Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for A comprehensive plasma metabolomics dataset for a cohort of mouse knockouts within the International Mouse Phenotyping Consortium (Study ST001154)

Reversed phase NEGATIVE ION MODE/Ion trap (Analysis AN001947)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	F8	F9	F10	F11	F12	F13	F14	F15	F16	F17	F18	F19	F20	F21	F22	F23	F24	F25	F26	F27	F28	F29	F30	F31
Cholic acid	ME280503	0.03	0.12	0.14	0.04	0.09	0.03	0.27	0.10	0.06	0.29	1.18	0.18	0.63	0.20	0.23	18.96	0.41	0.10	0.13	0.21	0.04	1.03	0.15	0.10	0.83	0.10	0.12	0.25	0.27	0.18	8.73
?-Muricholic acid	ME280495	0.01	0.02	0.56	0.01	0.02	0.13	0.01	0.01	0.02	0.01	0.43	0.03	0.37	0.01	0.02	2.21	0.01	0.02	0.30	1.70	0.01	0.47	1.46	0.03	0.72	0.01	0.16	1.28	11.91	0.01	3.82
Ursodeoxycholic acid	ME280504	NA	0.01	0.01	NA	0.01	0.00	NA	NA	0.00	0.00	0.03	0.01	NA	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	NA	2.48	0.03	5.72	0.01	0.01	0.03	0.02	8.95	0.04	0.01	0.01	0.10
testosterone	ME280467	0.65	2.44	3.08	0.25	0.39	0.60	2.22	0.22	1.33	0.11	3.13	3.06	0.34	0.10	0.09	0.14	0.68	0.11	0.19	0.35	3.81	2.16	0.41	0.32	4.39	0.13	NA	0.31	0.36	0.40	0.18
androstanediol	ME280478	0.81	0.54	1.09	NA	NA	0.69	0.47	0.59	0.65	NA	0.55	1.03	1.06	NA	NA	NA	7.07	0.60	NA	0.77	0.60	NA	NA	NA	NA	0.70	0.68	0.56	0.79	2.07	NA
progesterone	ME280463	1.04	0.66	1.16	4.44	0.91	0.39	1.20	0.26	0.46	1.28	3.11	1.55	0.73	1.72	0.35	0.89	0.73	0.77	0.43	0.80	0.31	1.52	0.60	1.27	1.23	0.84	0.62	1.12	0.29	0.59	0.59
Lithocholic acid	ME280511	0.39	0.67	0.09	0.14	1.16	1.31	0.98	0.58	0.83	NA	0.52	0.92	0.63	0.45	0.48	0.89	1.81	0.46	0.99	1.29	1.10	1.66	0.85	0.71	0.60	0.21	0.16	3.03	0.07	2.15	3.04
cortexone	ME280469	1.54	0.61	1.60	0.77	0.78	0.23	1.17	0.61	0.44	0.85	2.42	1.19	1.57	0.25	2.18	2.99	1.04	1.00	0.21	0.85	0.19	1.34	0.33	2.18	0.37	0.47	1.59	0.95	1.30	0.76	0.60
corticosterone	ME280462	1.36	0.73	1.48	1.08	1.09	0.69	1.09	0.53	0.76	0.47	1.14	1.14	2.29	0.42	1.53	1.30	1.82	0.93	0.64	0.90	0.39	0.95	0.82	1.69	0.32	0.75	1.13	1.07	1.57	0.81	0.69
17-OH pregnenolone	ME280475	0.81	NA	NA	1.03	1.02	1.41	1.64	1.29	0.70	1.27	0.76	NA	0.85	0.64	1.16	0.87	1.51	0.52	NA	1.09	0.92	0.92	NA	1.22	0.93	0.76	0.78	0.54	NA	1.10	0.83
cortisol	ME280459	1.00	1.00	0.99	1.01	0.99	1.04	0.99	0.99	1.00	0.99	0.99	0.98	1.00	0.99	0.97	0.99	NA	1.01	0.99	1.00	1.00	1.03	0.99	1.01	1.00	1.00	1.00	1.00	1.00	1.08	1.00
pregnenolone	ME280486	NA	0.98	NA	NA	1.15	NA	NA	NA	0.65	0.67	NA	0.74	0.69	0.73	0.63	0.69	1.08	2.66	1.33	0.86	0.79	0.98	NA	NA	1.30	1.41	1.56	NA	NA	NA	0.77
20-hydroxyprogesterone	ME280476	NA	0.90	0.97	NA	1.61	NA	0.69	NA	0.78	NA	NA	0.88	1.20	NA	0.88	NA	0.95	0.77	0.68	1.36	NA	NA	0.76	0.80	NA	NA	NA	1.42	NA	0.74	NA
Taurodehydrocholate	ME280489	NA	0.99	1.43	NA	1.05	1.11	0.99	NA	1.00	0.93	1.03	0.94	NA	NA	0.96	NA	0.80	0.90	NA	1.04	0.89	NA	NA	NA	0.93	1.07	NA	NA	NA	1.02	NA
dehydroepiandrosterone sulfate	ME280468	1.29	1.01	NA	NA	1.57	0.91	NA	0.57	NA	0.48	0.29	NA	NA	0.35	1.66	NA	NA	NA	NA	0.58	NA	1.41	NA	0.62	NA	0.96	1.04	0.73	0.53	NA	3.14
Glycolithocholic acid	ME280510	1.89	0.75	NA	NA	0.98	NA	0.67	1.50	1.09	0.35	0.37	1.05	NA	NA	0.33	0.95	NA	NA	1.14	0.58	2.12	NA	NA	0.92	0.75	1.86	0.73	NA	NA	NA	NA
Taurolithocholic acid	ME280507	0.64	NA	NA	NA	0.69	NA	0.67	2.99	0.74	0.61	0.88	0.44	NA	NA	NA	1.23	0.64	NA	NA	0.55	0.46	NA	NA	NA	0.46	0.50	NA	0.51	0.46	NA	2.46
Taurochenodeoxycholic acid	ME280501	0.73	0.44	0.78	0.51	0.20	0.25	0.25	0.20	0.29	0.57	1.52	0.46	2.08	0.25	0.28	2.85	4.29	0.46	0.39	0.41	0.34	0.76	0.55	0.35	0.85	0.21	0.41	3.29	0.31	6.06	4.75
Taurodeoxycholic acid	ME280502	0.05	0.25	0.35	0.13	0.18	0.08	0.66	0.25	0.12	0.37	3.55	0.35	1.62	0.42	0.25	5.45	0.41	0.12	0.37	0.21	0.06	3.10	0.24	0.28	1.37	0.34	0.37	0.18	0.58	0.30	13.85
Tauroursodeoxycholic acid	ME280493	0.15	0.36	0.17	0.22	0.13	0.23	0.20	0.21	0.18	0.37	1.39	0.38	NA	0.25	0.78	5.98	0.20	0.16	0.21	0.51	0.27	1.86	0.16	0.51	2.49	0.21	0.23	5.32	0.33	0.27	7.04
Glycocholic acid	ME280499	0.09	0.20	0.19	0.13	0.20	0.13	0.23	0.42	0.17	0.27	1.72	0.49	0.38	0.22	0.20	5.13	0.28	0.23	0.29	0.25	0.11	2.05	0.05	0.17	2.26	0.15	0.24	2.84	0.81	0.17	8.04
Glycodeoxycholic acid	ME280506	0.10	0.15	0.27	0.11	0.09	0.12	0.43	0.15	0.10	0.30	3.50	0.32	NA	0.25	0.19	4.97	0.09	0.10	0.18	0.20	0.06	1.85	0.31	0.32	1.16	0.18	0.34	1.46	0.80	1.13	8.20
ß-Muricholic acid	ME280500	0.62	0.35	0.12	0.33	0.43	0.48	0.69	0.47	0.31	0.27	1.08	1.03	0.85	0.50	0.47	4.95	0.95	0.40	0.14	1.11	0.71	0.75	0.29	0.16	1.26	0.41	0.09	1.18	0.23	0.72	7.42
Deoxycholic acid	ME280509	0.21	0.43	0.59	0.36	0.30	0.22	0.62	0.46	0.22	0.53	2.23	0.79	1.86	0.66	0.60	3.91	1.18	0.37	0.48	0.45	0.27	2.76	0.46	0.70	1.20	0.59	0.51	1.62	0.71	1.14	7.59
Chenodeoxycholic acid	ME280508	0.25	0.44	1.11	0.33	0.55	0.48	1.10	0.53	0.45	1.03	2.69	0.62	1.12	0.65	0.56	3.25	1.12	0.39	0.47	0.60	0.58	1.03	0.52	0.40	1.03	0.60	0.82	1.67	0.93	0.58	7.38
Glycoursodeoxycholic acid	ME280496	0.15	0.52	0.50	0.18	0.34	0.22	1.10	0.53	0.22	0.99	2.43	0.95	1.07	1.02	0.41	3.23	0.75	0.30	0.44	0.91	0.41	1.62	0.51	0.38	1.17	0.54	0.44	0.69	1.66	0.37	7.83
Taurocholic acid	ME280494	0.18	0.10	0.10	0.12	0.08	0.11	0.07	0.06	0.07	0.11	2.85	0.20	3.46	0.10	0.08	7.51	4.28	0.14	0.10	0.29	0.09	2.94	0.11	0.10	2.72	0.10	0.09	2.54	0.14	1.74	6.79
Tauro-?-Muricholic acid	ME280490	0.21	0.19	0.15	0.19	0.12	0.09	0.17	0.15	0.10	0.22	1.37	0.25	3.67	0.18	0.10	4.62	3.29	0.16	0.22	0.63	0.15	2.21	0.19	0.17	4.68	0.20	0.13	1.67	0.30	2.15	6.09
Tauro-a-Muricholic acid	ME280491	0.08	0.08	0.04	0.05	0.09	0.08	0.08	0.05	0.05	0.10	1.48	0.18	0.70	0.09	0.07	8.97	2.75	0.08	0.09	0.23	0.06	2.25	0.04	0.09	6.18	0.08	0.09	1.84	0.07	0.77	9.05
Tauro-ß-Muricholic acid	ME280492	0.06	0.06	0.04	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.03	0.06	1.61	0.10	2.17	0.05	0.05	11.27	3.14	0.04	0.04	0.40	0.03	2.25	0.03	0.05	3.77	0.05	0.04	1.95	0.07	1.88	6.58

Factors:

F1	Genotype:A2m
F2	Genotype:Ahcy
F3	Genotype:Atp5b
F4	Genotype:Atp6v0d1
F5	Genotype:C8a
F6	Genotype:Cdk4
F7	Genotype:Dhfr
F8	Genotype:Dync1li1
F9	Genotype:G6pd2
F10	Genotype:Galc
F11	Genotype:Gnpda1
F12	Genotype:Idh1
F13	Genotype:Iqgap1
F14	Genotype:Lmbrd1
F15	Genotype:Mfap4
F16	Genotype:Mmachc
F17	Genotype:Mvk
F18	Genotype:Nek2
F19	Genotype:Npc2
F20	Genotype:Null
F21	Genotype:Pebp1
F22	Genotype:Phyh
F23	Genotype:Pipox
F24	Genotype:Plk1
F25	Genotype:Pmm2
F26	Genotype:Ptpn12
F27	Genotype:Pttg1
F28	Genotype:Rock1
F29	Genotype:Sra1
F30	Genotype:Ulk3
F31	Genotype:Ywhaz

Data matrix