Clustering data with hclust algorithm for Lipid profile Dataset of optogenetics induced optic nerve regeneration (Study ST001381)
Reversed phase POSITIVE ION MODE (Analysis AN002301)| Metabolite | Structure | F1 | F2 | F3 | F4 | F5 | F6 | F7 | F8 | F9 | F10 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BisMePA(18:2p/18:1) | ME317198 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 3.08 | 5.92 |
| SM(d18:1/24:1) | ME317670 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 1.53 | 0.08 | 4.70 |
| CL(18:1/16:0/16:0/18:1) | ME317216 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 3.55 |
| PE(18:1p/22:1) | ME317580 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 5.00 |
| CerG1(d39:7+hO) | ME317352 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.20 | 0.53 | 0.32 | 0.75 | 4.52 |
| PE(18:1p/18:1) | ME317575 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.57 | 0.00 | 0.69 | 4.89 |
| DG(18:0/18:0) | ME317403 | NA | NA | NA | NA | NA | 4.17 | 2.24 | 1.08 | 0.19 | 0.63 |
| PC(16:0/22:6) | ME317490 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 2.06 | 0.00 | 3.77 | 0.00 |
| PG(16:0/18:1) | ME317608 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.34 | 0.86 | 0.54 | 4.60 | 0.00 |
| Cer(d18:1/23:1) | ME317247 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 4.82 | 0.68 |
| CerG1(d18:1/18:0) | ME317297 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 3.90 | 0.09 |
| dMePE(38:5) | ME317796 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.67 | 0.82 | 1.03 | 3.17 | 0.00 |
| PC(16:0/20:4) | ME317489 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.07 | 0.19 | 1.17 | 3.54 | 0.72 |
| PE(18:0/20:1) | ME317547 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.52 | 0.24 | 3.69 | 1.10 |
| PE(18:1p/22:4) | ME317582 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | 2.99 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| SoP(d22:1) | ME317709 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.77 | 3.86 | 0.95 | 0.24 | 0.67 |
| SM(d34:1) | ME317675 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.20 | 0.18 | 1.87 | 2.43 |
| CerG1(d37:5+hO) | ME317337 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.38 | 0.65 | 0.18 | 2.23 | 2.52 |
| PC(18:1/18:1) | ME317503 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.14 | 0.42 | 0.09 | 2.71 | 2.29 |
| dMePE(36:6) | ME317792 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.15 | 0.36 | 0.69 | 2.03 | 3.28 |
| PC(18:0/16:0) | ME317498 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.15 | 0.12 | 0.98 | 1.49 | 2.73 |
| CerG1(d18:1/22:1) | ME317307 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.97 | 0.00 | 0.85 | 0.00 | 1.78 |
| PE(18:1/20:4) | ME317568 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.14 | 0.03 | 1.81 | 0.38 | 1.86 |
| dMePE(36:6p) | ME317793 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.07 | 0.40 | 1.06 | 0.00 | 2.35 |
| PE(18:1p/20:4) | ME317578 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.09 | 0.03 | 1.10 | 0.00 | 2.77 |
| PE(18:1p/22:5) | ME317583 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.29 | 0.18 | 0.78 | 0.11 | 2.57 |
| TG(16:0/14:0/16:0) | ME317718 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.18 | 0.00 | 0.09 | 0.11 | 1.90 |
| PS(18:0/22:6) | ME317642 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.41 | 0.00 | 0.27 | 0.65 | 2.62 |
| So(d24:0+pO) | ME317707 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.03 | 0.04 | 0.52 | 1.10 | 2.19 |
| TG(12:0/12:0/14:0) | ME317711 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.03 | 0.00 | 0.00 | 1.02 | 2.17 |
| PE(16:0/22:6) | ME317535 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.93 | 0.80 | 0.31 | 2.41 | 0.61 |
| Cer(d36:2+hO) | ME317261 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.40 | 0.64 | 0.48 | 2.32 | 1.02 |
| PE(18:1/22:4) | ME317570 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.24 | 0.80 | 0.45 | 2.02 | 1.18 |
| PE(18:0p/20:1) | ME317558 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.63 | 0.76 | 2.79 | 1.14 |
| PE(16:0/18:1) | ME317531 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.45 | 0.43 | 0.54 | 2.29 | 1.07 |
| MGMG(32:0) | ME317446 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.46 | 0.36 | 0.80 | 2.19 | 1.64 |
| PAF(30:0) | ME317470 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.67 | 0.50 | 0.83 | 2.23 | 1.70 |
| CerG1(d18:1/24:2) | ME317316 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.13 | 0.22 | 0.89 | 1.68 | 1.07 |
| LPC(16:0) | ME317415 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.07 | 0.06 | 0.85 | 1.95 | 0.73 |
| Cer(d22:0+pO/18:0) | ME317253 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.49 | 0.03 | 1.92 | 0.80 |
| TG(16:0/12:0/12:0) | ME317715 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.02 | 0.06 | 0.07 | 2.29 | 0.96 |
| PE(18:0/22:6) | ME317555 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.28 | 0.71 | 0.06 | 1.12 | 1.74 |
| PI(18:0/18:1) | ME317620 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.66 | 0.96 | 0.37 | 0.66 | 1.88 |
| BisMePA(18:2p/20:3) | ME317201 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.88 | 1.48 | 0.71 | 0.32 | 1.67 |
| BisMePA(18:1/20:5) | ME317194 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.88 | 1.35 | 0.71 | 1.98 |
| dMePE(16:0p/22:6) | ME317767 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 1.40 | 0.95 | 0.77 | 1.65 |
| PE(18:0/18:1) | ME317545 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.42 | 1.13 | 0.93 | 0.62 | 1.53 |
| dMePE(34:4) | ME317788 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.91 | 0.49 | 1.14 | 1.28 | 1.76 |
| CerG1(d18:1/22:0) | ME317305 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | 1.12 | 1.44 | 1.56 | 0.70 |
| PS(37:0) | ME317654 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.88 | 1.41 | 1.10 | 0.87 |
| CerP(d42:1+pO+2O) | ME317383 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.04 | 0.52 | 1.24 | 1.39 | 1.27 |
| CerG1(d18:1/24:1) | ME317315 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.39 | 0.78 | 1.04 | 1.09 | 1.05 |
| MG(18:0) | ME317433 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.62 | 0.58 | 0.98 | 1.29 | 1.16 |
| CerG1(d38:1) | ME317342 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.01 | 1.17 | 2.10 | 0.84 | 0.28 |
| dMePE(16:1p/22:4) | ME317778 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.39 | 1.31 | 1.54 | 1.22 | 0.00 |
| dMePE(18:1/18:1) | ME317783 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.26 | 1.21 | 1.27 | 1.40 | 0.00 |
| LPC(18:0) | ME317416 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.48 | 1.07 | 0.35 | 1.60 | 0.98 |
| dMePE(38:1p) | ME317794 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.73 | 1.27 | 0.69 | 1.70 | 0.70 |
| TG(24:5) | ME317748 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.59 | 1.32 | 0.78 | 1.31 | 0.89 |
| BisMePA(18:0/20:5) | ME317191 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.07 | 0.77 | 0.90 | 1.62 | 0.67 |
| SM(d38:7+hO) | ME317680 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.52 | 1.19 | 1.14 | 1.10 | 0.56 |
| PG(18:3e) | ME317613 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.06 | 0.96 | 1.01 | 1.06 | 0.94 |
| SM(d18:1/18:0) | ME317667 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.94 | 1.04 | 0.98 | 1.09 | 0.80 |
| CerG1(d18:0/20:0+O) | ME317289 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.70 | 1.64 | 0.37 | 1.75 | 0.16 |
| PE(18:1p/22:6) | ME317584 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.49 | 1.39 | 0.53 | 1.49 | 0.19 |
| dMePE(16:0p/18:1) | ME317764 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.04 | 1.19 | 0.94 | 1.43 | 0.25 |
| dMePE(16:1p/22:1) | ME317776 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.77 | 1.28 | 0.89 | 1.57 | 0.00 |
| dMePE(16:1p/18:1) | ME317770 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 1.49 | 0.73 | 1.25 | 0.69 |
| PS(18:0/20:1) | ME317637 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.27 | 1.73 | 0.75 | 1.30 | 0.46 |
| TG(16:1/16:1/18:1) | ME317732 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.24 | 1.92 | 0.98 | 1.57 | 0.35 |
| PE(18:0/20:4) | ME317549 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.86 | 1.76 | 1.35 | 0.67 | 0.44 |
| PS(18:1/22:0) | ME317645 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.39 | 1.81 | 1.18 | 0.52 | 0.40 |
| PS(18:0/18:1) | ME317636 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.52 | 2.48 | 0.39 | 0.74 | 0.48 |
| PS(39:1) | ME317659 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.43 | 2.05 | 0.75 | 0.74 | 0.45 |
| dMePE(16:1p/22:6) | ME317780 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.70 | 1.68 | 0.65 | 0.12 | 1.54 |
| PS(18:0/20:4) | ME317639 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.39 | 1.19 | 0.49 | 0.29 | 2.51 |
| CerG1(d35:1+pO) | ME317327 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.72 | 0.80 | 0.63 | 1.48 | 0.91 |
| PC(18:0/18:1) | ME317499 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.04 | 0.23 | 0.11 | 1.54 | 1.82 |
| dMePE(16:1p/20:4) | ME317775 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.13 | 2.20 | 0.46 | 0.38 | 0.56 |
| CerG1(d18:1/23:0+O) | ME317310 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.15 | 1.47 | 0.05 | 1.07 | 0.06 |
| PS(18:1/23:0) | ME317647 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.65 | 1.42 | 0.93 | 0.64 | 0.02 |
| PE(18:1/18:1) | ME317567 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.55 | 1.22 | 1.29 | 0.57 | 0.55 |
| MGDG(16:0/20:1) | ME317443 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.40 | 1.14 | 1.69 | 0.81 | 0.02 |
| MGMG(30:0) | ME317445 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.53 | 0.97 | 1.25 | 0.92 | 0.00 |
| SM(d38:1) | ME317678 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.00 | 1.42 | 0.97 | 0.07 | 0.63 |
| MGMG(38:1) | ME317449 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.09 | 0.81 | 1.45 | 0.31 | 0.87 |
| PAF(36:1) | ME317476 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.56 | 0.80 | 1.22 | 0.62 | 0.70 |
| PE(16:0p/20:4) | ME317541 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.96 | 1.48 | 0.00 | 0.84 | 1.07 |
| PAF(34:1) | ME317475 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.98 | 0.80 | 0.96 | 1.08 | 0.86 |
| TG(6:0/10:4/10:4) | ME317753 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.38 | 0.66 | 0.89 | 1.05 | 1.29 |
| PC(20:0/18:1) | ME317508 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.66 | 0.94 | 0.48 | 1.17 | 1.16 |
| PS(18:1/22:1) | ME317646 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.51 | 1.18 | 0.33 | 0.95 | 0.97 |
| dMePE(34:4p) | ME317789 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.86 | 1.21 | 0.77 | 0.68 | 1.26 |
| PE(18:0p/20:4) | ME317561 | NA | NA | NA | NA | NA | 2.39 | 1.36 | 0.85 | 0.59 | 1.02 |
| dMePE(16:1p/20:1) | ME317772 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.68 | 1.82 | 0.53 | 0.64 | 0.93 |
| dMePE(32:1) | ME317786 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.95 | 1.62 | 0.76 | 1.18 | 0.75 |
| SM(d36:2) | ME317677 | NA | NA | NA | NA | NA | 1.89 | 1.21 | 3.18 | 0.15 | 0.53 |
| Cer(d18:0+pO/22:1) | ME317223 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.06 | 0.00 | 2.23 | 2.44 | 0.05 |
| PE(16:0/20:4) | ME317533 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.45 | 0.43 | 2.05 | 1.73 | 0.11 |
| PC(16:0/16:0) | ME317484 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.12 | 0.13 | 2.93 | 0.13 | 2.04 |
| Cer(d44:0) | ME317273 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.11 | 0.05 | 1.89 | 1.32 | 1.20 |
| CerG1(d18:1/25:1) | ME317319 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.02 | 2.54 | 0.49 | 0.96 |
| MG(20:0) | ME317435 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.00 | 1.95 | 0.17 | 1.31 |
| Cer(d18:0/16:0+O) | ME317231 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.00 | 0.78 | 1.96 | 0.20 | 1.40 |
| PE(16:0p/22:6) | ME317543 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.34 | 0.32 | 1.91 | 0.76 | 1.20 |
| SM(d36:1) | ME317676 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.79 | 0.61 | 1.77 | 0.62 | 1.16 |
| MGDG(16:0/18:0) | ME317440 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.02 | 1.90 | 1.60 | 0.03 | 0.09 |
| CL(75:6) | ME317217 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.67 | 0.19 | 2.81 | 0.11 | 0.00 |
| SM(d41:1) | ME317682 | NA | NA | NA | NA | NA | 0.02 | 1.28 | 2.83 | 0.01 | 0.01 |
Factors:
| F1 | Genotype:Crush, light stimulation | Treatment:- |
| F2 | Genotype:Thy1-ChR2-EYFP | Treatment:Crush, light stimulation |
| F3 | Genotype:Thy1-ChR2-EYFP | Treatment:Crush, No light stimulation |
| F4 | Genotype:Thy1-ChR2-EYFP | Treatment:No Crush, light stimulation |
| F5 | Genotype:Thy1-ChR2-EYFP | Treatment:No Crush, No light stimulation |
| F6 | Genotype:- | Treatment:- |
| F7 | Genotype:Wild-type | Treatment:Crush, light stimulation |
| F8 | Genotype:Wild-type | Treatment:Crush, No light stimulation |
| F9 | Genotype:Wild-type | Treatment:No Crush, light stimulation |
| F10 | Genotype:Wild-type | Treatment:No Crush, No light stimulation |
