Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with hclust algorithm for (Study ST001819)

(Analysis AN002951)

Metabolite	Structure	F1	F2	F3	F4	F5	F6
NAPS 38:2	ME420073	0.47	0.45	0.96	0.93	1.55	1.56
PS 38:1	ME420038	0.34	0.46	0.97	0.98	1.57	1.61
BMP 34:0	ME420060	0.63	0.77	1.03	0.92	1.14	1.51
Sulf 18:0	ME419925	0.51	0.59	1.00	1.01	1.32	1.54
BMP 32:1	ME420059	0.69	0.66	0.88	0.99	1.26	1.50
BMP 36:1	ME420064	0.57	0.71	0.96	1.00	1.28	1.46
BMP 32:0	ME420058	0.56	0.68	0.92	0.97	1.25	1.61
BMP 34:1	ME420061	0.60	0.67	0.95	1.00	1.21	1.55
PI 34:0	ME420018	0.58	0.65	0.72	1.24	1.32	1.50
PEp 36:2	ME419992	0.52	0.61	0.77	1.28	1.38	1.44
PI 40:6	ME420030	0.57	0.59	0.75	1.35	1.36	1.36
PEp 36:1	ME419991	0.51	0.65	0.86	1.18	1.38	1.40
PA 38:3	ME419958	0.57	0.76	0.86	1.17	1.30	1.35
PEp 36:0	ME419990	0.55	0.72	0.87	1.15	1.34	1.38
BMP 36:2	ME420065	0.56	0.63	0.78	1.11	1.30	1.61
PS 38:2	ME420039	0.52	0.67	0.84	1.06	1.41	1.48
PS 36:0	ME420035	0.50	0.65	0.78	1.15	1.40	1.53
PS 36:1	ME420036	0.47	0.62	0.81	1.16	1.42	1.50
NAPS 36:2	ME420072	0.38	0.47	0.71	1.27	1.79	1.32
PA 40:5	ME419960	0.38	0.55	0.68	1.31	1.64	1.42
NAPS 40:4	ME420076	0.54	0.67	0.56	1.15	1.55	1.50
NAPS 38:3	ME420074	0.42	0.44	0.80	1.30	1.34	1.69
Sulf 20:0	ME419927	0.43	0.52	0.87	1.17	1.38	1.61
PA 34:0	ME419950	0.39	0.54	0.73	1.21	1.40	1.73
PA 34:2	ME419952	0.38	0.48	0.66	1.27	1.46	1.75
PI 36:1	ME420020	0.49	0.49	0.62	1.25	1.44	1.71
Sulf(2OH) 26:1	ME419940	0.39	0.48	0.65	1.25	1.63	1.58
NAPS 36:1	ME420071	0.40	0.42	0.67	1.21	1.59	1.69
Sulf(2OH) 26:0	ME419939	0.36	0.43	0.69	1.30	1.55	1.64
Sulf 26:1	ME419932	0.37	0.44	0.71	1.17	1.52	1.77
PEp 38:2	ME419995	0.41	0.46	0.75	1.23	1.53	1.58
Sulf(2OH) 24:0	ME419937	0.42	0.50	0.72	1.27	1.47	1.61
Sulf 22:0	ME419928	0.39	0.45	0.83	1.19	1.48	1.63
Sulf 24:0	ME419929	0.39	0.45	0.76	1.18	1.50	1.68
Sulf 24:1	ME419930	0.42	0.48	0.72	1.18	1.50	1.68
Sulf(2OH) 22:1	ME419936	0.48	0.55	0.74	1.24	1.42	1.56
PI 34:1	ME420019	0.48	0.59	0.68	1.28	1.43	1.55
Sulf(2OH) 20:0	ME419934	0.45	0.62	0.63	1.28	1.47	1.56
Sulf(2OH) 24:1	ME419938	0.45	0.53	0.62	1.27	1.49	1.63
Sulf 26:0	ME419931	0.46	0.53	0.67	1.22	1.49	1.61
Sulf(2OH) 22:0	ME419935	0.43	0.56	0.68	1.26	1.48	1.57
LPEp 18:1	ME420054	0.50	0.55	0.62	1.08	1.57	1.66
PA 32:1	ME419949	0.44	0.56	0.70	1.16	1.51	1.62
Sulf(2OH) 18:0	ME419933	0.45	0.65	0.72	1.09	1.47	1.62
NAPS 38:4	ME420075	0.27	0.36	0.52	1.11	1.48	2.26
PA 38:1	ME419956	0.27	0.33	0.72	1.23	1.67	1.72
PA 38:2	ME419957	0.25	0.34	0.65	1.21	1.74	1.78
NAPS 36:0	ME420070	0.33	0.47	0.45	1.23	1.62	1.90
PA 34:1	ME419951	0.30	0.41	0.62	1.29	1.51	1.87
PA 36:0	ME419953	0.23	0.34	0.58	1.33	1.63	1.87
PA 36:1	ME419954	0.21	0.33	0.50	1.43	1.60	1.94
PA 36:2	ME419955	0.23	0.37	0.53	1.31	1.56	2.00
BMP 36:0	ME420063	0.80	1.01	1.49	0.70	0.99	0.98
GM3 22:0	ME419945	0.99	0.56	1.55	0.88	0.99	0.90
LPE 18:1	ME420050	0.85	0.85	0.91	0.83	1.10	1.46
NAPS 40:5	ME420077	0.71	1.12	1.00	1.18	1.02	1.01
PG 32:0	ME420006	0.67	1.19	0.79	1.15	1.16	1.12
PG 34:1	ME420009	0.71	1.21	0.85	1.12	1.09	1.11
PG 36:1	ME420012	0.70	1.17	0.87	1.13	1.08	1.13
PG 34:0	ME420008	0.68	1.16	0.81	1.13	1.11	1.18
PG 36:0	ME420011	0.72	1.18	0.80	1.10	1.11	1.17
PG 32:1	ME420007	0.74	1.18	0.86	1.15	1.11	1.02
PG 36:3	ME420014	0.78	1.22	0.89	1.11	1.11	0.95
PG 34:2	ME420010	0.68	1.25	0.89	1.14	1.07	1.05
PG 36:2	ME420013	0.77	1.22	0.91	1.09	1.03	1.05
PE 38:1	ME419973	0.58	0.64	1.00	1.29	1.31	1.14
Sulf 16:0	ME419924	0.65	0.80	0.83	1.03	1.32	1.37
PI 36:2	ME420021	0.70	0.69	0.81	1.13	1.31	1.35
PI 38:6	ME420027	0.75	0.69	0.81	1.18	1.30	1.24
PA 38:4	ME419959	0.64	0.93	0.92	1.15	1.19	1.19
PEp 34:2	ME419989	0.60	0.89	0.87	1.12	1.26	1.28
BMP 38:3	ME420067	0.69	0.74	0.95	1.09	1.20	1.31
PS 42:4	ME420046	0.62	0.79	0.94	1.10	1.20	1.35
Sulf 18:1	ME419926	0.69	0.84	1.08	0.97	1.11	1.30
PS 38:3	ME420040	0.74	0.90	0.99	0.98	1.14	1.26
PEp 34:1	ME419988	0.68	0.86	0.97	1.00	1.16	1.34
PS 38:4	ME420041	0.70	0.87	0.94	1.03	1.18	1.28
LPI 18:0	ME420056	0.70	0.95	0.92	1.24	1.16	1.06
PA 40:6	ME419961	0.68	0.81	0.94	1.31	1.13	1.15
PI 40:5	ME420029	0.80	0.82	0.93	1.06	1.19	1.18
PE 38:2	ME419974	0.74	0.78	1.03	1.17	1.18	1.07
PI 40:4	ME420028	0.83	0.79	1.03	1.16	1.12	1.05
PA 32:0	ME419948	0.74	0.88	1.01	1.09	1.09	1.20
PS 42:5	ME420047	0.72	0.92	1.04	1.13	1.09	1.12
PE 36:0	ME419968	0.80	0.89	0.96	1.18	1.11	1.06
PE 36:1	ME419969	0.80	0.87	0.92	1.22	1.11	1.08
PE 32:1	ME419964	0.84	0.92	0.95	1.12	1.07	1.11
PE 34:1	ME419966	0.84	0.94	0.99	1.13	1.05	1.05
PEp 32:1	ME419986	0.84	0.97	0.94	0.96	0.97	1.35
LPEp 18:0	ME420053	0.78	1.03	0.99	0.96	1.10	1.17
PS 36:2	ME420037	0.77	1.00	1.04	0.96	1.07	1.18
GM3 20:0	ME419944	1.21	1.03	1.04	0.80	1.24	0.62
GM3 24:0	ME419946	0.85	1.40	1.15	1.08	0.75	0.86
PG 38:4	ME420016	0.97	1.38	0.99	0.96	0.94	0.82
PG 38:5	ME420017	0.88	1.27	0.89	1.02	1.14	0.85
GM3 24:1	ME419947	1.28	1.05	0.91	0.96	0.78	1.04
LPE 20:4	ME420051	1.19	1.17	1.12	0.88	0.72	0.93
PEp 32:0	ME419985	1.11	1.21	1.21	0.75	0.80	0.94
PE 36:4	ME419972	1.15	1.24	1.24	0.90	0.77	0.71
PS 32:0	ME420031	1.21	1.14	1.24	0.75	0.85	0.78
PE 42:5	ME419983	1.13	1.18	1.37	0.78	0.73	0.81
PE 42:6	ME419984	1.10	1.12	1.27	0.82	0.79	0.89
PE 40:3	ME419979	1.09	1.17	1.27	0.85	0.77	0.86
PE 40:4	ME419980	1.10	1.18	1.28	0.83	0.76	0.85
PEp 36:4	ME419994	1.17	1.13	1.28	0.85	0.79	0.77
PEp 38:4	ME419997	1.13	1.13	1.28	0.86	0.78	0.82
PE 38:3	ME419975	1.14	1.20	1.26	0.84	0.75	0.81
PE 38:4	ME419976	1.18	1.21	1.29	0.81	0.74	0.77
BMP 38:5	ME420069	0.96	1.13	1.35	0.76	0.96	0.82
PEp 42:5	ME420004	0.96	1.14	1.18	0.83	0.91	0.98
PS 34:1	ME420034	0.90	1.13	1.24	0.87	0.90	0.96
PS 40:4	ME420043	0.94	1.08	1.15	0.88	0.94	1.02
PEp 34:0	ME419987	0.86	1.05	1.15	0.89	1.01	1.05
PS 34:0	ME420033	0.86	1.06	1.20	0.90	0.97	1.01
PEp 42:6	ME420005	1.00	1.22	1.11	0.91	0.90	0.89
PE 36:3	ME419971	1.07	1.10	1.18	0.96	0.85	0.83
PEp 40:3	ME420000	1.09	1.05	1.24	0.87	0.86	0.86
PEp 40:4	ME420001	1.12	1.07	1.22	0.89	0.82	0.87
PEp 38:6	ME419999	1.10	1.01	1.13	0.90	0.92	0.92
PE 40:6	ME419982	0.98	1.09	1.23	0.90	0.88	0.93
PE 38:5	ME419977	1.02	1.08	1.17	0.93	0.87	0.93
PE 40:5	ME419981	1.04	1.06	1.21	0.90	0.87	0.90
PEp 38:3	ME419996	1.04	0.97	1.21	0.93	0.89	0.92
PEp 38:5	ME419998	0.99	1.01	1.18	0.92	0.91	0.98
BMP 34:2	ME420062	1.07	0.81	1.10	0.86	0.92	1.20
LPI 20:4	ME420057	0.89	0.93	1.17	0.98	0.90	1.13
PI 38:3	ME420024	1.14	1.01	0.94	0.97	0.97	0.97
PI 38:4	ME420025	1.16	1.00	0.99	0.94	0.96	0.93
LPE 18:0	ME420049	1.04	1.01	0.96	0.86	1.04	1.10
LPE 16:0	ME420048	1.09	0.92	1.05	0.88	1.01	1.02
NAPS 40:6	ME420078	1.08	0.87	1.10	0.87	0.97	1.07
PG 38:3	ME420015	0.87	1.16	0.98	1.02	0.92	1.10
PEp 40:6	ME420003	1.00	0.98	1.07	0.97	1.00	0.96
BMP 36:3	ME420066	0.88	0.98	1.13	0.96	1.04	0.99
PE 30:0	ME419962	0.91	0.95	1.09	1.03	1.00	1.01
PEp 40:5	ME420002	0.93	0.91	1.07	0.99	1.04	1.05
PS 40:3	ME420042	0.89	1.03	1.04	0.95	1.02	1.07
PE 32:0	ME419963	0.85	1.03	1.13	1.03	0.96	1.01
PE 34:0	ME419965	0.84	0.99	1.04	1.09	1.02	1.02
PEp 36:3	ME419993	0.87	0.98	1.06	1.04	0.99	1.08
PI 38:5	ME420026	1.03	1.04	0.97	0.99	1.02	0.94
LPI 16:0	ME420055	0.98	1.07	0.97	1.03	0.99	0.97
PI 36:3	ME420022	1.01	1.02	0.96	1.05	1.02	0.96
PI 36:4	ME420023	0.94	1.01	0.99	1.06	1.07	0.92
PS 40:6	ME420045	0.93	0.98	0.99	1.04	1.06	1.00
PE 38:6	ME419978	0.93	0.98	1.04	1.04	1.04	0.96
PS 40:5	ME420044	0.91	1.01	1.02	1.03	1.05	0.98
LPEp 16:0	ME420052	0.90	0.98	0.92	1.13	1.06	1.03
PE 34:2	ME419967	0.94	0.94	1.00	1.10	1.02	1.00
PE 36:2	ME419970	0.90	0.94	0.99	1.11	1.06	1.00
BMP 38:4	ME420068	0.93	1.20	1.89	0.53	0.72	0.68
GM3 18:1	ME419943	1.50	1.47	1.31	0.65	0.55	0.54
GM3 16:0	ME419941	1.13	1.77	1.30	0.65	0.68	0.57
GM3 18:0	ME419942	1.15	1.40	1.40	0.64	0.75	0.68
PS 32:1	ME420032	1.03	1.44	1.34	0.55	0.83	0.85

Factors:

F1	Region:EC \| Genotype:E3/3
F2	Region:EC \| Genotype:E3/4
F3	Region:EC \| Genotype:E4/4
F4	Region:PVC \| Genotype:E3/3
F5	Region:PVC \| Genotype:E3/4
F6	Region:PVC \| Genotype:E4/4

Data matrix