Data for (Study ST003735)
(Analysis AN006129)Values for each metabolite have been scaled by dividing by the mean across all factors Run Hierarchial cluster analysis on this study | Run Heatmap cluster analysis on this study| Metabolite | F1 | F2 | F3 | F4 | F5 | F6 | F7 | F8 | F9 | F10 | F11 | F12 | F13 | F14 | F15 | F16 | F17 | F18 | F19 | F20 | F21 | F22 | F23 | F24 | F25 | F26 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1-Methylguanine | 1.3689 | NA | 1.3923 | NA | 1.2732 | NA | 0.7345 | NA | 0.9741 | NA | 0.5547 | NA | 1.1967 | NA | 1.3670 | NA | 1.4968 | NA | 1.0710 | NA | 0.6613 | NA | 0.4481 | NA | 0.9852 | NA |
| 2-Deoxyadenosine | 1.0381 | NA | 2.1966 | NA | 0.7663 | NA | 0.5610 | NA | 0.6399 | NA | 0.7270 | NA | 0.6714 | NA | 0.8449 | NA | 0.7119 | NA | 1.0588 | NA | 1.6442 | NA | 1.8524 | NA | 0.9222 | NA |
| 5-Aminovaleric acid | 1.0942 | NA | 1.1708 | NA | 1.4491 | NA | 0.9286 | NA | 0.4853 | NA | 1.3326 | NA | 0.8365 | NA | 1.3292 | NA | 1.0680 | NA | 1.0158 | NA | 0.6738 | NA | 1.2388 | NA | 0.9490 | NA |
| Adenine | 1.2825 | NA | 1.0220 | NA | 0.4439 | NA | 0.9371 | NA | 1.4383 | NA | 1.0138 | NA | 1.2548 | NA | 0.9587 | NA | 0.8736 | NA | 1.3379 | NA | 1.2775 | NA | 0.7064 | NA | 0.9782 | NA |
| Adenosine | 1.3327 | NA | 0.4646 | NA | 0.2131 | NA | 0.7151 | NA | 2.0322 | NA | 1.7849 | NA | 1.0568 | NA | 0.5776 | NA | 0.4005 | NA | 1.2364 | NA | 1.5957 | NA | 1.2994 | NA | 0.9227 | NA |
| Alanine | 1.3509 | NA | 1.2792 | NA | 1.4894 | NA | 0.8533 | NA | 0.6125 | NA | 1.1343 | NA | 0.9112 | NA | 1.2466 | NA | 0.9705 | NA | 1.0143 | NA | 0.7830 | NA | 0.8419 | NA | 0.9984 | NA |
| Arginine | 0.7186 | NA | 1.6168 | NA | 1.3120 | NA | 0.8931 | NA | 0.8397 | NA | 1.0155 | NA | 0.6162 | NA | 1.5007 | NA | 0.9392 | NA | 1.1417 | NA | 0.9824 | NA | 0.7637 | NA | 1.0581 | NA |
| beta-Homoproline* | 1.2996 | NA | 0.6841 | NA | 0.8757 | NA | 0.6996 | NA | 1.6187 | NA | 1.1695 | NA | 1.1755 | NA | 0.9342 | NA | 0.5803 | NA | 0.8821 | NA | 1.2550 | NA | 1.0050 | NA | 1.1133 | NA |
| Betaine | 1.2989 | NA | 1.1279 | NA | 1.0830 | NA | 1.1956 | NA | 0.4619 | NA | 0.6303 | NA | 1.1023 | NA | 0.9335 | NA | 0.7093 | NA | 1.1487 | NA | 1.2146 | NA | 1.2355 | NA | 1.1302 | NA |
| Cadaverine* | 0.2816 | NA | 0.3776 | NA | 0.7075 | NA | 0.0805 | NA | 1.4126 | NA | 2.0539 | NA | 0.6474 | NA | 1.3876 | NA | 1.2812 | NA | 0.0836 | NA | 1.7210 | NA | 1.9982 | NA | 1.1693 | NA |
| Carnitine | 0.6353 | NA | 0.6759 | NA | 0.7133 | NA | 0.3395 | NA | 0.7497 | NA | 2.8101 | NA | 0.3936 | NA | 0.6323 | NA | 0.5236 | NA | 0.5307 | NA | 1.2536 | NA | 3.1603 | NA | 1.0272 | NA |
| Choline | 1.8018 | NA | 2.4341 | NA | 2.1486 | NA | 0.9949 | NA | 0.2397 | NA | 0.4108 | NA | 1.1441 | NA | 0.9560 | NA | 0.6723 | NA | 1.1467 | NA | 0.3897 | NA | 0.2801 | NA | 0.9553 | NA |
| Citrulline | 1.4551 | NA | 1.0295 | NA | 0.7452 | NA | 0.8425 | NA | 0.7047 | NA | 1.0800 | NA | 1.1646 | NA | 0.8775 | NA | 0.5096 | NA | 1.4850 | NA | 0.7563 | NA | 1.9539 | NA | 0.9598 | NA |
| Creatinine | 1.5879 | NA | 0.7689 | NA | 1.5200 | NA | 1.2913 | NA | 0.6382 | NA | 1.1642 | NA | 0.8545 | NA | 1.2289 | NA | 1.1248 | NA | 1.7078 | NA | 0.3856 | NA | 0.3514 | NA | 0.9469 | NA |
| Cytosine | 2.5945 | NA | 1.0156 | NA | 0.8698 | NA | 1.1495 | NA | 0.7947 | NA | 0.7699 | NA | 1.2872 | NA | 0.9930 | NA | 0.6098 | NA | 0.7626 | NA | 0.7927 | NA | 0.8275 | NA | 1.0052 | NA |
| Deoxycarnitine* | 0.1132 | NA | 0.1651 | NA | 0.1974 | NA | 0.0905 | NA | 1.0826 | NA | 2.7851 | NA | 0.1550 | NA | 0.2045 | NA | 0.1379 | NA | 0.1120 | NA | 1.8586 | NA | 5.7040 | NA | 0.9589 | NA |
| Ethanolamine* | 1.0858 | NA | 1.3618 | NA | 0.6840 | NA | 0.8607 | NA | 1.1701 | NA | 0.6726 | NA | 1.6639 | NA | 1.6206 | NA | 1.2308 | NA | 1.4130 | NA | 0.3050 | NA | 0.2621 | NA | 1.0491 | NA |
| FAD | 1.1299 | NA | 0.6682 | NA | 0.5546 | NA | 1.1990 | NA | 0.7862 | NA | 0.8676 | NA | 1.1865 | NA | 0.7883 | NA | 0.6842 | NA | 1.5204 | NA | 1.3749 | NA | 1.2251 | NA | 1.0055 | NA |
| Flavin mononucleotide | 0.8865 | NA | 0.5289 | NA | 0.4656 | NA | 0.8920 | NA | 1.1573 | NA | 1.4418 | NA | 0.8081 | NA | 0.6020 | NA | 0.5470 | NA | 1.0993 | NA | 1.6985 | NA | 1.8355 | NA | 1.0136 | NA |
| Glucosamine | 0.6343 | NA | 0.2394 | NA | 0.2413 | NA | 0.9026 | NA | 1.3507 | NA | 1.1960 | NA | 1.4789 | NA | 0.8392 | NA | 1.1416 | NA | 1.0919 | NA | 2.1907 | NA | 0.7035 | NA | 1.1683 | NA |
| Glutamine | 1.5903 | NA | 2.0090 | NA | 1.6531 | NA | 1.3990 | NA | 0.0476 | NA | 0.2528 | NA | 0.5301 | NA | 0.7935 | NA | 0.4711 | NA | 2.3632 | NA | 0.7075 | NA | 0.4638 | NA | 1.0791 | NA |
| Guanine | 1.8623 | NA | 1.7821 | NA | 1.4269 | NA | 0.6882 | NA | 0.2288 | NA | 0.1589 | NA | 1.6371 | NA | 1.9149 | NA | 2.0712 | NA | 0.5163 | NA | 0.1007 | NA | 0.0856 | NA | 1.0097 | NA |
| Guanosine | 1.6816 | NA | 1.6082 | NA | 1.3191 | NA | 0.3394 | NA | 0.1582 | NA | 0.2134 | NA | 1.4103 | NA | 2.0940 | NA | 2.8011 | NA | 0.1457 | NA | 0.0726 | NA | 0.1069 | NA | 1.0180 | NA |
| Histamine | 0.6429 | NA | 1.0484 | NA | 0.4294 | NA | 0.4381 | NA | 0.3575 | NA | 1.6865 | NA | 1.4917 | NA | 1.7865 | NA | 0.7856 | NA | 1.2937 | NA | 0.7587 | NA | 1.5997 | NA | 1.0644 | NA |
| Histidine | 1.1143 | NA | 0.9441 | NA | 1.2066 | NA | 0.8593 | NA | 0.6706 | NA | 1.4803 | NA | 0.8012 | NA | 1.0889 | NA | 0.8249 | NA | 1.3561 | NA | 0.8883 | NA | 1.1313 | NA | 1.0479 | NA |
| Homocitrulline | 0.5806 | NA | 0.5023 | NA | 0.5326 | NA | 0.4921 | NA | 1.7172 | NA | 2.9171 | NA | 0.4676 | NA | 0.6532 | NA | 0.5006 | NA | 0.6358 | NA | 1.2642 | NA | 2.1621 | NA | 0.9929 | NA |
| Homocysteine | 0.9234 | NA | 0.3462 | NA | 0.1475 | NA | 0.8016 | NA | 1.9944 | NA | 0.8402 | NA | 0.9602 | NA | 0.4791 | NA | 0.3214 | NA | 0.8917 | NA | 2.9595 | NA | 1.6543 | NA | 0.9743 | NA |
| Homoserine* | 2.4213 | NA | 1.7950 | NA | 1.2162 | NA | 1.5369 | NA | 0.0550 | NA | 0.2560 | NA | 0.9519 | NA | 1.0618 | NA | 0.5327 | NA | 1.4899 | NA | 0.3586 | NA | 0.7939 | NA | 1.0096 | NA |
| Hypoxanthine | 1.2369 | NA | 1.1281 | NA | 0.9575 | NA | 0.9104 | NA | 1.1925 | NA | 0.8297 | NA | 1.2178 | NA | 1.1088 | NA | 1.2331 | NA | 1.1901 | NA | 0.9587 | NA | 0.5670 | NA | 0.9887 | NA |
| Isoleucine | 1.5356 | NA | 0.8823 | NA | 1.1525 | NA | 1.1162 | NA | 0.7822 | NA | 1.2029 | NA | 0.8662 | NA | 0.9464 | NA | 0.8403 | NA | 1.5629 | NA | 0.9256 | NA | 0.7141 | NA | 0.9883 | NA |
| Leucine | 1.4983 | NA | 0.9387 | NA | 1.2654 | NA | 1.1814 | NA | 0.7333 | NA | 1.1898 | NA | 0.8946 | NA | 1.0164 | NA | 0.8594 | NA | 1.4987 | NA | 0.7990 | NA | 0.6673 | NA | 0.9837 | NA |
| Lysine | 2.0144 | NA | 2.7848 | NA | 1.9323 | NA | 1.2041 | NA | 0.0359 | NA | 0.0689 | NA | 0.9884 | NA | 0.9323 | NA | 0.4791 | NA | 1.7942 | NA | 0.1140 | NA | 0.1505 | NA | 1.0003 | NA |
| Methionine | 1.7360 | NA | 1.0247 | NA | 1.4037 | NA | 1.3318 | NA | 0.6118 | NA | 1.3353 | NA | 0.9600 | NA | 0.9534 | NA | 0.8624 | NA | 1.6694 | NA | 0.1431 | NA | 0.5512 | NA | 0.9689 | NA |
| Methylguanine* | 1.0778 | NA | 1.1052 | NA | 0.7404 | NA | 0.6673 | NA | 1.5046 | NA | 0.7438 | NA | 1.4598 | NA | 1.6237 | NA | 1.7716 | NA | 0.9656 | NA | 0.6933 | NA | 0.5420 | NA | 0.8553 | NA |
| N8-Acetylspermidine | 1.2303 | NA | 1.4428 | NA | 1.2744 | NA | 1.1875 | NA | 0.5168 | NA | 0.6274 | NA | 1.5636 | NA | 1.1820 | NA | 0.8964 | NA | 1.2290 | NA | 0.7985 | NA | 0.3945 | NA | 1.0569 | NA |
| N-Acetyl-lysine* | 1.0255 | NA | 2.8390 | NA | 2.7502 | NA | 0.4545 | NA | 0.1090 | NA | 0.1302 | NA | 0.8573 | NA | 1.9123 | NA | 1.6374 | NA | 0.6535 | NA | 0.1554 | NA | 0.0776 | NA | 0.9578 | NA |
| N-Acetylputrescine* | 0.9972 | NA | 2.1048 | NA | 1.8781 | NA | 0.5534 | NA | 0.6960 | NA | 0.6063 | NA | 1.4240 | NA | 2.0337 | NA | 1.4614 | NA | 0.9368 | NA | 0.3046 | NA | 0.0269 | NA | 0.8096 | NA |
| NAD | 0.9510 | NA | 1.1739 | NA | 0.9080 | NA | 0.7633 | NA | 0.6965 | NA | 0.8452 | NA | 0.9812 | NA | 1.3582 | NA | 1.2555 | NA | 0.9791 | NA | 1.1297 | NA | 1.0560 | NA | 1.0553 | NA |
| Niacin | 0.4455 | NA | 0.5135 | NA | 0.8526 | NA | 0.4536 | NA | 3.5026 | NA | 0.5361 | NA | 0.6983 | NA | 0.9154 | NA | 2.8588 | NA | 0.4012 | NA | 0.8577 | NA | 0.4793 | NA | 0.9768 | NA |
| N,N-Dimethyldodecylamine N-oxide* | 0.9686 | NA | 1.3185 | NA | 2.2479 | NA | 0.8560 | NA | 1.8366 | NA | 0.3262 | NA | 0.3897 | NA | 0.2255 | NA | 0.7217 | NA | 1.2494 | NA | 0.1358 | NA | 0.1467 | NA | 1.6947 | NA |
| N,N-Dimethylglycine* | 1.1680 | NA | 0.6292 | NA | 0.4737 | NA | 1.2318 | NA | 0.2212 | NA | 0.6365 | NA | 1.1965 | NA | 1.3543 | NA | 0.8557 | NA | 3.0099 | NA | 0.5286 | NA | 0.9946 | NA | 1.0584 | NA |
| Ornithine* | 1.3654 | NA | 1.2558 | NA | 1.7389 | NA | 1.1411 | NA | 0.4373 | NA | 0.8898 | NA | 0.8245 | NA | 1.2605 | NA | 1.0631 | NA | 1.3926 | NA | 0.5008 | NA | 0.4844 | NA | 1.0081 | NA |
| Pantothenic acid | 1.4688 | NA | 0.2632 | NA | 0.2396 | NA | 1.2870 | NA | 1.3342 | NA | 1.0479 | NA | 1.0443 | NA | 0.3604 | NA | 0.2608 | NA | 1.5320 | NA | 2.2791 | NA | 1.1601 | NA | 1.0808 | NA |
| Phenethylamine* | 1.3746 | NA | 0.7780 | NA | 1.5625 | NA | 1.0944 | NA | 0.5962 | NA | 0.8963 | NA | 1.1191 | NA | 1.1839 | NA | 1.1129 | NA | 1.5173 | NA | 0.6875 | NA | 0.5339 | NA | 0.9899 | NA |
| Phenylalanine | 1.4520 | NA | 0.8731 | NA | 1.2766 | NA | 1.2074 | NA | 0.9081 | NA | 1.0681 | NA | 0.9186 | NA | 1.0295 | NA | 0.9556 | NA | 1.6119 | NA | 0.7913 | NA | 0.5132 | NA | 0.9607 | NA |
| Phenylethanolamine* | 1.4542 | NA | 0.8731 | NA | 1.2941 | NA | 1.1775 | NA | 0.9138 | NA | 1.1036 | NA | 0.9282 | NA | 1.0245 | NA | 0.9445 | NA | 1.6299 | NA | 0.7822 | NA | 0.4833 | NA | 0.9590 | NA |
| Pipecolic acid | 1.3623 | NA | 1.0061 | NA | 1.3070 | NA | 1.0660 | NA | 0.7975 | NA | 1.1973 | NA | 0.7460 | NA | 0.9367 | NA | 0.6843 | NA | 1.3910 | NA | 0.8709 | NA | 0.9168 | NA | 1.0391 | NA |
| Proline | 1.1270 | NA | 1.4083 | NA | 1.6505 | NA | 0.7004 | NA | 0.6255 | NA | 1.2215 | NA | 0.6787 | NA | 1.0929 | NA | 0.8246 | NA | 0.8501 | NA | 0.8773 | NA | 1.5627 | NA | 0.9562 | NA |
| Putrescine | 1.5812 | NA | 1.2578 | NA | 1.1124 | NA | 1.3699 | NA | 0.2934 | NA | 0.3683 | NA | 1.6573 | NA | 1.3916 | NA | 1.0233 | NA | 1.4025 | NA | 0.3931 | NA | 0.3278 | NA | 1.1163 | NA |
| Pyridoxal 5-phosphate* | 0.9293 | NA | 1.0286 | NA | 0.6844 | NA | 1.2365 | NA | 0.9328 | NA | 0.7325 | NA | 0.6547 | NA | 0.8948 | NA | 1.2196 | NA | 1.2222 | NA | 1.1056 | NA | 1.4531 | NA | 0.9658 | NA |
| Pyridoxine | 0.4265 | NA | 0.2850 | NA | 0.2692 | NA | 0.3604 | NA | 0.0736 | NA | 0.2682 | NA | 0.4964 | NA | 0.3834 | NA | 0.3514 | NA | 0.6456 | NA | 0.1130 | NA | 9.5861 | NA | 0.7178 | NA |
| Riboflavin | 0.9362 | NA | 0.2144 | NA | 0.1784 | NA | 1.6094 | NA | 1.0254 | NA | 1.2747 | NA | 0.9594 | NA | 0.3296 | NA | 0.3004 | NA | 1.4759 | NA | 1.6430 | NA | 2.4651 | NA | 0.9407 | NA |
| S-Adenosylmethionine (SAM) | 1.1260 | NA | 1.1605 | NA | 1.2068 | NA | 1.1062 | NA | 0.2484 | NA | 1.0227 | NA | 1.2305 | NA | 1.6253 | NA | 1.3706 | NA | 1.3238 | NA | 0.2656 | NA | 0.4211 | NA | 1.0518 | NA |
| Tryptophan | 0.9364 | NA | 0.4403 | NA | 1.1089 | NA | 0.5666 | NA | 2.9129 | NA | 2.0485 | NA | 0.8515 | NA | 0.5566 | NA | 0.7704 | NA | 0.5782 | NA | 1.6388 | NA | 0.2034 | NA | 0.9565 | NA |
| Tyrosine | 1.4380 | NA | 0.8609 | NA | 1.1959 | NA | 1.0934 | NA | 0.7545 | NA | 1.1337 | NA | 0.9985 | NA | 1.0185 | NA | 0.9448 | NA | 1.4346 | NA | 0.8659 | NA | 0.8096 | NA | 0.9809 | NA |
| Uridine diphosphate galactose* | 0.7791 | NA | 0.9631 | NA | 1.0647 | NA | 1.1313 | NA | 0.3186 | NA | 0.8324 | NA | 0.9074 | NA | 1.0521 | NA | 0.9958 | NA | 1.5050 | NA | 1.5233 | NA | 0.5802 | NA | 1.1262 | NA |
| Valine | 1.6958 | NA | 1.0412 | NA | 1.2584 | NA | 1.1936 | NA | 0.4613 | NA | 0.9304 | NA | 0.9708 | NA | 0.9022 | NA | 0.6864 | NA | 1.3441 | NA | 0.9604 | NA | 0.9702 | NA | 1.0221 | NA |
Factors:
| F1 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F2 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F3 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F4 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F5 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F6 | Treatment:0MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F7 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F8 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F9 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F10 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F11 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F12 | Treatment:4MIC CZA - 0MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F13 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F14 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F15 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F16 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F17 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F18 | Treatment:4MIC CZA - 4MIC TGC | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F19 | Treatment:Control | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F20 | Treatment:Control | Timepoint:0h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F21 | Treatment:Control | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F22 | Treatment:Control | Timepoint:2h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F23 | Treatment:Control | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria cell pellet |
| F24 | Treatment:Control | Timepoint:4h | Sample source:E coli bacteria medium supernatant |
| F25 | Treatment:QC | Timepoint:QC | Sample source:E coli bacteria cell pellet QC |
| F26 | Treatment:QC | Timepoint:QC | Sample source:E coli bacteria medium supernatant QC |
