Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for Open source discovery of starting points for next generation chemoprotective antimalarial drugs (Biofocus 1) (Study ST001074)

Normal phase NEGATIVE ION MODE (Analysis AN001756)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15
dTMP	ME263326	0.83	0.37	0.90	16.48	0.27	0.25	2.46	0.40	0.29	0.46	0.70	0.09	0.37	1.11	0.63
citrate/isocitrate	ME263308	0.40	0.31	0.25	0.38	NA	0.00	NA	0.00	13.74	0.27	NA	0.00	0.40	0.65	0.76
deoxyribose-phosphate	ME263321	1.10	5.80	0.11	0.47	0.08	2.05	0.06	1.65	1.70	0.14	0.87	2.03	0.18	0.35	0.80
glycerate	ME263339	0.83	7.56	0.20	0.12	0.03	2.02	1.30	1.85	0.00	0.19	0.82	1.98	0.21	0.51	0.51
pyruvate	ME263377	0.76	8.49	0.61	0.19	0.46	0.84	0.67	0.90	0.37	0.58	1.34	0.96	0.69	1.17	0.99
GTP	ME263341	0.82	0.22	0.34	0.13	4.87	0.00	3.42	0.00	0.01	0.20	4.71	0.00	0.22	0.33	0.94
dTTP	ME263327	0.58	1.01	0.77	5.87	1.82	0.15	2.55	0.17	0.41	0.70	1.33	0.08	0.53	0.23	0.98
phenylpyruvate	ME263372	0.63	0.34	0.45	0.60	NA	2.18	0.61	3.68	0.01	0.47	NA	4.61	0.67	NA	0.72
dCMP	ME263318	1.48	0.03	0.04	0.11	0.05	0.07	0.08	0.07	0.00	0.03	4.90	0.06	0.02	0.10	1.21
2_3-Diphosphoglyceric acid	ME263290	0.99	3.75	1.71	0.89	0.00	0.46	0.00	0.57	0.14	2.05	0.00	0.36	1.95	NA	1.03
CDP-ethanolamine	ME263307	1.01	4.32	1.81	1.13	0.22	0.89	0.29	0.75	1.79	1.77	0.50	0.05	0.70	1.28	1.21
guanosine	ME263343	1.05	0.55	3.58	0.68	0.17	0.59	0.14	0.35	2.62	4.26	0.65	0.24	1.72	1.14	0.99
4-aminobutyrate	ME263293	1.18	0.54	2.26	2.59	0.38	0.71	0.21	0.79	2.59	2.22	1.15	0.72	1.02	0.70	0.83
inosine	ME263347	1.10	1.91	2.33	2.24	0.27	0.34	0.28	0.41	3.19	2.25	1.41	0.36	1.01	0.46	1.07
SD	ME263382	1.17	1.87	2.64	1.30	0.76	0.37	0.32	0.37	2.78	2.33	1.40	0.48	0.95	0.54	0.97
dUMP	ME263328	0.77	NA	0.47	1.59	0.25	NA	2.64	NA	2.71	0.14	0.13	NA	0.19	NA	0.99
CMP	ME263309	0.98	1.69	0.80	2.39	1.78	0.17	3.76	0.33	0.02	0.93	1.22	0.15	0.49	1.21	1.00
thymidine	ME263386	0.71	NA	NA	NA	1.64	0.15	1.82	0.08	NA	NA	1.87	0.12	0.33	0.25	1.43
2-dehydro-D-gluconate	ME263287	1.04	1.64	1.09	1.11	2.02	NA	1.44	NA	0.48	0.26	1.70	NA	0.41	0.15	0.84
CTP	ME263310	0.69	0.94	0.78	0.62	2.22	NA	3.08	NA	0.01	0.70	1.81	NA	0.60	0.31	1.10
ATP	ME263304	0.89	0.11	1.42	0.19	2.67	0.17	2.32	0.14	NA	1.37	2.57	0.11	1.51	0.40	0.92
dATP	ME263316	0.97	0.15	0.72	0.41	3.01	0.06	1.95	0.06	NA	1.16	2.75	0.06	1.29	NA	0.88
dCTP	ME263319	0.78	0.62	0.94	1.39	2.50	NA	1.67	NA	0.02	1.08	2.62	NA	0.55	0.93	0.79
UTP	ME263394	0.70	1.06	1.00	0.97	3.45	0.21	1.93	0.23	0.01	1.14	2.43	0.08	0.37	0.44	1.21
sarcosine/alanine	ME263381	0.96	1.96	1.72	0.36	0.67	0.17	0.80	0.26	0.11	1.44	1.89	0.18	1.27	2.32	1.14
glucose-6-phosphate	ME263337	1.13	NA	NA	NA	1.15	0.05	0.72	0.04	2.49	NA	2.19	0.06	0.62	0.76	1.29
uridine	ME263393	0.93	0.60	1.00	0.71	0.34	0.08	2.98	0.66	1.71	1.30	1.39	0.22	0.67	1.17	1.17
FMN	ME263331	1.20	0.32	1.04	1.03	1.27	0.04	1.16	0.04	1.82	1.21	2.07	0.04	0.99	1.94	0.97
UDP-D-glucuronate	ME263390	1.08	0.98	1.06	1.08	1.33	0.42	1.67	0.35	2.02	1.05	2.37	0.23	0.70	1.69	1.08
Sedoheptoluse bisphosphate	ME263383	0.95	0.73	0.49	0.34	2.29	0.35	1.57	0.40	1.00	0.58	1.85	0.20	0.55	0.59	1.23
fructose-1-6-bisphosphate	ME263332	1.05	0.79	0.47	0.32	1.42	0.92	0.96	0.74	1.21	0.60	1.85	0.68	0.74	1.04	1.12
Octoluse Bisphosphate	ME263364	1.08	0.85	0.55	0.20	1.81	0.74	1.22	0.63	1.18	0.66	1.71	0.48	1.06	1.14	1.03
GDP	ME263336	1.05	0.21	0.85	0.17	2.48	0.05	1.28	0.05	0.80	0.73	2.29	0.03	0.43	2.34	0.98
ADP	ME263399	1.17	0.37	NA	NA	0.95	0.09	1.20	0.08	1.08	NA	2.17	0.07	1.19	2.59	1.09
dCDP	ME263317	1.13	0.32	0.78	1.25	0.85	0.51	1.85	0.50	0.66	0.73	1.97	0.38	0.70	2.23	0.82
CDP	ME263306	1.04	0.43	0.80	0.48	1.06	0.10	2.30	0.06	0.53	0.63	1.79	0.05	0.80	1.91	1.18
UDP	ME263388	1.33	0.40	0.58	0.42	0.85	0.58	1.62	0.53	0.34	0.55	1.24	0.34	0.64	1.98	1.14
4-phosphopantothenate	ME263294	1.02	0.70	0.70	0.64	NA	NA	NA	NA	1.31	0.68	NA	NA	0.72	NA	1.39
deoxyinosine	ME263320	0.84	0.52	0.93	2.03	NA	NA	NA	NA	1.16	0.71	NA	NA	1.07	NA	1.02
fructose-6-phosphate/glucose-1-phosphate	ME263333	0.90	0.72	1.55	1.04	NA	NA	NA	NA	0.09	1.82	NA	NA	1.87	NA	0.73
PRPP	ME263296	1.36	NA	1.64	0.12	NA	0.74	NA	0.14	NA	1.32	NA	0.25	1.20	NA	1.44
acetyl-CoA	ME263299	0.82	0.80	1.28	1.26	1.19	0.60	1.07	0.81	0.61	1.34	0.69	0.32	1.71	NA	1.24
p-hydroxybenzoate	ME263367	1.22	NA	1.26	0.63	1.07	0.83	1.50	0.53	1.50	0.88	1.08	0.77	1.04	NA	0.76
DLH	ME263324	1.30	0.96	2.97	0.10	0.23	0.62	0.07	0.65	2.78	1.87	1.10	0.81	1.10	0.41	0.99
PEEK	ME263371	1.30	0.76	1.98	0.06	0.72	0.74	0.85	0.67	2.32	1.44	1.43	0.84	0.96	0.56	0.86
hypoxanthine	ME263344	1.11	0.79	1.31	1.14	0.42	0.90	0.53	0.91	1.95	1.26	1.12	1.12	1.00	1.47	0.86
NADPH	ME263361	1.11	0.57	1.12	1.83	0.93	0.94	0.97	0.97	2.19	1.05	1.17	0.95	0.69	0.98	0.84
PD	ME263368	1.23	1.58	0.83	0.59	0.85	0.56	0.46	0.59	1.67	1.14	2.10	0.71	0.96	1.12	0.92
PE	ME263369	1.26	1.76	1.36	0.42	0.78	0.49	0.40	0.52	1.78	1.40	2.02	0.68	0.92	1.09	0.91
Acetyllysine	ME263300	1.28	1.51	1.50	0.17	0.37	0.53	0.11	0.61	1.77	1.24	1.25	0.91	1.19	1.33	0.99
N-acetyl-L-ornithine	ME263356	1.26	1.28	2.05	0.61	0.42	0.52	0.22	0.49	2.41	1.68	1.39	0.70	1.04	1.04	0.98
guanine	ME263342	1.05	0.35	1.29	0.25	1.01	0.88	1.00	1.07	1.47	1.45	2.14	1.09	0.71	1.25	0.78
N-Acetyl-L-alanine	ME263355	1.03	1.08	1.76	0.75	0.91	0.96	0.44	1.15	0.94	1.26	2.03	0.96	0.66	0.69	0.96
lactate	ME263348	0.98	2.34	1.07	0.57	0.76	0.89	0.87	0.81	0.65	1.06	1.42	0.90	0.77	1.60	1.01
myo-inositol	ME263351	0.94	2.37	0.72	0.35	1.21	1.07	1.38	0.86	0.18	0.77	1.38	1.05	0.46	1.81	0.94
N-acetyl-glucosamine-1/6-phosphate	ME263352	1.17	2.42	0.96	0.47	0.99	1.32	0.51	1.48	1.36	0.64	1.06	1.67	0.63	0.40	0.77
xanthosine	ME263397	1.07	2.12	1.55	0.66	0.80	1.14	0.30	1.46	0.08	1.10	1.43	1.57	0.67	0.49	0.83
cytidine	ME263312	1.05	1.24	1.83	1.40	0.54	1.41	0.67	1.66	0.03	1.67	0.52	1.76	0.98	0.79	0.62
sn-glycerol-3-phosphate	ME263384	1.17	2.29	1.56	2.94	0.38	1.05	0.28	1.13	1.64	1.80	0.72	0.94	0.75	0.56	0.77
3-phospho-serine	ME263291	1.16	1.41	1.50	1.26	0.06	1.24	0.05	1.13	1.12	1.54	0.94	1.17	0.96	0.83	0.92
Octoluse 8/1-phosphate	ME263363	1.11	1.99	1.19	1.49	0.12	1.07	0.20	1.10	1.64	1.73	0.72	1.22	0.99	0.60	0.75
dihydroorotate	ME263323	1.04	0.02	0.95	0.01	0.57	1.81	0.02	1.90	0.47	0.78	3.26	3.02	0.88	0.66	0.14
N-carbamoyl-L-aspartate	ME263357	1.18	0.01	0.64	0.02	0.49	1.93	0.02	2.12	1.22	0.65	1.92	2.79	0.37	1.29	0.22
G3P/DHAP	ME263335	1.10	1.90	0.31	0.62	0.07	1.82	NA	1.66	0.01	0.49	1.07	2.39	0.38	0.21	0.54
D-sedoheptulose-1/7-phosphate	ME263314	1.14	0.23	0.88	0.94	0.18	2.07	0.24	2.16	1.09	0.94	0.35	2.49	0.75	0.69	0.45
LD	ME263349	1.26	0.38	0.88	0.44	0.33	2.47	0.11	2.57	1.35	0.83	0.54	2.92	0.53	0.62	0.48
dGMP/AMP	ME263322	1.29	0.11	0.32	0.12	0.50	2.87	0.83	3.04	0.38	0.35	0.56	3.01	0.64	1.24	0.66
ribose-phosphate	ME263378	1.15	0.29	0.48	0.65	0.02	2.64	0.04	2.81	0.13	0.77	0.03	2.99	0.84	0.50	0.36
alpha-ketoglutarate	ME263298	1.30	0.32	0.29	0.53	0.33	2.42	0.32	2.38	0.28	0.30	0.62	2.68	0.27	0.60	0.36
xanthosine-5-phosphate	ME263398	1.37	0.07	0.16	0.71	0.33	2.45	0.51	2.80	0.25	0.11	0.45	2.02	0.42	0.68	0.33
xanthine	ME263396	0.96	0.13	0.47	0.82	0.50	3.61	0.91	0.95	1.10	0.72	1.06	1.45	0.54	0.73	0.66
adenosine	ME263302	0.88	NA	NA	NA	1.68	1.48	0.27	1.46	NA	NA	NA	1.57	0.21	1.00	0.90
Pyroglutamic acid	ME263375	1.03	0.75	1.03	1.12	0.29	1.90	0.34	1.39	1.20	0.96	1.10	1.46	0.64	0.70	0.87
N-acetyl-glutamate	ME263353	1.16	0.36	0.90	0.58	0.45	1.52	0.32	1.80	1.34	0.72	1.30	1.67	0.55	0.62	0.75
S-adenosyl-L-homoCysteine	ME263379	1.02	0.48	0.66	0.53	0.61	1.57	0.68	1.97	0.71	0.69	1.22	1.30	0.67	0.66	0.90
NADH	ME263359	1.09	0.25	0.60	0.92	0.39	2.50	0.39	2.48	0.59	0.54	0.85	1.36	0.35	0.25	0.75
indole	ME263346	1.08	0.22	0.68	0.60	0.22	2.27	0.24	2.18	0.93	0.43	1.04	2.34	0.42	NA	0.52
2-Hydroxy-2-methylbutanedioic acid	ME263288	1.21	0.56	0.57	0.51	0.53	1.92	0.74	2.05	0.82	0.49	1.15	2.08	0.36	0.38	0.53
IMP	ME263345	1.23	0.20	0.34	0.48	0.40	1.88	0.32	2.15	1.05	0.52	1.29	1.93	0.45	0.83	0.54
4-Pyridoxic acid	ME263295	1.46	0.01	NA	NA	0.22	1.25	0.37	1.89	0.46	NA	1.11	1.21	0.54	1.03	0.64
UMP	ME263392	1.31	0.41	0.38	0.40	0.66	1.98	0.82	1.92	0.01	0.49	0.85	1.66	0.44	0.75	0.83
3-phosphoglycerate	ME263292	1.14	0.99	0.24	0.23	0.45	1.59	0.57	1.49	0.91	0.30	1.47	1.61	0.51	0.92	0.85
phosphoenolpyruvate	ME263373	1.18	0.88	0.21	0.24	0.28	1.82	0.47	1.81	0.58	0.27	1.06	1.92	0.67	1.00	0.69
succinate/methylmalonic acid	ME263385	1.04	0.60	0.57	1.20	0.54	1.13	0.42	1.12	0.39	0.66	1.21	1.63	0.75	1.55	0.98
VD	ME263395	1.20	0.59	0.50	0.22	0.21	1.52	0.08	1.30	0.53	0.57	1.73	1.22	0.58	1.64	0.93
S-methyl-5--thioadenosine	ME263380	1.20	0.42	0.89	0.48	0.77	1.03	1.01	1.02	1.22	0.69	1.76	1.08	0.69	1.22	0.84
FAD	ME263330	1.19	0.29	0.61	0.25	0.85	0.91	0.97	0.87	0.93	0.59	1.49	0.89	1.02	1.83	0.90
glutathione disulfide	ME263338	1.11	0.32	0.45	0.51	0.57	1.07	0.50	0.93	0.99	0.57	1.44	0.92	1.07	1.73	1.05
PVNF	ME263374	1.34	0.31	0.96	0.03	0.54	1.28	0.08	1.13	1.37	0.68	1.25	1.31	0.84	1.08	0.85
2-oxo-4-methylthiobutanoate	ME263289	1.22	NA	0.84	0.55	0.30	1.08	0.49	1.40	0.57	0.63	1.16	1.31	0.88	1.67	0.89
GMP	ME263340	1.27	0.18	0.72	0.05	0.60	1.24	0.61	1.38	0.97	0.78	1.21	1.45	0.85	1.44	0.71
ADP-D-glucose	ME263303	1.23	0.38	0.54	0.40	0.48	1.33	0.64	1.44	0.73	0.57	1.32	1.64	0.77	1.35	0.70
nicotinate	ME263362	1.15	0.28	0.86	0.54	0.51	1.46	0.48	1.51	0.58	0.81	1.41	1.65	0.61	1.29	0.75
6-phospho-D-gluconate	ME263297	1.19	0.48	0.53	0.44	0.57	1.46	0.32	1.35	1.18	0.59	1.55	1.21	0.85	1.09	0.82
PEE	ME263370	1.28	0.57	1.06	0.23	0.53	1.25	0.72	1.08	1.19	0.73	1.29	1.30	0.80	1.14	0.77
UDP-N-acetyl-glucosamine	ME263391	1.14	0.52	0.72	0.78	0.50	1.18	0.70	1.27	0.92	0.72	1.09	1.33	0.90	1.31	0.87
NADP+	ME263360	1.23	0.44	0.72	0.66	0.54	1.25	0.73	1.30	1.16	0.74	1.18	1.34	0.71	1.39	0.76
UDP-D-glucose	ME263389	1.20	0.48	0.72	0.74	0.41	1.32	0.57	1.33	1.08	0.72	1.19	1.48	0.82	1.23	0.76
fumarate	ME263334	1.31	0.26	0.21	0.35	1.09	1.06	0.56	1.16	0.19	0.23	2.30	0.89	0.23	0.89	1.06
malate	ME263350	1.32	0.61	0.68	1.12	0.90	1.12	0.53	1.04	0.78	0.70	1.64	0.63	0.42	0.87	1.01
orotate	ME263366	1.34	0.07	0.44	0.08	1.51	1.67	0.26	1.88	0.24	0.86	2.49	1.25	0.29	0.52	0.52
cyclic-AMP	ME263311	0.94	0.21	0.65	0.39	1.33	2.24	1.01	1.99	0.46	0.67	1.31	1.38	0.72	NA	1.05
D-gluconate	ME263313	1.07	0.63	0.73	0.69	1.32	1.42	1.57	1.52	0.67	0.51	1.67	1.48	0.40	0.42	0.69
dAMP	ME263315	1.15	0.19	0.20	2.73	0.59	0.12	1.03	0.08	0.01	0.28	1.97	0.07	1.00	2.74	1.09
dTDP	ME263325	1.17	0.43	0.69	3.90	0.48	0.78	1.39	0.64	0.36	0.49	0.97	0.41	0.78	1.58	1.06
ornithine	ME263365	1.01	0.54	0.32	0.27	0.08	0.02	0.13	0.01	NA	0.38	0.48	0.02	2.82	3.11	1.05
dUTP	ME263329	1.17	NA	0.02	0.18	0.22	0.21	0.16	0.17	NA	0.06	1.62	0.21	1.41	2.93	1.39
NAD+	ME263358	1.20	0.19	0.41	0.34	0.10	0.72	0.12	0.64	0.94	0.42	1.13	0.38	2.06	2.89	1.06
aconitate	ME263301	0.82	0.54	0.23	0.44	0.15	0.20	0.31	0.44	2.25	0.21	1.88	0.23	1.56	2.98	1.46
N-acetyl-glutamine	ME263354	0.72	0.53	0.22	0.20	1.26	0.78	0.95	0.93	1.17	0.18	1.61	0.84	2.00	3.35	0.80

Factors:

F1	Drug:Atovaquone \| Treatment conc.:10 nM
F2	Drug:MMV011772 \| Treatment conc.:6040 nM
F3	Drug:MMV1010248 \| Treatment conc.:18795 nM
F4	Drug:MMV1068987 \| Treatment conc.:7931.5 nM
F5	Drug:MMV1319550 \| Treatment conc.:9680 nM
F6	Drug:MMV1427995 \| Treatment conc.:1389 nM
F7	Drug:MMV1431916 \| Treatment conc.:6320 nM
F8	Drug:MMV1432165 \| Treatment conc.:1070 nM
F9	Drug:MMV1432711 \| Treatment conc.:860 nM
F10	Drug:MMV1449124 \| Treatment conc.:482.6 nM
F11	Drug:MMV1451822 \| Treatment conc.:560 nM
F12	Drug:MMV1454442 \| Treatment conc.:1730 nM
F13	Drug:MMV1490397 \| Treatment conc.:1250 nM
F14	Drug:MMV1490405 \| Treatment conc.:1130 nM
F15	Drug:None (Control) \| Treatment conc.:N/A

Data matrix