Data for (Study ST002172)
(Analysis AN003560)Values for each metabolite have been scaled by dividing by the mean across all factors Run Hierarchial cluster analysis on this study | Run Heatmap cluster analysis on this study| Metabolite | F1 | F2 | F3 | F4 |
|---|---|---|---|---|
| 10-Hydroxydecanoate | NA | NA | NA | NA |
| 1-Aminoethylphosphonate | NA | NA | NA | NA |
| 2^,3^-cCMP | NA | NA | NA | NA |
| 2,3-DPG | NA | NA | NA | NA |
| 2,3-Pyridinedicarboxylate | 0.9488 | 1.1688 | 1.1825 | 0.6999 |
| 2,4-Dihydroxypyrimidine-5-carboxylate | NA | NA | NA | NA |
| 2,5-Dihydroxybenzoate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| 2-Amino-3-phosphonopropionate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Aminoethylphosphonate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Deoxyglucose 6-phosphate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| 2-Deoxyribose 1-phosphate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Furoate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Hydroxy-4-methylpentanoate | NA | NA | 1.2522 | 0.7478 |
| 2-Hydroxybutyrate | 0.6490 | NA | 0.8582 | 1.4928 |
| 2-Hydroxyglutarate | 0.2363 | 0.2885 | 0.7009 | 2.3924 |
| 2-Hydroxyisobutyrate | NA | NA | 1.0000 | NA |
| 2-Hydroxyoctanoate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Hydroxypentanoate | NA | NA | 0.5075 | 1.4925 |
| 2-Hydroxyphenylacetate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Isopropylmalate | NA | NA | 0.0485 | 1.9515 |
| 2-Oxoadipate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Oxobutyrate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Oxoglutarate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Oxoisopentanoate | NA | 0.9677 | 1.0323 | NA |
| 2-Oxooctanoate | NA | NA | NA | NA |
| 2PG | NA | NA | NA | NA |
| 2-Quinolinecarboxylate | NA | NA | NA | NA |
| 2-Thiopheneacetate | NA | NA | NA | NA |
| 3-(2-Hydroxyphenyl)propionate | NA | NA | NA | NA |
| 3-(4-Hydroxyphenyl)propionate | NA | NA | NA | NA |
| 3^,5^-Cyclic dAMP | NA | NA | NA | NA |
| 3^-AMP | NA | NA | NA | NA |
| 3-Hydroxy-3-methylglutarate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| 3-Hydroxybutyrate | 0.6866 | 0.1457 | 2.0519 | 1.1158 |
| 3-Hydroxypropionate | NA | NA | NA | NA |
| 3-Indolebutyrate | NA | NA | NA | NA |
| 3-Indoxyl sulfate | NA | NA | 1.0000 | NA |
| 3-Methylbutanoate | 0.0907 | 0.1028 | 1.9062 | NA |
| 3PG | NA | NA | NA | NA |
| 3-Phenyllactate | NA | NA | NA | NA |
| 3-Phenylpropionate | NA | NA | NA | NA |
| 3-Ureidopropionate | NA | NA | NA | NA |
| 4-Acetylbutyrate | 0.9426 | 1.1870 | 0.9950 | 0.9688 |
| 4-Hydroxy-3-methoxymandelate | NA | NA | NA | NA |
| 4-Hydroxymandelate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| 4-Methyl-2-oxopentanoate | 0.7490 | 0.7134 | 1.4660 | NA |
| 4-Methylthio-2-oxobutyrate | NA | NA | NA | NA |
| 4-Oxohexanoate | NA | NA | NA | NA |
| 4-Oxopentanoate | NA | NA | NA | NA |
| 4-Pyridoxate | 0.4455 | 0.6452 | 0.6695 | 2.2398 |
| 6-Hydroxyhexanoate | NA | NA | NA | NA |
| 6-Phosphogluconate | NA | NA | NA | NA |
| Acetyl CoA | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Adenosine 3^,5^-diphosphate | NA | NA | NA | NA |
| Adenosine 5^-phosphosulfate | NA | NA | NA | NA |
| Adenylosuccinate | NA | NA | NA | NA |
| Adipate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| ADP | NA | 0.4520 | NA | 1.3653 |
| ADP-glucose | NA | NA | NA | NA |
| ADP-ribose | 0.5217 | 0.6957 | NA | 1.1957 |
| Allantoate | 0.5364 | 1.6116 | 0.5428 | 1.1949 |
| AMP | 0.1000 | 0.5242 | 0.5443 | 2.3815 |
| ATP | NA | NA | NA | NA |
| Azelate | 0.8733 | 1.0200 | 0.8867 | 1.2200 |
| Barbiturate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Benzoate | NA | NA | NA | NA |
| Benzoylformate | NA | NA | NA | NA |
| Benzylsuccinate | NA | NA | NA | NA |
| Biotin | NA | NA | NA | NA |
| Butyrate | 0.0254 | NA | 1.0748 | 1.4126 |
| cAMP | NA | 0.8034 | NA | 1.1966 |
| Carbamoylaspartate | NA | NA | 0.6016 | 1.3984 |
| Carbamoylphosphate | NA | NA | NA | NA |
| CDP | NA | NA | NA | NA |
| CDP-choline | NA | NA | NA | NA |
| cGMP | NA | NA | NA | NA |
| Cholate | NA | NA | 0.5000 | 1.5000 |
| cIMP | NA | NA | NA | NA |
| cis-Aconitate | 0.3322 | 1.0897 | 1.1296 | 1.0498 |
| Citraconate | 1.2030 | 0.5245 | 0.5281 | 1.7444 |
| Citramalate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Citrate | 0.1523 | 1.5124 | 0.4686 | 1.8667 |
| CMP | 0.1792 | 0.2240 | 1.8978 | 0.6955 |
| CMP-N-acetylneuraminate | 1.1549 | 0.7934 | 1.0235 | 1.3146 |
| CoA | NA | NA | NA | NA |
| Crotonate | NA | NA | NA | NA |
| CTP | NA | NA | NA | NA |
| Cysteate | NA | NA | 0.4004 | 1.1499 |
| Cysteine S-sulfate | 2.8533 | 0.4955 | 0.1452 | 0.0122 |
| Cysteine sulfinate | 1.0656 | 0.8687 | NA | NA |
| dADP | NA | NA | NA | NA |
| dAMP | NA | NA | NA | NA |
| dATP | NA | NA | NA | NA |
| DCA | NA | NA | NA | NA |
| dCDP | NA | NA | NA | NA |
| dCMP | NA | NA | NA | NA |
| dCTP | NA | NA | NA | NA |
| Deamido-NAD+ | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Decanoate | 0.5465 | 0.5065 | 2.3948 | 0.4028 |
| dGTP | NA | NA | NA | NA |
| DHAP | NA | NA | NA | NA |
| Digalacturonate | NA | 1.0000 | NA | NA |
| Dihydroorotate | NA | NA | NA | NA |
| dITP | NA | NA | NA | NA |
| Dodecanedioate | 1.0171 | 0.9581 | 1.1276 | 0.8490 |
| Dodecanoate | 0.6923 | 0.4489 | 1.8878 | 0.3329 |
| dTDP | NA | NA | NA | 1.0000 |
| dTMP | NA | NA | 1.0526 | 0.9868 |
| dTTP | NA | NA | NA | NA |
| dUDP | NA | NA | NA | NA |
| dUMP | NA | NA | NA | NA |
| dUTP | NA | NA | NA | NA |
| F1,6P | NA | NA | NA | NA |
| F6P | NA | NA | NA | 1.0000 |
| FAD | NA | NA | 0.6443 | 1.2668 |
| Folate | NA | NA | NA | NA |
| Fumarate | 0.4359 | 0.3783 | 1.6859 | 1.3590 |
| G1P | NA | NA | NA | 1.0000 |
| G3P | NA | NA | NA | NA |
| G6P | NA | NA | 0.1294 | 1.8706 |
| Galacturonate 1-phosphate | NA | NA | NA | NA |
| GDP | NA | NA | NA | NA |
| GDP-mannose | NA | NA | NA | NA |
| Gluconate | 0.5299 | 2.9911 | 0.1925 | 0.2865 |
| Glucosamine 6-phosphate | NA | NA | NA | NA |
| Glucuronate | 3.1958 | 0.7040 | 0.0661 | 0.0341 |
| Glutarate | 0.1610 | 0.1571 | 0.2166 | 2.4146 |
| Glycerate | 0.9987 | 0.9661 | 1.1907 | 0.8360 |
| Glycerophosphate | 0.2816 | 0.2714 | 0.6693 | 1.9741 |
| Glycocholate | NA | NA | NA | NA |
| Glycolate | 0.6831 | 0.8537 | 1.5207 | 0.9059 |
| Glyoxylate | NA | NA | NA | NA |
| GMP | NA | 0.7134 | 0.6752 | 2.5478 |
| GTP | NA | NA | NA | NA |
| Heptanoate | NA | NA | 1.0000 | NA |
| Hexanoate | 0.8890 | 0.7564 | 1.2958 | 0.8739 |
| Hippurate | NA | NA | NA | NA |
| Homovanillate | NA | NA | NA | NA |
| IDP | NA | NA | NA | NA |
| IMP | NA | 0.9724 | NA | 1.0553 |
| Indolelactate | 0.2699 | 0.2904 | 0.2945 | 3.1452 |
| Isethionate | 1.8056 | 1.3583 | 0.0617 | 0.0737 |
| Isobutyryl CoA | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Isocitrate | 0.3888 | 1.4433 | 0.6406 | NA |
| Itaconate | NA | NA | NA | NA |
| ITP | NA | NA | NA | NA |
| Lactate | 1.1733 | 0.8946 | 0.6675 | 1.2646 |
| Malate | 0.1347 | 0.2612 | 1.0667 | 2.5374 |
| Malonate | 0.1370 | 0.7799 | 0.5478 | 2.5353 |
| Malonyl CoA | NA | NA | NA | NA |
| Methanesulfonate | NA | NA | NA | NA |
| Methyl sulfate | 0.7639 | 0.5764 | 1.8981 | 0.9861 |
| (Methylthio)acetate | NA | NA | NA | NA |
| m-Hydroxybenzoate | NA | NA | NA | NA |
| Mucate | 0.2930 | 2.4929 | 0.2140 | NA |
| N-Acetylaspartate | 0.0372 | NA | 1.7814 | 0.4593 |
| N-Acetyl-beta-alanine | NA | NA | NA | NA |
| N-Acetylglucosamine 1-phosphate | 0.3113 | 0.4260 | 1.5154 | 1.2595 |
| N-Acetylglucosamine 6-phosphate | NA | NA | 0.1257 | 1.2186 |
| N-Acetylglutamate | 0.0544 | 0.1155 | 0.9935 | 2.6003 |
| N-Acetylleucine | 0.4775 | 0.4595 | 1.5315 | 1.5315 |
| N-Acetylmethionine | 1.0991 | 0.8523 | 1.5402 | 0.5084 |
| N-Acetylmuramate | NA | NA | NA | NA |
| N-Acetylneuraminate | 3.3739 | 0.4150 | 0.1285 | 0.0826 |
| N-Acetylphenylalanine | NA | NA | 0.8571 | 1.1429 |
| NAD+ | NA | NA | NA | 1.0000 |
| NADH | NA | NA | NA | NA |
| NADP+ | NA | NA | NA | 1.0000 |
| NADPH | NA | NA | NA | NA |
| N-Carbamylglutamate | NA | NA | NA | NA |
| N-Formylaspartate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| N-Formylmethionine | 0.4052 | 0.3313 | 1.5184 | 1.7451 |
| Nicotinate | NA | NA | 0.4650 | 1.5350 |
| o-Coumarate | NA | NA | NA | NA |
| Octanoate | 0.8229 | 0.6397 | 1.3653 | 0.6135 |
| o-Hydroxybenzoate | NA | NA | NA | NA |
| o-Hydroxyhippurate | NA | NA | NA | NA |
| O-Phosphoserine | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Orotate | 0.8000 | NA | 0.8235 | 1.5529 |
| Orotidine 5^-monophosphate | NA | NA | NA | NA |
| P1, P4-Di(adenosine-5^) tetraphosphate | NA | NA | NA | NA |
| Pantothenate | 0.5545 | 0.3345 | 1.7052 | 1.4058 |
| p-Coumarate | 1.0938 | 0.8125 | NA | NA |
| Pelargonate | 0.9328 | 0.7724 | 1.4434 | 0.5891 |
| Pentanoate | NA | NA | NA | NA |
| PEP | NA | NA | NA | NA |
| Phenaceturate | NA | NA | NA | NA |
| Phenyl phosphate | NA | NA | NA | NA |
| Phenylpyruvate | NA | NA | NA | NA |
| Phosphonoacetate | NA | NA | NA | NA |
| Phthalate | 0.6756 | 1.2078 | 0.9268 | 1.1898 |
| p-Hydroxybenzoate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| p-Hydroxyphenylacetate | NA | NA | 1.0000 | NA |
| Pimelate | NA | NA | 0.3868 | 1.6132 |
| Porphobilinogen | NA | NA | NA | NA |
| Propionate | 0.0311 | 0.0278 | 1.6239 | 1.3467 |
| Prostaglandin E2 | 0.2636 | NA | 2.1677 | 0.4250 |
| Prostaglandin F2alpha | NA | NA | NA | NA |
| PRPP | NA | NA | NA | NA |
| Pyrrole-2-carboxylate | NA | NA | NA | NA |
| Pyruvate | 1.0000 | NA | NA | NA |
| Quinate | 1.0634 | 1.7180 | 0.2186 | NA |
| R5P | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Ribulose 1,5-diphosphate | NA | NA | NA | NA |
| Ru5P | NA | NA | 0.8333 | 1.0833 |
| S7P | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Saccharate | NA | 1.0000 | NA | NA |
| Sebacate | 0.9341 | 1.2036 | 0.8743 | 0.9072 |
| Serine O-sulfate | NA | NA | NA | NA |
| Shikimate | NA | NA | NA | NA |
| Sinapate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| Sorbitol 6-phosphate | NA | NA | NA | NA |
| Succinate | 0.0030 | 0.0026 | 0.4993 | 3.4951 |
| Succinyl CoA | NA | NA | NA | NA |
| Syringate | NA | NA | NA | NA |
| Tartrate | 0.3716 | NA | 1.6284 | NA |
| Taurocholate | 1.8979 | 0.5288 | 1.2991 | 0.2742 |
| TDP-glucose | NA | NA | NA | NA |
| Terephthalate | 1.1888 | 1.1720 | 0.7350 | 0.9041 |
| threo-beta-methylaspartate | NA | NA | 1.1452 | 0.7095 |
| Threonate | 1.0921 | 0.5680 | 1.1292 | 1.2107 |
| Tiglate | NA | NA | NA | NA |
| trans-4-Hydroxy-3-methoxycinnamate | NA | NA | NA | NA |
| trans-Aconitate | NA | NA | NA | NA |
| trans-Cinnamate | NA | NA | NA | NA |
| Trehalose 6-phosphate | NA | NA | NA | NA |
| UDP | NA | NA | NA | 1.0000 |
| UDP-glucose | 0.2368 | 0.1805 | NA | 1.3957 |
| UDP-glucuronate | NA | NA | NA | 1.0000 |
| UDP-N-acetylglucosamine | 0.5112 | 0.1943 | NA | 1.5251 |
| UMP | 0.1997 | 0.4497 | 1.2951 | 1.5177 |
| Undecanoate | NA | 0.2627 | 1.1843 | NA |
| Urate | 1.1402 | 1.6075 | 0.3607 | 0.5662 |
| UTP | NA | NA | NA | NA |
| Xanthurenate | NA | NA | 0.9951 | 1.0049 |
| XMP | NA | NA | NA | NA |
| XTP | NA | NA | NA | NA |
Factors:
| F1 | Organ:Cecum | Treatment:Germfree | Diet:Fiber-free |
| F2 | Organ:Cecum | Treatment:Germfree | Diet:Fiber-rich |
| F3 | Organ:Cecum | Treatment:Gnotobiote (14SM) | Diet:Fiber-free |
| F4 | Organ:Cecum | Treatment:Gnotobiote (14SM) | Diet:Fiber-rich |
