Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for Lipidomics Dataset of Sonication-Induced Traumatic Optic Neuropathy in Mice (Study ST001273)

Reversed phase POSITIVE ION MODE (Analysis AN002113)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4
SM(d34:1)	ME298922	0.01	0.17	7.48	0.00
PC(16:0/18:1)	ME298866	5.59	0.88	0.00	0.79
PC(38:1)	ME298879	NA	7.00	0.00	0.00
CerG1(d42:2)	ME298859	0.99	5.03	0.00	0.00
CerG1(d18:1/22:1)	ME298844	0.00	4.67	0.00	0.00
PC(34:0)	ME298871	0.00	4.67	0.00	0.00
PC(30:0)	ME298868	NA	5.00	NA	0.00
SM(d18:1/22:0)	ME298919	NA	5.00	NA	0.00
BisMePA(18:0/20:5)	ME298820	0.94	0.03	0.00	3.33
TG(18:0/18:0/18:1)	ME298941	0.01	0.02	NA	3.29
PC(32:0)	ME298869	0.01	NA	3.97	NA
BisMePA(18:1p/20:4)	ME298822	NA	0.57	1.74	0.69
LPC(18:1)	ME298863	NA	1.10	1.27	0.87
PC(35:1)	ME298874	0.01	NA	1.99	NA
PC(38:4)	ME298881	1.02	0.65	2.18	0.13
PE(16:0p/18:1)	ME298891	0.40	2.33	0.00	0.00
CerG1(d42:0+pO)	ME298855	0.08	2.04	0.00	0.18
SM(d18:1/24:0)	ME298920	0.00	2.00	NA	0.00
PS(18:0/22:6)	ME298916	NA	2.00	NA	0.00
PS(37:0)	ME298918	NA	2.00	0.00	NA
PE(16:0/22:6)	ME298889	0.17	1.28	NA	NA
PE(20:1/18:1)	ME298909	0.15	1.31	NA	0.00
SM(d42:2)	ME298927	0.00	1.33	NA	0.00
PI(16:0/20:4)	ME298911	0.00	1.33	NA	NA
SM(d40:7)	ME298925	0.00	1.33	NA	0.00
CerG1(d18:1/24:0+O)	ME298846	NA	1.25	NA	0.00
BisMePA(18:2p/22:4)	ME298828	NA	1.20	NA	0.00
PE(16:0e/22:4)	ME298890	NA	1.17	NA	0.00
PE(18:0p/20:4)	ME298900	NA	1.16	NA	0.02
PE(16:0/18:1)	ME298887	0.29	1.71	NA	NA
PE(18:0/20:1)	ME298894	0.29	1.81	NA	0.00
TG(16:0/16:0/18:1)	ME298936	0.20	1.80	NA	NA
dMePE(16:1p/20:1)	ME298948	0.00	1.50	NA	NA
PC(40:1)	ME298884	NA	1.50	0.00	NA
PE(16:0/20:3)	ME298888	0.22	1.59	0.00	NA
TG(18:1/18:1/18:1)	ME298945	0.19	1.54	NA	NA
PC(33:1)	ME298870	NA	1.22	NA	0.42
TG(16:0/17:0/18:1)	ME298937	NA	1.15	NA	0.59
LPC(18:0)	ME298862	0.00	1.56	0.00	0.68
PE(38:4p)	ME298910	NA	1.77	0.01	0.59
PC(36:1)	ME298875	0.42	1.19	NA	NA
PC(40:6)	ME298886	0.59	1.28	NA	NA
CerG1(d18:1/20:0+O)	ME298841	1.13	0.87	NA	NA
CerG1(d41:5)	ME298854	0.99	1.01	NA	NA
PC(38:6)	ME298883	1.04	0.96	NA	NA
PE(18:1p/20:4)	ME298905	1.03	0.97	NA	NA
dMePE(16:1p/22:4)	ME298950	0.90	1.19	NA	NA
ST(d18:0+pO/24:1)	ME298929	0.94	1.13	NA	NA
dMePE(16:1p/20:4)	ME298949	0.85	1.31	NA	NA
PC(38:2)	ME298880	0.76	1.37	NA	0.00
SM(d18:1/24:1)	ME298921	1.35	1.99	0.00	0.00
PE(18:1p/20:1)	ME298904	1.03	1.57	0.00	0.00
BisMePA(18:1p/18:1)	ME298821	0.67	1.93	0.00	NA
PC(18:0/18:1)	ME298867	0.88	1.96	0.00	0.00
PE(18:0p/18:1)	ME298898	1.22	2.92	0.00	0.00
PC(36:2)	ME298876	0.71	2.25	0.33	0.66
PE(16:0p/22:4)	ME298892	0.27	2.49	0.40	0.82
CerG1(d18:1/24:2)	ME298848	0.00	2.37	0.10	0.73
CerG1(d18:0+pO/24:2)	ME298836	NA	2.30	0.07	0.63
So(d16:0+pO)	ME298935	0.00	2.25	0.13	0.67
BisMePA(18:2p/20:1)	ME298826	0.07	2.48	0.00	0.00
CerG1(d41:1)	ME298853	0.00	2.50	0.00	NA
PE(18:0/22:6)	ME298897	NA	2.50	0.00	0.00
dMePE(16:0p/18:1)	ME298946	0.00	2.67	0.00	NA
dMePE(16:1p/18:1)	ME298947	0.00	2.75	0.00	NA
CerG1(d42:1+pO)	ME298858	0.32	2.87	0.00	0.00
TG(18:0/18:1/18:1)	ME298942	0.00	3.00	NA	NA
PE(18:1p/22:1)	ME298906	NA	3.00	NA	0.00
CerG1(d18:1/18:0+O)	ME298839	NA	3.00	0.00	0.00
Cer(d42:2)	ME298833	NA	3.00	NA	0.00
Cer(d18:1/24:1)	ME298832	NA	3.00	NA	0.00
BisMePA(18:2p/20:0)	ME298825	0.00	3.00	0.00	0.00
Cer(d18:0+pO/24:1)	ME298830	NA	3.00	NA	0.00
PE(18:0/20:3)	ME298895	0.00	4.00	0.00	0.00
Cer(d18:0+pO/22:1)	ME298829	NA	4.00	0.00	0.00
Cer(d18:1/22:1)	ME298831	NA	4.00	0.00	0.00
PC(40:2)	ME298885	0.25	3.64	0.06	0.14
ST(d18:1/24:1)	ME298933	0.00	3.50	0.00	0.00
CerG1(d18:0+pO/23:1)	ME298834	0.00	3.50	0.00	0.00
CerG1(d18:1/23:1)	ME298845	0.00	3.50	0.00	0.00
CerG1(d18:0/22:0+O)	ME298837	0.00	3.67	0.00	0.00
PE(18:0p/20:1)	ME298899	0.00	3.60	0.00	0.00
CerG1(d41:0+pO)	ME298851	3.73	0.50	NA	0.38
PE(18:0/18:1)	ME298893	3.54	0.21	0.00	0.00
CerG1(d42:1)	ME298857	3.21	0.56	0.00	NA
SM(d36:1)	ME298923	3.38	0.62	0.00	0.00
CerG1(d42:0+pO+O)	ME298856	2.85	0.06	NA	0.57
CerG1(d18:1/18:0)	ME298838	3.00	NA	0.00	0.00
PE(18:1p/22:4)	ME298907	3.00	NA	NA	0.00
CerG1(d18:1/24:1)	ME298847	4.72	0.06	0.00	0.12
PE(18:0p/22:4)	ME298901	4.08	0.45	0.53	0.17
PC(16:0/16:0)	ME298865	1.92	0.13	NA	1.66
PC(34:2)	ME298873	1.20	1.28	0.61	0.89
LPC(16:0)	ME298861	0.93	0.94	1.05	1.10
ST(d18:0+pO/25:0)	ME298930	1.00	0.99	0.99	1.03
ST(d18:1/25:0)	ME298934	0.99	1.00	0.98	1.02
PC(36:3)	ME298877	1.28	0.79	1.04	0.89
ST(d18:1/20:3)	ME298931	1.18	0.91	0.96	0.94
CerG1(d18:1/22:0+O)	ME298843	1.78	1.70	0.00	0.48
PE(18:0/20:4)	ME298896	1.67	1.48	0.04	0.33
PC(36:4)	ME298878	1.21	1.75	0.35	0.66
CerG1(d40:0+pO+O)	ME298849	1.33	1.31	0.00	0.78
PS(18:0/18:1)	ME298913	1.24	1.27	0.22	1.27
CerG1(d40:1)	ME298850	2.38	1.62	0.00	0.00
PS(18:0/20:1)	ME298914	2.72	1.28	0.00	0.00
PE(18:1p/18:1)	ME298903	2.15	0.55	0.82	0.65
BisMePA(18:2p/18:1)	ME298824	2.33	NA	0.00	0.00
BisMePA(18:1p/22:4)	ME298823	1.39	NA	0.22	NA
CerG1(d18:0+pO/24:1)	ME298835	1.61	NA	0.00	0.16
PE(18:1p/22:6)	ME298908	1.59	0.10	0.13	NA
ST(d18:1/24:0)	ME298932	2.00	NA	NA	0.00
CerG1(d18:1/20:1)	ME298842	1.83	0.17	NA	NA
SM(d38:1)	ME298924	1.72	0.28	NA	NA
PI(18:0/20:4)	ME298912	1.89	0.61	0.00	NA
PE(18:0p/22:6)	ME298902	2.22	0.72	0.00	0.00
CerG1(d44:4+pO)	ME298860	2.00	0.75	NA	NA
BisMePA(18:2p/20:4)	ME298827	2.03	0.97	NA	0.00
PS(18:1/22:0)	ME298917	2.07	0.86	0.00	NA
CerG1(d41:0+pO+O)	ME298852	1.31	0.69	NA	NA
SM(d41:7)	ME298926	1.59	0.80	NA	NA
PC(34:1e)	ME298872	1.65	1.35	0.00	NA
TG(18:0/8:0/18:0)	ME298944	1.52	1.48	0.00	NA
PC(38:5)	ME298882	1.42	1.20	NA	0.19
CerG1(d18:1/18:1)	ME298840	1.59	1.16	NA	0.00
PS(18:0/22:4)	ME298915	1.67	1.06	NA	0.00

Factors:

F1	Exposure:No Sonication \| Days Post Exposure:Control
F2	Exposure:Sonication \| Days Post Exposure:Day Fourteen
F3	Exposure:Sonication \| Days Post Exposure:Day One
F4	Exposure:Sonication \| Days Post Exposure:Day Seven

Data matrix