Metabolomics Workbench : NIH Data Repository

Clustering data with heatmap algorithm for (Study ST001711)

This analysis uses the 'heatmap.2' function of gplots package in the R statistics environment

The rows are scaled to have mean=0 and standard deviation=1

Factors:

F1	NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:-
F2	NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F3	NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:3
F4	NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F5	NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F6	NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F7	NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F8	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:-
F9	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F10	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:2
F11	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:-
F12	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F13	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F14	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:3
F15	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:-
F16	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F17	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F18	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:1
F19	NAFLD.Category:1 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:NA
F20	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:-
F21	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F22	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:2
F23	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:-
F24	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F25	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:-
F26	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F27	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F28	NAFLD.Category:1 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:2
F29	NAFLD.Category:2 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F30	NAFLD.Category:2 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F31	NAFLD.Category:2 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F32	NAFLD.Category:2 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:3
F33	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:-
F34	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F35	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:2
F36	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:3
F37	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:-
F38	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F39	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F40	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:3
F41	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F42	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F43	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:3
F44	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:-
F45	NAFLD.Category:2 \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:2
F46	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:-
F47	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F48	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:2
F49	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:3
F50	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:-
F51	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F52	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F53	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:3
F54	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:NA
F55	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F56	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F57	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:3
F58	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:1
F59	NAFLD.Category:2 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:2
F60	NAFLD.Category:4 \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F61	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F62	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:3
F63	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F64	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F65	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:3
F66	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:-
F67	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F68	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F69	NAFLD.Category:NA \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:NA
F70	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:-
F71	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F72	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:2
F73	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F74	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F75	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:-
F76	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F77	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:-
F78	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:1
F79	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:3
F80	NAFLD.Category:NA \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:NA
F81	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:-
F82	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1
F83	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:2
F84	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:1
F85	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:2 \| Inflammation:2
F86	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:1
F87	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:3 \| Inflammation:2
F88	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:1
F89	NAFLD.Category:NA \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:NA \| Inflammation:NA
F90	NAFLD.Category:- \| T2DM:N \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:-
F91	NAFLD.Category:- \| T2DM:Y \| Kleiner.Steatosis:- \| Inflammation:-
F92	Sex:NA \| NAFLD.Category:1 \| T2DM:NA \| Kleiner.Steatosis:1 \| Inflammation:1

Data matrix