Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for FASN effect on HCT116 metabolism probed by 13C6-glucose tracer (Study ST001045)

Targeted GC POSITIVE ION MODE (Analysis AN001709)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
Orn-13C5	ME252748	0.04	0.08	1.35	1.27
t-aconitate-13C1	ME252874	1.40	NA	0.43	1.24
Lys-13C1	ME252716	0.20	1.21	1.30	0.99
t-aconitate-ALL	ME252880	0.78	0.70	1.32	0.85
t-aconitate-13C6	ME252879	NA	NA	1.19	0.81
Tyr-13C8	ME252806	1.06	NA	0.94	NA
Succinate-13C4	ME252777	0.19	0.13	1.32	1.24
Thr-ALL	ME252784	0.83	0.80	1.28	0.85
pyroGlu-13C3	ME252869	NA	NA	1.12	0.88
Pro-13C4	ME252765	0.05	0.33	1.16	1.37
Ser-13C2	ME252770	0.42	NA	0.71	1.39
Trp-13C0	ME252785	0.80	0.32	1.52	0.77
pyroGlu-13C4	ME252870	0.04	0.03	0.87	1.77
Pro-13C0	ME252761	1.05	1.08	1.12	0.83
Succinate-ALL	ME252778	0.63	0.79	1.29	0.90
Ile-13C0	ME252699	0.78	0.77	1.25	0.90
Arg-13C0	ME252642	0.62	0.61	1.32	0.94
Ile-13C3	ME252702	0.45	2.60	0.04	0.97
lactate-13C2	ME252863	0.20	NA	1.24	1.02
Ser-13C1	ME252769	0.45	1.11	1.49	0.66
t-aconitate-13C3	ME252876	NA	NA	1.25	0.75
Ser-13C0	ME252768	0.92	0.88	1.25	0.82
t-aconitate-13C4	ME252877	NA	NA	1.18	0.82
Arg-13C2	ME252644	0.31	0.43	1.06	1.38
Lys-13C4	ME252719	NA	0.76	1.24	NA
Ser-ALL	ME252772	0.87	0.88	1.26	0.82
Val-13C0	ME252809	0.71	0.79	1.25	0.91
Glu-13C0	ME252680	1.20	1.39	1.02	0.79
Gly-13C1	ME252688	1.86	1.03	1.08	0.63
GAB-13C1	ME252668	1.09	0.32	1.38	0.82
Gln-13C2	ME252675	1.12	0.24	1.30	0.92
Asn-13C3	ME252653	0.05	NA	1.24	1.08
Leu-13C2	ME252709	0.03	NA	1.32	NA
citrate-13C2	ME252849	0.03	0.04	1.60	1.05
Leu-13C6	ME252713	0.45	NA	2.02	0.53
Leu-ALL	ME252714	0.75	0.77	1.23	0.93
Lys-13C0	ME252715	0.56	0.71	1.24	1.01
ascorbate-13C0	ME252833	0.68	1.07	NA	1.12
Asn-13C1	ME252651	0.20	0.55	1.27	1.15
fumarate-13C2	ME252857	0.02	0.10	1.37	1.26
GAB-13C3	ME252670	0.48	2.51	0.82	0.79
Arg-ALL	ME252649	0.66	0.63	1.25	0.98
Orn-13C1	ME252744	NA	0.31	1.19	1.04
a-glycerol-3P_#1-13C0	ME252816	1.32	1.89	0.73	0.87
ascorbate-13C4	ME252837	1.02	0.67	NA	1.15
ascorbate-13C2	ME252835	1.04	0.97	NA	1.00
Arg-13C4	ME252646	NA	1.53	1.09	0.65
Tyr-ALL	ME252808	0.76	0.77	1.25	0.90
Malate-13C0	ME252723	1.15	1.59	0.87	0.88
pyroGlu-13C0	ME252866	0.91	1.12	1.12	0.87
Ile-ALL	ME252706	0.81	0.78	1.22	0.92
Lys-13C3	ME252718	NA	NA	1.63	0.37
a-glycerol-3P_#1-13C1	ME252817	1.52	0.47	0.94	1.04
Gln-13C4	ME252677	NA	0.38	1.02	1.18
a-glycerol-3P_#2-13C0	ME252821	1.43	1.74	0.81	0.80
Tyr-13C0	ME252798	0.78	0.75	1.25	0.91
citrate-ALL	ME252854	0.92	0.87	1.21	0.86
citrate-13C4	ME252851	0.01	NA	1.35	0.98
t-aconitate-13C0	ME252873	1.95	2.07	0.80	0.53
Glu-13C4	ME252684	NA	0.01	1.18	1.15
OHPro-13C1	ME252737	0.88	1.05	0.95	1.07
Thr-13C0	ME252779	0.85	0.80	1.27	0.85
Asn-13C4	ME252654	0.13	0.05	1.40	1.20
Pro-13C3	ME252764	0.03	0.14	1.38	1.23
pyroGlu-13C1	ME252867	0.60	0.82	1.15	1.04
pyroGlu-13C2	ME252868	NA	NA	0.97	1.03
Gln-ALL	ME252679	0.81	0.82	1.22	0.91
Gly-13C2	ME252689	NA	0.73	0.56	1.53
Gln-13C5	ME252678	0.03	0.59	0.91	1.74
lactate-13C0	ME252861	1.19	1.88	0.93	0.71
Tyr-13C7	ME252805	1.07	1.43	NA	0.75
Glu-13C3	ME252683	0.04	NA	1.25	1.08
Ile-13C5	ME252704	NA	0.64	0.87	1.20
Met-ALL	ME252735	0.80	0.76	1.30	0.84
Gln-13C0	ME252673	0.82	0.83	1.21	0.90
Pro-13C2	ME252763	NA	NA	1.21	0.79
GAB-13C2	ME252669	1.10	0.00	1.56	0.61
Arg-13C1	ME252643	0.93	0.58	1.05	1.11
pyroGlu-13C5	ME252871	0.13	0.07	1.30	1.30
a-ketoglutarate-13C2	ME252828	0.13	NA	1.27	1.02
Tyr-13C2	ME252800	0.45	0.91	1.09	1.12
lactate-13C3	ME252864	0.02	0.04	1.35	1.30
GAB-ALL	ME252672	0.97	0.75	1.30	0.79
Trp-13C2	ME252789	0.42	NA	NA	1.19
Met-13C2	ME252731	0.89	0.75	1.29	0.83
bOHbutyrate-13C2	ME252843	0.46	NA	1.45	0.64
a-glycerol-3P_#2-13C1	ME252822	NA	0.11	1.45	0.84
Glu-13C2	ME252682	0.06	0.05	1.43	1.20
OHPro-ALL	ME252742	0.83	0.80	1.26	0.87
Val-13C5	ME252814	1.42	NA	0.58	NA
Met-13C0	ME252729	0.80	0.71	1.33	0.84
fumarate-ALL	ME252860	0.77	0.82	1.15	0.99
Lys-ALL	ME252722	0.54	0.81	1.24	0.98
Gln-13C1	ME252674	0.58	0.84	1.31	0.88
Malate-13C3	ME252726	NA	0.05	1.11	1.20
bOHbutyrate-13C1	ME252842	NA	0.43	1.17	1.03
Glu-13C1	ME252681	0.74	1.07	1.21	0.85
Glu-13C5	ME252685	NA	0.05	1.15	1.16
OHPro-13C0	ME252736	0.83	0.76	1.29	0.84
Met-13C3	ME252732	0.87	2.75	0.20	1.39
a-glycerol-3P_#2-13C2	ME252823	NA	0.27	1.21	1.05
a-glycerol-3P_#2-13C3	ME252824	NA	NA	1.14	0.86
OHPro-13C5	ME252741	NA	2.72	0.48	0.32
Glu-ALL	ME252686	0.80	0.94	1.15	0.93
Tyr-13C5	ME252803	0.67	NA	1.15	1.03
Tyr-13C1	ME252799	0.63	0.91	1.29	0.86
OHPro-13C2	ME252738	NA	1.16	0.59	1.08
Tyr-13C6	ME252804	0.12	NA	2.53	0.34
Met-13C4	ME252733	0.79	0.76	1.22	0.93
Leu-13C5	ME252712	NA	NA	1.48	0.04
Malate-13C2	ME252725	0.09	0.01	1.24	1.39
a-glycerol-3P_#2-ALL	ME252825	0.66	0.83	1.21	0.96
OHPro-13C4	ME252740	0.76	0.01	1.80	0.88
a-glycerol-3P_#1-ALL	ME252820	0.76	1.08	1.01	1.04
Val-ALL	ME252815	0.73	0.80	1.23	0.92
a-glycerol-3P_#1-13C3	ME252819	0.00	0.04	1.36	1.29
Asn-13C2	ME252652	NA	0.02	1.16	1.16
t-aconitate-13C5	ME252878	NA	NA	1.18	0.82
Trp-13C11	ME252788	NA	NA	1.22	0.78
Asp-ALL	ME252661	0.81	1.00	1.08	0.98
Thr-13C4	ME252783	NA	NA	1.38	0.25
Gln-13C3	ME252676	NA	NA	0.77	1.23
Succinate-13C3	ME252776	0.53	1.08	0.84	1.29
Ile-13C4	ME252703	1.61	NA	1.33	0.06
ascorbate-13C3	ME252836	0.95	0.63	NA	1.21
bOHbutyrate-13C0	ME252841	0.83	0.75	1.12	1.02
Met-13C5	ME252734	NA	NA	0.69	1.16
fumarate-13C1	ME252856	0.52	0.69	1.19	1.08
Gly-13C0	ME252687	0.85	0.87	1.18	0.91
Succinate-13C1	ME252774	0.67	1.22	1.12	0.92
Succinate-13C2	ME252775	0.32	0.24	1.53	0.95
citrate-13C1	ME252848	1.27	0.64	1.31	0.72
Tyr-13C9	ME252807	NA	1.81	0.75	0.95
lactate-13C1	ME252862	0.72	1.05	1.19	0.89
Succinate-13C0	ME252773	0.67	0.79	1.31	0.87
Trp-13C5	ME252792	1.08	NA	0.92	NA
pyroGlu-ALL	ME252872	0.74	0.92	1.15	0.96
Leu-13C1	ME252708	0.37	0.55	1.48	0.88
t-aconitate-13C2	ME252875	0.28	0.12	1.72	0.82
Asp-13C4	ME252660	NA	0.05	0.99	1.33
bOHbutyrate-ALL	ME252846	0.75	0.70	1.21	0.98
fumarate-13C4	ME252859	NA	NA	1.05	0.95
citrate-13C5	ME252852	0.02	NA	1.25	1.07
fumarate-13C0	ME252855	1.14	1.16	1.04	0.86
lactate-ALL	ME252865	0.58	0.91	1.16	1.01
fumarate-13C3	ME252858	0.04	0.16	1.41	1.19
citrate-13C3	ME252850	0.06	0.02	1.41	1.23
Leu-13C4	ME252711	NA	0.63	1.40	0.78
citrate-13C0	ME252847	2.46	2.42	0.61	0.43
citrate-13C6	ME252853	NA	0.00	1.32	1.01
Asn-ALL	ME252655	0.77	0.86	1.11	1.02
Asp-13C3	ME252659	0.05	0.07	1.32	1.30
Leu-13C0	ME252707	0.79	0.82	1.19	0.94
Lys-13C2	ME252717	0.73	0.68	1.59	NA
Thr-13C1	ME252780	0.46	0.61	1.40	0.91
Thr-13C3	ME252782	0.77	NA	1.62	0.60
Asp-13C1	ME252657	0.70	0.64	1.10	1.12
Thr-13C2	ME252781	0.41	0.86	1.21	1.05
Asp-13C2	ME252658	0.00	0.03	1.40	1.26
Asp-13C0	ME252656	1.16	1.45	0.97	0.83
a-glycerol-3P_#1-13C2	ME252818	0.18	0.98	1.44	0.84
Tyr-13C3	ME252801	0.59	0.33	1.93	0.22
Tyr-13C4	ME252802	1.07	NA	NA	0.93
OHPro-13C3	ME252739	0.95	NA	0.81	1.31
a-ketoglutarate-13C5	ME252831	0.07	0.33	1.27	1.26
Asn-13C0	ME252650	1.11	1.20	0.99	0.90
Met-13C1	ME252730	0.77	1.16	1.60	0.43
Orn-13C3	ME252746	0.40	NA	1.26	0.91
a-ketoglutarate-13C3	ME252829	NA	0.09	1.35	0.95
Malate-ALL	ME252728	0.72	1.02	1.02	1.07
Malate-13C4	ME252727	NA	0.03	0.85	1.47
Malate-13C1	ME252724	0.17	0.66	1.34	1.05
Orn-13C0	ME252743	1.16	1.42	1.05	0.75
a-ketoglutarate-13C0	ME252826	1.17	1.12	1.09	0.82
Leu-13C3	ME252710	0.95	NA	0.55	1.46
a-ketoglutarate-13C1	ME252827	0.60	1.35	0.85	1.17
Orn-13C2	ME252745	0.11	0.09	1.36	1.24
Pro-13C5	ME252766	0.17	NA	1.24	1.04
Ile-13C2	ME252701	0.27	0.18	1.30	1.48
Trp-13C1	ME252786	NA	0.25	1.35	0.90
Ala-ALL	ME252641	0.82	0.89	1.15	0.95
Gly-ALL	ME252690	0.88	0.88	1.17	0.91
Trp-13C8	ME252795	1.28	0.89	0.88	1.06
Trp-ALL	ME252797	0.91	0.52	1.30	0.89
ascorbate-13C1	ME252834	NA	1.28	NA	0.86
Pro-13C1	ME252762	0.83	0.27	1.27	1.03
Phe-ALL	ME252760	0.77	0.80	1.25	0.90
Pro-ALL	ME252767	0.76	0.77	1.22	0.93
Ser-13C3	ME252771	NA	NA	1.28	0.72
Phe-13C5	ME252755	0.60	1.00	1.59	0.54
Phe-13C7	ME252757	1.07	0.38	0.54	1.73
Phe-13C6	ME252756	0.98	1.45	1.07	0.81
Trp-13C9	ME252796	0.81	1.78	1.03	0.77
Ile-13C1	ME252700	1.26	0.91	0.89	1.05
Val-13C3	ME252812	NA	1.00	1.14	0.86
Phe-13C8	ME252758	0.47	0.70	1.62	0.66
Phe-13C9	ME252759	0.76	1.03	NA	1.21
Ala-13C0	ME252637	1.54	1.60	0.92	0.70
Val-13C2	ME252811	0.48	0.86	1.38	0.97
Ala-13C1	ME252638	0.39	1.74	1.30	0.65
ascorbate-ALL	ME252840	0.93	0.94	NA	1.07
Val-13C1	ME252810	0.91	0.78	1.25	0.93
a-ketoglutarate-ALL	ME252832	0.78	0.77	1.19	0.96
Trp-13C6	ME252793	NA	NA	1.07	0.93
Val-13C4	ME252813	NA	1.21	1.45	0.67
Ala-13C3	ME252640	NA	NA	1.05	0.95
GAB-13C0	ME252667	0.95	0.79	1.28	0.80
Orn-ALL	ME252749	0.76	0.90	1.18	0.93
Orn-13C4	ME252747	NA	0.03	0.87	1.45
a-ketoglutarate-13C4	ME252830	0.04	0.11	1.37	1.24
Ala-13C2	ME252639	0.32	0.32	1.33	1.12
Arg-13C3	ME252645	1.07	1.16	0.30	1.16
Trp-13C10	ME252787	0.66	NA	1.26	0.56
Phe-13C0	ME252750	0.78	0.77	1.25	0.91
Phe-13C4	ME252754	NA	0.47	NA	1.18
Phe-13C1	ME252751	0.88	0.73	1.27	0.86
Phe-13C2	ME252752	0.01	0.88	0.91	1.43

Factors:

F1	protocol.id:12CGlc_FASN_shRNA
F2	protocol.id:12CGlc_NTC_shRNA
F3	protocol.id:13CGlc_FASN_shRNA
F4	protocol.id:13CGlc_NTC_shRNA

Data matrix