46	0.77	0.65	0.92	1.95	0.35	0.30	1.38	0.70	0.58	2.03
LPE(22:6)	ME227387	0.80	NA	NA	1.07	0.22	0.46	0.44	1.61	1.21	0.52	0.40	2.66
LPC(22:6)	ME227381	NA	0.26	NA	0.65	0.64	1.24	NA	0.60	0.88	0.30	0.36	3.06
LPC(20:4)	ME227386	NA	NA	NA	NA	NA	0.83	NA	1.02	0.46	0.08	0.38	1.84
SM(d18:1/16:1)	ME227449	0.63	0.07	0.36	NA	NA	0.50	0.29	NA	0.25	NA	NA	2.94
SM(d18:1/20:0)	ME227452	0.49	NA	NA	0.06	NA	0.91	NA	NA	0.14	0.08	0.13	2.56
PE(38:5)	ME227429	0.62	0.04	0.02	2.16	0.95	0.84	2.25	0.08	0.82	0.93	0.30	2.06
PS(38:4)	ME227474	0.39	NA	1.16	1.06	0.04	0.44	0.94	0.06	0.08	1.16	0.27	3.22
PS(18:0_22:6)	ME227475	0.81	0.31	1.57	1.23	0.18	0.70	1.72	0.36	0.38	1.27	0.45	3.16
PS(36:2)	ME227471	1.19	0.37	1.71	1.17	0.30	0.68	1.53	0.32	0.35	1.14	0.45	2.62

Factors:

F1	Diet:Chow \| Treatment:none \| Strain:129Jax
F2	Diet:Chow \| Treatment:none \| Strain:129Tac
F3	Diet:Chow \| Treatment:none \| Strain:B6Jax
F4	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Strain:129Jax
F5	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Strain:129Tac
F6	Diet:HFD \| Treatment:metronidazole \| Strain:B6Jax
F7	Diet:HFD \| Treatment:placebo \| Strain:129Jax
F8	Diet:HFD \| Treatment:placebo \| Strain:129Tac
F9	Diet:HFD \| Treatment:placebo \| Strain:B6Jax
F10	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Strain:129Jax
F11	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Strain:129Tac
F12	Diet:HFD \| Treatment:vancomycin \| Strain:B6Jax

Data matrix